算法 - DNA搜索 - Ako Corasick】的更多相关文章

场景:从很长的字符串(输入字符串.DNA)中搜索大量固定字符串(字典.基因) 题目:Determining DNA Health | HackerRank 算法:Aho–Corasick algorithm - Wikipedia 实现:zjffun/ahocorasick.js: Just a JS implementation of Aho–Corasick algorithm.…
1.目标 通过本文,希望可以达到以下目标,当遇到任意问题时,可以: 1.很快建立状态空间: 2.提出一个合理算法: 3.简单估计时空性能: 2.搜索分类 2.1.盲目搜索 按照预定的控制策略进行搜索,在搜索过程中获得的中间信息不用来改进控制策略: 常见算法: 1.广度优先搜索(Breadth First Search): 2.深度优先搜索(Depth First Search): 3.纯随机搜索.重复式搜索.迭代加深搜索.迭代加宽搜索.柱形搜索: 2.2.启发式搜索 在搜索中加入了与问题有关的启…
总时间限制: 1000ms 内存限制: 65536kB 题目 佐助被大蛇丸诱骗走了,鸣人在多少时间内能追上他呢? 已知一张地图(以二维矩阵的形式表示)以及佐助和鸣人的位置.地图上的每个位置都可以走到,只不过有些位置上有大蛇丸的手下,需要先打败大蛇丸的手下才能到这些位置.鸣人有一定数量的查克拉,每一个单位的查克拉可以打败一个大蛇丸的手下.假设鸣人可以往上下左右四个方向移动,每移动一个距离需要花费1个单位时间,打败大蛇丸的手下不需要时间.如果鸣人查克拉消耗完了,则只可以走到没有大蛇丸手下的位置,不可…
题意:通过剪切粘贴操作,将n个自然段组成的文章,排列成1,2,……,n.剪贴板只有一个,问需要完成多少次剪切粘贴操作可以使文章自然段有序排列. 分析: 1.IDA*搜索:maxn是dfs的层数上限,若在maxn范围内未找到解,则++maxn,直到找到解.对于每个当前深度deep,若还需要搜索m层才能找到解,而deep+m>maxn,则剪枝. 2.对于本题,选取估价函数,若当前深度下,后继不正确的数字个数是m,则还需要m/3层才能找到解.即若deep+m/3>maxn则剪枝. 3.不断枚举剪切片…
面对海量的信息,我们很容易被淹没在信息的海洋中:当我们需要查找某个信息的时候,我们就会输入能够体现我们意图的关键字,搜索引擎会通过解析我们的关键字从而构造相应的查询表示方法:然后搜索引擎通过构造的查询在内存存储的文档集合中查找跟用户需求相关的文档,并根据相关度进行排序:以上搜索引擎进行计算的过程就是相关度计算,而其相关的理论基础就是检索模型: 用户输入的是关键字,搜索引擎输出的是相关文档,从关键字和相关性两个角度可以将文档集合分为4个子集:检索模型要解决的就是尽量包含并提升set1.set3的排…
bellman-ford算法 给定一个 n 个点 m 条边的有向图,图中可能存在重边和自环, 边权可能为负数. 请你求出从 1 号点到 n 号点的最多经过 k 条边的最短距离,如果无法从 1 号点走到 n 号点,输出 impossible. 注意:图中可能 存在负权回路 . 输入格式 第一行包含三个整数 n,m,k. 接下来 m 行,每行包含三个整数 x,y,z,表示存在一条从点 x 到点 y 的有向边,边长为 z. 输出格式 输出一个整数,表示从 1 号点到 n 号点的最多经过 k 条边的最短…
单源最短路 所有边权都是正数 朴素Dijkstra算法(稠密图) #include<cstdio> #include<cstring> #include<iostream> #include<algorithm> using namespace std; const int N=510; int n,m; int g[N][N]; int dist[N]; bool st[N]; int dijkstra(){ memset(dist,0x3f,sizeof…
宽度优先搜索(BFS) #include<cstdio> #include<cstring> #include<iostream> #include<algorithm> #include<queue> #define x first #define y second using namespace std; typedef pair<int,int> PII; const int N=210; char g[N][N]; int d…
题目说明: 今日的一些高阶程式语言对于字串的处理支援越来越强大(例如Java.C#.Perl等),不过字串搜寻本身仍是个值得探讨的课题,在这边以Boyer- Moore法来说明如何进行字串说明,这个方法快且原理简洁易懂. 题目解析: 串搜寻本身不难,使用暴力法也可以求解,但如何快速搜寻字串就不简单了,传统的字串搜寻是从关键字与字串的开头开始比对,例如 Knuth-Morris-Pratt 演算法 字串搜寻,这个方法也不错,不过要花时间在公式计算上:Boyer-Moore字串核对改由关键字的后面开…
Description 牛牛最近迷上了一种叫斗地主的扑克游戏.斗地主是一种使用黑桃.红心.梅花.方片的A到K加上大小王的共54张牌来进行的扑克牌游戏.在斗地主中,牌的大小关系根据牌的数码表示如下:3<4<5<6<7<8<9<10<J<Q<K<A<2<小王<大王,而花色并不对牌的大小产生影响.每一局游戏中,一副手牌由n张牌组成.游戏者每次可以根据规定的牌型进行出牌,首先打光自己的手牌一方取得游戏的胜利.现在,牛牛只想知道,对…