今天用fastx_tookit 时遇到问题, 我的fastq 文件的碱基质量值格式为phred33, 而fastq_tookit 默认碱基质量值的格式为phred64, 所以报错了,提示我的fastq文件中包含非法的碱基质量值,逗号 逗号的在ascii 码表中对应的十进制数字为44, 按照phred 33 格式,其对应的碱基质量值为11,如果按照phred64处理的化, 其质量值为-20,此时就会报错, 所以需要将碱基质量给位phred64 格式的,我没找到现有工具, 只能自己写了,虽然很慢,…

在新装的Linux服务器上部署了一个作业监控磁盘空间并提前告警,在shell脚本里面调用了一个perl脚本发送告警邮件.结果出现了一个很奇怪的现象:如果手工执行该脚本/home/oracle/scripts/disk_capatiy_alarm.sh能发出告警邮件,但是在crontab里面发现脚本没有发出告警邮件.检查了/var/log/cron后发现该作业执行了.最后发现shell执行了,但是perl脚本没有执行.搜索了相关资料后,了解到一般出现这种情况要么是因为环境变量,要么是因为使用了相对…

linux 全自动提权 exp perl脚本 作者: admin 日期: 2013/01/19发表评论 (0) 查看评论   国外流传过来的 地址 http://dl.packetstormsecurity.net/UNIX/penetration/rootkits/var.txt 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39…

  原文地址:  http://blog.csdn.net/johnny710vip/article/details/8905239   这是一篇关于perl脚本测试的总结性文章,其中提到了很多实用的模块,如果文中介绍的不够详细,请到cpan上搜索该模块并查阅其文档.  1基本语法检查 Perl语言的哲学是“There is more than one way to do it”,很多讨厌Perl的人总是拿Perl的这个特性来攻击Perl,而喜欢Perl的人却又极力推崇它.这里不讨论这个特性是好…

最近接触一些需要csv,txt,excel文件之间的转换,根据一些网上搜索加上自己的改动,实现自己想要的结果为主要目的,代码的出处已经找不到了,还请见谅,以下主要是针对csv&excel 和txt&excel写的perl脚本. 主要用到的模块是:   Text::CSVSpreadsheet::WriteExcel Spreadsheet::ParseExcel Spreadsheet::ParseExcel::FmtUnicode Unicode::Map 可以支持中文,具体也没有要仔细…

这个perl文件将执行的任务是, 按照指定的文件夹目录,自动将该文件夹下的所有文件上传到指定ftp站点的指定目录下 本应用程序设计的几个基本理念是:工具箱再利用:尽可能利用已有的工具:简化运行步骤:不引入过多的业务逻辑,满足的需求越简单越好. 所以,我们定义了本应用程序依赖于以下几个工具的运行:ActivePerl-5.8.4.810-MSWin32-x86Upload.plUpload.config 我们将主要的执行逻辑都放在Perl源文件Upload.pl中了,配置文件为Upload.con…

刚学习perl脚本的时候,喜欢频繁使用defined关键字判断一个hash中某个key是否存在,后来程序出了问题才去perl官方文档查看关于defined关键字的准确使用方法.因此,这里我把perl中几个关键字的用法和区别加以介绍,希望大家能够有所借鉴. defined()和exists(): 在perl脚本中,undef是一个非常特殊的整数,这个整数用来表示失败.系统错误.文件末尾.未初始化的变量以及其他一系列的异常情况.了解了undef这个变量,那么就可以来看defined变量的作用了.当d…

来源:http://www.veryhuo.com/a/view/38338.html 今天想把 perl 脚本编译成 exe 以便脱离 perl 解释器独立运行.都可以生成PERL的PE文件,在PERL官网有介绍. perl脚本编译成exe 一般有4种方法: 1. 使用 perl2exe 工具(需要购买,当然也有破解版或绿色版,不过网上只找到5.0版本的,而我的是5.12版本,版本太低所以不能使用) exe文件体积大 运行慢 2. 使用 ActiveState 公司的 Perl Dev Kit…

工具推荐:ATSCAN,功能强大的Perl脚本扫描器 使用perl语言编写的开源的扫描器,功能丰富强大,除了基本的tcp和udp端口扫描之外,还可以搜索wordpress.joomla等网站并进行口令猜解等攻击. 描述: ATSCAN version6.3 搜素引擎 XSS扫描器 sqlmap 本地文件包含扫描器 筛选出wordpress和Joomla网站 寻找Admin页面 编解码MD5和Base64 端口扫描 搜索网站的电子邮件地址 使用代理 user-agent随机 错误扫描 检测Cms…

版权声明:本文为博主原创文章.未经博主同意不得转载. https://blog.csdn.net/sunshoupo211/article/details/32711165 编程中错误不可避免.调试可以帮助我们发现有问题的代码段.在网上看了一下Perl脚本调试,发现事实上非常多东西并不须要,并且那么多也没人看. 以下简单整理一下. 1.进入debug. 使用-d.进入debug状态. 例:perl -d Perl程序名称. 2.设置断点 b:设置断点.例:b 行号. c:程序运行到下一个断点处,…