conda是个安装软件的神器,但镜像不稳定,下载安装软件的速度有时很慢.对于几十Mb甚至上百Mb的软件往往下不动,下了半天可能失败. 找了一个叫mamba的加速神器,可以用来并行下载和安装,大大加快速度,减少失败几率. 首先,mamba本身需要先通过conda来安装: conda install -c conda-forge mamba 依赖python,所以这里慢也没办法,只有等. mamba安装成功后,后续所有软件安装都可将conda替换为mamba了,如mamba install -y b…

conda的确是一个非常好的工具,对于初学者而言,安装软件就跟用XXX软件管理器一样方便.正因为他如此便利,以至于我介绍如何手动安装工具时,总有人问我为啥不用conda. 我用conda,并且用的很好. 下面解决一个非常有趣的conda安装工具后出现的动态库缺失的问题.这是我最近遇到的例子, $ samtools samtools: error while loading shared libraries: libtinfow.so.5: cannot open shared object fi…

1.ports的目录在/usr/ports2.POSTS安装软件有时可能这个包已经安装过了,会有提示,无法 继续安装.能够用提示中的参数:#make install clean FORCE_PKG_REGISTER=yes这样就能够继续安装了,yes不区分大小写.3.PORTS安装软件时有时能够下载回来的包的md5值不匹配,能够加参数强制安装.#make install clean NO_CHECKSUM=yes4.PORTS安装软件如何 提速?最先配置一个速度比较快的国内镜像.#vim /et…

rhel系统貌似安装不了xmgrace,配置的时候居然说要那个M*tif库.百度了一下,需要openmotif库,然后用root账户想要用yum安装一下这个库,搞了好久没搞懂.后面搞明白了,原因竟是因为所需要的库不支持rhel,枉我之前搞了这么久没安装好.不过也还好,安装这个破软件的过程让我更进一步了解了Linux安装软件的步骤. 一般的源代码安装,基本操作真的是非常简单. ①下载源码包 ②解压,新建一个build文件夹,进入文件夹.新建文件夹并进入文件夹的目的是等下配置的时候会生成一堆配置文件…

下面简要说一下Linux下非root用户安装软件的一般流程: 1. 获取源代码,一般是wget方式,ubuntu可以使用apt-get source来获取源代码. 2. 解压源代码,一般使用tar -zxvf xxx.tar.gz即可 3. 切换到解压后的目录,运行 ./configure.其选项可以通过 ./configure –help来获取,非root用户下最重要的应该是定义安装目录,即应该定义 ./configure –prefix=/path/to/bin, 对于一些依赖库,可能还需要…

Linux下非root用户如何安装软件 从windows转移到Linux的用户最开始总会有各种不适,因为这种不适最终放弃linux的不在少数.对于这类人只能说可惜,还没有领略到linux的美好就过早放弃了.还有就是用着Linux还不错,但是因为熟悉了在个人电脑上使用,有着各种权限.突然发现工作的时候只能使用普通账户,许多sudo命令都不能再使用,然后各种不适应和各种纠结.本文主要面向对象是第二类人群,简要的介绍在没有root权限的情形下良好的使用Linux来工作. windows毫无疑问是PC操…

背景 之前用的linux操作系统移植都是ubuntu,没有用过redhat版本的linux,最近开始想学习redhan版本的linux,就从centos开始.在安装完centos以后,第一个碰到的问题就是如何安装软件.之前在ubuntu中如何安装软件我已经写了一篇博客了,可以参考:ubuntu下安装程序的三种方法 .下面开始将如何在centos下安装软件. centos安装软件的命令 CentOS 下 rpm包与 yum 安装与卸载 一.rpm包的安装: .安装一个包 # rpm -ivh .升…

FreeBSD的默认下载工具是fetch,既慢又不好用.在FreeBSD下安装软件有一些很有效率的方式,下面就给大家介绍一下. Ports机制 首先,FreeBSD下最有特色的软件安装和升级机制就是ports,既方便又高效.下面我们从ports套件的安装开始讲起,让你细致的了解有关ports的每一个细节 一.ports套件的安装 ①我的FreeBSD 8.0-release是最小化安装,所以既没有ports,也没有/usr/ports目录.选择启用ports的话,需要在root下输入"sysin…

新安装了redhat6.5.安装后,登录系统,使用yum update 更新系统.提示: This system is not registered to Red Hat Subscription Management. You can use subscription-manager to register. 无法更新. redhat 默认自带的 yum 源需要注册,才能更新.我们想不花钱也可以更新,需要替换掉redhat的yum源. 1.检查是否安装yum包 查看RHEL是否安装了yum,若…

1. 获取源代码,一般是wget方式,ubuntu可以使用apt-get source来获取源代码. 2. 解压源代码,一般使用tar -zxvf xxx.tar.gz即可 3. 切换到解压后的目录,运行 ./configure.其选项可以通过 ./configure –help来获取,非root用户下最重要的应该是定义安装目录,即应该定义 ./configure –prefix=/path/to/bin, 对于一些依赖库,可能还需要使用 ./configure  –prefix=xxx –wi…