根据维基百科的定义: 厘摩(centimorgan,简写为cM),或称为图距单位(map unit),是遗传连锁中的距离单位,以现代遗传学之父托马斯·亨特·摩尔根的名字命名.1厘摩的定义为两个位点间平均100次减数分裂发生1次遗传重组.连锁位点之间的距离不超过50厘摩,两个位点间距50厘摩即意味着两者完全不连锁.对于人类来说,1厘摩平均相当于100万个碱基对.参考链接:https://zh.wikipedia.org/zh-sg/%E5%8E%98%E6%91%A9 如果看了上面那段定义,你能理

Description 为了进一步分析外星生物,专家们决定对 DNA 进行切割.限制性核酸内切酶是基因工程中的重要的工具酶.它会识别一段碱基序列(说白了就是只包含 ATGC 的序列)并且切割开.EcoRI 是某种限制酶的名称,它识别有某种特性的 DNA序列,即 DNA序列双链反向排列相同的.(双链对应位碱基对要满足碱基互补配对原则)比如识别序列为 G A A T T C互补链序列为 C T T A A G第一条链从左读和第二条链从右读的是一样的.专家们想知道某一段 DNA的序列中,具有这种特性的

                       Blender的修改器(modifier)模块,默认界面右下块(Property)面板的扳手,分类(修改.生成.形变.模拟)列出所有的修改器.也可以空格键输入modifier,出现"Add Modifier"后点击即可.我参与翻译了官方的修改器文档,也跟着制作双螺旋结构的DNA教程走了一遍,算是对修改器有个大致的了解.制作很简单,用上细分表面(Subsurf).镜像(Mirror).阵列(Array).曲线(Curve)四个修改器.首先添加

### miRNA特点 (1)广泛存在于真核生物中, 是一组不编码蛋白质的短序列RNA,它本身不具有开放阅读框架(ORF),并且由不同于mRNA的独立转录单位表达. (2)通常的长度为20-24 nt,但在3′端可以有1-2 个碱基的长度变化(对miRNA 的具体长度范围尚无统一标准). (3)成熟的miRNA , 5′端有磷酸基团, 3′端为羟基,且具有独特的序列特征.它们可以和上游或下游的序列不完全配对形成茎环结构. (4)miRNA5′端第一个碱基对U有强烈的倾向性,而对G却有抗性,但第2

03:基因相关性 总时间限制:  1000ms 内存限制:   65536kB 描述 为了获知基因序列在功能和结构上的相似性,经常需要将几条不同序列的DNA进行比对,以判断该比对的DNA是否具有相关性. 现比对两条长度相同的DNA序列.首先定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对,如果一个碱基对中的两个碱基相同的话,则称为相同碱基对.接着计算相同碱基对占总碱基对数量的比例,如果该比例大于等于给定阈值时则判定该两条DNA序列是相关的,否则不相关. 输入 有三行,第一行是用来判定出两条DNA序列

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的

核心提示:这是网上开源编程学习项目FCC的javascript中级编程题(Intermediate Algorithm Scripting(50 hours)),一共20题.建议时间是50个小时,对于刚入门的人来说,操作是有些难度了. #### 1.我们会传递给你一个包含两个数字的数组.返回这两个数字和它们之间所有数字的和. 最小的数字并非总在最前面. 简单地说,就是两个数之间的连续自然数列求和问题.项数可以用Math.abs()方法求出. function sumAll(arr) { var

Erlang 一直以慢“著称”,本文就来看看 Erlang 慢在什么地方,为什么比实现同样功能的 C 语言程序慢那么多倍.Erlang 作为一种虚拟机解释的语言,慢是当然的.不过本文从细节上分析为什么 Erlang 这种虚拟机语言会慢. 本文从 shootout benchmark[注1]中选择了一个 Erlang 和 C 语言单核性能差距最大的例子——reverse complement[注2].根据 shootout 网站上给出的使用某款 64 位处理器单个核心的 benchmark 数据,

01:统计数字字符个数 查看 提交 统计 提问 总时间限制:  1000ms 内存限制:  65536kB 描述 输入一行字符,统计出其中数字字符的个数. 输入 一行字符串,总长度不超过255. 输出 输出为1行,输出字符串里面数字字符的个数. 样例输入 Peking University is set up at 1898. 样例输出 4 来源 习题(7-1) 医学部 2010 期末试题 樊波 #include<cstdio> #include<cstring> ]; int m

http://blog.csdn.net/skenoy/article/details/38346489 经过几天的摸索和网上资料的查询对GATK软件有点小心得,现总结如下: 1. fasta文件最好用定位到染色体上的数据,可以不用注释VCF文件(GVF),但如果用VCF文件保证以下几个条件: 1)VCF染色体必须和fasta的染色体数目一致,顺序一致 2)VCF的位点必须从小到大排序 3)VCF的碱基有可能有其他符号,如“~”等,要去除干净 2. 做之前分别使用bwa index,picard

Week2的作业主要是关于概率图模型的构造,主要任务可以分为两个部分:1.构造CPD;2.构造Graph.对于有向图而言,在获得单个节点的CPD之后就可依据图对Combine CPD进行构造.在获得Combine CPD之后则可利用变量的观测来进行问答.此周作业的大背景是对基因型与表现型之间的关系进行探索.在已知表现性的情况下对基因型以及下一代的基因进行推测.这是一个很有实际意义的有向图网络. 1.CPD构造 1.1.基因型与表现型的关系——确定 在孟德尔遗传假说基础上,对双碱基配对的基因推测表

怀着期望,忐忑的心情看完了asp.net的一部分视频,这部分的学习也到了一个段落,颗粒归仓的工作还是要做的,但是有什么比一张图来得更直观有效呢? 先来张图,这次真的是有图有真相: 通过asp.net的学习,让我更深刻地理解了什么是结网,也明白了吃饭原理! 首先结网: 结网是用我们已有的知识作为节点,绑住新知识里的相同点,然后延伸出去让知识的整体性为新一点的知识联系起来,这样我们就可以让新旧知识在大脑里接一个线,线的两头有旧的和新的知识,但是这还不够…… 大家都知道基因很复发,多少大国的精英一起研

SNPs,全称是single nucleotide polymorphisms,SNPs等位基因频率的容易估计.采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略.该策略的原理是:首先选择参考样本制作标准曲线,然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较,根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率. SNPs概念 在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性.即:在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象. 只涉及到单个核苷酸碱基

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以

在学习FCC中级算法这一块,自己遇到了很多问题,通过RSA也慢慢把问题解决了,发现每一个问题都会有很多的解决思路,因此把自己想到的一些思路记录到这里. 1. Sum All Numbers in a Range 我们会传递给你一个包含两个数字的数组.返回这两个数字和它们之间所有数字的和. 思路1:定位最大和最小的值,进行累和相加,用到函数:Math.max(),Math.min(),Function.apply() function sumAll(arr) { var sum=0; var ma

1. NLP问题简介 0x1:NLP问题都包括哪些内涵 人们对真实世界的感知被成为感知世界,而人们用语言表达出自己的感知视为文本数据.那么反过来,NLP,或者更精确地表达为文本挖掘,则是从文本数据出发,来尽可能复原人们的感知世界,从而表达真实世界的过程.这里面就包括如图中所示的模型和算法,包括: ()文本层:NLP文本表示: ()文本-感知世界:词汇相关性分析.主题模型.意见情感分析等: ()文本-真实世界:基于文本的预测等: 显而易见,文本表示在文本挖掘中有着绝对核心的地位,是其他所有模型建构

NGS又称为下一代测序技术,高通量测序技术 以高输出量和高解析度为主要特色,能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列读取,在提供丰富的遗传学信息的同时,还可大大降低测序费用.缩短测序时间的测序技术. Sanger法测序(一代测序):是一种利用DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物的测序技术.每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP).由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以

1. 确定一个字符串中有多少个元音字母 def getCount(inputStr): return len([a for a in inputStr if a in "aeiou"]) 2. 对字符串中的各个字符按照位置的不同进行重复输出 def accum(test): return "-".join([c.upper()+c.lower()*i for i,c in enumerate(test)]) 3. 去除字符串中的元音字符 def disemvowel

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,