illumina SBS测序详解 2018年01月02日 09:33:56 sixu_9days 阅读数:9789 标签: 生物信息学二代测序 更多 个人分类: 测序原理   最近回头重新看了illlumina paired end sequence的测序原理视频,发现了以前没有注意的一些问题,而这些问题也是大家平时容易搞错的,因此花了几天时间将illumina 的paired end sequence 从构建文库到上机测序的整个过程以及原理较为详细的写了出来. 基础知识:illumina测序的

参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本来源单一的就是单样本,样本来源于多处就是多样本,一般我们测序用的样本都是单样本,但有时候有特殊需求,我们会把一些样本混合在一起测序,也就是多样本测序. 文库:二代三代读长都是有限的,为此我们必须将全长的序列打断成小片段的文库才能进行测序.总的来说,在NGS分析之前,制备RNA或DNA的主要步骤包括:

原文:https://blog.csdn.net/Tencent_TEG/article/details/103021226 提到hash,相信大多数同学都不会陌生,之前很火现在也依旧很火的技术区块链背后的底层原理之一就是hash,下面就从hash算法的原理和实际应用等几个角度,对hash算法进行一个讲解. 1.什么是Hash Hash也称散列.哈希,对应的英文都是Hash.基本原理就是把任意长度的输入,通过Hash算法变成固定长度的输出.这个映射的规则就是对应的Hash算法,而原始数据映射后的

SAX解析原理示意

DOM解析原理示意  

NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析.ChIP-seq分析.DNA甲基化分析.重测序分析五部分内容. NGS基础系列文章包括高通量测序原理,测序数据获取和质量评估,常见文件格式解释和转换4部分. 本文 (高通量测序原理) 涉及测序文库构建原理.连特异性文库的构建方式和识别方法.测序簇生成过程.双端测序过程.测序接头产生.PCR duplicate.测序通量选择标准等.

针对PacBio单分子测序——第三代测序技术的测序原理和读长     DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业.测序技术的应用也扩展到了生物.医学.制药.健康.农林.园艺.花卉.环保.法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业.据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度,预计2017年市场产值将加倍.因此可以说,基因测序在我国生物科技领域具有非常重要的战略意义.        “第三代测序技术”的

上期(RSA简介及基础数论知识)为大家介绍了:互质.欧拉函数.欧拉定理.模反元素 这四个数论的知识点,而这四个知识点是理解RSA加密算法的基石,忘了的同学可以快速的回顾一遍. 一.目前常见加密算法简介 二.RSA算法介绍及数论知识介绍 三.RSA加解密过程及公式论证 三.RSA加解密过程及公式论证 今天的内容主要分为三个部分: rsa密钥生成过程: 讲解如何生成公钥和私钥 rsa加解密演示: 演示加密解密的过程 rsa公式论证:解密公式的证明 1.rsa密钥生成过程 大家都知道rsa加密算法是一

手头有一套完整的PacBio技术资料,会慢慢的总结到博客上. 写在前面:PacBio公司主要有两个测序平台一个是RS,一个是最新的Sequel,下面如果没有指明则是在讲RS平台. SMRT测序技术总览(SMRT® Sequencing Technology Overview) 首先必须对下面几个东西形成概念: 1.SMRT Cell:纳米制造的,不可回收的消耗品,每个 cell 里有 1M 的well(即ZMW),ZMW是单分子实时测序的最小场所. Sequel SMRT Cell 1M are

一些常用基本概念的介绍: flowcell流动池 是指Illumina测序时,测序反应发生的位置,1个flowcell含有8条lane lane通道 每一个flowcell上都有8条泳道,用于测序反应,可以添加试剂,洗脱等等 tile 每一次测序荧光扫描的最小单位 reads 指测序的结果,1条序列一般称为1条reads bp base pair碱基对,用于衡量序列长度 双端测序 指一条序列可能比较长如500bp,我们可以两端每端各测150bp junction 上面说的双端测序,中间会留有20

话不多说,先上图. ***.class文件执行大概就是这样来走的.我们都知道我们的java文件经过编译以后会生成对应的class文件.先经过类装载子系统,然后塞进运行时内存模型的元空间,开始执行方法,对象放在堆,线程开辟栈空间,程序计数器控制执行顺序.字节码执行引擎整体调控程序计数器,走你...大概就是这样的.我们先来看一下类装载子系统是如何工作的. 类装载子系统大概分为,验证->准备->解析->初始化.笼统的来说就这个4个步骤. 1,验证:验证我们的编译文件(字节码文件)是否正确. 2

Node.js require 模块加载原理 All In One require 加载模块,搜索路径 "use strict"; /** * * @author xgqfrms * @license MIT * @copyright xgqfrms * @created 2020-10-01 * @modified * * @description * @difficulty Easy Medium Hard * @complexity O(n) * @augments * @exa

一.什么是镜像 镜像是一种轻量级.可执行的独立软件包,用来打包软件运行环境和基于运行环境开发的软件. 它包含运行某个软件所需的所有内容,包括代码.运行时环境.库.环境变量和配置文件. 所有的应用,直接打包成docker镜像,就可以直接跑起来. 如何得到镜像: 从远程仓库下载 从其他地方copy 自己制作一个镜像 DockerFile 二.docker镜像加载原理 1. 联合文件系统UnionFS UnionFS是一种分层.轻量级并且高性能的文件系统.支持对文件系统的修改作为一次提交来一层层的叠加

到目前为止,我们接触过的重点术语,总结一下: Java体系的技术被划分为三大块: JavaSE:标准版 JavaEE:企业版 JavaME:微型版 安装JDK之后: JDK:java开发工具箱 JRE: java运行环境 JVM:java虚拟机 Java零基础教程视频 030-Java的加载与执行原理剖析 对Java的加载与执行的理解(理论比较重要) java程序从编写到最终运行经历了哪些过程? java程序非常重要的两个阶段: 编译阶段 运行阶段 注意:java程序员直接编写的java代码(普

面试题:类加载机制的原理 面试官考察点 考察目标: 了解面试者对JVM的理解,属于面试八股文系列. 考察范围: 工作3年以上. 技术背景知识 在回答这个问题之前,我们需要先了解一下什么是类加载机制? 类加载机制简述 什么是类加载机制? 简单来说:类的加载指的是将类的.class文件中的二进制数据读入到内存中,将其放在运行时数据区的方法区内,然后在堆区创建一个java.lang.Class对象,用来封装类在方法区内的数据结构. 经过类加载这个过程后,我们才能在程序中构建这个类的实例对象,并完成对象

本文转自https://blog.csdn.net/niucsd/article/details/50966733,描述了redis实现原理和应用场景,篇幅较长,有意学习redis的同学可耐心阅读.   Redis是一个开源的使用ANSI C语言编写.支持网络.可基于内存亦可持久化的日志型.Key-Value数据库,并提供多种语言的API.从2010年3月15日起,Redis的开发工作由VMware主持.   1. MySql+Memcached架构的问题 实际MySQL是适合进行海量数据存储的

一.图片上传前端压缩的现实意义 对于大尺寸图片的上传,在前端进行压缩除了省流量外,最大的意义是极大的提高了用户体验. 这种体验包括两方面: 由于上传图片尺寸比较小,因此上传速度会比较快,交互会更加流畅,同时大大降低了网络异常导致上传失败风险. 最最重要的体验改进点:省略了图片的再加工成本.很多网站的图片上传功能都会对图片的大小进行限制,尤其是头像上传,限制5M或者2M以内是非常常见的.然后现在的数码设备拍摄功能都非常出众,一张原始图片超过2M几乎是标配,此时如果用户想把手机或相机中的某个得意图片

实验材料 构建的群体,或自然群体,如各地方品种. RAD文库构建 提取DNA后,构建文库,简要步骤如下: ① 限制性内切酶TaqI酶切: ② 连接P1接头: ③ DNA随机打断片断化: ④ 目的片段回收与末端修复: ⑤ 连接P2接头: ⑥ RAD片段富集: ⑦ 上机测序. 参考:Rapid and cost-effective polymorphism identification and genotyping using restriction site associated DNA (RAD

目录 MySQL 5.6并行复制架构 MySQL 5.7并行复制原理 Master 组提交(group commit) 支持并行复制的GTID slave LOGICAL_CLOCK(由order commit实现),实现的group commit目的 MySQL是如何做到将这些事务分组的? 1. 事务两阶段提交 2. Order Commit:是LOGICAL_CLOCK并行复制的基础 探索:binlog_group_commit_sync_delay .binlog_group_commit

问题: 页面中有一个按钮,点击之后会更新网页中的一个盒子的内容. Ajax可以很容易的满足这种无须刷新整个页面就可以实现数据变换的需求. 但是,Ajax有一个缺点,就是他不允许跨域请求资源. 如果我的代码在codepen上,我不能将我的数据放到codepen网站上,那么我只能放到我自己的服务器中,这样的话,就无法通过Ajax访问到这个数据了. 解决: 想要实现这种跨域资源请求,有很多解决办法,列举出一部分: 让服务器来加载远程数据,然后在用户请求时提供给浏览器. 用<script>或是<