参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库. 脚本使用方法: perl update_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast

1)介绍 我们用SRAdb library来对SRA数据进行处理. SRAdb 可以更方便更快的接入  metadata associated with submission, 包括study, sample, experiment, and run. SRAdb 包通过 NCBI SRA数据库中的metadata信息 作用. 首先dbConnect ()接入 R system 中的local database systems, 所有的搜索就在本地文件的基础上进行.the queries we

1 下载程序 在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载 ncbi-blast-2.2.25+-x64-linux.tar.gz 2 解压 如解压到用户的主目录(/home/***)下,把解压后的文件夹重新命名为blast,则BLAST+的所有程序在目录/home/***/blast/bin下. 3 添加环境变量 打开终端(Terminal),切换为root用户,执行vim /etc/profile 在最末尾添加e

链接:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=830496&do=blog&quickforward=1&id=640600 Linux下BLAST+的本地化(NCBI-BLAST 2.2.29+): 1.  下载软件BLAST: 在以下网址  ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 下载:   ncbi-blast-2.2.29+-x6

详见:http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用),高手可直接忽视.不介绍Windows系统中的安装方法,一是因为思路一样,二是因为Linux中BLAST效率更高,系统更稳定,不会卡死.所以,请用Linux服务器,我想你也不忍心让自己心爱的本本跑几十个小时的程序吧. 请不要因为篇幅长,而觉得很困难,只是为了初学者能懂,叙述比较详(luo)细(s

本文是因为(笔者使用的windows系统)使用过好几次wget后,始终存在各种细节问题,于是下定决定细致的研究一下,并记录下其中细节. 下载与安装 第一步:下载wget,网络地址:http://downloads.sourceforge.net/gnuwin32/wget-1.11.4-1-setup.exe(这个地址传播较广,可自行搜索) 第二步:执行wget.exe安装文件,TIPS:网络上说的不能安装在C盘programes files文件夹,经笔者测试不受影响,所以可以任意选择安装位置.

wget是linux下命令行的下载工具,功能很强大,它能完成某些下载软件所不能做的,比如如果你想下载一个网页目录下的所有文件,如何做呢?网络用户有时候会遇到需要下载一批文件的情况,有时甚至需要把整个网站下载下来或者制作网站的镜像.在Windows下的用户都比较熟悉 Teleport,webzip等等网站下载工具,实际上AIX中也完全可以做到这样的功能,那就是利用wget工具.wget是一个命令行工具,用来下载网络文件或者整个网站,它具有自动重试.断点续传.支持代理服务器等等强大的功能.它可以完全

需要下载某个目录下面的所有文件.命令如下 wget -c -r -np -k -L -p www.xxx.org/pub/path/ 在下载时.有用到外部域名的图片或连接.如果需要同时下载就要用-H参数. wget -np -nH -r --span-hosts www.xxx.org/pub/path/ -c 断点续传-r 递归下载,下载指定网页某一目录下(包括子目录)的所有文件-nd 递归下载时不创建一层一层的目录,把所有的文件下载到当前目录-np 递归下载时不搜索上层目录,如wget -c

20150707 Created By BaoXinjian

我们平时都用"迅雷"下载软件,当下载到一半的时候突然断网,下次开启的时候能够从上次下载的地方继续下载,而且下载速度很快,那么这是怎么做到的呢! 其实它的“快”其实就是多线程的下载实现的,断点下载的原理是将每次下载的字节数存取下来,保证存取的子节点跟下载的同步,并在用户下次下载的时候自动读取 存储点,并以存储点为开始值继续下载.那么android里面如何实现这么断点的下载呢?

wget是一个从网络上自动下载文件的自由工具,支持通过HTTP.HTTPS.FTP三个最常见的TCP/IP协议下载,并可以使用HTTP代理.wget名称的由来是“World Wide Web”与“get”的结合. 要从一台主机上下载大量的文件到另一条主机上  ,登陆你的主机 执行 shell  脚本 wget -m -nd -np ftp://bjd:bjd@132.33.66.134/prodFile/data bjd 用户名密码 132.33.66.134 dcn  --当然要通 /prod

import android.content.Context; import android.net.ConnectivityManager; import android.net.NetworkInfo; import android.widget.ImageView; import com.android.volley.RequestQueue; import com.android.volley.Response; import com.android.volley.VolleyError

需要下载某个目录下面的所有文件.命令如下 wget -c -r -np -k -L -p www.xxx.org/pub/path/ 在下载时.有用到外部域名的图片或连接.如果需要同时下载就要用-H参数. wget -np -nH -r –span-hosts www.xxx.org/pub/path/ -c 断点续传 -r 递归下载,下载指定网页某一目录下(包括子目录)的所有文件 -nd 递归下载时不创建一层一层的目录,把所有的文件下载到当前目录 -np 递归下载时不搜索上层目录,如wget

阅读目录:详解wget命令-文件下载工具 安装wget 命令格式 命令功能 参数指南 启动参数 记录和输入文件参数 下载参数 目录参数 http选项参数 ftp选项参数 递归下载参数 递归下载中的包含和不包含(accept/reject) 使用实例--很重要!! wget是Linux系统中的一个下载文件的工具,用在命令行下.用于下载一些软件或从远程服务器恢复备份到本地服务器.(不能下载目录) wget的优点: wget 非常稳定,在带宽很窄的情况下和不稳定网络中有很强的适应性: ①如果是由于网络

转自:http://www.cnblogs.com/peida/archive/2013/03/18/2965369.html Linux系统中的wget是一个下载文件的工具,它用在命令行下.对于Linux用户是必不可少的工具,我们经常要下载一些软件或从远程服务器恢复备份到本地服务器.wget支持HTTP,HTTPS和FTP协议,可以使用HTTP代理.所谓的自动下载是指,wget可以在用户退出系统的之后在后台执行.这意味这你可以登录系统,启动一个wget下载任务,然后退出系统,wget将在后台执

为了监控Redis3的运行状况,去zabbix官网查找资料,根据提示,找到了这个项目:https://github.com/blacked/zbx_redis_template 但是文档和内容已经不匹配了,比如这个配置项: hostname = 'redis.srv.name' # Name of monitored server, like it shows in zabbix web ui 试验了 trap-message mode 和 Zabbix Agent mode 均以失败告终,然后

Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同 有的文章在做DEG分析时,会把reads比对到RefSeq的转录组上.我也没搞清楚这和直接比对到常规转录组上有什么区别. 文章:Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Changes in lncRNA Expression during Reprogramming 方法:For differential expression analysis, we aligne

FROM : http://www.cnblogs.com/lidp/archive/2010/03/02/1696447.html 需要下载某个目录下面的所有文件.命令如下 wget -c -r -np -k -L -p www.xxx.org/pub/path/ 在下载时.有用到外部域名的图片或连接.如果需要同时下载就要用-H参数. wget -np -nH -r --span-hosts www.xxx.org/pub/path/ -c 断点续传-r 递归下载,下载指定网页某一目录下(包括

目前有很多的数据库都存储了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各个数据库之间,或者是在某个数据库中,蛋白序列有大量冗余:为了方便使用,ncbi 构建了nr 库, 全称是 RefSeq non-redundant proteins: Non-redundant protein sequences from GenPept,  Swissprot, PIR, PDF, PDB, and NCBI RefSeq 完整的nr 数据库的蛋白序列和预先构建好的

Linux系统中的wget是一个下载文件的工具,它用在命令行下.对于Linux用户是必不可少的工具,我们经常要下载一些软件或从远程服务器恢复备份到本地服务器.wget支持HTTP,HTTPS和FTP协议,可以使用HTTP代理.所谓的自动下载是指,wget可以在用户退出系统的之后在后台执行.这意味这你可以登录系统,启动一个wget下载任务,然后退出系统,wget将在后台执行直到任务完成,相对于其它大部分浏览器在下载大量数据时需要用户一直的参与,这省去了极大的麻烦. wget 可 以跟踪HTML页面