原理: 主成分分析 - stanford 主成分分析法 - 智库 主成分分析(Principal Component Analysis)原理 主成分分析及R语言案例 - 文库 主成分分析法的原理应用及计算步骤 - 文库 主成分分析之R篇 [机器学习算法实现]主成分分析(PCA)--基于python+numpy scikit-learn中PCA的使用方法 Python 主成分分析PCA 机器学习实战-PCA主成分分析.降维(好) 关于主成分分析的五个问题 多变量统计方法,通过析取主成分显出最大的个

如果你的职业定位是数据分析师/计算生物学家,那么不懂PCA.t-SNE的原理就说不过去了吧.跑通软件没什么了不起的,网上那么多教程,copy一下就会.关键是要懂其数学原理,理解算法的假设,适合解决什么样的问题.学习可以高效,但却没有捷径,你终将为自己的思维懒惰和行为懒惰买单. 2019年04月25日 不该先说covariacne matrix协方差矩阵的,此乃后话,先从直觉理解PCA.先看一个数据实例,明显的两个维度之间有一个相关性,大部分的方差可以被斜对角的维度解释,少数的noise则被虚线解

重测序便宜了,群体的测序和分析也多了起来.群体结构分析,是重测序最常见的分析内容.群体结构分析应用十分广泛,首先其本身是群体进化关系分析里面最基础的分析内容,其次在进行GWAS分析的时候,本身也需要使用PCA或structure分析的结果作为协变量,来校正群体结构对关联分析带来的假阳性.我们之所以冠以 "群体结构三剑客"的称呼,那是因为这三张图(或者说三项分析)几乎总是在一篇文章中一起出现.虽然这三张图常常一起出现,但它们能够解释的生物学问题,以及绘制的方法都是有所不同的,所以我们还是

现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp,大多数都找到了很多的snp,而且snp都落在非编码区了,这就导致对这些snp的解读非常的困难. 目前,已经有非常傻瓜式的GWAS pipeline了,比如:A tutorial on conducting genome‐wide association studies: Quality contr

第十四章:主成分和因子分析 本章内容 主成分分析 探索性因子分析 其他潜变量模型 主成分分析(PCA)是一种数据降维技巧,它能将大量相关变量转化为一组很少的不相关变量,这些无关变量称为主成分.探索性因子分析(EFA)是一系列用来发现一组变量的潜在结构的方法.它通过寻找一组更小的.潜在的或隐藏的结构来解释已观测到的.显式的变量间的关系. PCA与EFA模型间的区别 主成分(PC1和PC2)是观测变量(X1到X5)的线性组合.形成线性组合的权重都是通过最大化各主成分所解释的方差来获得,同时还要保证个

这篇文章主要介绍了CentOS 6.3下Samba服务器的安装与配置方法(图文详解),需要的朋友可以参考下   一.简介  Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件,而SMB是Server Message Block的缩写,即为服务器消息块 ,SMB主要是作为Microsoft的网络通讯协议,后来Samba将SMB通信协议应用到了Linux系统上,就形成了现在的Samba软件.后来微软又把 SMB 改名为 CIFS(Common Internet File Sy

一.简介 Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件,而SMB是Server Message Block的缩写,即为服务器消息块 ,SMB主要是作为Microsoft的网络通讯协议,后来Samba将SMB通信协议应用到了Linux系统上,就形成了现在的Samba软件.后来微软又把 SMB 改名为 CIFS(Common Internet File System),即公共 Internet 文件系统,并且加入了许多新的功能,这样一来,使得Samba具有了更强大的功能

注释:文章中fg:为示例  红色标记的为命令 在上篇博文中详细讲解了iptables的原理及一些常用命令,这里在简要的说明一下: Linux防火墙包含了2个部分,分别是存在于内核空间的(netfilter)和用户空间的(iptasbles):而iptables可以定义规则如: filter:防火墙的核心所在,实现包过滤功能 nat:实现地址转换,(如:IP.PORT) mangle:实现数据包的修改操作,如打标记.修改TTL等 raw:对数据包进行状态跟踪,不是很常用,不做过多解释 而它们的优先

OpenSSH服务器: ssh协议:提供安全的ssh环境用于远程管理,默认端口:22: 服务名称:sshd openssh-server包的安装文件: 使用ssh客户端程序: 连接目标主机: ssh 用户名@主机名 远程复制 : 复制到远程主机:scp 目标文件名 用户名@主机名:/目的文件夹 从远程主机复制过来:scp 用户名@主机名:/目标文件夹/文件名 目的文件夹 sftp:安全ftp下载 使用ssh客户端的常用程序:putty.winscp ssh密钥登录流程: 创建客户端用户: 使用该

之前介绍了<OpenStack Swift All In One安装部署流程与简单使用>,那么接下来就说一说Swift集群部署吧. 1. 简介 本文档详细描述了使用两台PC部署一个小型Swift集群的过程,并给出一些简单的使用实例.本文档假定如下前提条件: 使用Ubuntu操作系统. 每台机器都运行Swift的所有服务,既是Proxy Server,又是Storage Server,用户可以向任何一台机器发起存储服务请求. 采用Swift自带的TempAuth作为用户的身份与权限认证. 所有机

一.简介 Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件,而SMB是Server Message Block的缩写,即为服务器消息块 ,SMB主要是作为Microsoft的网络通讯协议,后来Samba将SMB通信协议应用到了Linux系统上,就形成了现在的Samba软件.后来微软又把 SMB 改名为 CIFS(Common Internet File System),即公共 Internet 文件系统,并且加入了许多新的功能,这样一来,使得Samba具有了更强大的功能

Samba的主配置文件叫smb.conf,默认在/etc/samba/目录下. smb.conf含有多个段,每个段由段名开始,直到下个段名.每个段名放在方括号中间.每段的参数的格式是:名称=指.配置文件中一行一个段名和参数,段名和参数名不分大小写. 除了[global]段外,所有的段都可以看作是一个共享资源.段名是该共享资源的名字,段里的参数是该共享资源的属性. Samba安装好后,使用testparm命令可以测试smb.conf配置是否正确.使用testparm –v命令可以详细的列出smb.

一.简介 Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件,而SMB是Server Message Block的缩写,即为服务器消息块 ,SMB主要是作为Microsoft的网络通讯协议,后来Samba将SMB通信协议应用到了Linux系统上,就形成了现在的Samba软件.后来微软又把 SMB 改名为 CIFS(Common Internet File System),即公共 Internet 文件系统,并且加入了许多新的功能,这样一来,使得Samba具有了更强大的功能

前话 我们经常到机房上课,想必对机房后面那层叠的跟DVD一样的机器有印象吧,那些就是交换机. 交换机作用是什么? 我这里度娘一下: 交换机(Switch)意为"开关"是一种用于电(光)信号转发的网络设备.它可以为接入交换机的任意两个网络节点提供独享的电信号通路. 说简单点,就是为主机之间创建通信道路的机器,如下图,各主机连接同个交换机,且IP在同一网段,在同一VLAN,他们是可以互相通信的,他们就简单构成了一个局域网. 刚才提到了vlan,vlan又是什么呢? 同样度娘一下: VLAN

VLAN主要有两个作用: vlan可以有效的控制广播域的范围 vlan可以分组设备,增强局域网的安全性(业务隔离) vlan的范围: 一共有4096个vlan,vlan 1为默认vlan.但其中vlan 0 和 vlan 4095是保留的,故用户真正可以创建的vlan数为4094. Cisco交换机中,vlan 1002-1005默认用于 FDDI 和 TOKEN RING Vlan标签: 交换机用vlan标签来区分不同的以太网帧. Access类型端口: 仅属于某个特定的vlan 行为总结:“

CentOS 6.3下Samba服务器的安装与配置   一.简介 Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件,而SMB是Server Message Block的缩写,即为服务器消息块 ,SMB主要是作为Microsoft的网络通讯协议,后来Samba将SMB通信协议应用到了Linux系统上,就形成了现在的Samba软件.后来微软又把 SMB 改名为 CIFS(Common Internet File System),即公共 Internet 文件系统,并且加入了

较早的编译器是不同意这样做的,所以一些书籍比方以Tc解说的书本都说数组的下标不能是变量.在vc6.0下亦是如此. 只是在一些较新的编译器如dev c++已经支持了,例如以下代码不会报错 #include <stdio.h> #include <stdlib.h> int main() { int a; int i; scanf("%d",&a); int c[a]; for( i =0 ;i<a;i++) scanf("%d",

在LoadRunner中为什么要设置思考时间和pacing 答: 录制时记录的是客户端和服务端的交互,如果要精确模拟 用户的行为,那么客户操作客户端时花费了很多时间要怎么模拟呢?录入 填写提交的内容,从列表中下拉搜索选择特定的值等,这时LOADRUNNER 不会记录用户 的客户端操作,而是记录了用户这段时间,成为思考时间(Think-time),因为用户的这些客户端操作不会影响服务端,只是让服务器端在这段时间内没有请求而已.,所以加入思考时间就能模拟出熟练的或者生疏的用户操作,接近实际对于服务端

    本节将简单介绍一下网络设备模拟软件GNS3的配置和使用方法.     (1)GNS3概述: GNS3是一款具有图形化界面可以运行在多平台(包括Windows, Linux, and MacOS等)的网络虚拟软件.Cisco网络设备管理员或是想要通过CCNA,CCNP,CCIE等Cisco认证考试的相关人士可以通过它来完成相关的实验模拟操作.同时它也可以用于虚拟体验Cisco网际操作系统IOS或者是检验将要在真实的路由器上部署实施的相关配置.简单说来它是dynamips的一个图形前端,相比

在LoadRunner中为什么要设置思考时间和pacing 答: 录制时记录的是客户端和服务端的交互,如果要精确模拟 用户的行为,那么客户操作客户端时花费了很多时间要怎么模拟呢?录入 填写提交的内容,从列表中下拉搜索选择特定的值等,这时LOADRUNNER 不会记录用户 的客户端操作,而是记录了用户这段时间,成为思考时间(Think-time),因为用户的这些客户端操作不会影响服务端,只是让服务器端在这段时间内没有请求而已.,所以加入思考时间就能模拟出熟练的或者生疏的用户操作,接近实际对于服务端