亚型突变瀑布图代码

2024-11-04

maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总，分析和可视化

本文首发于公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图) R-maftools包绘制组学突变结果(MAF)的oncoplot或者叫“瀑布图”,以及一些细节的更改和注释. 本文继续介绍maftools对于MAF文件的其他应用,为更易理解和重现,本次使用TCGA下载的LIHC数据. 一数据部分 setwd("C:\\Users\\Maojie\

ComplexHeatmap|根据excel表绘制突变景观图（oncoplot）

本文首发于“生信补给站”:https://mp.weixin.qq.com/s/8kz2oKvUQrCR2_HWYXQT4g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot包绘制瀑布图,有多种展示和统计maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)和maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化,如果只有多个样本的基因突变与否的excel,不用担心,也可以用complexheatmap包绘制. 这个包功能很强大,本次只简单的介绍如何绘制基因组景观图(瀑布图).

教你用Python创建瀑布图

介绍对于绘制某些类型的数据来说,瀑布图是一种十分有用的工具.不足为奇的是,我们可以使用Pandas和matplotlib创建一个可重复的瀑布图. 在往下进行之前,我想先告诉大家我指代的是哪种类型的图表.我将建立一个维基百科文章中描述的2D瀑布图. 这种图表的一个典型的用处是显示开始值和结束值之间起“桥梁”作用的+和-的值.因为这个原因,财务人员有时会将其称为一个桥梁.跟我之前所采用的其他例子相似,这种类型的绘图在Excel中不容易生成,当然肯定有生成它的方法,但是不容易记住. 关于瀑布图需要记

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图）

本文首发于微信公众号 **“ 生信补给站 ”** ,期待您的关注!!! 原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/G-0PtaoO6bYuhx_D_Rlrlw 对于组学数据的分析和展示来说,maftools算是一个宝藏“R包”,可用于MAF格式的组学数据的汇总,分析和可视化展示. 随着癌症基因组学的进步, 突变注释格式+Specification) (MAF) 被广泛用于存储检测到的somatic variants.The Cancer Genome Atlas 项目对

西山居首页jQuery焦点图代码

西山居首页jQuery焦点图代码是一款带文字描述,左右箭头,索引按钮,自动轮播切换的jQuery特效代码.效果图如下: 在线预览源码下载实现的代码. html代码: <div style="height:10px;width:100%;"></div> <div class="main"> <div class="kv"> <ul class="kv_pic">

看懂 Fiddler 的瀑布图

最近准备给组内的新同学们分享下 Fiddler 这枚神器,可以讲的地方太多,我打算把一节课讲不完的内容写在博客上,大家可以随便看看.今天先介绍下 Fiddler 的瀑布图. 每个网络请求都会经历域名解析.建立连接.发送请求.接受数据等阶段.把多个请求以时间作为 X 轴,用图表的形式展现出来,就形成了瀑布图.在 Fiddler 中,只要在左侧选中一些请求,右侧选择"Timeline"标签,就可以看到这些请求的瀑布图,如下(点击查看大图): 看到这张图,你是否可以回答这些问题: 图标的 Y

基于js仿汽车之家2015新版焦点图代码

今天给大家分享一款仿汽车之家2015新版焦点图代码.这是一款基于jQuery实现的适合电子商务网站或者企业产品展示功能特效.效果图如下: 在线预览源码下载实现的代码. html代码: <div id="box"> <div class="prev"> </div> <div class="next"> </div> <ul class="bigUl"&g

Qt绘制简单的风向玫瑰图代码

1.绘制简单的风向玫瑰图代码2.主要使用QPainter3.在子widget上绘制需要使用widget监视事件 eventfilter update();//更新界面 //镜头12 QPainter painter1(WindRose12)/**/; painter1.begin(WindRose12); painter1.setFont(QFont("宋体")); painter1.translate(WindRose12->width() >> 1, WindRo

Excel催化剂图表系列之品味IBCS瀑布图观察企业利润构成

IBCS图表,每个细节都值得反复琢磨参悟,此篇给大家送上详尽的瀑布图方式下的利润数据观察.请不要拿Excel2016版提供的瀑布图与IBCS版的瀑布图作对比,那完全不是一个级别的,可以类比为拿一辆经济型小车和一辆特拉斯来对比,没有可比性. Excel原生的设计图表从来都只有被吐槽的份千呼万唤出来的Excel新图表,真的好用么?真的够用么?从来对图表有点追求的人都很不屑于用Excel原生图表出来的效果,颜色丑,看多两眼就显呆板,就连新出的一堆瀑布图.树状图.漏斗图等也不出例外. 当一般普通用户用

Tableau绘制漏斗图、甘特图、瀑布图、镶边面积图、阴影坡度图

Tableau绘制漏斗图.甘特图.瀑布图.镶边面积图.阴影坡度图本文首发于博客冰山一树Sankey,去博客浏览效果更好.直接右上角搜索该标题即可一. 漏斗图数据源 1.1 分色直条漏斗图 (1)导入数据 (2)将[数量]拖到行这一栏,将[阶段]拖到标记下的颜色选项卡吗,之后对数量进行降序排列. (3)把[数量]拖到标记下的大小选项卡,视图设置为整个视图 (4)把[阶段],[数量]拖到标签选项卡,并对数量进行快速表计算--合计百分比. (5)下面的图形由于太少而导致无法显示标签,对此可手动的

木马轮播图代码Jq

效果图(将就一下) <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8" /> <title>木马轮播图</title> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/css.css"> <scri

【AdaBoost算法】积分图代码实现

一.积分图介绍定义:图像左上方的像素点值的和: 在Adaboost算法中可用于加速计算Haar或MB-LBP特征值,如下图: 二.代码实现 #include <opencv/highgui.h> #include <opencv/cv.h> #include <opencv2/imgproc/imgproc_c.h> using namespace cv; int calcIntImage(unsigned char *pucSrcImage, unsigned in

原生Js写轮播图代码

html css js 在知道jQuery如何实现轮播效果的基础上,用js写代码如图:标记这里的地方理解一下用到的知识: 1.HTML DOM 的appendChild() 和 removeChild(): 2.css 的 transition: 3.需要理解作用域,全局变量,生命周期等(图中注释的地方)

原生js简单轮播图代码

在团队带人,突然被人问到轮播图如何实现,进入前端领域有一年多了,但很久没自己写过,一直是用大牛写的插件,今天就写个简单的适合入门者学习的小教程.当然,轮播图的实现原理与设计模式有很多种,我这里讲的是用面向过程函数式编程去实现,相对于面向对象设计模式,代码难免会显得臃肿冗余.但没有面向对象的抽象却很适合新手理解与学习.已经在BAT的同学看到希望少喷点.另外可以多提意见. 轮播图的原理: 一系列的大小相等的图片平铺,利用CSS布局只显示一张图片,其余隐藏.通过计算偏移量利用定时器实现自动播放,或通过

iOS开发：代码通用性以及其规范第一篇（附带，自定义UITextView\进度条\双表显示\瀑布流代码设计思路）

在iOS团队开发中,我见过一些人的代码,也修改过他们的代码.有的人的代码写的非常之规范.通用,几乎不用交流,就可以知道如何修改以及在它基础上扩展延生.有的人的代码写的很垃圾,一眼看过去,简直会怀疑自己和他是用两种语言在开发,代码可复用性极差,往往一个已写好的功能遇到要扩展(或者让我自己写,在稍微改动的情况下就可以移动其他地方使用)的情况下,需要把他代码全部清掉,自己重新写一个类或者方法出来,反正,改起来,简直就是不能令人愉快的玩耍了. 如果,进入了一家代码不规范的公司,个人建议早走为妙.不然要么

WPF数据可视化-瀑布图

实现方式一: 将数据(Point[])根据索引沿X轴使用虚拟画布进行绘制,每个数据绘制大小为1px * 1px:最终绘制出的宽度等于数据的总长度.标记并存储当前绘制的图为PreviousBitmap; 继续置顶绘制第二组数据,第二组数据绘制完后,将标记的PreviousBitmap作为Image在Y轴距离顶部距离为1px的地方用DrawingContext.DrawImage()方式绘制,以此类推.核心代码如下: private void DoAddDataArray(Point[] arrPo

[Web] 通用轮播图代码示例

首先是准备好的几张图片, 它们的路径是: "img/1.jpg", "img/2.jpg", "img/3.jpg", "img/4.jpg", "img/5.jpg", "img/6.jpg" 代码最基本的 HTML 代码: <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="UTF-8&quo

Jquery简单瀑布流代码示例

最近很多网站都采用瀑布流风格设计,感觉挺有个性的,比较合适做图片类型的网站,没事仿开心网做一个瀑布流示例. 需要用到Jquery,jquery.masonry.min.js <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="

js 轮播图代码

js代码 (function(){ /** parent //父容器 changeTime //每次间隔几秒切换下一条 leaveTime //鼠标从小图上离开过后几秒继续切换 index //从第几个开始 changeFn //新的显示完全后的回调 hoverFn//鼠标移到小图上的回调 initFn//初始化完成后的回调 dataFormat //数据格式化函数 */ var def = { changeTime : 5000, leaveTime : 5000, index : 0, da

JD轮播图代码

<!DOCTYPE html> <html> <head> <title>jd网站的轮播图效果</title> <meta charset="utf-8"> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="./css/style.css"> </head> <

python递归评论tree形图代码

首先我有必要记录下来这段代码,因为我遇到了这个问题, 然后没有解决后来, 前段说我找到一段代码给我看看, 我并没有在意, 然后她实现了, 她实现了,她真的实现了, 我... 为了感谢她,我陪她玩了一中午的五子棋, 并假装输了几把先说目的: 递归迭代再看数据: 其实有个前提, 就是aid不能重复 fid是父级id, 指向的aid 如果 aid == fid , 证明fid的那个aid是子集如果 fid == 0 就证明是顶级代码: def aaa(oldArr, fid): newArr

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