视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 有些pre-mRNA存在不只一种剪接方式,成为可变剪接 一.RNA剪接的化学基础 1.决定剪接位点的特定序列 3'端是多聚嘧啶区 2.当内含子两边的外显子连接时,内含子是以套索(lariat)除去的 二.剪接体 1.RNA剪接是由一

位点特异性重组 和 DNA转座 视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 很多重要DNA重排是由两类重要遗传重组造成的 保守位点特异性重组CSSR 两端特定序列之间 需要重组酶 形成联会复合体 转座重组 transpositional recombination 不一定特定 一.保守性位点特异性重组 1.CSSR的三种类

期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2019年9月) IF:3.78 单位: 中国科学院大连化学物理研究所 中国科学院大学 大连医科大学第二附属医院 物种:人血浆 技术:用组氨酸修饰的具有可变换表面电荷的亲水性智能材料(组氨酸键合的二氧化硅,HBS)可选择性地从复杂的生物样品中富集唾液酸化的糖肽(SGP)   一. 概述: 糖蛋白的异常唾液酸化与许多恶性疾病密切相关,唾液酸化的分析对于揭示这些疾病的现状具有很大的潜力.然而,深入分析唾液酸化仍然具有挑战性

转自声明的奥秘 www.lifeomics.com DNA甲基化与肿瘤发生:         DNA甲基化水平和模式的改变是肿瘤发生的一个重要因素.这些变化包括CpG岛局部的高甲基化和基因组DNA低甲基化状态.如图1左所示,在正常细胞中,位于抑癌基因启动子区域的CpG岛处于低水平或未甲基化状态,此时抑癌基因处于正常的开放状态,抑癌基因不断表达抑制肿瘤的发生.而在肿瘤细胞中,该区域的CpG岛被高度甲基化,染色质构象发生改变,抑癌基因的表达被关闭,从而导致细胞进入细胞周期,凋亡丧失,DNA修复缺陷,

DNA甲基化测序方法介绍 甲基化 表观遗传学 DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能.遗传印记.胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一. DNA 甲基化及CpG岛 DNA 甲基化是最 DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能.遗传印记.胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一. DNA 甲基化及CpG岛 DNA 甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,可能存

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA的突变和修复 一.复制错误及修复 1.突变的本质 点突变 大范围插入.缺失 染色体结构整体重排 与转座子插入,细胞重组异常活动有关 染色体上有重组热点 微卫星DNA极易发生突变 如CA二核苷酸序列重

Chapter1 WHERE IN THE GENOME DOES DNA REPLICATION BEGIN    一. ·聚合酶启动结构域会结合上游序列的一些位点,这些位点有多个,且特异,并且分布在两条链上.通过计算,找到出现频率最高的k-mer可能为为聚合酶结合位点:dnaA BOX. 但是如何定位Ori的大概位置呢? ·DNA链复制的不对称性,其导致突变速率的不对称,使得有(forward链C->T,脱氨基)的趋势.由此,依据skew增的处于forward链,skew减的处于revers

在机器学习的算法评估中,尤其是分类算法评估中,我们经常听到精确率(precision)与召回率(recall),RoC曲线与PR曲线这些概念,那这些概念到底有什么用处呢? 首先,我们需要搞清楚几个拗口的概念: 1. TP, FP, TN, FN True Positives,TP:预测为正样本,实际也为正样本的特征数 False Positives,FP:预测为正样本,实际为负样本的特征数 True Negatives,TN:预测为负样本,实际也为负样本的特征数 False Negatives,

超文本传输协议-HTTP/1.1(修订版) ---译者:孙超进本协议不限流传发布.版权声明Copyright (C) The Internet Society (1999). All Rights Reserved.摘要超文本传输协议(HTTP)是一种为分布式,协作式的,超媒体信息系统.它是一种通用的,无状态(stateless)的协议,除了应用于超文本传输外,它也可以应用于诸如名称服务器和分布对象管理系统之类的系统,这可以通过扩展它的请求方法,错误代码和消息头[47]来实现.HTTP的一个特性

多目标跟踪方法:deep-sort deep_sort Multitarget tracking data association 读'Simple Online and Realtime Tracking with a Deep Association Metric, arXiv:1703.07402v1 ' 总结 前言 这篇文章依然属于tracking-by-detection 类,其在匹配detections时使用的是传统的匈牙利算法.文章中需要注意的几点包括: 在计算detections

发表时间:(2019年4月) IF:3.950 单位:韦恩州立大学化学系 物种:小鼠心肌细胞 技术:谷胱甘肽修饰蛋白组学 一. 概述: 本研究采用化学选择性蛋白组学方法,鉴定出过氧化物诱导HL-1小鼠心肌细胞后的含有半胱氨酸特异位点谷胱甘肽修饰多肽1763个,经过生信分析发现125个与心肌疾病相关的谷胱甘肽修饰蛋白,这些被修饰蛋白包括肌节结构和收缩蛋白.分子伴侣.信号及调节蛋白.并进一步通过对修饰位点的结构分析,预测蛋白质谷胱甘肽修饰对功能的作用.本研究建立了一个选择性直接鉴定谷胱甘肽修饰蛋白质

分类技术或模型试图从观测值中得出一些结论. 在分类问题中,我们有分类输出,如“黑色”或“白色”或“教学”和“非教学”. 在构建分类模型时,需要有包含数据点和相应标签的训练数据集. 例如,如果想检查图像是否属于汽车. 要实现这个检查,我们将建立一个训练数据集,其中包含与“车”和“无车”相关的两个类. 然后需要使用训练样本来训练模型. 分类模型主要用于人脸识别,垃圾邮件识别等. 在Python中构建分类器的步骤 为了在Python中构建分类器,将使用Python 3和Scikit-learn,这是一

众所周知,全基因组关联分析(GWAS)发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点1)要么调控基因表达(eQTL); 2)要么影响增强子活性; 3)要么影响转录因子(TF)结合特异性; 4)要么啥也不是. 针对以上四种情况: 1)是否调控基因表达(eQTL)可通过GTEx(https://gtexportal.org/home/)查询. 2)是否影响增强子活性可通过之前的推文查询:感兴趣的SNP/区域上是否有增强子/转录因子?增强子/转录因子调控哪个靶基因?(EnhancerDB) 3)是否影响

Sensitivity, specificity, and reproducibility of RNA-Seq differential expression calls RNA-Seq差异表达调用的灵敏度 特异性 重复性 抽象背景:MAQC / SEQC联盟最近编制了一个关键基准,可用于测试微阵列和RNA-seq表达谱分析工具的最新发展.这些客观基准是基础研究和应用研究所需,对临床和监管结果至关重要.超越原始SEQC研究中提出的第一次比较,我们在此提出包括效果的扩展基准常见实验的典型优势.

转载自:http://www.68idc.cn/help/jiabenmake/qita/20160530618218.html 参考书本: <2012.李航.统计学习方法.pdf> 书上首先介绍概率无向图模型,然后叙述条件随机场的定义和各种表示方法,那这里也按照这个顺序来. 概率无向图模型(马尔可夫随机场) 其实这个又叫做马尔可夫随机场(MRF),而这里需要讲解的条件随机场就和其有脱不开的关系. 模型定义 首先是无向图.那什么是无向图呢? 其实无向图就是指没有方向的图....我没有开玩笑,无

最近没事登登好几年前玩过的游戏看看,发现有人喊高价收号,这一看就是骗子,这等骗子还想骗我?我就来看看这逗逼是怎么骗人的,结果发现这人给了一个说是 5173平台交易的网站,叫我直接把号的信息填上去然后填好了之后就去他就会去购买,然后仔细看了一下平台,获取了源代码后看了一下~呵呵,漏洞还是有不 少的~ 仿5173网游交易平台游戏交易平台存在注入与getshell漏洞,可直接拖掉玩家数据~     发乌云上乌云不收,所以没事就发zone里给大家玩玩.其实这系统还是蛮多漏洞的,我最痛恨骗子了,大家能搞几

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读前必读,博客园的文章并非最新,想看最新还是建议点击这里.博客园的文章是为了方便不能FQ的同学,同步而来的.不放在博客园,不是不支持国产,而是博客园的排版太难看了,太难看了,太难看了!而且还没有客户端. 博客园的运营,你们能不能上点心~~~. 槽已吐完,开始正文吧. 海鳖曾欺井内蛙,大鹏张翅绕天涯.强中更有强中手,莫向人前满自夸. 各位看官,现在开始脱衣裳.你不用脱,自个衣裳要穿好了,别脱下来.我们是来学Golang的,不是来耍流氓的.本节,我们来正式的学习Golang.如果前面几节一路看下来,

GO语言的进阶之路-Golang高级数据结构定义 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 我们之前学习过Golang的基本数据类型,字符串和byte,以及rune也有所了解,但是说起高级点的数据类型,可能我们还是不太清楚,那么今天就跟着我脚步一起学习一下这些高级数据类型数据吧.相信有部分人可能学习过Python,那么我这篇博客基本上不用看了,因为对你来说会觉得so easy.因为太多的相似之处了,只是写法不同.本章主要介绍数组(array),切片(scice),字典(m

面向对象思想概述.开发设计特征 1:面向对象思想 面向对象是基于面向过程的编程思想. 面向过程:强调的是每一个功能的步骤 面向对象:强调的是对象,然后由对象去调用功能 2:面向对象的思想特点 A:是一种更符合我们思想习惯的思想 B:可以将复杂的事情简单化 C:将我们从执行者变成了指挥者 举例: 买电脑: 面向过程:我的了解电脑--了解我自己的需求--找对应的参数信息--去中关村买电脑--讨价还价--买回电脑 面向对象:我知道我要买电脑 -- 班长去给我买 -- 班长就买回来了 洗衣服: 面向过程