在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is

基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid,第2~61列是疾病样本的表达,第62~76列是正常样本的表达. 图1 基因表达谱的矩阵表示 寻找差异表达的基因: 原理介绍: 差异表达分析是目前比较常用的识别疾病相关miRNA以及基因的方法,目前也有很多差异表达分析的方法,但比较简单也比较常用的是Fold change方法.它的优点是计算简单直观

转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充. Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度. 1.例如,若初始值为30,最终值为60,则相应的fold change为2,或者可以描述为一个2折的增长.fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到.

fold change 英文简称 : FC 中文全称 : 倍性变化 所属分类 : 生物科学 词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法.例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2. 用这种方法分析微阵列的数据可以说明: 1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的: 2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著: 3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选.

2015年11月25日 13:39:03 $().ready(function(){ //默认显示#input_div if ($("input[name='type']:checked").val() == '2') { $("#input_div").css('display', 'block'); } else { $("#input_div").css('display', 'none'); } //点击type==2的radio显示,

实现一个依据iframe页面返回充值卡类型不同,安排不同的input部件. 点击选择弹出一个iframe.点击充值卡数据行.返回1.充值卡类型.2.充值卡id(用的UUID).3.充值卡号(字符串). 遇到的问题是当iframe选择充值卡时,无法获取parent页面input部件value值的change事件. parent页js $("#id_card_type").change(function(){ //事件无法捕获 }); parent页form <form id=&qu

对el-input输入框的验证,trigger的值选blur,即失去焦点时进行验证. 下拉框(el-select).日期选择器(el-date-picker).复选框(el-checkbox).单选框(el-radio)的验证时,trigger的值选择change,即当值发生变化时就进行验证. 下拉框的验证: <el-form-item label="活动区域" prop="region"> <el-select v-model="rul

前段时间在学习空间统计相关的知识,于是把ArcGIS里Spatial Statistics工具箱里的工具好好研究了一遍,同时也整理了一些笔记上传分享.这一篇先聊一些基础概念,工具介绍篇随后上传. 空间统计研究起步于上个世纪70年代,空间统计其核心就是认识与地理位置相关的数据间的空间依赖.空间关联等关系,通过空间位置建立数据间的统 计关系.空间统计学依赖于tablor地理学第一定律,即空间上越临近的事物拥有越强的相似程度:和空间异质性,即空间位置差异造成的行为不确定现象.例 如要度量犯罪率与教育程

//Jquery中select的使用 //select获取当前选中的value值 $('#sel').change(function () { var depId = $(this).children('option:selected').val(); }); //select根据当前的text文本设置是否选中 $("#sel option[text='当前文本']").attr("selected", true);

突然想到这个问题,然后做了下实验,下面以Integer来讲解,其他的忽略: import java.util.Iterator; /** * Created by lili on 15/9/24. */ public class TestNew { public static void main(String args[]){ Integer i1 = 10; Integer i2 = 20; System.out.println(i1 + " " + i2); change(i1,i

  先来说下C#中的数据类型.分值类型和引用类型两大类. 值类型:直接存储数据的值,保存在内存中 引用类型:存储对值的引用,实际上存储的就是一个内存的地址 C#预定义的简单类型,像int,float,bool,char都是值类型,另外enum(枚举),struct(结构)也是值类型 string,数组,自定义的class类.接口.委托和封装就都是引用类型了.其中的string是比较特殊的引用类型 C#函数的参数如果不加ref,out这样的修饰符显式申明参数是通过引用传递外,默认都是值传递. 一.

Change Data Capture 功能是从 Winter '19 版本开始正式启用的功能. 它是基于"发布-订阅"模式设计,可以将 Salesforce 中记录的改变自动推送给订阅者所在的系统,比如 Salesforce 内部的功能模块或外部的数据库. 在 Lightning 框架中,lightning:empApi 组件可以实现"订阅者"的角色.在本文中,我们将演示如何使用 lightning:empApi 组件来实时得到记录的更新信息. 启用 Change

http://www.cnblogs.com/dyf520/p/3805297.html Key-Value Observing Programming Guide 1,注册Key-Value Observing: 要实现这个目的,需要: 1)被观察的类对你想要观察的属性必须是服从Key-Value observing的 2)你必须注册被观察对象的观察对象,使用addObserver:forKeyPath:options:context:. 3)观察者类必须实现observeValueForKe

1.input选中$('#checkBox').find('input').each(function(i){ if($(this).prop('checked')){//获取是否选中 并判断 $(this).prop('checked', false); //修改设置为不选中状态 }else{ $(this).prop('checked', true);//修改设置为选中状态 } });2.select点击下拉选择获取选中选项的值$('#demo').change(function(){   

如何实时的获取你选中的值 只用@change件事 @change="changeProduct($event)" 动态传递参数 vue操作select获取option的ID值 如果select的v-model(value)与option绑定的value值一致.那么就会显示option中的值 {{item.title}}--> <div id="app"> <select class="fl" v-model="P

select2设置select多选,select2取值和赋值,作为筛选条件的时候,取值相对简单,把选中的id值转为字符串传给后端查询,查询之后会刷新页面,为了在下拉框中显示刚刚选中的值,就需要给select赋值,可以将刚才传给后端的字符串再传回前端,然后转为一位数组,再赋值给select2就会显示刚刚选中的值,赋值方法:$('#id').val(arr).trigger('change'),id为select的id属性,这里的arr是刚才从后端传回前端的id转成的一位数组. select2设置s

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实

使用limma.Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi Tian1, Gordon K. Smyth4 and Matthew E. Ritchie5 1The Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, 1G Royal Parade, Parkville, VIC 3052, Melbo

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文献名:利用靶向质谱策略进行上皮性卵巢癌病例的蛋白质组生物标志物研究 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年7月) IF:5.41 单位: 苏黎世联邦理工学院 美国东北大学 隆德大学 苏黎世大学附属医院 普渡大学 巴塞尔大学附属医院 巴赛尔大学生物医学系 法兰克福大学附属医院 哈佛医学院 斯科讷大学附属医院 苏黎世大学 物种:小鼠卵巢组织,小鼠卵巢肿瘤组织,人类血浆,人类卵巢组织,人类良性卵巢肿瘤组织,人类上皮卵巢癌组织 技术:非靶糖蛋白质