使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子  2017-06-12 09:42:47     293     0     0 Trinity 将测序数据分为许多独立的de Brujin graph,理论上每一个图对应一个表达的基因. 整个流程分为三个步骤:Inchworm, Chrysalis, and Butterfly Inchworm: 从reads中提取所有的重叠k-mers,根据丰度递减的顺序检查每个k-mers,然后将重叠的k-mers延长到不能再延长,称为一个contig C

1.编辑一个配置文件 flume-app.conf  拷贝至fulme的安装目录的conf下 # The configuration file needs to define the sources, # the channels and the sinks. ### define agent a3.sources = r3 a3.channels = c3 a3.sinks = k3 ### define sources a3.sources.r3.type = spooldir ### 要扫

原文:Visual Studio Installer打包后生成的安装文件每次执行都需要重新安装C++ 2010运行库(x86)的解决方案 如果你是用Visual Studio自带的打包项目打包了一个Installer,并且生成的.msi和setup.exe安装文件,并且在项目安装系统必备环境中选择了"Visual C++ 2010运行库(x86)",那你一定会发现,点击setup.exe安装以后,如果再次点击setup.exe安装文件,一定会需要再次安装C++运行环境,好像每次都不能通

Eclipse中的工程引入jar包后没有整合到一个文件夹而是全部在根目录下显示 解决方案: 1,在Eclipse中,点击window-->Preferences-->Java-->Build Path-->Add Library-->User Library-->User Libraries--> 点击New 输入Libraries ,OK 2.然后右键项目,BuildPath-->Configure Bulid Path --> Libraries

这里直接先将我摸索出的结果贴出来,文章后面会一一详细说明和分析:.vs目录是用来存储当前用户在解决方案中的工作配置,具体包括VS关闭前最后的窗口布局.最后打开的选项卡/操作记录/文件文档.某些自定义配置/开发环境.调试断点等这类设置信息和状态.这样每当用户关闭解决方案后再重新打开,就能继续之前的工作状态. 在VS2015之前的版本,这些信息都是散乱的保存在解决方案根目录下(最明显的参照物就是.suo文件),现在是将这些统一放在.vs这个隐藏文件夹里,如果没在Windows系统中开启查看隐藏的文件

https://shiyousan.com/post/636441130259624698 在某个契机的引发下,对VS解决方案中自动生成的.vs文件夹产生了兴趣,以前总对这个文件夹不怎么上心,最近正好遇到点情况来搞懂.vs目录究竟有什么作用. 这里直接先将我摸索出的结果贴出来,文章后面会一一详细说明和分析:.vs目录是用来存储当前用户在解决方案中的工作配置,具体包括VS关闭前最后的窗口布局.最后打开的选项卡/操作记录/文件文档.某些自定义配置/开发环境.调试断点等这类设置信息和状态.这样每当用户

<UNIX环境高级编程>中的程序清单4-7就介绍了如何实现递归地统计某个目录下面的文件!我刚开始看过它的代码后,觉得照着敲太没意思了,所以就合上书自己写了一遍!为此还写了一篇博文,这是博文地址:在linux下用C语言实现递归查看某个目录中的所有文件[CSDN]! 今天做<Unix环境高级编程>的课后题,看到题目4.11这里提供了一种新的实现这个程序的思路,那就是每回读到一个目录,就通过chdir函数进入到这个目录,然后再通过opendir函数和readdir函数来读取这个目录中的文

eclipse 新建项目下后.metadata\.plugins的文件夹解释和如何保存自己的特定工程设置 [org.eclipse.core.runtime] 字体,maven的setting.xml,jre,各种配置,基本上是Preference下的所有配置都保存在 这个文件夹中 [org.eclipse.e4.workbench]  自定义的工作视图设置,如J2EE或Debug等视图下的各种 窗口位置拖放顺序窗口布局都放在这里里面,当然,菜单.工具栏的各种按钮顺序位置的配 置也放在这里面.布

p{ text-align:center; } blockquote > p > span{ text-align:center; font-size: 18px; color: #ff0000; } --> C# 将文件夹中文件复制到另一个文件夹 //新建一个文件夹 var imgPath = Directory.GetCurrentDirectory() + "\\DevicePic1"; if (!Directory.Exists(imgPath)) { Dir

gulp-uglify:压缩js大小,只支持es5 安装: cnpm: cnpm i gulp-uglify -D yarn: yarn add gulp-uglify -D 使用: 代码实现1:压缩js文件夹下的index.js文件输出到dist文件夹下面(注意要压缩的js文件中此处只能使用es5) var gulp = require('gulp'); var uglify = require('gulp-uglify'); gulp.task("uglify",function(

现在有一个文件夹,里面有很多子文件夹,每个子文件夹中有很多不同类型的图片,现在想将其所有.png图片整理出来,一开始我是手动拷贝的,拷贝了几个图片后,突然想能不能让计算机来自动完成此项功能,经过一番尝试,确实可以. 首先看一下目录结构: pushd C:\2015_VSIcon for /r %%a in (*.png) do ( XCOPY /Y "%%a" "C:\vs2015png" ) popd 我这里是win10操作系统,将其保存为.bat文件,然后用管理

一个文件夹下面最多可以放多少文件 这个问题其实我也不知道,不过我们可以来进行个测试,看看文件夹下面最多能放多少个文件. 那么怎么来测试这样一个问题呢,很显然我们一个个的去建立文件是不现实的,没那么多时间,而且这个方法也太笨了.这里我们会用到批处理命令,新建一个bat文件,然后将“for /l %%a in (1,1,10000000000000000) do echo text> %%a.txt”这段代码复制进去,保存后退出.这段代码的意思是在文件夹下面从1.txt开始建立10000000000

前段时间做项目需要读取一个文件夹里面所有的txt文件,查询资料后得到以下实现方法:首先了解一下这个结构体struct _finddata_t {    unsigned    attrib;    time_t      time_create;       time_t      time_access;       time_t      time_write;    _fsize_t    size;    char        name[260];};其中各成员变量的含义如下:unsi

代码简洁,亲测可用. 1,首先来获取(输出)一个文件夹中所有的文件名 void getFiles(string path, vector<string>& files) { //文件句柄 ; //文件信息 struct _finddata_t fileinfo; string p; ) { do { //如果是目录,迭代之 //如果不是,加入列表 if ((fileinfo.attrib & _A_SUBDIR)) { && strcmp(fileinfo.na

鉴于用caffe做实验的时候,里面牵扯到一个问题是必须将训练集和测试集都转成256*256的图像,而官网给出的代码又不会用,所以我用opencv转了.其实opencv只转一幅图会很简单,关键在于“批量”二字,因此本博客应运而生了. 本博客详细讲解了如何使用opencv批量处理图像,使某一个文件夹内全部图像都resize成256*256的.如果理解了本次博客内容,则不光可以对图像进行resize操作,还可以用来对图像做其它批处理操作. 1 先用opencv转一幅图像试试 #include "cv.

Java工具中为我们提供了一个用于管理文件系统的类,这个类就是File类,File类与其它流类不同的是,流类关心的是文件的内容.而File类关心的是磁盘上文件的存储. 一,File类有多个构造器,经常使用的构造器有: 1.public File(String pathname){} 在pathname路径下创建文件对象 2.public File(String path,String name){} 在path參数指定的文件夹中创建具有给定名字的File对象.假设path为null,构造器将使用

var fs = require("fs") var path = require("path") var listRealPath = path.resolve(__dirname); var newPath = path.resolve(__dirname+'/newFile'); // 整合到 新文件夹的名称 需要手动创建 或者更改为已存在的名称 var formatList = ['avi', 'mp4', 'mov', 'rmvb', 'mkv']; re

GitHub如何创建文件夹 创建新文件的时候名字后面加个斜杠(/)就可以了 点击新建文件,输入文件名的时候后面加上斜杠/就是创建了一个文件夹,没有斜杠就是创建了一个文 创建好后点提交 Commit new file  即可完成文件夹和文件夹下面文件的新建 备注: 如果删除文件夹下面的所有文件,文件夹也会消失(github不允许创建空文件夹) GitHub允许的上传的最大单个文件的大小是25M

转移大于2m的pdf文件到另外一个文件夹 remove_moret2M_pdfs.py # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Mon Sep 19 09:36:48 2016 @author: Administrator """ import os from os.path import join, getsize import shutil,xlrd excelFilename="test.xl

将e:/source文件夹下的文件打个zip包后拷贝到f:/文件夹下面 import java.io.*; import java.util.zip.ZipEntry; import java.util.zip.ZipOutputStream; public class DirCopy { public static void main(String[] args) throws Exception{ dirZipCopy("E:/source","F:/source.zip

这个题目用传统的File,InputStream可以做,但是如果用Files,Path类做,虽然思路上会困难一些,但是代码简洁了很多,以下是代码: import java.io.IOException; import java.nio.file.FileVisitResult; import java.nio.file.Files; import java.nio.file.Path; import java.nio.file.Paths; import java.nio.file.Simple