比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的说明并不详细,在众人的博客中也比较零散. 我刚使用这个包的时候(2017年)还很难安装,需要预装各种依赖,不过现在的同学们很幸福了,可以直接用pip一键安装了. 软件包链接:https://github.com/tanghaibao/jcvi 安装过程很简单: pip install jcvi pi

Python是一种面向对象.解释型计算机程序设计语言.被认为是比较好的胶水语言.至于其他的,你可以去百度一下.本文仅介绍python的安装和配置,供刚入门的朋友快速搭建自己的学习和开发环境.本人欢迎大神拍砖,邮箱:it_red@sina.com   本博文出处:http://itred.cnblogs.com   欢迎转载,请在显眼处标明文章出处. 安装环境:windows7     64位操作系统 一. 安装包的下载: 网上都能下载到各种版本的python安装包.本人用的是python2.6.

在 windows 系统下,只需要输入命令 pip install requests ,即可安装. 在 linux 系统下,只需要输入命令 sudo  pip install requests ,即可安装. 或者 ================= Window 1.  下载requests  被墙 打开这个网址, http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs 在这个网站上面有很多 python 的第三方库文件, ctrl+f 找到 requests 下载

Python2.7安装配置 python的官网地址:https://www.python.org/ 我这里下载的是python2.7.12版本的 下载后点击安装文件,直接点击下一步知道finally完成. 安装完后要配置环境变量: 在系统属性点击"环境变量"-"系统变量"-"path",添加python的安装路径 命令行输入python,出现下图表示安装配置完成.

一开始安装python的时候,安装的是最新版的python3.6的最新版.而且怕出问题,选择的都是默认安装路径.以为这样总不会出什么问题.一开始确实这样,安装modgodb等一切顺利.然而在安装jupyter botebook的时候确出现了问题. 安装mongodb的时候有提示我pip的版本是8.1.2,最新版的是9.0.0,我当时没有更新.昨晚安装jupyter的时候最后出现了exception,不知道怎么解决,网上也没有相关的资料.然后我升级pip,也是类似的exception.迷样的异常搞

原文地址: http://blog.chinaunix.net/uid-12014716-id-3859827.html 1.在以下地址下载最新的PIP安装文件:http://pypi.python.org/pypi/pip#downloads 2.解压安装 3.下载Windows的easy installer,然后安装:http://pypi.python.org/pypi/setuptools 4.安装setuptools工具 5.命令行工具cd切换到pip的目录,找到setup.py文件,

<转自:http://www.noanylove.com/2014/10/centos-6-5-sheng-ji-python-he-an-zhuang-ipython/>自己常用.以做备份 以前用CentOS 5.8的时候,写过一篇<升级CentOS的Python>.后来换成了CentOS 6.5,系统自带的Python版本是2.6.6,就懒得折腾.最近安装IPython,才发现IPython 2.3需要Python 2.7或者大于等于3.3,如图一所示.只有升级Python了.

python Scrapy安装和介绍 Windows7下安装1.执行easy_install Scrapy Centos6.5下安装 1.库文件安装yum install libxslt-devel libxml2-devel 2.将系统自带python2.6的easy_install备份,使用python2.7.10升级后的easy_install mv /usr/bin/easy_install /usr/bin/easy_install_2.6 ln -s /usr/local/pytho

Numpy等Python科学计算包的安装与配置 参考: 1.下载并安装 http://www.jb51.net/article/61810.htm 1.安装easy_install,就是为了我们安装第三方扩展包更容易 首先下载easy_install的安装包,下载地址:http://pypi.python.org/pypi/setuptools 在python下运行ez_setup.py 2.添加环境变量python安装地址\scripts python的安装目录中生成scripts目录,其中有

Python virtualenv安装库报错SSL: CERTIFICATE_VERIFY_FAILED 问题描述 使用pip按照virtualenv报错,如下: pip install virtualenv Collecting virtualenv /opt/python27/lib/python2./site-packages/pip/_vendor/requests/packages/urllib3/util/ssl_.py:: SNIMissingWarning: An HTTPS r

从今天起,我将开启python学习模式,并用博客记录学习的过程和相关知识点 1.Python下载安装 可以在官网:https://www.python.org/downloads/ 中下载各种版本的Python (目前我安装的版本是2.7.6) 2.语法要点记录 代码注释,使用#号符: >>> a=1 #value of a>>> b=2 #value of b>>> a+b #a add b3>>> 字符串可以跨多个行,可以使用反斜

今天,python 3 安装 scrapy, 并运行成功.特此纪念! 我的环境:windows 10(64位) + python 3.5.2(64位) 其中几个要点说明一下: 1.有几个依赖库需要事先单独安装 往往,在安装scrapy依赖库,即在 pip install scrapy 过程中,会出现红色错误的.此时,做两件事 更新pip: $ python pip install --upgrade pip 去lfd下载单独的whl文件,pip安装之(若有多个依赖库安装出现红色文字错误,则此步重

1.在以下地址下载最新的PIP安装文件:http://pypi.python.org/pypi/pip#downloads 2.解压安装 3.下载Windows的easy installer,然后安装:http://pypi.python.org/pypi/setuptools 4.安装setuptools工具 5.命令行工具cd切换到pip的目录,找到setup.py文件,然后输入python setup.py install,运行即可(之所以能运行这步,是因为之前安装的setuptools工

篇幅主要是别人的分享,我这里主要是添加注意点.我当初就是按照下面的图片开始安装python,安装的是python3.5,pyDev也是使用的博主的(还花了1资源分下载).但是运行程序时,一直显示 Error in sitecustomize; set PYTHONVERBOSE for traceback: KeyError: 'sitecustomize' 经过查找资料,发现是因为python与pydev的版本不合.博主的pydev可能是适合python2.x.如果是python3.X,建议大

一,Python简介      Python是一种计算机程序设计语言,都是使用C语言实现,但是比C语言容易学习,易于阅读.Python可以应用于众多领域,整体呈上升趋势,广泛使用Python来做的事一般有:自动化运维.自动化测试.大数据分析.爬虫.Web 等.所以Python前景是非常好的. 二,Python的种类 从下图看出,我们学会python规则这几种基于python的都可以. 三,Python环境:           1,windows下的python安装: python下载地址:ht

网上找了一些资料都没有成功~~然后自己装的过程中编辑记录了一些 当然博客园里也有人用这一种方法也可以参考IBM中的 http://www.cnblogs.com/visec479/p/4139882.html 但是我没有成功! 就换了一种方法 接着呢我们要做已下几个步奏 1.下载python.exe安装 这里呢我就不提供下载网址了,网上这个很容易下载到   安装完测试下: XP安装很快,但是win7安装时,中间有段时间需要等待很长时间 2.下载pydev http://sourceforge.n

Linux环境下Python的安装过程 前言 一般情况下,Linux都会预装 Python了,但是这个预装的Python版本一般都非常低,很多 Python的新特性都没有,必须重新安装新一点的版本,从下边的截图,可以看到我的 linux下,预装Python 的版本非常低,古老的 2.4.3版本.这里我准备安装现阶段稍微主流点的版本 2.7.3. 下载 官网下载地址:http://www.python.org/download/ 安装 解压 后边需要做的事情需要你具有 super user或者ad

一.在python官网上下载python3.4或python2.7版本,这两个版本目前比较稳定,安装第3方包相对而言没有什么问题. 二.安装成功后,在计算机->属性->高级系统设置->环境变量->path,在path中添加python的安装路径,如C:/python34.(此步骤为设置环境变量,每个环境变量之间的分号) 三:设置成功后,在系统的命令提示框中输入命令python,出现如下界面,标示环境变量设置成功. 四:安装pip工具,方便下载管理第3方包,在官网下载pip安装包,下

1.python控制软件pyenv 依赖软件:git [root@localhost ~]# curl https://raw.github.com/yyuu/pyenv-installer/master/bin/pyenv-installer| bash...Seems you still have not added 'pyenv' to the load path: export PYENV_ROOT="${HOME}/.pyenv" if [ -d "${PYENV_

Python是一种面向对象.解释型计算机程序设计语言.被认为是比较好的胶水语言.至于其他的,你可以去百度一下.本文仅介绍python的安装和配置,供刚入门的朋友快速搭建自己的学习和开发环境.本人欢迎大神拍砖,邮箱:it_red@sina.com   本博文出处:http://itred.cnblogs.com   欢迎转载,请在显眼处标明文章出处. 安装环境:windows7     64位操作系统 一. 安装包的下载: 网上都能下载到各种版本的python安装包.本人用的是python2.6.

首先进入python的官方网站:http://www.python.org在下载处,我们找到windows下有两个版本,下载最新版本Python3.4.0