启动子会影响RNA的剪切吗

生物信息学——RNA的剪切过程

生物信息学——RNA的剪切过程外显子(exon expressed region)是真核生物基因的一部分,它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质. 外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列.既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列.术语外显子也指编码相应RNA外显子的DNA中的区域.所有的外显子一同组成了遗传信息,该信息会体现在蛋白质上. 内含子(intron)在转录后的加工中,从最初的转录产物

单细胞RNA测序技术之入门指南

单细胞RNA测序技术之入门指南 [字体: 大中小 ] 时间:2018年09月12日来源:生物通编辑推荐: 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”.若要评选出目前最受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属. 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”.若要评选出目前最受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属. 以往,研究人员通常利用RNA测序(RNA-seq)来检测样本中的所有RNA转录本,以发现新型RNA

一些有用的 Emacs 配置（窗口快速切换、一键透明效果、任意位置删除整行等）

本篇文章记录的是一些有用的 Emacs 配置,有些是自己原创,有些是借鉴别人(能记起来出处的我放了链接). 规定:C 代表 Ctrl,M 代表 Alt. 1.设置一次跳跃 n 行的快捷键按 C-M-n 可以连续下跳 5 行,按 C-M-p 可以连续上跳 5 行: (global-set-key (kbd "C-M-n") (lambda () (interactive) (next-line 5))) (global-set-key (kbd "C-M-p") (

variant的过滤 | filtering and prioritizing genetic variants

WGS和WES测序和分析会产生大量的variant数据. 显然直接分析全部的variant是非常不靠谱的. 做疾病的话,有一些常用的过滤套路. variant作用于基因表达主要分两大类: 1. coding,可以直接影响RNA的形成,以及后面蛋白的折叠组装: 2. non-coding,现在最流行的就是enhancer这个媒介,已经有比较好的结果了. 过滤的必要性首先GWAS已经做了,要理解GWAS产生了哪些结果,GWAS的局限性在哪? Our previous meta-analysis o

kubernetes之副本控制器(RC/RS)

1.了解ReplicationController ReplicationController是一种kubernetes资源,可确保它的pod始终保持运行状态. 如果pod因任何原因消失(例如节点从集群中消失或由于该pod己从节点中逐出),则ReplicationController会注意到缺少了pod并创建替代pod. 图4.1显示了当一个节点下线且带有两个pod时会发生什么.Pod A是被直接创建的,因此是非托管的pod,而podB由ReplicationController管理.节点异常退

java web学习总结(二十六) -------------------JSP属性范围

所谓的属性范围就是一个属性设置之后,可以经过多少个其他页面后仍然可以访问的保存范围. 一.JSP属性范围 JSP中提供了四种属性范围,四种属性范围分别指以下四种: 当前页:一个属性只能在一个页面中取得,跳转到其他页面无法取得一次服务器请求:一个页面中设置的属性,只要经过了服务器跳转,则跳转之后的页面可以继续取得. 一次会话:一个用户设置的内容,只要是与此用户相关的页面都可以访问(一个会话表示一个人,这个人设置的东西只要这个人不走,就依然有效) 上下文中:在整个服务器上设置的属性,所有人都可以访

javaweb学习总结(十八)——JSP属性范围

所谓的属性范围就是一个属性设置之后,可以经过多少个其他页面后仍然可以访问的保存范围. 一.JSP属性范围 JSP中提供了四种属性范围,四种属性范围分别指以下四种: 当前页:一个属性只能在一个页面中取得,跳转到其他页面无法取得一次服务器请求:一个页面中设置的属性,只要经过了服务器跳转,则跳转之后的页面可以继续取得. 一次会话:一个用户设置的内容,只要是与此用户相关的页面都可以访问(一个会话表示一个人,这个人设置的东西只要这个人不走,就依然有效) 上下文中:在整个服务器上设置的属性,所有人都可以访

RNA提取和建库流程对mRNA-Seq的影响

RNA提取和建库流程对mRNA-Seq的影响已有 10460 次阅读 2014-8-14 14:21 |个人分类:转录组测序|系统分类:科研笔记|关键词:转录组测序,RNA-Seq,,链特异性RNA-Seq,转录组文库构建,总RNA提取| RNA-seq, 转录组测序, 链特异性RNA-Seq, 转录组文库构建, 总RNA提取目前RNA-Seq是挖掘不同生长时期及不同胁迫条件下.不同组织细胞中其差异表达基因通常所采用的研究方法,同时还可以鉴定获得新的转录本信息以及不同的可变剪切事件,因而

长链非编码RNA（lncRNA）

长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控.转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平. lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能.然而,近年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默,基因组

RNA测序的质量控制

RNA测序的质量控制发表评论 3,112 A+ 所属分类:Transcriptomics 收藏 ENCODE项目向我们揭示,人类基因组中超过70%能得到转录,只不过不会发生在同一个细胞里.为了研究如此多样的转录本,研究人员开发了许多技术,其中RNA测序(RNA-seq)是最全面也最有效的. 许多人相信,未来基因组数据将会对患者的治疗产生重要的影响.不过也有不少专家质疑基因组分析的准确性和可靠性.为此,美国FDA牵头了RNA测序质量控制(SEQC)项目,评估了多个试验室RNA-seq数据

MicroRNA in Control of Gene Expression: An Overview of Nuclear Functions 微RNA控制基因表达：核功能概述

MicroRNA in Control of Gene Expression:An Overview of Nuclear Functions微RNA控制基因表达:核功能概述抽象:小的非编码RNA(ncRNA)能够以序列特异性方式控制基因表达的发现对生物学产生了巨大影响.最近的改进很高吞吐量排序和计算预测方法已经允许发现和几种类型的ncRNA的分类.基于它们的前体结构,生物发生途径和作用模式,ncRNA被分类为小干扰RNA(siRNAs),microRNAs(miRNA),PIWI相互作用的R

PR视屏剪切

一款常用的视频编辑软件,由Adobe公司推出.现在常用的有CS4.CS5.CS6.CC.CC 2014及CC 2015版本.是一款编辑画面质量比较好的软件,有较好的兼容性,且可以与Adobe公司推出的其他软件相互协作.目前这款软件广泛应用于广告制作和电视节目制作中. 其最新版本为Adobe Premiere Pro CC 2015. 软件名称 adobe premiere 开发商 Adobe公司软件平台 WIN XP ,WIN 7 ,WIN 8, WIN 10, Mac OS X 软件版本最

js屏蔽浏览器右键菜单,粘贴,复制,剪切,选中（转）

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <head> <meta http-equiv="Content-

非编码RNA

生命的基本过程是从DNA转录成mRNA,再翻译成蛋白质发挥功能.DNA就像一张绝密的密码图,不能随意被移动,只能被锁在细胞核里.要想知道这些密码,只能像复印一样,将密码图复印到mRNA上,由它们把这些密码带到细胞质中进一步加工成蛋白质,让蛋白质发挥生物学功能.由于这些蛋白质是由mRNA所编码的,因此我们称这些mRNA为编码RNA:相反,那些不编码蛋白质的RNA被称为非编码RNA. 长期以来,非编码RNA以及被认为是基因组上的Junk或"暗物质",然而,随着2001年人类基因组测序的完成

App Store有哪些原因会影响app应用上架呢？（分享）

App Store对于应用上架的审核是非常严格的,很可能一个没有注意到的细节,或者一个你根本没想想到的原因就会导致你的应用上架失败.而排除这些无可避免的错误以外,还有一些导致应用上架失败的原因,非常常见,但开发者却很可能不知道.App Store有哪些原因会影响app应用上架呢?那么亿合科技小编来为读者分享下: 1. 条款和条件 1.1 为App Store开发程序,开发者必须遵守 Program License Agreement (PLA).人机交互指南(HIG)以及开发者和苹果签订的任何协

权威发布：长链非编码RNA命名规则

转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_8088f3700101pab7.html 权威发布:长链非编码RNA命名规则对于人类基因命名标准的制定而言,雨果基因命名委员会(HGNC)是唯一官方授权的机构.HGNC的数据库中有38000个基因名称,其中大部分是编码蛋白基因:但HGNC也命名了8500多个人类非编码基因及假非编码基因,通过与各层次专家们的合作,他们命名了大多数的小非编码RNA. 小非编码RNA一般可根据它们的同源性及相同功能来分类.相比而言,长链非编码R

CSS和SVG中的剪切——clip-path属性和<clipPath>元素

剪切是什么剪切是一个图形化操作,你可以部分或者完全隐藏一个元素.被剪切的元素可以是一个容器也可以是一个图像元素.元素的哪些部分显示或隐藏是由剪切的路径来决定的. 剪切路径定义了一个区域,在这个区域内的内容将会显示,而不在这个区域内的内容不会显示.这个区域被称之为“裁剪区域”.只要在这个区域之外的任何元素都不会显示.包括元素的内容.背景.边框.文本.轮廓等,甚至还包括他的子元素. 剪切的元素可以是任何容器和图片元素. 剪切路径的概念就相当于在元素上定义了一个视窗.它决定了元素哪些部分在这个“视窗

启动子&外显子&内含子

启动子 http://baike.baidu.com/link?url=HMqaMY4mXusH--4hMu1p6P_XUzEve9lZhFGtxScnbb8Z9HaLYJ981eWxAuZt2iAP 启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性. 起始时间和表达的程度.启动子(Promoters)就像“开关”,决定基因的活动.既然基因是成序列的核苷酸(nucleotides),那么启动子也应由DNA组成.启动子本身并不控制

php imagemagick 处理图片剪切、压缩、合并、插入文本、背景色透明

php有一款插件叫做imagemagick,功能很强大,提供了图片的很多操作,图片剪切.压缩.合并.插入文本.背景色透明等.并且有api方法调用和命令行操作两种方式,如果只是简单处理的话建议api方法调用,如果是很复杂的操作建议服务器端搭shell命令行操作,因为api方法调用同操作对比命令行他更吃内存,并且效率没有命令行那么高. 本文章就对于这些常见操作进行介绍说明首先要提一声的时候每次通过imageMagic处理图片都会new一个对象出来,当图片处理好之后最好是把这个对象给销毁,它会占用c

清除float浮动造成影响的几种解决方案

1. “清除浮动” ??准确的描述应该是“清除浮动造成的影响” 学习浮动推荐的视频教程<CSS深入理解之float浮动> 2.如何清除浮动造成的影响??? 栗子块级div元素包含一个内联img元素,此时div的高应该是图片img撑开的高度,当设置了图片img元素设置浮动后,div高度就会坍塌浮动的破坏性浮动导致高度坍陷代码 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta chars

启动子会影响RNA的剪切吗

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