在上一篇帖子中,我介绍了CellPhoneDB的原理.实际操作,以及一些值得注意的地方.这一篇继续细胞通讯分析的可视化. 公众号后台回复20210723获取本次演示的测试数据,以及主要的可视化代码. 所有的数据和结果文件均已打包,下载后直接就能跑下面的代码画图. 下面的代码可以绘制对称热图 (如果你不清楚为啥热图要沿着对角线对称,可以看一下之前的推文) library(tidyverse) library(RColorBrewer) library(scales) pvalues=read.ta

细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息,这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合,传递信号来实现的.不同的分化.疾病过程,可能存在特异的细胞通讯关系,因此阐明这些通讯关系至关重要. CellPhoneDB配有详实的受配体数据库,其整合了此前的公共数据库,还会手动矫正,以得到更加准确的受配体注释.此外,针对受配体有多个亚基的情况,也进行了注释.下面这张图显示了CellPhoneDB配有的数据库包含多少种分泌蛋白和膜蛋白.蛋白质复合物.受配体关系,以及它们来源于什么数据库. 1.

基于OSS的数据查询分析和可视化BI报表 数据存储在OSS后,有多种查询分析的方法,包括阿里云MaxCompute.DataLakeAnalytics产品等Severless查询分析服务,也可以自建Spark.Presto.Imapla应用来分析OSS上的数据. 本文,介绍基于OSS+DataLakeAnalytics+QuickBI,实现对数据的存储.Serverless化的Ad-hoc查询.可视化BI的实验. 实验步骤( OSS+DataLakeAnalytics+QuickBI) 本次实验

基于GPU加速的三维空间分析 标签:supermap地理信息系统gisit 文:李凯 随着三维GIS 的快速发展和应用普及,三维空间分析技术以其应用中的实用性成为当前GIS技术研究的热点领域.面对日益庞大的三维数据处理现状,为满足GIS各行业对专业化三维空间分析的实用性需求,SuperMap GIS 7C(2015)提供了丰富且实用的基于GPU图形硬件加速的三维空间分析功能,做到“即时分析.即时完成”的超强性能,具体包括通视分析.可视域分析.动态可视域分析.阴影率统计分析.天际线分析.剖面线分析

最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R包工具,部分罗列如下: 1. mixOmics 应该是在多组学领域知名度最高的一个R包,有专门的团队,做了十余年了,引用量也比较高. 官网:http://mixomics.org/ 文章:mixOmics: An R package for 'omics feature selection and multiple data integration Gi

MySQL 慢查询日志分析及可视化结果 MySQL 慢查询日志分析 pt-query-digest分析慢查询日志 pt-query-digest --report slow.log 报告最近半个小时的慢查询: pt-query-digest --report --since 1800s slow.log 报告一个时间段的慢查询: pt-query-digest --report --since '2013-02-10 21:48:59' --until '2013-02-16 02:33:50'

前言 智慧楼宇和人们的生活息息相关,楼宇智能化程度的提高,会极大程度的改善人们的生活品质,在当前工业互联网大背景下受到很大关注.目前智慧楼宇可视化监控的主要优点包括: 智慧化 -- 智慧楼宇是一个生态系统,像人一样拥有感知能力.自我判断能力以及控制能力. 绿色化 -- 绿色建筑在耗能.产能以及能源管理方面实现绿色化,楼宇安防实现绿色化监控. 运行成本可控制 -- 基于可持续发展的要求,现代建筑.商业建筑需运行50年以上,建筑在运行过程中能源消耗巨大,如何降低运营成本降低,使建筑在低碳.环保的状态

前言 智慧楼宇和人们的生活息息相关,楼宇智能化程度的提高,会极大程度的改善人们的生活品质,在当前工业互联网大背景下受到很大关注.目前智慧楼宇可视化监控的主要优点包括: 智慧化 -- 智慧楼宇是一个生态系统,像人一样拥有感知能力.自我判断能力以及控制能力. 绿色化 -- 绿色建筑在耗能.产能以及能源管理方面实现绿色化,楼宇安防实现绿色化监控. 运行成本可控制 -- 基于可持续发展的要求,现代建筑.商业建筑需运行50年以上,建筑在运行过程中能源消耗巨大,如何降低运营成本降低,使建筑在低碳.环保的状态

上一篇博客中说了基于“泵”的UDP通讯,附上了一个Demo,模拟飞鸽传书的功能,功能不太完善,主要是为了说明“泵”在编程中的应用.本篇文章我再附上一个关于TCP通讯的两个Demo,也都采用了“泵”模式: 1.由于我把通讯部分的代码写在了一个dll中,这个demo只是简单的应用这个dll,主要完成发送字符串.字节流.可序列化对象等功能,效果图如下: 图1 服务端 图2 客户端 2. 一个简单的屏幕监控程序,主要有屏幕监控.键盘鼠标监控.键盘鼠标控制等功能.监控服务端可以同时监控多个客户端,效果图如

Resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improvement in soybean 中文名:基于GWAS与群体进化分析挖掘大豆驯化及改良相关基因 发表期刊杂志:nature biotechnology影响因子:41.514发表时间:2015年2月发表单位:中科院遗传与发育生物学研究所 一.      研究取材62株野生大豆.130株地方种和110个

这篇博文主要讲表情发送的一些东西. 参考:Android基于XMPP的即时通讯1-基本对话 1.准备好资源文件 采用的是emoji的表情,我打包好了,下载地址:http://files.cnblogs.com/files/pear-lemon/drawable.zip 2.表情布局文件layout_send_emotion.xml <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <RelativeLayout xmln

本文是在上一篇博文Android基于XMPP的即时通讯1-基本对话的基础上,添加新的功能,文件传输 1.初始化文件传输管理类 public static FileTransferManager getFileTransferManager() { if (fileManager == null) { ServiceDiscoveryManager sdManager = ServiceDiscoveryManager .getInstanceFor(connection); if (sdMana

高性能Linux服务器 第10章    基于Linux服务器的性能分析与优化 作为一名Linux系统管理员,最主要的工作是优化系统配置,使应用在系统上以最优的状态运行.但硬件问题.软件问题.网络环境等的复杂性和多变性,使得对系统的优化变得异常复杂,如何定位性能问题出在哪个方面,是性能优化的一大难题.本章从系统人手,重点讲述由于系统软.硬件配置不当造成的性能问题,并且给出了检测系统故障和优化性能的一般方法和流程. 10.1  系统性能分析的目的 10.1.1  找到系统性能的瓶颈系统的性能是指操作

基于Keil C的覆盖分析,总结出编程中可能出现的几种不可预知的BUG,供各位网友参考 1.编译时出现递归警告,我看到很多网友都采用再入属性解决,对于再入函数,Keil C不对它进行覆盖分析,采用模拟栈来分配局部变量,对于data型的模拟栈,假设函数中如果用了x个变量,递归级数为y,那每调用一次递归函数就要使用(x+2)*y个堆栈空间,极易造成堆栈空间溢出,产生不可预知的错误.连汉诺塔问题都可以采用非递归算法实现,因此使用Keil C编程建议不要使用递归算法. 2.使用函数指针变量间接调用函数,

基于“泵”的TCP通讯(接上篇) 上一篇博客中说了基于“泵”的UDP通讯,附上了一个Demo,模拟飞鸽传书的功能,功能不太完善,主要是为了说明“泵”在编程中的应用.本篇文章我再附上一个关于TCP通讯的两个Demo,也都采用了“泵”模式: 1.由于我把通讯部分的代码写在了一个dll中,这个demo只是简单的应用这个dll,主要完成发送字符串.字节流.可序列化对象等功能,效果图如下: 图1 服务端 图2 客户端 2. 一个简单的屏幕监控程序,主要有屏幕监控.键盘鼠标监控.键盘鼠标控制等功能.监控服务

基于Petri网的工作流分析和移植 一.前言 在实际应用场景,包括PEC的订单流程从下订单到订单派送一直到订单完成都是按照一系列预先规定好的工作流策略进行的. 通常情况下如果是采用面向过程的编程方法,我们采用的方式无非就是判断当前的工作流状态以及操作步骤来选择工作流分支继续下一步,如果整个工作流从起始到结束所执行的步骤不多的话,采用此方式相当简便,但如果步骤一多起来,或者分支太多以及需要判断的或者切换的状态太多的时候,很容易出错,或者说在原有的工作流分支上新增一个操作步骤,则改起代码来会非常繁琐

基于ZeroMQ的实时通讯平台 上篇:C++分布式实时应用框架 (Cpp Distributed Real-time Application Framework)----(一):整体介绍 通讯平台作为C++分布式实时应用框架(Cpp Distributed Real-time Application Framework)的最核心模块,承担了分布式实时框架的基础通讯功能.通讯平台框架具备了基于Reactor模式的网络通讯能力,并且依赖于ZeroMQ库,因此支持非持久化的message queue的

# 前言 本文由 本人 首发于 先知安全技术社区: https://xz.aliyun.com/u/5274 最近在分析 dlink 的一个固件时遇到了用 goahead 开发的 web 服务.本文以一个 github 上的 开源项目为例简单介绍下对基于 goahead 的程序的分析. https://github.com/Grant999/goahead-1 这里用的 goahead 程序的版本为 2.5 正文 编译运行 把源码下载下来,然后使用 make 编译即可. $ make .....

得益于 HTML5 WebGL 技术的成熟,从技术上对工控管理的可视化,数据可视化变得简单易行!完成对工控设备的管理效率,资源管理,风险管理等的大幅度提高,同时也对国家工业4.0计划作出有力响应! 如本案例所示,是一个基于 HTML5 WebGL 技术实现的计量站三维可视化监控系统,在本案例中,具体宏观的展示一个油田站点的整体场景,然后点击可以进入内景看到油田计量站内景的具体情况,同时可以看到各个设备的参数的当前状态. 同样的其中功能组件具有很高的复用性,所以也会非常方便的应用到其他场景中! 如

转载自:https://www.ibm.com/developerworks/cn/cognitive/library/cc-1606-spark-seniment-analysis/index.html IBM 公司在 2015 年对外宣告了一个新的科技和商务时代的来临—认知时代.这个巨大的转变,来自 IBM 对技术和商业领域的三个重要的洞察力［1］.第一,这个世界被数据所充斥.第二,这个世界通过代码被改造.第三,认知计算的出现.其中,认知计算可以: 通过感知与互动,理解非结构化数据 通过生成