基因组共线型分析在线

2024-08-27

基因组共线性分析工具MCScanX

软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析..MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具. 软件安装进入官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm,下载安装 1 unzip MCscanX.zip 2 cd MCScanX 3 make 软件使用所需要文件两个或多个物种的gff文件,蛋白序列(** 该软件最多能做5个物种的共线性) 第一步:构建索引,进行blastp比对注

BSA分析

目录两种算法 1. 欧氏距离(ED)算法 2. SNP-index算法实操 1. 上游分析 2. 下游分析两种算法 1. 欧氏距离(ED)算法 mut与wt分别代表突变型混池.野生型混池,A.C.G.T表示标记位点各突变型所占测序reads的比例,对于二倍体来说,大部分标记只有两种突变型. MMAPPR,ED法是其中一个环节,通过计算不同混池间各突变型的频率距离,采用距离差异来反映标记与目标区域的连锁强度. 2. SNP-index算法通过寻找混池之间基因型频率的显著差异,用Δ(SNP-

MISA(在线)注释叶绿体基因组SSR

SSR (Simple Sequence Repeat),即简单重复序列,是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,也称为微卫星序列或者串联重复. 简单重复顾名思义就是以很短的序列为一个单元,比如5个碱基(ACGTA),连续进行重复多次的重复.根据重复单元的长短,可将其细分为如下几类. < 6 bp 微卫星DNA 10-60 bp 小卫星DNA 100-300 bp 卫星DNA 等... 今天介绍一款可用于鉴定基因组SSR的软件,MISA 对叶绿体基因组进行SSR的鉴定,因为叶绿体基因组序列

共克时艰，停工不停学 Serverless 在线课堂免费开课

二月份,Serverless 团队联合腾讯云大学与云+社区免费推出 Serverless 在线直播课程,课程涵盖 Serverless 架构解密.技术解析以及不同应用场景下的最佳实战指导,让你从 0 到 1 快速掌握 Serverless 开发知识,足不出户,就能完成开发技能升级. 直播课第一期将于本周四(2月6日)19:00 开课,Serverless Framework 社区专家陈涛将分享<Serverless 架构揭秘与静态网站部署实战>,扫描文中二维码,或点击文末阅读原文,即可进行课程

Andriod小项目——在线音乐播放器

转载自: http://blog.csdn.net/sunkes/article/details/51189189 Andriod小项目——在线音乐播放器 Android在线音乐播放器从大一开始就已经开始自学Java和Android了,到现在差不多有一年了. 终于到了开始做项目实战的阶段了.就先DIY个在线音乐播放器. 实现了以下功能: 这个播放器可以从本机电脑搭建的简易服务器里异步读取并解析json数据,播放音乐,实现音乐切换,时间显示,以及显示播放进度. 程序有三个界面,启动画面,音乐列表

online_jf.lua --累计在线时间领取物品(积分)的lua脚本

原作者: ayase 8-27修正修复首次使用后的红字不需要额外进数据库导入计分表,这lua全自动生成 --------------------------------------------------------------惯例写在前面: 写这玩意其实学习性更大于目的性..= =研究了两天晚上写的我人参中滴第一个lua脚本,居然还真给我写出来了,好感动由于写代码的基础基本是零所以碰了N+N次壁什么函数字母大小写还要区分 -- 闹哪样啊喂因为这个原因我试了半个多钟才发现问题所在什么函

简单5步说清App软件在线开发、App制作多少钱？

开发制作一款App,所有人都会首先关心开发一款App多少钱这个问题.从网上的信息来看,花费个几十万是很正常的事情,甚至有人说要花上百万才能制作出一款App.那么App软件的开发制作到底和什么有关?怎么能大致预估一个App制作的成本呢?小编用5个步骤来介绍一下. 一.App开发模式-App定制还是App模板首先要搞清楚的是App的开发模式,市面上一般有App定制和App模板两种模式可以选择. App定制顾名思义就是自定义制作一款App,从梳理需求到每一个功能的开发和制作,到最终App上线.在AP

海量数据处理利器之Hash——在线邮件地址过滤

标题用了了海量数据(Massive datasets)而不用大数据(Big data).感觉大数据还是略微有点虚,来点实际的. 一.需求现在我们需要设计一个在线过滤垃圾邮件地址的方案,我们的数据库里面已经有10亿个合法的邮件地址(称为合法地址集S),当有新的邮件发过来时,要检查这个邮件地址是不是在我们的数据库里面,如果在,我们接收邮件,如果不在,我们就把它当做垃圾邮件过滤掉. 二.直觉想到的方法一拿到这个问题,我就想到了用log(n)的折半查找,先将10亿个邮件地址排序,当收到一个邮件地址时

一个共通的viewModel搞定所有的编辑页面-经典ERP录入页面（easyui + knockoutjs + mvc4.0)

http://www.cnblogs.com/xqin/archive/2013/06/06/3120887.html 前言我写代码喜欢提取一些共通的东西出来,之前的一篇博客中说了如何用一个共通的viewModel和简洁的后台代码做查询页面,所有的查询页面都要对应一个数据录入的编辑及查看明细的页面,那么今天我们就来实现这个页面,同样我们也要使用一个共通的viewModel完成前台UI与JSON数据交互的处理,同样以超简洁的后台代码来处理保存. 需求分析我们先弄明白我们要做怎么样一个编辑的页面

删除ecshop底部共执行个查询Gzip 已禁用，占用内存方法

删除ecshop底部共执行个查询Gzip 已禁用,占用内存方法 ECSHOP教程/ ecshop教程网(www.ecshop119.com) 2013-03-25 “共执行 41 个查询,用时 2.607806 秒,在线 1 人,Gzip 已禁用,占用内存 3.271 MB” 这段代码是ecshop自带的功能.但是由于内容基本没啥作用而且非常长一些客户希望删除,具体位置在后台库项目管理-page_footer.lbi,(具体文件位置在模板目录library文件夹里面的page_foote

eclipse插件在线发布发布和版本更新(web site) 转

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go五笔——基于Google在线五笔制作

go五笔 v0.0.2 加入新世纪版 86版收录几个不常用汉字,其它无更新下载 86版64位密码: qe7k 86版32位密码: y25a 06版64位密码: d2ug 06版32位密码: bxxz 百度云下载 go五笔 v0.0.1 基于Google在线五笔整理制作标准86五笔(标准五笔字型WB-18030) 完整的容错码支持拼音反查支持(码表自Android开源拼音,Rime使用相同方式) 自动造词下载百度云下载 64位密码: cets MD5:8f6f7fee90ef42bdc

各大公司广泛使用的在线学习算法FTRL详解

各大公司广泛使用的在线学习算法FTRL详解现在做在线学习和CTR常常会用到逻辑回归( Logistic Regression),而传统的批量(batch)算法无法有效地处理超大规模的数据集和在线数据流,google先后三年时间(2010年-2013年)从理论研究到实际工程化实现的FTRL(Follow-the-regularized-Leader)算法,在处理诸如逻辑回归之类的带非光滑正则化项(例如1范数,做模型复杂度控制和稀疏化)的凸优化问题上性能非常出色,据闻国内各大互联网公司都第一时间应

各大公司广泛使用的在线学习算法FTRL详解 - EE_NovRain

转载请注明本文链接:http://www.cnblogs.com/EE-NovRain/p/3810737.html 现在做在线学习和CTR常常会用到逻辑回归( Logistic Regression),而传统的批量(batch)算法无法有效地处理超大规模的数据集和数据流,google先后三年时间(2010年-2013年)从理论研究到实际工程化实现的 FTRL(Follow-the-regularized-Leader) 算法,在处理诸如逻辑回归之类的带非光滑正则化项(例如1范数,做模型复杂度控

ArcGis学习教程免费版在线观看

ArcGis学习教程免费版在线观看作者:池建文章来源:清华大学出版社点击数:150220 更新时间:2013-8-8 摘要:Arcgis学习视频教程根据书籍章节逐步讲解较为详细,无需下载直接在网上观看,有土豆和优酷视频,任你选择.<精通ArcGIS地理信息系统>本书从gis软件应用与开发的角度,全面.系统.由浅入深地介绍了arcgis软件的结构功能.软件操作.数据处理及应用与开发.书中提供了大量实例,供读者理解软件的功能与操作. 2013年12月27日更新 ArcGIS

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JavaWeb项目开发案例精粹-第3章在线考试系统-007View层

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ECSHOP在线手册之模板结构说明 (适用版本v2.7.3)

名称类型备注(作用或意义) 文件(目录)名可否更改 images 目录存放模板图片目录不可更改 library 目录存放模板库文件目录不可更改 screenshot.png 图片用于“后台管理 -> 模板管理 -> 模板选择”显示模板缩略图. 不可更改 style.css css样式表不可更改备注:模板文件共35(格式:.dwt). 提醒: 1, 更改模板文件里面库文件的内容是无效的,页面刷新时,程序自动重新载入库文件内容到模板文件里(以库文件内容为准). 2, 模板内所

ECSHOP在线手册之数据库结构说明 (适用版本v2.7.3)

1.account_log 用户账目日志表字段类型 Null/默认注释 log_id mediumint(8) 否 / 自增 ID 号 user_id mediumint(8) 否 / 用户登录后保存在session中的id号,跟users表中user_id对应 user_money decimal(10,2) 否 / 用户该笔记录的余额 frozen_money decimal(10,2) 否 / 被冻结的资金 rank_points mediumint(9) 否 / 等级积分,跟消费积

Cloudera Hadoop 4 实战课程(Hadoop 2.0、集群界面化管理、电商在线查询+日志离线分析)

课程大纲及内容简介: 每节课约35分钟,共不下40讲第一章(11讲) ·分布式和传统单机模式 ·Hadoop背景和工作原理 ·Mapreduce工作原理剖析 ·第二代MR--YARN原理剖析 ·Cloudera Manager 4.1.2安装 ·Cloudera Hadoop 4.1.2 安装 ·CM下集群管理一 ·CM下集群管理二 ·Hadoop fs 命令详解 ·cloudera manager管理集群·cloudera manager下集群高级管理第二章(约10讲) ·Hive数据表和

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