文章摘要 本文首先介绍了并行计算的基本概念,然后简要阐述了R和并行计算的关系.之后作者从R用户的使用角度讨论了隐式和显示两种并行计算模式,并给出了相应的案例.隐式并行计算模式不仅提供了简单清晰的使用方法,而且很好的隐藏了并行计算的实现细节.因此用户可以专注于问题本身.显示并行计算模式则更加灵活多样,用户可以按照自己的实际问题来选择数据分解,内存管理和计算任务分配的方式.最后,作者探讨了现阶段R并行化的挑战以及未来的发展. R与并行计算 统计之都的小伙伴们对R,SAS,SPSS, MATLAB之类

R语言使用向量化计算,因此非常容易在集群上进行并行计算.parallel 包提供了非常方便的函数用来进行并行计算,但有一个问题是并行时对于内存中的对象会拷贝多份,因此会比较占内存,这里提供一个比较简易的方法在内存中共享对象从而达到降低内存占用的目的. cl<-makeCluster(, type="FORK") result_list <- parLapply(cl, list, function) stopCluster(cl) 非常简单,在创建集群的时候添加type为

先上代码案例: 主要的操作: library(parallel);#加载并行计算包 cl <- makeCluster(8);# 初始化cpu集群 clusterEvalQ(cl,library(RODBC));#添加并行计算中用到的包 clusterExport(cl,'variablename');#添加并行计算中用到的环境变量(如当前上下文中定义的方法) dt <- parApply(cl,stasList, 1, stasPowerPre_Time);# apply的并行版本 all_

本文在Creative Commons许可证下发布 什么是并行计算? 并行计算,准确地说应该包括高性能计算机和并行软件两个方面.不过,近年来随着个人PC机,廉价机群,以及各种加速卡(NVIDIA GPU, Intel Xeon Phi, FPGA)的快速发展,现在个人电脑已经完全可以和过去的高性能计算机相媲美了. 相比于计算机硬件的迅速发展,并行软件的发展多少有些滞后,试想你现在使用的哪些软件是支持并行化? 软件的并行化需要更多的研发支持,以及对大量串行算法和现有软件的并行化,这部分工作被称之为

要学的东西太多,无笔记不能学~~ 欢迎关注公众号,一起分享学习笔记,记录每一颗"贝壳"~ --------------------------- 终于开始攻克并行这一块了,有点小兴奋,来看看网络上R语言并行办法有哪些: 赵鹏老师(R与并行计算)做的总结已经很到位.现在并行可以分为:  隐式并行:隐式计算对用户隐藏了大部分细节,用户不需要知道具体数据分配方式 ,算法的实现或者底层的硬件资源分配.系统会根据当前的硬件资源来自动启动计算核心.显然,这种模式对于大多数用户来说是最喜闻乐见的.

转自:http://bbs.pinggu.org/thread-3078817-1-1.html 有人说Python和R的区别是显而易见的,因为R是针对统计的,python是给程序员设计的,其实这话对Python多多少少有些不公平.2012年的时候我们说R是学术界的主流,但是现在Python正在慢慢取代R在学术界的地位.不知道是不是因为大数据时代的到来. Python与R相比速度要快.Python可以直接处理上G的数据:R不行,R分析数据时需要先通过数据库把大数据转化为小数据(通过groupby

本文对应<R语言编程艺术> 第14章:性能提升:速度和内存: 第15章:R与其他语言的接口: 第16章:R语言并行计算 ========================================================================= 性能提升:速度和内存 要使R代码运行速度更快,有以下建议: 通过向量化的方式优化.使用字节码编译等: 将代码中最消耗CPU的核心部分用编译型语言编写,如C或C++: 将代码用某种并行的方式编写. 消除显示循环: 采用向量化提升速度

一.Python与R功能对比分析 1.python与R相比速度要快.python可以直接处理上G的数据:R不行,R分析数据时需要先通过数据库把大数据转化为小数据(通过groupby)才能交给R做分析,因此R不可能直接分析行为详单,只能分析统计结果.Python=R+SQL/Hive 2.如果是统计理论研究.前沿科学研究,R比python更胜一筹.R的优势在于有包罗万象的统计函数可以调用,特别是在时间序列分析方面(主要用在金融分析与趋势预测)无论是经典还是前沿的方法都有相应的包直接使用:相比pyt

有一个大数据项目,你知道问题领域(problem domain),也知道使用什么基础设施,甚至可能已决定使用哪种框架来处理所有这些数据,但是有一个决定迟迟未能做出:我该选择哪种语言?(或者可能更有针对性的问题是,我该迫使我的所有开发人员和数据科学家非要用哪种语言?)这个问题不会推迟太久,迟早要定夺. 当然,没有什么阻止得了你使用其他机制(比如XSLT转换)来处理大数据工作.但通常来说,如今大数据方面有三种语言可以选择:R.Python和Scala,外加一直以来屹立于企业界的Java.那么,你该选

上期回顾 上一期:NanoProfiler - 适合生产环境的性能监控类库 之 基本功能篇 上次介绍了NanoProfiler的基本功能,提到,NanoProfiler实现了MiniProfiler欠缺的多线程和异步代码的支持,并且,由于采用不同的内部数据结构,NanoProfiler拥有更高的执行效率,而且占用极少的系统资源,因此,是适合在生产环境下使用的性能监控类库.并且,我们也提到了,NanoProfiler设计理念的另一大不同,即面向大数据分析. 这一期,我重点介绍一下NanoProfi

GNU's Screen homepage Screen是由GNU计划开发的用于命令行终端切换的自由软件,可以看作是窗口管理器的命令行界面版本. 可以通过该软件同时连接多个本地或远程的命令行会话,并在其间自由切换. 多窗口 在Screen环境下,所有的会话都独立的运行,并拥有各自的编号.输入.输出和窗口缓存. 用户可以通过快捷键在不同的窗口下切换,并可以自由的重定向各个窗口的输入和输出. 会话共享与限制 可以让一个或多个用户从不同终端多次登录一个会话,并共享会话的所有特性(比如可以看到完全相同的

读者朋友,在比较新的版本(Python 2 >=2.7.9 or Python 3 >=3.4)中,pip或者easy_install 扩展包命令已经默认安装(可查看   你的安装目录\python-(你的版本号)\Scripts),不需要额外手动安装,只需把安装命令加入到环境变量即可. 1 以scikit learn 安装为例子 scikit learn 是Python下开源的机器学习包.(安装环境:win7.0 32bit和Python2.7) 方法一:命令行  easy_install 

[转]linux中强大的screen命令 http://pythonorg.diandian.com/post/2012-01-05/40027464147 今天用SCREEN用点生了,有几个功能不知道怎么用,上网搜了一下,有位哥们写的挺细的,向这哥们致敬,我这里就转走了,备查用.因为还有好几个有用实用好用的功能文章都没有描述到.我将在转载的最后给预补充.以下转载开始 转载地址:http://hi.baidu.com/nkhzj/blog/item/9de2cdfdddf0db42d7887d4

参考URL: http://jingyan.baidu.com/article/295430f128d8ea0c7e005089.html ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 其它的不提,主要用的几个命令: A,screen -S screenname B,在screen窗口键入Ctrl+a-d中断(先按ctrl+a,然后再接d,进行detach操作) C,screen -ls D,screen -r screenname  ~~~~~~~~~~~~~~~~ [jawidx@fed

参考地址:iozone使用技巧.iozone和Fio安装测试说明 iozone介绍 iozone(www.iozone.org)是一个文件系统的benchmark工具,可以测试不同的操作系统中文件系统的读写性能.可以测试 Read, write, re-read,re-write, read backwards, read strided, fread, fwrite, random read, pread, mmap, aio_read, aio_write 等等不同的模式下的硬盘的性能.  

什么是iozone? iozone是一个文件系统的benchmark工具,可以测试不同的操作系统中文件系统的读写性能. 可以测试 Read, write, re-read,re-write, read backwards, read strided, fread, fwrite, random read, pread, mmap, aio_read, aio_write 等等不同的模式下的硬盘的性能. 测试的时候请注意,设置的测试文件的大小一定要大过你的内存(最佳为内存的两倍大小),不然linu

GNU's Screen homepage Screen是由GNU计划开发的用于命令行终端切换的自由软件,可以看作是窗口管理器的命令行界面版本. 可以通过该软件同时连接多个本地或远程的命令行会话,并在其间自由切换. 多窗口 在Screen环境下,所有的会话都独立的运行,并拥有各自的编号.输入.输出和窗口缓存. 用户可以通过快捷键在不同的窗口下切换,并可以自由的重定向各个窗口的输入和输出. 会话共享与限制 可以让一个或多个用户从不同终端多次登录一个会话,并共享会话的所有特性(比如可以看到完全相同的

iozone介绍: iozone(www.iozone.org)是一个文件系统的benchmark工具,可以测试不同的操作系统中文件系统的读写性能. 可以测试 Read, write, re-read,re-write, read backwards, read strided, fread, fwrite, random read, pread, mmap, aio_read, aio_write 等等不同的模式下的硬盘的性能. 测试的时候请注意,设置的测试文件的大小一定要大过你的内存(最佳为

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1.写一个一竖的自定义布局: <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <LinearLayout xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android" android:orientation="vertical" android:layout_width="wrap_content" an