本文首发于公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图) R-maftools包绘制组学突变结果(MAF)的oncoplot或者叫“瀑布图”,以及一些细节的更改和注释. 本文继续介绍maftools对于MAF文件的其他应用,为更易理解和重现,本次使用TCGA下载的LIHC数据. 一 数据部分 setwd("C:\\Users\\Maojie\

两部分,1需要喂什么东西给软件,2它能干什么(输出什么东西在下一篇讲) 博客园/B站/知乎/CSDN @秋意正寒 转载请在头部附上源地址 目录:https://www.cnblogs.com/onsummer/p/10777520.html 1. 数据的输入 DepthMapX(简称DMX)主要支持以下几种数据格式: AutoCAD的交换格式 *.dxf,只能是线或者面 MapInfo的 *.mif csv/txt/gml... 吐槽:居然不支持shp/json,真垃圾 1.1 数据的类型及要求

转载生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA TCGA数据源 - R包RTCGA的简单介绍 - 首先安装及加载包 - 指定任意基因从任意癌症里面获取芯片表达数据 - 绘制指定基因在不同癌症的表达量区别boxplot - 更多boxplot参数 - 指定任意基因从任意癌症里面获取测序表达数据 - 用全部的rnaseq的表达数据来做主成分分析 - 用5个基因在3个癌症的表达量做主成分分析 - 用突变数据做生存分析 - 多个基因在多

目录 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—1.后台主框架 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—2.菜单特效 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—3.面板折叠和展开 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—4.tab多页签支持 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—5.Demo演示Controller和View的交互 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—6.客户管理(添加.修改.查询.分页) ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—7.统计报表 ASP

MySQL数据列类型选择是在我们设计表的时候经常会遇到的问题,下面就教您如何正确选择MySQL数据列类型,供您参考学习. 选择正确的数据列类型能大大提高数据库的性能和使数据库具有高扩展性.在选择MySQL数据列类型时,请从以下几个方面考虑: 存放到数据列中的数据类型. 数据值的取值范围. 考虑性能和处理效率. 数值操作比字符操作快. 小类型的处理速度比大类型快. 不同数据表中固定长度类型和可变长度类型的处理效率是不同的. 可变长度类型在经过删除和修改操作后容易产生碎片,降低系统性能,需定期运行O

将View中选择的数据行中的部分数据传入到Controller中   ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—1.后台主框架 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—2.菜单特效 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—3.面板折叠和展开 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—4.tab多页签支持 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—5.Demo演示Controller和View的交互 ASP.NET MVC搭建项目后台UI框架—6.客户管理(添加.修改.查询.分页)

body { font-family: "Microsoft YaHei UI","Microsoft YaHei",SimSun,"Segoe UI",Tahoma,Helvetica,Sans-Serif,"Microsoft YaHei", Georgia,Helvetica,Arial,sans-serif,宋体, PMingLiU,serif; font-size: 10.5pt; line-height: 1.5;

Excel作为一项的数据图表绘制软件,在工作中经常用到.“建议不可用于您所选择的数据这一错误提示,我也遇到了几次了,但是每次遇到总是忘了上次是什么原因.这次,写下博客记录.一般都是在复制网页或者其他数据时,会出现这种错误. 错误如下图: 查看选择的数据,如下所示: 看出错误在哪里了吗?这个问题困扰了我很久,网上查了很久,但是没有找到问题.但是,经过仔细观察,发现数据格式存在问题.如数字未对齐,但是这不是根本问题,在Excel里也看不到问题在哪,数字并没有什么不对. 那么,问题在哪里呢?把数据复制

由于经常需要涉及到TCGA数据的分析,我简单的整理了一下数据批量下载的文件后缀. cancer_name <- "SKCM" output_path <- paste0("/home/wang/Documents/课题/data/zip/", cancer_name) system(paste0("mkdir ", output_path)) axel_string <- paste0("axel -n 30 -o &

atitit.手动配置列表文件的选择and 数据的层次结构 attilax总结最佳实践--yaml 1. yaml是个好的选择.. 1 2. 数据的层次结构--结构:hash,list,和block literal. 1 3. yaml跟json的实现区别 1 4. xml的优点及json的问题 2 4.1. ide友好 2 4.2. JSON也适合与任何数据,复杂struts难以阅读 2 4.3. json难以手工维护 3 5. 基于YAML的开源项目解析YAML文件最常用的Java库是JvY

本文来自网易云社区. 关于如何选择BI数据可视化工具,总体而言,主流BI产品在选择的时候要除了需要考虑从数据到展现.从公司内到公司外等各种场景,结合前面朋友的回答,还需要考虑以下几点:1:以后的数据处理能力,是否能够在大批量,上亿条数据的情况下给出解决方案:2:BI的侧重点是不是和公司的需求匹配,如报表智能预警还是预测分析或者是数据挖掘:3:厂商的创新能力和迭代速度,因为BI发展太过迅速,没人想买一个产品刚刚部署用了好长时间没有更新的:4:移动办公支持能力:5:最重要的,厂商的服务水平,作为B端

http://blog.csdn.net/anzhsoft/article/details/39859463 当触发一个RDD的action后,以count为例,调用关系如下: org.apache.spark.rdd.RDD#count org.apache.spark.SparkContext#runJob org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler#runJob org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler#submit

  image Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a computational method that determines whether an a priori defined set of genes shows statistically significant, concordant differences between two biological states (e.g. phenotypes). 用GSEA做富集分析是非常简单的,结

Redis应该说是目前最受欢迎的NoSQL数据库之一了.Redis通常被作为缓存组件,用作缓存数据.不过,除了可以缓存数据,其实Redis可以做的事还有很多.下面列举几例,供大家参考. 1.最新列表 例如新闻列表页面最新的新闻列表,如果总数量很大的情况下,尽量不要使用select a from A limit 10,尝试redis的 LPUSH命令构建List,一个个顺序都塞进去就可以啦.不过万一内存清掉了咋办?也简单,查询不到存储key的话,用mysql查询并且初始化一个List到redis中

抓取摩拜单车API数据,并做可视化分析 纵聊天下 百家号|04-19 15:16 关注 警告:此篇文章仅作为学习研究参考用途,请不要用于非法目的. 摩拜是最早进入成都的共享单车,每天我从地铁站下来的时候,在APP中能看到很多单车,但走到那里的时候,才发现车并不在那里.有些车不知道藏到了哪里:有些车或许是在高楼的后面,由于有GPS的误差而找不到了:有些车被放到了小区里面,一墙之隔让骑车人无法获得到车. 那么有没有一个办法通过获得这些单车的数据,来分析这些车是否变成了僵尸车?是否有人故意放到小区里面

Hadoop基础-HDFS数据清理过程之校验过程代码分析 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 想称为一名高级大数据开发工程师,不但需要了解hadoop内部的运行机制,还需要掌握hadoop在写入过程中的报文分析.当然代码的调试步骤是一个开发必须得会的技能!想要掌握这三个技能,我们就可以拿HDFS写入过程来练练手,了解一下平时就几行的代码在它的内部是如何帮我们实现数据传输的. 一.Idea代码调试简介 1>.编写测试代码 /* @author :yinzhengjie

Wireshark数据抓包教程之认识捕获分析数据包 认识Wireshark捕获数据包 当我们对Wireshark主窗口各部分作用了解了,学会捕获数据了,接下来就该去认识这些捕获的数据包了.Wireshark将从网络中捕获到的二进制数据按照不同的协议包结构规范,显示在Packet Details面板中.为了帮助用户能够清楚的分析数据,本节将介绍识别数据包的方法. 在Wireshark中关于数据包的叫法有三个术语,分别是帧.包.段.下面通过分析一个数据包,来介绍这三个术语.在Wireshark中捕获

以下是对Ensembl突变数据库中储存的数据的描述,对于Ensembl数据库中不同的物种,我们从各种来源(例如,dbSNP数据库)导入突变数据(SNP.CNV.等位基因频率.基因型等),导入的突变数据和等位基因经过质量控制过程来标记可疑数据. 我们将突变分成几个不同的类,并计算突变的预测结果,并且我们还创建了突变集以帮助人们从特定数据集中检索特定突变体组. 我们计算了人类每个突变在种群中的连锁不平衡. 突变数据类型 Ensembl突变数据库储存了从外部导入的数据以及就算得来的数据. 外部导入的数

一.数据接收原理 二.源码分析 入口包org.apache.spark.streaming.receiver下ReceiverSupervisorImpl类的onStart()方法 ### override protected def onStart() { // 这里的blockGenerator很重要,和数据接收有关,其运行在worker的executor端负责数据接收后的一些存取工作,以及配合ReceiverTracker // 在Executor上,启动Receiver之前,就会先启动这

前几天尝试用loadrunner初试了一下性能测试,对于如何选择数据.生成数据后如何分析很是迷惑,刚刚翻看一篇网友的博客,很有条理,特此记录一下,以供参考 转自: http://liriguang.iteye.com/blog/684641 http://www.tuicool.com/articles/EBFryq 一.对于并发用户的数据选择 1.2.5.10.20.30.50.100.150.200.500.1000 二.压力测试结果的指标选择: 吞吐量.请求等待时间.请求处理时间 Time

一.SQL语句入门 1. SQL语句是和DBMS“交谈”专用的语句,不同DBMS都认SQL语法. 2. SQL语句中字符串用单引号. 3. SQL语句中,对于SQL关键字大小写不敏感,对于字符串值大小写敏感. 4. 创建表.删除表不仅可以手工完成,还可以执行SQL语句完成,在自动化部署.数据导入中用的很多,Create Table T_Person(Id int not NULL,Name nvarchar(50),Age int NULL).Drop Table T_Person1 5. 简单