手把手教你看KEGG通路图! 亲爱的小伙伴们,是不是正关注代谢通路研究?或者你正面对数据,绞尽脑汁?小编当然不能让亲们这么辛苦,今天就跟大家分享KEGG代谢通路图的正确解读方法,还在迷糊中的小伙伴赶紧mark起来吧~ 怎么看KEGG中代谢通路图? KEGG,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因和基因组百科全书,是系统分析基因功能,联系基因组信息和功能信息的知识库.其中包含有大量的通路图,如下图所示:   1.代谢通路中各种符号标识: 代谢通路图

SAP 同一个序列号可以同时出现在2个不同的HU里? 答案是可以的. 如下图示,HU 180141003288里的序列号11810010540121, 而序列号11810010540121已经出现在另外一个HU 180141003287里, 实际上,这2个HU都是在库状态(WHSE), SAP这么不严谨?这不是SAP的风格啊!不过细想一下,序列号并不与库存挂钩,只是一个文本信息而已.所以出现这种看起来不太靠谱的现象也就不足为怪了. 2019-06-05 写于苏州市.

文献名:Down-Regulation of a Male-Specific H3K4 Demethylase, KDM5D, Impairs Cardiomyocyte Differentiation 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:2019年12月 IF:3.78 单位:Shahid Beheshti医科大学等 一.概述: 除了决定性别,Y染色体上的基因充分表达对转录.翻译和蛋白质稳定性必不可少.本文作者观察到Y染色体上的KDM5D基因及其X染色体

北京时间2022年3月22日凌晨,<Nature>期刊在线刊登了由中国科学院广州生物医学与健康研究所等单位牵头,深圳市易基因科技有限公司.中国科学技术大学等单位参与,应用人多能干细胞向胚胎8细胞状态人工诱导的科研成果.深圳市易基因科技有限公司运用简化基因组甲基化测序.单细胞和微量细胞基因组DNA甲基化测序等技术,完成了研究中不同人工干预及细胞状态下的基因组DNA甲基化的时空动态变化. 图源Nature官网 论文中,研究者设计了一种非转基因.快速.可控的"细胞重编程"方法,将

目录 第1章源代码文件    1 1.1 研究思路    1 1.2 实验结果    3 1.3 #pragma setlocale    4 1.4 /source-charset    5 1.5 使用UTF-8字符串    6 1.5.1 /execution-charset    6 1.5.2 #pragma execution_character_set    7 1.5.3 u8    7 1.5.4 /utf-8和/validate-charset    8 1.6 总结    

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is

一.基础概念 字符与字节 字符是相对于人类而言的可识别的符号标识,是一种人类语言,如中文.英文.拉丁文甚至甲骨文.梵语等等.    字节是计算机内部识别可用的符号标识(0和1组成的二进制串,机器语言),属于机器语言.    人与计算机交互就需要在人类语言和机器语言之间来回转换,因此当把各种各样的字符存储或输入到计算机时,最终都必须以字节形式来表示:反之当计算机输出相应信息给人类用户时,最终也需要以人类可识别的字符形式来传递.    综上所述,字符与人类更为接近,而字节则与计算机(机器)更为接近.

http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)是一种生物信息学的计算方法,用于确定是否存在这样一个基因集,能在两个生物学状态中显示出显著的一致性的差异.表达谱数据里的基因数目众多,我们需要对基因进行功能注释,看哪些基因属于同一通路,以及该通路上的上调.下调情况,这就是富集分析了. 例如2019年4月在Cancer cell(PMID 30991027)上发表的一篇文章中有一张

目录 背景介绍 程序表示 初始化 (Initialization) Depth定义 Grow方法 Full方法 Ramped half-and-half方法 适应度(Fitness)与选择(Selection) Fitness & Fitness Function 选择 Selection 遗传算子Genetic Operators 交叉 Crossover 变异 Mutation 复制 Reproduction (Copy) 参考资料 (reference) 本篇博文提供了关于GP过程的总结型

很久很久以前,有一群人,他们决定用8个可以开合的晶体管来组合成不同的状态,以表示世界上的万物.他们看到8个开关状态是好的,于是他们把这称为"字节".再后来,他们又做了一些可以处理这些字节的机器,机器开动了,可以用字节来组合出很多状态,状态开始变来变去.他们看到这样是好的,于是它们就这机器称为"计算机". 开始计算机只在美国用.八位的字节一共可以组合出256(2的8次方)种不同的状态. 他们把其中的编号从0开始的32种状态分别规定了特殊的用途,一但终端.打印机遇上约定

前言 LZ77算法是无损压缩算法,由以色列人Abraham Lempel发表于1977年.LZ77是典型的基于字典的压缩算法,现在很多压缩技术都是基于LZ77.鉴于其在数据压缩领域的地位,本文将结合图片和源码详细介绍其原理. 原理介绍: 首先介绍几个专业术语. 1.lookahead buffer(不知道怎么用中文表述,暂时称为待编码区): 等待编码的区域 2. search buffer: 已经编码的区域,搜索缓冲区 3.滑动窗口: 指定大小的窗,包含“搜索缓冲区”(左) + “待编码区”(右

引言 图片处理在前端工作中可谓占据了很重要的一壁江山.而图片的 base64 编码可能相对一些人而言比较陌生,本文不是从纯技术的角度去讨论图片的 base64 编码.标题略大,不过只是希望通过一些浅显的论述,让你知道什么是图片的 base64 编码,为什么我们要用它,我们如何使用并且方便的使用它,并让你懂得如何去在前端的实际工作中运用它.    什么是 base64 编码? 我不是来讲概念的,直接切入正题,图片的 base64 编码就是可以将一副图片数据编码成一串字符串,使用该字符串代替图像地址

1.字符集及编码方式 概括:字符编码方式及大端小端 详细:彻底理解字符编码 可以通过Charset.availableCharsets()获取Java支持的字符集,以JDK8为例,得到其支持的字符集: SortedMap<String, Charset> charsets = Charset.availableCharsets(); System.out.println(charsets.size()); for (String key : charsets.keySet()) { Syste

知乎--http://www.zhihu.com/question/23374078 http://wenku.baidu.com/view/cb9fe505cc17552707220865.html 作者:于洋链接:http://www.zhihu.com/question/23374078/answer/69732605来源:知乎著作权归作者所有,转载请联系作者获得授权. =============很久以前保存的,别人写的但是很明了============= 很久很久以前,有一群人,他们决定

说明 天气预报API系列文章涉及到的天气网站10个左右,只发现了中国气象频道和腾讯天气城市代码参数特别: 暂且称 中国气象频道.腾讯天气使用的城市代码为 "新编码" 注:中国气象频道获取参数(json)接口:http://3g.tianqi.cn/getAllCitys.do 腾讯天气可从js中的变量查到:http://mat1.gtimg.com/weather/index2014/searchData_v2.js 010101 北京 北京 01010101 0101010101 昌

说明 2016-12-10 补充 (后来)偶然发现中国天气网已经有城市ID列表的网页...还发现城市编码有两种,暂且称中国天气网这些编码为旧标准"旧编码"的特征是 9个字符长度; 注:景点代码为12个字符长度 数据来自中国天气网非官方接口,由我来清洗.加工.共享. 北京 1 101010100 北京 北京2 101010200 北京 海淀3 101010300 北京 朝阳4 101010400 北京 顺义5 101010500 北京 怀柔6 101010600 北京 通州7 10101

说明 2016-12-09 补充 (后来)偶然发现中国天气网已经有城市ID列表的网页... 还发现城市编码有两种,暂且称中国天气网这些编码为旧标准 "旧编码"的特征是 9个字符长度 中国天气网(www.weather.com.cn)是中国气象服务网站的领先者,是中国气象局开展对外气象服务的权威网站,由中国气象局公共气象服务中心主办... 数据来自中国天气网非官方接口,由我来清洗.加工.共享. 数据格式说明: 省份 市/区 市(县/镇) 代码 吉林 通化 柳河 101060503 辉南

My Sql 大部分都是用绿色版(解压版) 然后注册服务 简单方便. 但是.配置文件头痛的一逼. 首先配置mysql的环境变量. mySQL 环境变量(我的电脑-右击属性-高级-环境变量) MYSQL_HOME(解压路径):E:\MYSQL\mysql-5.6.23-winx64 path:在最后面添加 ;%MYSQL_HOME%\bin 注意分号 不加环境变量CMD时会提醒不是内部外部命令. 楼主用的.5.6.23版本. my-default.ini内容如下 [mysqld]#skip-gra

http://blog.csdn.net/leixiaohua1020/article/details/25430449 本文介绍一个最简单的基于FFMPEG的音频编码器.该编码器实现了PCM音频采样数据编码为AAC的压缩编码数据.编码器代码十分简单,但是每一行代码都很重要.通过看本编码器的源代码,可以了解FFMPEG音频编码的流程. 本程序使用最新版的类库(编译时间为2014.5.6),开发平台为VC2010.所有的配置都已经做好,只需要运行就可以了. 流程(2014.9.29更新) 下面附一

详细请参考这篇博文 http://blog.csdn.net/dbzhang800/article/details/7540905 运行字符编码就是指,当你源代码写下const char* p = "我";的时候(不管源文件保存为什么编码格式,但标准规定源文件带bom utf8),编到二进制模块内的常量p的内容究竟是什么编码,GBK?UTF8?还是其他? C++根据编译器不同,有不同的行为: GCC可以使用编译参数指定 而MSVC是根据操作系统“非Unicode程序的语言”这个设置来编

本文介绍一个最简单的基于FFMPEG的视频编码器.该编码器实现了YUV420P的像素数据编码为H.264的压缩编码数据.编码器代码十分简单,可是每一行代码都非常重要,适合好好研究一下.弄清楚了本代码也就基本弄清楚了FFMPEG的编码流程.眼下我尽管已经调通了程序,可是还是有些地方没有全然搞明确,须要下一步继续探究然后补充内容. 本程序使用最新版的类库(编译时间为2014.5.6),开发平台为VC2010.全部的配置都已经做好,仅仅须要执行就能够了. 流程图(2014.9.29更新) 以下附一张使