1)Introduction DEXSeq是一种在多个比较RNA-seq实验中,检验差异外显子使用情况的方法. 通过差异外显子使用(DEU),我们指的是由实验条件引起的外显子相对使用的变化. 外显子的相对使用定义为: number of transcripts from the gene that contain this exon / number of all transcripts from the gene 大致思想:. For each exon (or part of an exon

[我的Segmentfault原文]https://segmentfault.com/a/1190000008030346 前言   JavaMail的使用本身并不难,网上有不少案例,简单易懂,而且有详细的中文注解.但是由于JavaMail的机制设置不够完善,特别是异常出错时的参考信息太少,给初学者造成了不少麻烦,而我就是其中之一.在此,把我遇到过得那些坑总结出来,以免大家重蹈覆辙,浪费时间.(注:后续还有遇到新的问题,我会持续更新到这里) 一.JavaMail概述   JavaMail是由Su

  在JDK的bin目录下有很多命令行工具: 我们可以看到各个工具的体积基本上都稳定在27kb左右,这个不是JDK开发团队刻意为之的,而是因为这些工具大多数是jdk\lib\tools.jar类库的一层薄包装而已,他们的主要功能代码是在tools类库中实现的.命令行工具的好处是:当应用程序部署到生产环境后,无论是直接接触物理服务器还是远程telnet到服务器上都会受到限制.而借助tools.jar类库里面的接口,我们可以直接在应用程序中实现功能强大的监控分析功能. 常用命令: 这里主要介绍如下几

我们常常会在新开的服搭建一个游戏的server,有时候要进行压力測试,那么怎样来看呢,一般我们会通过top命令查看各个进程的cpu和内存占用情况,获得到了我们的进程id,然后我们或许会通过pstack命令查看里边的各个线程id以及相应的线程如今正在做什么事情,分析多组数据就能够获得哪些线程里有慢操作影响了server的性能,从而得到解决方式. 比方这种以组数据: [root@AY130816144542124256Z bin]# pstack 30222 Thread 9 (Thread 0x7

最近在使用kafka,过程中遇到了一些疑问,在查阅了一些资料和相关blog之后,关于手动提交offset的问题,做一下总结和记录. 消费端手动提交offset代码如下: /** * 这是手动提交的消费方式 * @param record * @param ack * @throws Exception */ @KafkaListener(topics = TopicConstants.COMMON_PAY,groupId = "写自己的消费组 id") public void list

1.环境介绍 测试环境 SQL2005 测试数据 200W条 2.环境准备 2.1建表 CREATE TABLE [dbo].[Depratments](         [Dep_id] [int] NOT NULL,         [Dep_name] [varchar](50) COLLATE Chinese_PRC_CI_AS NOT NULL ) ON [PRIMARY] 2.2创建数据 create procedure ins_Depratments as         decl

2009年,W3C提出了一种新的方案----Flex布局,可以简便.完整.响应式地实现各种页面布局.目前,它已经得到了所有浏览器的支持,这意味着,现在就能很安全地使用这项功能. 通过笔者大量实践,发现flex布局屡试不爽,尤其在移动端自适应方面.但处于其大量的属性记忆混乱,今天图文并茂梳理如下. 语法及概念部分 实例演示部分 结合笛卡尔坐标系(仅考虑一个item情况,其它情况可以据此的排列组合实现) css部分 /*骰子的布局*/ .box { display: flex; width: 50p

有日志 1.log,部分内容如下: 112.111.12.248 – [25/Sep/2013:16:08:31 +0800]formula-x.haotui.com“/seccode.php?update=0.5593110133088248″ 200″http://formula�x.haotui.com/registerbbs.php” “Mozilla/4.0 (compatible; MSIE 6.0; Windows NT 5.1;SV1;)”61.147.76.51 – [25/S

题目要求 有日志 1.log,部分内容如下: 112.111.12.248 – [25/Sep/2013:16:08:31 +0800]formula-x.haotui.com"/seccode.php?update=0.5593110133088248″ 200″http://formula�x.haotui.com/registerbbs.php" "Mozilla/4.0 (compatible; MSIE 6.0; Windows NT 5.1;SV1;)"

[sql] view plain copy ---查看现在所有的事务 select '正在运行事务的会话的 ID'=session_id, --session_id与transaction_id的对应关系 '事务的 ID'=transaction_id, '正在处理事务的会话中的活动请求数'=enlist_count, then '事务由用户请求启动' then '系统事务' end, then '分布式事务或登记的绑定会话事务' then '本地事务' end, then '非登记的分布式事务

<ignore_js_op> 数读|中国的经济只剩下房地产了么? 引言: 近日一则标题为“房奴们又立功啦,7月份新增贷款几乎都来自房贷!”的报道吸引了大众的目光.该报道指出在央行8月13日公布的7月份金融数据中,房贷几乎占据了全部贷款,7月份人民币贷款为4636亿元,而房贷却占了4575亿元.知名政经评论员雷思海对此评论到:这种局面如果不得到控制的话,房地产恐怕最终成为毁掉中国经济的洪荒之力.那么到底是什么推动了房贷的激增呢?除了政策上的影响,银行加大对居民住房按揭贷款的投入,还有一个重要的推

RNA-seq差异表达基因分析之TopHat篇 发表于2012 年 10 月 23 日 TopHat是基于Bowtie的将RNA-Seq数据mapping到参考基因组上,从而鉴定可变剪切(exon-exon splice junctions). 安装 最简单的安装方法,注意版本 下载Bowtie.TopHat.Cufflinks的二进制发布包,解压到相同的目录 下载samtools,make,将生成的可执行samtools程序也cp到同一个目录 增加该目录到PATH 参数与使用 Usage: t

一.生存分析(survival analysis)的定义 生存分析:对一个或多个非负随机变量进行统计推断,研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科. 生存分析:既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法,并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息,对生存时间的分布特征进行描述,对影响生存时间的主要因素进行分析. 生存分析不同于其它多因素分析的主要区别点:生存分析考虑了每个观测出现某一结局的时间长短. 应用场景 什么是生存?生存的意义很广泛,它可以指人或动物的存活(相对于死亡),可以是患者的病情正

此文已由作者张耕源授权网易云社区发布. 欢迎访问网易云社区,了解更多网易技术产品运营经验. 日常工作生活中大家在维护自己的服务器.VPS有时会碰到这样的情况:服务器上突然出现了许多来自未知ip的网络连接与流量,我们需要第一时间切断这些可能有害的网络连接.除了iptables/ipset, blackhole routing这些常规手段,我们还可以借助一些更轻量级的小工具来临时处理这些情况,如tcpkill. tcpkill使用简介 tcpkill是一个网络分析工具集dsniff中的一个小工具.在

火山图 Volcano plot 在统计学上,火山图是一种类型的散点图,被用于在大数据中快速鉴定变化.由于它的形成像火山喷发的样子,所以被称为火山图.和上文讲的曼哈顿图类似.   火山图基本元素 火山图也有很多种样式,在生物学高通量测序结果中,常见有的X和Y轴分别为aboundance 和 fold-change,或p-value和fold-change两种样式.如上图中为p-value versus fold-change的样式,,先此为例进行图中基本元素解读: - X轴:通常为两组基因表达或

在早期的.NET Framework程序员心里,重定向Redirect其实分为两种: Response.Redirect: Response对象的Redirect方法提供了一种实现客户端重定向的方法 Server.Transfer: Server对象的Transfer方法使用服务器执行重定向,并避免HTTP请求 关键区别是发生转移的地方: Client Redirect vs Server Redirect Response.Redirect方法的默认行为:当前页面暂停执行,并向浏览器发送302

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Java中try catch finally语句中含有return语句的执行情况(总结版) 有一点可以肯定,finally块中的内容会先于try中的return语句执行,如果finall语句块中也有return语句的话,那么直接从finally中返回了,这也是不建议在finally中return的原因.下面来看这几种情况. 情况一(try中有return,finally中没有return): public class TryTest{ public static void main(String