手把手教你看KEGG通路图! 亲爱的小伙伴们,是不是正关注代谢通路研究?或者你正面对数据,绞尽脑汁?小编当然不能让亲们这么辛苦,今天就跟大家分享KEGG代谢通路图的正确解读方法,还在迷糊中的小伙伴赶紧mark起来吧~ 怎么看KEGG中代谢通路图? KEGG,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因和基因组百科全书,是系统分析基因功能,联系基因组信息和功能信息的知识库.其中包含有大量的通路图,如下图所示:   1.代谢通路中各种符号标识: 代谢通路图

参考: 转录组文章的常规套路 文章解读:<Science>小麦转录组研究文章 转录组数据饱和度评估方法 Paper这个东西是多么的诱人,可以毕业,可以评职称,可以拿绩效. 现在的文章都是有套路的,也不能说是水文,但大多是一个模式下的产物,真正有价值的好文其实是少之又少的. 大部分的Paper都是八股文,只需要填词就好了. Transcriptome analysis of leaves, roots and flowers of Panax notoginseng identifies gen

KEGG数据库的使用方法与介绍 KEGG的数据 KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系:基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图:另外 KEGG中有一个“专有名词”KO(KEGG Orthology),它是蛋白质(酶)的一个分类体系,序列高度相似,并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组,然后打上KO(或K)标签.下面就首先来讲一下KEGG orthology. 任找一个

随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜.通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,阐明不同层次多基因协同作用的机理,进而在人类重大疾病如癌症.心血管疾病的发病机理.诊断治疗.药物开发等方面的研究发挥巨大的作用.它将大大推动人类结构基因组及功能基因组的各项基因组研究计划.生物信息学在基因组

[转http://tqmeng.blog.163.com/blog/static/169263916201162002414612/]SAP ATP邏輯可用性檢查1.可用性檢查群組OVZ2主要用於檢查類型,如可以按日需求.個別需求.周需求.批量需求進行檢查,可以根據需要進行定義,SAP標準01為每日需求.02為個別需求.CH為批量需求:一般最常用02,這裡不多做解釋.2.可用性檢查控制OVZ9檢查控制實際上是通過檢查規則檢查,檢查規則裡面的參數決定了不同的檢查方法,檢查規則是檢查群組層面的,所以

高精度 a.加法 b.减法 c.乘法(应该只会有高精乘单精)                                d.高精度除单精                 (后面c,d考的可能性较小,应该只考a,b) 排序算法 a.选择排序 b.插入排序 c.hash排序 d.归并排序(单纯的排序可能用不到,有快排就行了,但是归并排序的思想很重要) e.堆排序 f.快排 字符串匹配算法 a.蛮力法 b.KMP 数论 a.欧几里德算法(用辗转相除法求最大公约数) b.扩展欧几里德算法 ax+by

參考博客文章http://www.cnblogs.com/kebixisimba/category/130432.html http://www.cnblogs.com/qqlin/tag/Unity/ 依赖注入容器Unity Application Block快速入门 http://www.cnblogs.com/zjypp/archive/2011/07/08/2319268.html http://www.cnblogs.com/doriandeng/category/123100.htm

首先来一张图,很直观(截止到2012年数据) 下面是收集的一些,我改了一下 红色加粗表示特别重要,必须掌握 绿色加粗表示最好掌握,可能性不是很大,但是某些可以提高程序效率 高精度 a.加法 b.减法 c.乘法(应该只会有高精乘单精)                                d.高精度除单精                 (后面c,d考的可能性较小,应该只考a,b) 排序算法 a.选择排序 b.插入排序 c.hash排序 d.归并排序(单纯的排序可能用不到,有快排就行了,但

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Java到 底 是 一 种 什 么 样 的 语 言 呢? Java是 一 种 简 单 的 面 象 对 象 的 分 布 式 的 解 释 的 健 壮 的 安 全 的 结 构 中 立 的 可 移 植 的 性 能 很 优 异 的 多 线 程 的 动 态 的 语 言. [1]    简 单 Java最 初 是 为 对 家 用 电 器 进 行 集 成 控 制 而 设 计 的 一 种 语 言, 因 此 它 必 须 简 单 明 了.Java语 言 的 简 单 性 主 要 体 现 在 以 下 三 个 方 面: 1

1.预定定义特性之一:AttributeUsage AttributeUsage有三个属性: 第一个属性:ValidOn 规定特性可被放置的语言元素,默认是AttributeTargets.All.

文献名:Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of diosgenin against cerebral ischemia reperfusion effects(大脑的定量蛋白质组学揭示了薯蓣皂苷元对脑缺血再灌注效应的分子机制) 期刊名:J. Proteome Res 发表时间:(2020年3月) IF:3.78 (2018) 单位: 西安交通大学 中科院

针对截取字符串出现中文乱码问题,网上有很多介绍,也有很多函数,但笔者看着网上的函数,总感觉有点别扭, 所以自己动手写了一个防止截取字符串时出现中文乱码的函数. 实现的原理还是比较简单,主要是利用ASCII编码和中文编码的二进制范围不一致而把它们区分开来,然后,通过substr()截取字符串的函数实现的. 下面给出我写的代码,注意:我这里只针对utf-8编码,其他编码,看官可以自己手动改一下函数,以便支持其他的编码. <?php header('content-type:text/html;cha

参考博文: centos安装memcached 源码安装 Yum安装Memcache Memcached内存分配优化及使用问题 <转>php+memcached 实现session共享 PHP如何将session保存到memcached中?如何分布式保存PHP session    这个参考价值高 centos系统为php安装memcached扩展 参考价值很高 session多机共享双向备份参考博文(很好):Repcached实现Memcached主从复制功能 一.安装Memcache 1.

微信小程序最近比较热门,再加上自然语义理解也越来越被人关注,于是我想赶赶潮流,做一个小程序试试.想来想去快递查询应该是一种比较普遍的需求. 如果你也在通过自然语言接口做点什么,希望我的这篇博客能帮到你.我建了一个QQ群656580961,感兴趣的朋友可以加入互通有无.或者你也可以直接下载代码试一试. 用微信扫描下面的二维码可以直接测试小程序 也可以通过关注下面的公众号,点解工具使用小程序 ----------------功能介绍: 我的小程序名字叫"智能生活宝"------------

这个qq的oauth2.1有个坑,坑了我半天,后来查了不少资料总算弄通了,现在把详细步骤记录下来. 步骤一.登陆http://connect.qq.com/     步骤二.创建应用.我创建的是wenwutest这个应用.具体的创建如下图所示:     要特别注意这个回调地址.首先这个回调地址必须与网站地址的根域名写的一样(http://m.mumayi.com),其次,这里写的这个地址一定是登陆成功后回调的地址.不能再像oauth2.0那样再写个根域名就可以了,我这里就掉在这个坑里半天.  

WebSocket项目笔记 1. What is WebSocket? (以下内容来源于百度百科) WebSocket是一种在单个TCP连接上进行全双工通信的协议 WebSocket使得客户端和服务器之间的数据交换变得更加简单,允许服务端主动向客户端推送数据. 在WebSocket API中,浏览器和服务器只需要完成一次握手,两者之间就直接可以创建持久性的连接,并进行双向数据传输. 背景: 推送技术的演进发展:轮询 ---> Comet ---> WebSocket 握手协议: WebSock

主要内容数据结构: 1.二叉搜索树 一棵二叉树,对于包括根节点在内的节点,所有该节点左儿子比此节点小,所有该节点右儿子比该节点大,(感觉好像二分...) 每个节点包含一个指向父亲的指针,和两个指向儿子的指针.如果没有则为空.每个节点还包含一个key值,代表他本身这个点的权值 常用操作: 插入一个数,删除一个数,询问最大/最小值,询问第k大值. 插入操作: 现在我们要插入一个权值为x的节点.为了方便,我们插入的方式要能不改变之前整棵树的形态.首先找到根,比较一下key[root]和x,如果key[

如何判断 Linux 服务器是否被入侵? w-last-history top-lsof-strace netstat CPU利用率很高 800%爆了 netstat find 文件 查/etc/rc.local有无变化 查异常文件,mv reboot 改密码 备份数据 iowait高?cpu100? 用户反应网站打开慢排查思路? 路通不(ping/traceroute)-->丢包排查机房线路-->查服务(telnet/cur)-->查带宽/浏览器调试-->查db/存储 - **1

RNA-seq这个工具该什么时候用?ATAC-seq该什么时候用?有相当一部分项目设计不行,导致花大钱测了一些没有意义的数据. 还是在中心法则这个框架下来解释,这是生物信息的核心.打开华大科技服务官网梳理一下现在到底都有些什么测序技术: 全基因组测序和重测序 - 组装以及寻找变异 (外显子和目标区域测序) RNA-seq测序 - 基因表达 (smRNA,lncRNA,circRNA,PB全长,可变剪切) 甲基化测序 ChIP-seq和ATAC-seq 蛋白组 - 所有蛋白的变化 代谢组 - 植物

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is