众所周知,全基因组关联分析(GWAS)发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点1)要么调控基因表达(eQTL); 2)要么影响增强子活性; 3)要么影响转录因子(TF)结合特异性; 4)要么啥也不是. 针对以上四种情况: 1)是否调控基因表达(eQTL)可通过GTEx(https://gtexportal.org/home/)查询. 2)是否影响增强子活性可通过之前的推文查询:感兴趣的SNP/区域上是否有增强子/转录因子?增强子/转录因子调控哪个靶基因?(EnhancerDB) 3)是否影响

是单核苷酸多态性,人的基因是相似的,有些位点上存在差异,这种某个位点的核苷酸差异就做单核苷酸多态性,它影响着生物的性状,影响着对某些疾病的易感性.SNPedia是一个SNP调査百科,它引用各种已经发布的文章,或者数据库信息对SNP位点进行描述,共享着人类基因组变异的信息.我们可以搜索某个SNP位点来寻找与之相关的信息,也可以根据相关疾病,症状来寻找相关的SNP. 初次使用SNPedia   SNPedia主页网址为http://snpedia.com/index.php/SNPedia,比如我想

Finding Enriched Motifs in Genomic Regions (findMotifsGenome.pl) 在指定区域做motif enrichment,大大降低了假阳性. MEME也可以做,但是设定更加复杂. 转录因子的表达具有高度的组织特异性,而且已知的TF只有1000多个,基因有30000多个,所以一个TF的靶基因可能有几百个,而且具有高度的时空组织特异性. 实验的方法就不说了,可靠.成本高.耗费劳力. 以下只说高通量数据的预测方法. 最简单的预测就是基于基因表达,c

ORF和CDS的区别 ORF的英文展开是open reading frame(开放阅读框). CDS的英文展开是coding sequences (编码区). CDS:DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列,不考虑mRNA加工等过程中的序列变化,总之,就是与蛋白质的密码子完全对应. ORF:理论上的氨基酸编码区,一般是在分析DNA核酸图谱中(主要是利用电脑程序)得到的.程序会自动在DNA

研究可以做得很浅,查查genecard数据库,从数据库里找找motif,用工具跑跑target gene,构建一下基因调控网络GRN. 研究也可以做得很深,了解一个物种里面有哪些transcription factor families,这些转录因子各自是如何发挥作用的,这些家族是如何归类的,各自有什么特性. TRANSCRIPTION FACTORS: Structural Families and Principles of DNA Recognition[非常古老的综述1992年,也非常有

到底什么是eQTL? eQTL和QTL之间有什么联系?为什么说QTL比eQTL难很多? QTL和GWAS有什么关系? GTEx数据库里的eQTL数据如何利用? 说eQTL之前必须先解释QTL,QTL,一说到中文名就清楚了,数量性状位点,就是一个性状,比如身高,会由成百上千个基因来决定,目的简单明确,那么我们如何找到这些位点呢? Quantitative Trait Locus (QTL) Analysis - 来自nature的介绍 实现层面,其实研究的不是基因,而是染色体上的区段,更明确的说就

Kafka 是一个高度可扩展的分布式消息系统,在实时事件流和流式处理为中心的架构越来越风靡的今天,它扮演了这个架构中核心存储的角色.从某种角度说,Kafka 可以看成实时版的 Hadoop 系统.Hadoop 可以存储和定期处理大量的数据文件,而 Kafka 可以存储和持续处理大型的数据流. Hadoop 和文件系统提供文件流的读取位点( offset ),并支持通过 seek 方法将文件流移动到特定位置:Kafka 对应的提供了主题下每个分区的消费位点( offset ),并允许消费者设置分区

Alink漫谈(十九) :源码解析 之 分位点离散化Quantile 目录 Alink漫谈(十九) :源码解析 之 分位点离散化Quantile 0x00 摘要 0x01 背景概念 1.1 离散化 1.2 分位数 1.3 四分位数 0x02 示例代码 0x03 总体逻辑 0x04 训练 4.1 quantile 4.2 countElementsPerPartition 4.3 MultiQuantile 4.4 QIndex 0x05 输出模型 0x06 预测 6.1 加载模型 6.2 预测

上一篇零散地罗列了看源码时记录的一些类的信息,这篇完整介绍一个作业流在Azkaban中的执行过程,希望可以帮助刚刚接手Azkaban相关工作的开发.测试. 一.Azkaban简介 Azkaban作为开源的调度系统,在大数据中有广泛地使用.它主要有三部分组成:Azkaban Webserver.Azkaban Executor. DB. 图1 Azkaban架构 图1所示的是Azkaban的基本架构:Webserver主要负责权限验证.项目管理.作业流下发等工作:Executor主要负责作业流/作

看完SQL Server 2014 Q/A答疑集锦:想不升级都难! 转载自:http://mp.weixin.qq.com/s/5rZCgnMKmJqeC7hbe4CZ_g 本期嘉宾为微软技术中心技术架构师韩凯(社区ID:Chris_Han0015),主要负责大数据和云计算领域.在美国取得系统工程硕士学位后,服务于华尔街主要银行与金融机构.从事流程再造与创新与商务智能方案设计实施. IT名人堂栏目对微软技术中心技术架构师韩凯进行了独家访谈,揭秘了SQL Server 2014不可不知的那些事儿.

现在最热门的前端框架有AngularJS.React.Bootstrap等.自从接触了ReactJS,ReactJs的虚拟DOM(Virtual DOM)和组件化的开发深深的吸引了我,下面来跟我一起领略ReactJs的风采吧~~ 文章有点长,耐心读完,你会有很大收获哦~  一.ReactJS简介 React 起源于 Facebook 的内部项目,因为该公司对市场上所有 JavaScript MVC 框架,都不满意,就决定自己写一套,用来架设 Instagram 的网站.做出来以后,发现这套东西很

摘要 : 最近在博客园里面看到有人在讨论 C# String的一些特性. 大部分情况下是从CODING的角度来讨论String. 本人觉得非常好奇, 在运行时态, String是如何与这些特性联系上的. 本文将侧重在通过WinDBG来观察String在进程内的布局, 以此来解释C# String的一些特性. 问题 C# String有两个比较有趣的特性. String的恒定性. 字符串横定性是指一个字符串一经创建,就不可改变.那么也就是说当我们改变string值的时候,便会在托管堆上重新分配一块

写在前面 阅读目录: 具体业务场景 业务需求变化 "愚蠢"的应对 消息列表实现 消息详情页实现 消息发送.回复.销毁等实现 回到原点的一些思考 业务需求变化,领域模型变化了吗? 对象读取的额外思考 写在最后 领域驱动设计的核心-Domain Model(领域模型),这个大家都知道,可是,上次关于领域模型的设计分享,要追溯到两个月之前了,这中间搞了一些有的没有的东西,比如纠结于仓储等,说这些东西不重要,其实也蛮重要的,因为它是一个完整应用程序所必须要考虑的东西(Demo 除外),但是相对

在知乎上看到这篇文章讲得确实挺好,从头看到尾都非常形象生动,一口气看完,没有半点模糊,非常不错,所以推荐给大家,非常值得一读. 作者:Ovear链接:https://www.zhihu.com/question/20215561/answer/40316953来源:知乎 一.WebSocket是HTML5出的东西(协议),也就是说HTTP协议没有变化,或者说没关系,但HTTP是不支持持久连接的(长连接,循环连接的不算)首先HTTP有1.1和1.0之说,也就是所谓的keep-alive,把多个HT

以前学习渗透时,虽然也玩过万能密码SQL注入漏洞登陆网站后台,但仅仅会用,并不理解其原理. 今天学习c#数据库这一块,正好学到了这方面的知识,才明白原来是怎么回事. 众所周知的万能密码SQL注入漏洞,大家相信很熟悉了. 不懂得简单了解下,懂的大牛直接飘过即可. ***************************************************************************** 当我们用御剑之类的扫描器扫描到某些有这个万能密码SQL注入的漏洞网站后台后, 打开

前言 2016年9月22日凌晨,微信官方通过“微信公开课”公众号发布了关于微信小程序(微信应用号)的内测通知.整个朋友圈瞬间便像炸开了锅似的,各种揣测.介绍性文章在一夜里诞生.而真正收到内测邀请的公众号据说只有200个. 虽然内测名额十分稀少,但依赖中国广大开发者的破解和分享精神,在网络上很快出现了开发工具的破解版本和API文档.然而可能是微信的妥协或者早已预料,9月24日微信官方发布了不需要破解就可以使用的微信小程序开发者工具和文档,对于费劲心思破解完的开发者来说应该瞬间整个人都不好了. 以下

原文链接:https://github.com/AlloyTeam/AlloyTouch/wiki/kandian 先验货 访问DEMO你也可以点击这里 源代码可以点击这里 如你体验所见,流程的滚动的同时还能支持头部的动画?不断地加载新数据还能做到流畅的滑动!怎么做得的?使用AlloyTouch CSS 0.2.0及以上版本便可! 头部动画 加载更多 实现代码 var infoList = document.getElementById("infoList"), mockHTML =

前言: 虽说网上有太多的Android课程,但是大多都是视频,有Android在线开发环境的几乎没有,但是对于学习Android的人来说拥有在线的Android开发环境是非常好的,可以随时动手操作学习Android开发,及时了解自己的掌握情况! 实验楼就提供了Android在线开发环境,你不需要本地搭建Android开发环境,打开浏览器就可以进行Android开发的学习~ 可以随便折腾!!而且边看边动手操作,可以更快上手Android开发. Android开发在线环境 项目介绍: 项目一:[SQ

去年参加几次技术沙龙时,我注意到一个有意思的现象:与之前大家统一接受的换名片不同,有些人并不愿意被添加微信好友--"不好意思,不熟的人不加微信". 这个现象之所以有意思,是因为名片暴露的个人信息似乎更多:所在公司.职位.电话.邮件等等;相反,微信只暴露一个账号.如果是从隐私角度考虑,能接受换名片就应当能接受加微信.但不愿意加微信,恰恰也是从隐私的角度出发的,因为不愿意被打扰. 所以不加微信的原因,是"隐私"之外另一重考虑:不愿意跟你发生某种形式的联系. 所谓&quo

作为前端开发人员,对于我们的站点或应用的缓存机制我们能做的似乎不多,但这些却是与我们关注的性能息息相关的部分,站点没有做任何缓存机制,我们的页面可能会因为资源的下载和渲染变得很慢,但大家都知道去找前端去解决页面慢的问题而不会去找服务端的开发人员.因此,了解相关的缓存机制和充分的利用它似乎就变得必不可少. web端的缓存机制其实有多种,我在这里只是学习和整理了以浏览器为载体的HTTP缓存机制,看看它是如何工作的. 文章目录: 一.web缓存的种类 二.为什么需要浏览器缓存?我们需要做些什么? 三.