1.下载安装bcftools. 2.准备样本ID文件,这里命名为samplelistname.txt,一个样本一行,如下所示: sample1 sample2 sample3 3.输入命令: bcftools view -S samplelistname.txt /1000genomes/ALL.chr16.phase3_shapeit2_mvncall_integrated_v5a.20130502.genotypes.vcf.gz -Ov > samplelist_1000Genomes.v

1. 如果你只想看文件的前5行,可以使用head命令,如: head -5 /etc/passwd 2. 如果你想查看文件的后10行,可以使用tail命令,如: tail -2 /etc/passwd 或 tail -n 2 /etc/passwd tail -f /var/log/messages 参数-f使tail不停地去读最新的内容,这样有实时监视的效果,用Ctrl+c来终止! 3. 查看文件中间一段,你可以使用sed命令,如: sed -n '5,10p' /etc/passwd 这样你

head 命令 读取文件的前n行 默认查看文件的前十行 head /etc/passwd # 默认查看文件的前十行 /etc/passwd # 查看文件的前两行

默认查看文件的后10行 -n 3 数字   也可以忽略-n 直接加数字 tail 3 查看文件后3行 [root@localhost ~]# tail /etc/passwd // 默认查看文件的后十行 [root@localhost ~]# /etc/passwd // 查看文件的后三行 [root@localhost ~]# tail -f /var/log/messages // 动态查看文件内容 [root@localhost ~]# /etc/passwd //查看文件的最后10行,动

tail命令 查看文件尾部  用于查看日志 默认查看文件的后10行 -n 3 数字   也可以忽略-n 直接加数字 tail 3 查看文件后3行 [root@localhost ~]# tail /etc/passwd // 默认查看文件的后十行 [root@localhost ~]# /etc/passwd // 查看文件的后三行 [root@localhost ~]# tail -f /var/log/messages // 动态查看文件内容 [root@localhost ~]# /etc

文件内容rolling.txt: There's a fire starting in my heart 我怒火中烧 Reaching a fever pitch and it's bringing me out the dark 熊熊烈焰带我走出黑暗 Finally, I can see you crystal clear 最终 我将你看得一清二楚 Go ahead and sell me out and I'll lay your ship bare 去吧 出卖我 我会让你一无全部 See

需求描述: 今天看了一个系统的临时文件,有5.6G的大小,这个文件也没有用了,想要将大部分的文件都删除掉. 在此记录下删除的过程.删除前n行的记录. 操作过程: 对于数据量比较大的情况(本例5800万) 1.通过tail命令,将文件尾部的n行数据重定向到新的文件中 out.tmp > out.tmp.bak 2.然后删除旧的文件,将新的文件修改为原名字 rm out.tmp mv out.tmp.bak out.tmp 备注:这样的话文件out.tmp尾部的30000行就保存下来,之前的行就删除

需求描述: 今天看了一个系统的临时文件,有5.6G的大小,这个文件也没有用了,想要将大部分的文件都删除掉. 在此记录下删除的过程.删除前n行的记录. 操作过程: 对于数据量比较大的情况(本例5800万行) 1.通过tail命令,将文件尾部的n行数据重定向到新的文件中 tail -n 30000 out.tmp > out.tmp.bak 2.然后删除旧的文件,将新的文件修改为原名字 rm out.tmp mv out.tmp.bak out.tmp 备注:这样的话文件out.tmp尾部的3000

随机返回指定行数的样本数据hadoop fs -cat /test/gonganbu/scene_analysis_suggestion/* | shuf -n 5返回前几行的样本数据hadoop fs -cat /test/gonganbu/scene_analysis_suggestion/* | head -100返回最后几行的样本数据hadoop fs -cat /test/gonganbu/scene_analysis_suggestion/* | tail -5查看文本行数hadoo

输入vim test.sh 新建后缀sh的文件,效果如下: 具体/etc/vimrc配置为: if expand("%:e") == 'sh'  call setline(1,"#!/bin/bash") call setline(2,"#") call setline(3,"#*************************************") call setline(4,"#Author: hushu

import java.util.Scanner;public class yanghui{ public static void main(String[] args){  Scanner sc=new Scanner(System.in);  System.out.println("\nPlease enter the number of Yang Hui triangle rows:");  int n=sc.nextInt();  int [][]a=new int [n][]

实例cat logt.log|sort -s -t '-' -k1n |awk '{print $1;}'|uniq -c|sort -k1nr|head -100 统计文件中出现次数最多的前10个单词 使用linux命令或者shell实现:文件words存放英文单词,格式为每行一个英文单词(单词可以重复),统计这个文件中出现次数最多的前10个单词. cat words.txt | sort | uniq -c | sort -k1,1nr | head -10 主要考察对sort.uniq命令

[一]显示文件前几行 ll -lrth:按照更改时间倒序排列,最新文件在下边 ll -lrSh:按照文件大小倒序排列,最大文件在下边 grep --color :高亮查询关键字 grep -A 10 xxx : 显示关键字后10行,查异常栈时很有用 grep -B 10 xxx : 显示关键字前10行 grep -C 10 xxx : 显示关键字前后10行 grep -i :不区分大小写 egrep ‘aaa|bbb’:可以统计aaa或bbb的结果,egrep基本等价 grep -E [1]从第

1.使用linux命令或者shell实现:文件words存放英文单词,格式为每行一个英文单词(单词可以重复),统计这个文件中出现次数最多的前10个单词 主要考察对sort.uniq命令的使用,相关解释如下,命令及参数的详细说明请自行通过man查看,简单介绍下以上指令各部分的功能: sort:  对单词进行排序 uniq -c:  显示唯一的行,并在每行行首加上本行在文件中出现的次数 sort -k1,1nr:  按照第一个字段,数值排序,且为逆序 sort -nr-n:按照数值的大小排序-r:以

做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools-1.5 一.根据个体提取子集 根据样品名提取vcf文件,准备要保留的个体名文件 keep.list,一行一个个体(参考第三步). 无痛处理,速度超快,命令如下: 1 bcftools view -S keep.list test.vcf >sub_indv.vcf 二.根据染色体位置提取子集 注意

需求: txt.dat.csv文件很大,需要花很长的时间打开, 但实际上我们只需要查看文件的前几行,查看数据的内容和格式 exe & code :  https://github.com/congmingyige/preRead-first-few-lines-txt-dat-csv- 展示:

博主推荐:获取更多 linux文件内容查看命令 收藏:linux命令大全 tail命令用于输入文件中的尾部内容.tail命令默认在屏幕上显示指定文件的末尾10行.如果给定的文件不止一个,则在显示的每个文件前面加一个文件名标题.如果没有指定文件或者文件名为“-”,则读取标准输入. 注意:如果表示字节或行数的N值之前有一个”+”号,则从文件开头的第N项开始显示,而不是显示文件的最后N项.N值后面可以有后缀:b表示512,k表示1024,m表示1 048576(1M). 语法 tail(选项)(参数)

linux下获取占用CPU资源最多的10个进程,可以使用如下命令组合: ;|head linux下获取占用内存资源最多的10个进程,可以使用如下命令组合: ;|head 命令组合解析(针对CPU的,MEN也同样道理): ps aux|head -1;ps aux|grep -v PID|sort -rn -k +3|head 该命令组合实际上是下面两句命令: ps aux|head -1 ps aux|grep -v PID|sort -rn -k +3|head 可以使用一下命令查使用内存最多

在实际工作中,我们可能根据某种排序后,只需要显示前多少条数据,此时就需要根据不同的数据库,使用不同的关键字 一.SQL Server/Access select top 数量/百分比 from table 如: select top 10 from ticket---返回ticket表中的前10行数据 select top 10 from ticket where name='测试'---返回ticket表中,name为测试的前10行数据 select top 10 from ticket or

下载安装bcftools 见如下命令: bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800000.vcf 注意:输入的vcf以gz格式存在,不然会报错:Failed to open 1000Genomes.vcf: not compressed with bgzip 如何将vcf生成gz格式,见这篇文章bcftools将vcf生成bgzip和index格式 如果只想提取指定位置(specifi

du命令 计算出单个文件或者文件夹的磁盘空间占用 -a或--all:包含全部的文件系统: --block-size=<区块大小>:以指定的区块大小来显示区块数目: -h或--human-readable:以可读性较高的方式来显示信息: -H或--si:与-h参数相同,但在计算时是以1000 Bytes为换算单位而非1024 Bytes: -i或--inodes:显示inode的信息: -k或--kilobytes:指定区块大小为1024字节: -l或--local:仅显示本地端的文件系统: -