曼哈顿图,QQ plot 图,膨胀系数

2024-11-03

GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）

画曼哈顿图和QQ plot 首推R包“qqman”,简约方便.下面具体介绍以下. 一.画曼哈顿图 install.packages("qqman") library(qqman) 1.准备包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults(如果没有zscore可以不用管),如下所示: 2.上代码,如下所示: manhattan(gwasResults) 如果觉得不够美观,考虑添加一下参数: manhattan(gwasResults, main = "Manhat

Q-Q图和P-P图

一. QQ图分位数图示法(Quantile Quantile Plot,简称 Q-Q 图) 统计学里Q-Q图(Q代表分位数)是一个概率图,用图形的方式比较两个概率分布,把他们的两个分位数放在一起比较.首先选好分位数间隔.图上的点(x,y)反映出其中一个第二个分布(y坐标)的分位数和与之对应的第一分布(x坐标)的相同分位数.因此,这条线是一条以分位数间隔为参数的曲线.如果两个分布相似,则该Q-Q图趋近于落在y=x线上.如果两分布线性相关,则点在Q-Q图上趋近于落在一条直线

一个简单的QQ隐藏图生成算法通过jQuery和C#分别实现对.NET Core Web Api的访问以及文件上传

一个简单的QQ隐藏图生成算法隐藏图不是什么新鲜的东西,具体表现在大部分社交软件中,预览图看到的是一张图,而点开后看到的又是另一张图.虽然很早就看到过这类图片,但是一直没有仔细研究过它的原理,今天思考了一下,发现挺有趣的,所以自己也写了个简单的算法把两张图片合成为一张隐藏图. 比如下面这张图. 当背景颜色为白色时,通常也就是在预览状态下,它是这个样子的而当背景颜色变黑以后,通常也就是点开图片以后,它是这样子的.. 隐藏图原理我们知道一张图片中具有透明度的像素会叠加一部分的背景色,因此当背

R & ggplot2 & Excel绘图（直方图/经验分布图/QQ图/茎叶图/箱线图）实例

持续更新~ 散点图条形图文氏图饼图盒型图频率直方图热图 PCA图 3D图火山图分面图分面制作小多组图地图练习数据: year count china Ame jap '12 2.800000 1.500000 4.500000 2.500000 '13 2.941956 1.587559 5.342547 2.814862 '14 3.508838 1.648075 5.429438 2.701108 '15 4.011208 1.533966 5.419301 2.660

一个简单的QQ隐藏图生成算法

隐藏图不是什么新鲜的东西,具体表现在大部分社交软件中,预览图看到的是一张图,而点开后看到的又是另一张图.虽然很早就看到过这类图片,但是一直没有仔细研究过它的原理,今天思考了一下,发现挺有趣的,所以自己也写了个简单的算法把两张图片合成为一张隐藏图. 比如下面这张图. 当背景颜色为白色时,通常也就是在预览状态下,它是这个样子的而当背景颜色变黑以后,通常也就是点开图片以后,它是这样子的.. 隐藏图原理我们知道一张图片中具有透明度的像素会叠加一部分的背景色,因此当背景色为白色时,所有具有透明度的白色

Matlab 语谱图(时频图)绘制与分析

Matlab 语谱图(时频图)绘制与分析语谱图:先将语音信号作傅里叶变换,然后以横轴为时间,纵轴为频率,用颜色表示幅值即可绘制出语谱图.在一幅图中表示信号的频率.幅度随时间的变化,故也称"时频图". %matlab 2016a %需要先安装语音处理工具箱(matlab_voicebox) [Y,FS,WMODE,FIDX]=readwav('sound0_10','s',-1,-1); %Y为读到的双声道数据 %FS为采样频率 %这里的输入参数sound0_10为双声道数字0到10的

JFreeChart 图表生成实例(饼图、柱状图、折线图、时序图)

import java.awt.BasicStroke; import java.awt.Color; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; import java.text.DateFormat; import java.text.SimpleDateFormat; import javax.servlet.ServletException; import javax.servlet.ServletReques

前端数据统计用做Bootstrap的一些柱状图、饼状图和折线图案例

Bootstrap,来自 Twitter,是目前最受欢迎的前端框架.Bootstrap 是基于 HTML.CSS.JAVASCRIPT 的,它简洁灵活,使得 Web 开发更加快捷. Bootstrap 使用了一些 HTML5 元素和 CSS 属性.为了让这些正常工作,您需要使用 HTML5 文档类型(Doctype). 因此,请在使用 Bootstrap 项目的开头包含下面的代码段. <!DOCTYPE html> <html> .... </html> Bootstr

06. Matplotlib 2 |折线图| 柱状图| 堆叠图| 面积图| 填图| 饼图| 直方图| 散点图| 极坐标| 图箱型图

1.基本图表绘制 plt.plot() 图表类别:线形图.柱状图.密度图,以横纵坐标两个维度为主同时可延展出多种其他图表样式 plt.plot(kind='line', ax=None, figsize=None, use_index=True, title=None, grid=None, legend=False, style=None, logx=False, logy=False, loglog=False, xticks=None, yticks=None, xlim=None, yl

GIS案例学习笔记-ArcGIS整图大图出图实例教程

GIS案例学习笔记-ArcGIS整图大图出图实例教程联系方式:谢老师,135-4855-4328,xiexiaokui#qq.com 1. 通过出图比例尺(1:2000),地图范围测算图纸大小. 图纸大小=地图范围*比例尺=10米*8米 2. 设置页面布局 3. 设置参考比例尺 4.页面布局,调整地图布局 5. 导出地图. 6.由于地图太大,普通图片查看器,例如美图看看,可能不能正确.全部.放大显示.考虑在ps中打开,20个屏幕大小. 7. 出错原因和walkarounds: (1)默认需

python 绘图---2D、3D散点图、折线图、曲面图

python中绘制2D曲线图需要使用到Matplotlib,Matplotlib 是一个 Python 的 2D绘图库,它以各种硬拷贝格式和跨平台的交互式环境生成出版质量级别的图形,通过 Matplotlib,开发者可以仅需要几行代码,便可以生成绘图,直方图,功率谱,条形图,错误图,散点图等. 1. 绘制折线图 plt.plot() 可以用于绘制折线图.只传入一维的散点(n个)p1时,横坐标对应散点的次序,从0到n-1,纵坐标对应散点的值.示例: # -*- coding: utf-8 -*-

R语言学习 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）

箱线图箱线图是能同时反映数据统计量和整体分布,又很漂亮的展示图.在2014年的Nature Method上有2篇Correspondence论述了使用箱线图的好处和一个在线绘制箱线图的工具.就这样都可以发两篇Nature method,没天理,但也说明了箱线图的重要意义. 下面这张图展示了Bar plot.Box plot.Volin plot和Bean plot对数据分布的反应.从Bar plot上只能看到数据标准差或标准误不同:Box plot可以看到数据分布的集中性不同:Violin

seaborn（2）---画分类图/分布图/回归图/矩阵图

二.分类图 1. 分类散点图 (1)散点图striplot(kind='strip') 方法1: seaborn.stripplot(x=None, y=None, hue=None, data=None, order=None, hue_order=None, jitter=True, dodge=False, orient=None, color=None, palette=None, size=5, edgecolor='gray', linewidth=0, ax=None, **kwa

多变量分析绘图（hue参数）以及盒图和小提琴图

1,函数stipplot() stipplot()函数用来画散点图,其x轴是离散型的变量直接上代码 import seaborn as sns import numpy as np import pandas as pd import matplotlib as mpl import matplotlib.pyplot as plt tips = sns.load_dataset("tips") #seaborn内置数据集,DaraFram类型 sns.stripplot(x=&qu

数据可视化基础专题（十二）：Matplotlib 基础（四）常用图表（二）气泡图、堆叠图、雷达图、饼图、

1 气泡图气泡图和上面的散点图非常类似,只是点的大小不一样,而且是通过参数 s 来进行控制的,多的不说,还是看个示例: 例子一: import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np # 处理中文乱码 plt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei'] x_data = np.array([2011,2012,2013,2014,2015,2016,2017]) y_data = np.array([58000,

matplotlib常见图表绘制——极坐标图-雷达图、极轴图

前言本文的文字及图片来源于网络,仅供学习.交流使用,不具有任何商业用途,版权归原作者所有,如有问题请及时联系我们以作处理. 作者:斑点鱼极坐标轴调用subplot()创建子图时通过设置projection='polar',便可创建一个极坐标子图,然后调用plot()在极坐标子图中绘图 #极坐标图 s = pd.Series(np.arange(20)) fig = plt.figure(figsize=(8,4)) ax = plt.subplot(111, projection = 'p

图机器学习(GML)&图神经网络(GNN)原理和代码实现(前置学习系列二）

项目链接:https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/4990947?contributionType=1 欢迎fork欢迎三连!文章篇幅有限,部分程序出图不一一展示,详情进入项目链接即可图机器学习(GML)&图神经网络(GNN)原理和代码实现(PGL)[前置学习系列二] 上一个项目对图相关基础知识进行了详细讲述,下面进图GML networkx :NetworkX 是一个 Python 包,用于创建.操作和研究复杂网络的结构.动力学和功

【开源】专业K线绘制[K线主副图、趋势图、成交量、滚动、放大缩小、MACD、KDJ等）

这是一个iOS项目雅黑深邃的K线的绘制. 实现功能包括K线主副图.趋势图.成交量.滚动.放大缩小.MACD.KDJ,长按显示辅助线等功能预览图最后的最后,这是项目的开源地址:https://github.com/yate1996/Y_KLine,如果帮到了你,麻烦点赞鼓励鼓励呗~(*^__^*) ~ 欢迎加群讨论其它无关内容

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