转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大,其下面有非常多的参数,但是一般使用的参数如:-p.-i.-d.-o.-e等几个. -p: 执行的程序名称 -d: 搜索的数据库名称 -i : 要查询的序列文件名(Query File) -e:(数学)期望值(Expectation value),E值是个统计阈值,缺省值10, 意指比对结果中由于随

方法的参数有六种,分别是值参数.引用参数.输出参数.参数数组.命名参数.可选参数. 值参数 值参数是方法的默认类型,通过复制实参的值到形参的方式把数据传递到方法,方法被调用时,系统作两步操作: 在栈中为形参分配空间. 复制实参到形参. 1)在方法被调用前,用作实参的变量a1的引用已经在栈里了. 2)随着方法的开始,系统在栈中为形参分配空间,并从实参复制值. 3)因为a1是引用类型,所以引用被复制,结果实参和形参都引用堆中的同一个对象. 4)因为a2是值类型,所以值被复制,产生了一个独立的数据.

之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out format. 常见的网页版blast结果可以参照:Blast结果的详细解析 *** Formatting options -outfmt <String> alignment view options: 0 = Pairwise, 1 = Query-anchored showing identit

10-2. 返回输出参数 问题 想获取存储过程里的一个或多个输出参数的值 解决方案 假设我们有一个像Figure 10-1所示的,出租车辆与租金收入的模型 Figure 10-1.出租车辆与租金收入的模型 我们想知道在指定日期里,收入了几笔租金和金额, 以及车辆的租凭情况. 存储过程Listing 10-7 就是获取这些信息的. Listing 10-7. A Stored Procedure for the Vehicles Rented, the Number of Rentals, and

异常处理汇总-后端系列 http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4523006.html 后期会在博客首发更新:http://dnt.dkill.net/Article/Detail/312 今天一同志问我这个问题,这个是过程还原: 调用SQLHelper的时候发现输出参数没值了??? 不用sqlhelper也是没有?神马情况? 用sqldataadapter却可以? 吓死宝宝了,赶紧看看啥情况.先换种方法看看 ,,,我去,可以哇!那么是不是ExecuteReader

insert INTO stu(name) VALUES('maimai'); set @ReturnValue=@@IDENTITY; string sql="insert INTO stu(name) VALUES(@name);set @ReturnValue=@@IDENTITY; MySqlParameter[] parameters = { new MySqlParameter("@name", MySqlDbType.VarChar,100),MySqlDbTy

场景: 写了一个有返回参数的存储过程,在个另开发人员机器上都正常.其它机器报如题错误.让人郁闷的是,所有调用方都是客户端,根本不存在网上众贴所说的版本不一致问题. 分析: 虽然网上的帖子没有根本解决问题,但还是给了些丝路.参数值类型问题.而且,我也把输出参数赋值语句注释后,也可以正常调用(只是结果没返回).尝试了将类型转为Oracle的OracleString,强制转clr的string,都不行. dicParaOut[kvp.Key] = (string)command.Parameters[

在上一篇随笔:SqlDataReader读取分页数据,pageCount你是肿么了? 遇到了很让人头疼的问题:SqlDataReader执行带输出参数的存储过程总是获取不到输出参数的正确值.这里将解决办法及分析过程列出,为遇到相同问题的小伙伴提供一种解决方案. 在SqlDataReader读取分页数据,pageCount你是肿么了?的评论中有博友提出将 param[].Direction = ParameterDirection.Output; 该句代码放在执行查询前,确实有这一部分原因.按照该

using (SqlConnection conn = new SqlConnection(this.GetConnectionString(this.WMPDBName))) { SqlCommand cmd = conn.CreateCommand(); cmd.CommandType = System.Data.CommandType.StoredProcedure; cmd.CommandText = "存储过程名称"; ////输出参数 cmd.Parameters.Add(

一些存储过程通过参数返回值.当参数在SQL表达式或者存储过程中被定义为“输出”,参数值会返回给调用者.返回值存储在 OleDbCommand 或者 SqlCommand 对象的参数集合的参数里.   和下面的示例不同,即使 Connection 和 Command 都没有指定,你仍然可以建立参数,但是你必须创建参数集合和预期类型.     workParam = myCommand.Parameters.Add(); workParam.Value = "CUSTID"; 下面的示例演

最近做项目需要把以前Vc写的程序整合到VS2005来,用c#写的,以前VC的动态连接库写好了,重写比较麻烦,让C#调用VC dll就好了.但碰到了一个问题:VC中作为输出参数的char*类型的变量应该怎样申明才能正确输出数据呢? 一般说来,在VC中一般的输出参数都为指针或数组的形式,如果是一般类型的指针如整形等,在c#中用ref加上数据变量则可获得返回值.所以我试着把VC中char*输出变量在c#中写成ref string(因为char*在c#中可以写成string或char[]),但发现这样写

1.不含动态sql.带输出参数存储过程调用实例 1.存储过程代码:   2.EF自动生成代码(包括对应ObjectResult的实体模型): 3.调用存储过程代码实例: 总结: ObjectParameter参数对应输出类型时,不必指定类似Output等 ObjectParameter的命名空间:using System.Data.Objects; ObjectParameter参数的Name是对应存储过程参数字符串去掉@符号, 例如存储过程参数‘@Count int output‘,对应Nam

本文转自:http://www.cnblogs.com/hnsdwhl/archive/2011/07/23/2114730.html 当需要根据外部输入的参数来决定要执行的SQL语句时,常常需要动态来构造SQL查询语句,个人觉得用得比较多的地方就是分页存储过程和执行搜索查询的SQL语句.一个比较通用的分页存储过程,可能需要传入表名,字段,过滤条件,排序等参数,而对于搜索的话,可能要根据搜索条件判断来动态执行SQL语句. 在SQL Server中有两种方式来执行动态SQL语句,分别是exec和s

玛德,数据行都返回过来了,就是没有输出参数!!! 扒官方设计文档:这么一段 雷死人了!!! When a stored procedure is called using MySqlCommand.ExecuteReader, and the stored procedure has output parameters, the output parameters are only set after the MySqlDataReader returned by ExecuteReader i

1.不含动态sql.带输出参数存储过程调用实例 a.存储过程代码: b.EF自动生成代码(包括对应ObjectResult的实体模型): c.调用存储过程代码实例:  总结: ObjectParameter参数对应输出类型时,不必指定类似Output等 ObjectParameter的命名空间:using System.Data.Objects; ObjectParameter参数的Name是对应存储过程参数字符串去掉@符号,例如存储过程参数‘@Count int output‘,对应Name为

说明(因为Java中java Application的参数都是默认的字符型的数据,所以需要强制类型转换这一步骤) 设计思想: 向系统里输入若干个参数,计算出参数个数,利用for语句计算出参数的和.(程序中需要进行强制类型转换,因为java Application中的数据是字符型的,不能进行运算),最后输出参数的和 流程图:

一.Oracle创建表及存储过程 1.创建表T_MONITOR_DEVICE 创建后的表结构 2.创建存储过程 create or replace procedure ProcTestNew(v_monitordeviceid in number,curdata out sys_refcursor ) As begin open curdata for select ID, IP,PORT from T_MONITOR_DEVICE where id=v_monitordeviceid;--带参

CREATE PROCEDURE [dbo].[GetNameById] @studentid varchar(8), @studentname nvarchar(50) OUTPUT AS BEGIN SELECT @studentname=studentname FROM student WHERE studentid=@studentid if @@Error<>0 RETURN -1 else RETURN 0 END using (SqlConnection conn = new S

mybatis入门系列二之详解输入与输出参数   基础知识   mybatis规定mapp.xml中每一个SQL语句形式上只能有一个@parameterType和一个@resultType 1. 返回值是一个对象的集合,@resultType中只能写该对象的类型,而不是写list<T> 2. 输入参数可以用#{}和${}两种取值方法,两者区别与联系: 1. 当传入类型为JDBC基本类型(8种java基本类型+String)时,#{}里面可以写成任意值,${}里面必须写value 2. 当传入类

前面介绍了方法的输入参数,与输入参数相对应的则为输出参数,输出参数也被称作方法的返回值,意思是经过方法的处理最终得到的运算数值.这个返回值可能是整型数,也可能是双精度数,也可能是数组等其它类型,甚至允许不返回任何参数.与输入参数类似,输出参数也需要定义数据类型,它的返回值类型在方法名称前面定义,具体位置参见方法的定义形式“访问权限类型 可选的static 返回值的数据类型 方法名称(参数类型 参数名称)”.这里特别要注意,即使方法不返回任何输出参数,也需定义一个名叫void的返回值类型,而不像输

解决方法: 要获取到输出参数.需要连接关闭之后才行. 一般都是用using把打开数据库连接的reader包起来