#http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2881355/ 一致聚类方法,采用重抽样方法来验证聚类合理性. library(ALL)data(ALL)d=exprs(ALL)d[1:5,1:5] #对上面这个芯片表达数据我们一般会简单的进行normalization (本次采用中位数中心化),然后取在各个样品差异很大的那些gene或者探针的数据来进行聚类分析 mads=apply(d,1,mad)# mad(x) 绝对中位数差 按行(1)取d数据的

两种RNA seq的基因表达量计算方法: 1. RPKM:http://www.plob.org/2011/10/24/294.html 2. RSEM:这个是TCGAdata中使用的.RSEM据说比RPKM更有优势.anyway,原来还以为TCGA 的data需要重新换算成RPKM,现在不需要了~:)

摘 要: 多位点序列分型(MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过PCR扩增多个管家基因内部片段,测定其序列,分析菌株的变异,从而进行分型.MLST被广泛应用于病原菌.环境菌和真核生物中.与传统分子生物学分型方法相比,MLST操作简单,具有更高的分辨力,能将同种细菌分为更多的亚型,并确定不同ST型之间的系统发育关系以及与疾病的联系. 关键词: 多位点序列分型   多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过

最近项目中不少表的数据量越来越大,并且导致了一些数据库的性能问题.因此想借助一些分库分表的中间件,实现自动化分库分表实现.调研下来,发现Sharding-JDBC目前成熟度最高并且应用最广的Java分库分表的客户端组件.本文主要介绍一些Sharding-JDBC核心概念以及生产环境下的实战指南,旨在帮助组内成员快速了解Sharding-JDBC并且能够快速将其使用起来.Sharding-JDBC官方文档 核心概念 在使用Sharding-JDBC之前,一定是先理解清楚下面几个核心概念. 逻辑表

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GO類似PHP,每行的結尾要加分號來結束,不同點在於GO對此並不強制,這一點又像javascript,另外GO的語句塊是用一對大括號來包裹的,但是go要求左大括號必須要在語句的結尾處,不能在行首出現左大括號,這是一個新的特性,至少在我接觸的編程語言中第一次遇到這種狀況.還有就是GO對大小寫敏感,這一點相信大家不會有什麽爭議.    GO語言的註釋方法和PHP是相同的,單行註釋用//,而多行註釋用/*註釋內容*/,這一點是沒差別的. Go有眾所周知的數據類型int,這個類型很特殊,他會自動根據您的

肿瘤的发生与免疫系统的功能密切相关.在免疫系统中,MHC(主要组织相容性复体,majorhistocompatibilitycomplex)是所有生物相容复合体抗原的一种统称.HLA(humanleucocyteantigen)就是人类的MHC基因,即人类白细胞抗原,位于6号染色体,它所在的区域是人类基因组中多态性最高的区域之一,有高达上千个等位基因. HLA–I类基因在细胞毒性T细胞反应中作用至关重要,可以在细胞表面呈递可被T细胞受体识别的肽段. 研究表明,肿瘤中HLA基因存在大量的体细胞突变

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java的基本数据类型一共有8种.其中:(每种类型后面列出了java中的该类型的字面量) 四种整型: int  4字节: 12  +12  -12  077 0xFF  0b101(JDK7中支持的二进制表示)  字面范围:0x800000000 --> 0x7FFFFFFF short  2字节: 2个字节内的int字面量可以认为是short类型的字面量,可以给short变量赋值  字面范围:(short)0x8000 -->  0x7FFF long 8字节:    int字面量形式后加字

在计算机科学中,字面量(literal)是用于表达源代码中一个固定值的表示法(natation).几乎所有计算机编程语言都具有对基本值的字面量表示,诸如:整数.浮点数以及字符串:而有很多也对布尔类型和字符类型的值也支持字面量表示:还有一些甚至对枚举类型的元素以及像数组.记录和对象等符合类型的值也支持字面量表示法. 在Java中通俗的说:int i = 1;把整数1赋值给int型变量i,整数1就是Java字面量,同样,String s = "abc";中的abc也是字面量. 整数字面量

1.基本类型 布尔类型:bool 注意:布尔类型不能接受其他类型的赋值,不支持自动或强制的类型转换. 整型:int8.byte(uint8).int16.int.uint.uintptr int.uint .uintptr 长度同平台有关 int和int32等 不是同一种类型,可以强制类型转换,但要注意精度丢失. C#代码:两个不同类型的整型数不能直接比较,比如int8类型的数和int类型的数不能直接比较,但各种类型的整型变量都可以直接与字面常量(literal)进行比较: ; Int64 j

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