代码如下: #!/usr/bin/perl -w use strict; die "perl $0 <vcf> <genome>" if(@ARGV == 0); #Author:yueyao@genomics.cn my $vcf=shift; my $genome=shift; my%hash; my $id; open GENOME,$genome or die $!; while(<GENOME>){ chomp; if(/^>/)

缓存服务,还未创建完缓存时, 需要更改图层名称.服务名称.数据源位置.mxd名称等.已经创建好的缓存还可以再用吗? 测试后可以, 注意:新服务相对旧服务,符号样式没有改变,切片方案没有变化. 测试步骤. 如下图,某地图文档,发布服务,创建了一部分缓存. 在新发的服务上右键    ->   查看缓存状态,缓存创建了   25.6%. 服务的缓存方案如图所示, 更改了地图文档中的  图层名称.数据源位置.另外发布了服务,相对之前服务使用了新的 服务名称,切片方案相同. 将第一个服务的已经创建的切片拷

一·简介 提取文件名称或者目录,一般都会使用到#,##,%和%%,但是他们的区别很容易记混淆了.在一下4种方式中,目标匹配字符是不在结果中. #:表示从左开始算起,并且截取第一个匹配的字符 ##:表示从左开始算起,并且截取最后一个匹配的字符 %:表示从右开始算起,并且截取第一个匹配的字符 %%:表示从右开始算起,并且截取最后一个匹配的字符 二·例子 当前有一个文件名称为1_2_3_4.txt,把文件名称赋值给变量var 1.echo "${var#*_}"输出结果为:2_3_4.txt

1.从左到右提取:left(value,num_chars) 注释:value为操纵单元格,num_chars表示截取的字符的数量 2.从右往左提取:right(value,num_chars) 注释:value为操纵单元格,num_chars表示截取的字符的数量 3.任意位置提取:mid(value,start_num,num_chars) 注释:value为操纵单元格,start_num从左起第几位开始截取,num_chars表示截取的字符的数量 4.find(find_text,value

如何获取hg19的CDS.UTR.intergenic.intron等的位置信息? 参考手册: Hg19 regions for Intergenic, Promoters, Enhancer, Exon, Intron, 5-UTR, 3-UTR 怎么从gtf文件获取genome feature的区间 The coding region of a gene, also known as the CDS (from coding sequence), is that portion of a g

select  u_dump.value || '/' ||  db_name.value || '_ora_' ||  v$process.spid ||  nvl2(v$process.traceid, '_' || v$process.traceid, null )  || '.trc' "Trace File" from  v$parameter u_dump  cross join v$parameter db_name cross join v$process  join 

生物信息:找出基因,生物学家使用字母A.C.T和G构成的字符串建模一个基因组.一个基因是基因组的子串,它从三元组ATG后开始在三元组TAG.TAA或TGA之前结束.此外,基因字符串的长度是3的倍数,而且基因不包含三元组ATG.TAG.TAA和TGA.编写程序提示用户输入一个基因组,然后显示基因组里的所有基因.如果在输入序列中没有找到基因,那么程序显示“no gene is found” s=input('Please input the Gene String:\r\n') endsplit=[

概述 函数方法不只是适用下述场景,主要目的是在不同业务场景中个人解决问题的思维方法: 下图中数据都为测试数据,不具备真实性! 场景一 数据库Task表中存储的实际任务id太长,但PC/移动端看到展示的是任务id后7位(也具有唯一性),为方便在平台和移动端对照,追踪任务和排查问题需要从Task_id列截取右边位置后7位. 目标 从Task表中的原始数据id列中提取后7位. 解决方案 right()函数实现. 函数解释: =Right(string, length) #参数解释:string-要被提

目录 一.来源 研究一:Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二:Genome sequencing of adzuki bean (Vigna angularis) provides insight into high starch and low fat accumulation and domestication 二.研究一(小豆基因组草图) 基因组组装 基因与重复序列预测 小豆驯化痕迹 标记开发及育种应用 红豆基因

目录 来源 一.简介 二.结果 基因组组装 重复序列和转座子 基因组特征和基因注释 绿豆的驯化 豆科基因组复制历史 基于转录组分析的豇豆属形成 绿豆育种基因组资源 三.讨论 四.方法 材料 组装 SNP/INDEL 分析和全基因组比对 遗传图谱构建 转座子(TE)检测和重复序列屏蔽 基因预测和注释 转录因子(TF)鉴定 非编码RNA鉴定 转录组组装和豇豆物种形成分析 抗病基因鉴定 全基因组复制分析 来源 Kang, Y., Kim, S., Kim, M. et al. Genome seque

运用Jmeter正则提取器,可以从请求的响应结果中取到需要的内容,从而实现关联. jmeter之关联 的个人理解: 关联是请求与请求之间存在数据依赖关系,需要从上一个请求获取下一个请求需要回传回去的数据

下面简单介绍一下Jmeter正则表达式提取器的使用方法. 1.添加Jmeter正则表达式提取器:在具体的Request下添加Jmeter正则表达式提取器(Jmeter正则表达式在“后置处理器”下面)  例1如下: 引用名称: tokenid(自己定义) 正则表达式:<input type="hidden" name="org.apache.struts.taglib.html.TOKEN" value="(.*?)"> 模板:$1$

假设想要计算ATP1A4基因上的外显子碱基覆盖度 首先查询这个基因所有exon的起始和终止位置,查询链接:http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Exons?db=core;g=ENSG00000132681;r=1:160121360-160156767;t=ENST00000368081 如下图所示,可以看到该基因有6个转录本,假定选择第二个转录本ENST00000470705.1,点击进去,显示该转录本有5个外显子 具体外显子的详

http://desert3.iteye.com/blog/1394934 1.http://www.cnblogs.com/quange/archive/2010/06/11/1756260.html 2.http://blog.csdn.net/zhangren07/archive/2010/10/15/5944158.aspx <input type="hidden" name="hidName" value="(.*)">  

庐州月光 如何提取一个转录本的3'UTR区域的序列 在做microRNA 和 mRNA 相互作用预测的时候,大家都知道microRNA 作用的靶点是位于mRNA 的3'UTR取,所以只需要提取mRNA 对应的3'UTR 区的序列去做分析即可: 那么如何提取一个mRNA的3'UTR区呢? 在UCSC数据库中,提供了3'UTR区序列的下载,以人类hg19为例, 利用table browser 浏览器选择对应的序列 链接:http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables

目录 材料与方法 结果分析 本文利用99085个高质量SNP 通过STRUCTURE,PCA和neighbour-joining tree的群体结构分析将地方品种分为三个亚群,这些亚群表现出地理上的遗传分化.利用纬度相差10°的两个位置(北京.武汉)收集的表型数据,鉴定了17个与开花时间性状相关的SNP(TAS),包括一个稳定的基因位点Chr12:5914898和以前未检测到的在开花基因E1和E2附近的候选基因.利用与地方种收集地点相关的已公布数据,鉴定出与三个生物气候学变量(温度,日长和降水)

PASA, acronym for Program to Assemble Spliced Alignments, is a eukaryotic genome annotation tool that exploits spliced alignments of expressed transcript sequences to automatically model gene structures, and to maintain gene structure annotation cons

1. Android开发位置感知应用程序方式:1. GPS 定位     精确度高,仅适用于户外,严重消耗电量.如果手机内置GPS接受模块,即使手机处于信号盲区,依然可以获取位置信息. 2. NETWORK_PROVIDER   网络定位,室内室外都可以使用,响应速度快,耗电量少. 下面演示 根据条件,自动选择最优的定位方式 package demo.map4; import java.util.List; import android.app.Activity; import android.

原文:[百度地图API]建立全国银行位置查询系统(三)--如何在地图上添加银行标注 <摘要>你将在第三章中学会以下知识: 如何在地图上添加带银行logo的标注?(你也可以换成商场logo,酒店logo等) 如何在标注上显示信息窗口,以及添加文字标签等其他覆盖物: 最后,介绍一个获取坐标的给力工具. ---------------------------------------------------------------------------------------------------

症状描述 Cnario Player正常工作期间, 更改了电脑的Windows系统计算机名称(不是登录Windows的用户名), 重启后, 新计算机名生效. 此时Cnario自动启动, 但没有进入播放画面, 可以看到Cnario Player的软件界面, 界面中的播放按钮呈灰色, 表明已经在播放进程, 也没有音频播放: 原因分析 出现这个原因是因为计算机名称更换了, 因为Windows可以扩展多个屏幕显示, 每个屏幕可显示不同的内容, Cnario Player要将Layout的内容分区播放至每