一.BED 文件格式 BED 文件格式提供了一种灵活的方式来定义的数据行,以用来描述注释的信息.BED行有3个必须的列和9个额外可选的列. 每行的数据格式要求一致. 必须包含的3列: 1.chrom, 染色体名字(e.g. chr3, chrY) 2.chromStart, 目标区段在染色体起始位置,染色体第一个碱基的位置是0 3.chromEnd, 目标区段在染色体结束位置,染色体的末端位置没有包含到显示信息里面.例如,首先得100个碱基的染色体定义为chromStart =0 . chrom

目标如题,有多个fasta文件和一个文件名列表,将文件名列表中包含的文件匹配出来并提取第一条序列合并成一个fa文件. 这个采用perl实现,用法和代码如下: 1 #!/usr/bin/perl -w 2 use strict; 3 4 sub usage{ 5 die "usage:perl $0 <fa.list> <Fasta_Dir> <merged.fa>\n",unless(@ARGV==3); 6 } 7 usage(); 8 9 ope

最近在上生物信息学原理,打算记录一些课上的作业.第一次作业:如题. 基本思路: 1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息.GFF格式见http://blog.sina.com.cn/s/blog_8a4f556e0102yd3l.html. 2.利用起始/终止位置等信息从FNA文件中提取CDS序列.FNA格式见 http://boyun.sh.cn/bio/?p=1192. 3.利用CDS序列及密码子表得到FAA文件并输出. 注意:最需要注意的一点是:当GFF中CDS位于负链时,需要

Linux文件夹对比并提取的差分文件技巧-rsync的妙用 [日期:2016-02-13] 来源:oschina.net  作者:mengshuai [字体:大 中 小] https://www.linuxidc.com/Linux/2016-02/128307.htm 早上刚百度到的 一会儿 到公司 试试   需求 最近团队正在开发一个版本对比工具,要求是把A1文件夹与A2对比,将A2中的增量部分,输出到update文件夹中,生成增量升级包/差分包. 方案研究 实现该功能的第一反应是,分别遍历

如何使用Keka for Mac提取受密码保护的文件?keka Mac是很多人喜欢的压缩解压工具,以小巧,使用简单,界面简洁受到很多Mac用户的喜欢,你还可以使用它提取文件,下面我们就来介绍一下关于用Keka提取文件的方法. https://www.macdown.com 用Keka提取文件的格式RAR,7z,Lzma,xz,Zip,Tar,Gzip,Bzip2,ISO,EXE,CAB,PAX如何提取支持的文件如果您已将Keka设置为默认提取应用程序,只需双击压缩文件即可将其解压缩将一些压缩文件

一. 配置静态网络地址 目标: 本例要求为虚拟机 server 配置以下静态地址参数: 1> 主机名:server0.example.com    2> IP地址:172.25.0.11    3> 子网掩码:255.255.255.0    4> 默认网关:172.25.0.254    5> DNS服务器:172.25.254.254 方案: 使用nmcli配置网络连接时的基本操作,查看网络连接.连接详情: 1> nmcli con show      2>

安装Win7或者XP系统用虚拟光驱加载Win7或者XP镜像 iso文件xp win7wim文件 http://pcedu.pconline.com.cn/teach/xt/1201/2657834_8.html Linux笔记本安装Win7或者XP系统第四步——用虚拟光驱加载Win7或者XP镜像 在这里先说明一下,安装Win7或者XP系统,都需要一个Win7或者XP系统的镜像文件,这个镜像文件可以来自正版Windows7或者XP光盘.MSDN用户还可以直接从网上下载. 那些已经有正版Window

增量备份的应用在recovery阶段.不再restore阶段 了解数据库设置表: SQL>desc database_properties  Name                                      Null?    Type  ----------------------------------------- -------- ----------------------------  PROPERTY_NAME                            

务必提前预读这里的内容:http://www.cnblogs.com/stemon/p/3999844.html 回到cpp文件与头文件各写什么内容的话题上: 理论上来说cpp文件与头文件里的内容,只要是C语言所支持的,无论写什么都可以的,比如你在头文件中写函数体实现,任何一个cpp文件包含此头文件就可以将这个函数编译成目标文件的一部分(编译是以cpp文件为单位的,如果不在任何cpp文件中包含此头文件的话,这段代码就形同虚设),你可以在cpp文件中进行函数声明.变量声明.结构体声明,这也不成问题

1.生产资料概述 为了资料保密和传输方便,交给PCB厂商打样的资料一般以Gerber和钻孔文件为主,换句话说,只要有前面说的两种文件,就能制作出你想要的PCB了. 一般来说,交给PCB厂商的Gerber有以下几层: GTO(Top Overlay, 顶层丝印层,常见的白油) GTS(Top Solder,顶层阻焊层,常见的绿油) GTL (Top Layer,顶层走线层) Gx (中间信号层,x为层数) GBL (Bottom Layer, 底层走线层) GBS (Bottom Solder,底

java 查询路径中所有文件夹和文件的名称,支持文件名模糊查询 有时候我们遇到需要查询服务器或者本机某个路径下有哪些文件?或者根据文件名称模糊搜索文件,那么就可以使用本方法:可以获取某个路径下所有文件夹名称,以及所有文件名称. 代码: import java.io.File; import java.util.ArrayList; import java.util.HashMap; import java.util.List; public class Test { /** * 获取文件夹下所有

看大多数说的都是简单地将整个工程转换成.LIB,在Project->Options for Target->Output下,选择Create Library,就可以了. 不过这样生成的lib文件巨大,我现在编译的工程最后生成的lib有2.6MB. 若只想将工程中的单个c文件生成相应的lib文件 1.右键点击工程,假设为a,选Add Group,假设为b,再将想生成lib的文件加入b group,假设文件是cc.c,必须要有cc.h. 2.右键依次点击其他的group,按KEIL官网资料所说的,

说明(2017.3.26): 1. 采用的是兰色幻想教学视频中的“父子转换法” 2. 这种VBA的遍历文件夹方法非常难理解,主要是因为dir这个函数,第一次带参数调用,返回的是此目录下的第一个文件,第二次无参数调用,返回的是此目录下一个第二个文件,这就很操蛋了,还要配合do循环. 3. VBA的各种do..until..loop, do..while..loop, if..then..end if, for 1 to 10..next尼玛这么多关键字要死啊!不骂不痛快!本来思考的就很累,还时不时

HEX文件和BIN文件是我们经常碰到的2种文件格式.因为自己也是新手,所以一直对这两个文件懵懵懂懂,不甚了解,最近在做STM32单片机的IAP更新,其中要考虑HEX文件和BIN文件,所以需要学习下这两种文件.下面是最近的我的了解,如有不对地方还请指正. HEX文件是包括地址信息的,而BIN文件格式只包括了数据本身 在烧写或下载HEX文件的时候,一般都不需要用户指定地址,因为HEX文件内部的信息已经包括了地址.而烧写BIN文件的时候,用户是一定需要指定地址信息的. HEX文件格式 HEX文件都是由

Python 文件夹及文件操作 我们经常会与文件和目录打交道,对于这些操作,python可以使用 os 及 shutill 模块,其中包含了很多操作文件和目录的函数. os 可以执行简单的文件夹及文件操作,引入用  import os,可用  help(os)  或是  dir(os)  查看其用法.注意有些函数在os模块中,有的是在os.path模块中. shutil 模块提供了大量的文件的高级操作,特别针对文件拷贝和删除.主要功能为目录和文件操作以及压缩操作.须引入 import shuti

如果程序的运行结果仅仅显示在屏幕上,当要再次查看结果时,必须将程序重新运行一遍:而且,这个结果也不能被保留. 如果希望程序的运行结果能够永久保留下来,供随时查阅或取用,则需要将其保存在文件中. 文件分类 外部文件和内部文件 外部文件:指磁盘文件,也是通常所谓的文件. 内部文件:指在程序中运行的文件,更正式的称谓是“文件流对象”. 程序中操作的是内部文件,最后保存的是外部文件. 文本文件和二进制文件 文本文件:由字符序列组成,以字符(character) 为存取最小信息单位,也称“ASCII码文件

http://www.weixueyuan.net/view/5825.html 如果程序的运行结果仅仅显示在屏幕上,当要再次查看结果时,必须将程序重新运行一遍:而且,这个结果也不能被保留. 如果希望程序的运行结果能够永久保留下来,供随时查阅或取用,则需要将其保存在文件中. 文件分类 外部文件和内部文件 外部文件:指磁盘文件,也是通常所谓的文件. 内部文件:指在程序中运行的文件,更正式的称谓是“文件流对象”. 程序中操作的是内部文件,最后保存的是外部文件. 文本文件和二进制文件 文本文件:由字符

简单的说其实要理解C文件与头文件(即.h)有什么不同之处,首先需要弄明白编译器的工作过程,一般说来编译器会做以下几个过程:       1.预处理阶段 2.词法与语法分析阶段 3.编译阶段,首先编译成纯汇编语句,再将之汇编成跟CPU相关的二进制码,生成各个目标文件 (.obj文件) 4.连接阶段,将各个目标文件中的各段代码进行绝对地址定位,生成跟特定平台相关的可执行文件,当然,最后还可以用objcopy生成纯二进制码,也就是去掉了文件格式信息.(生成.exe文件) 编译器在编译时是以C文件为单位

简单的说其实要理解C文件与头文件(即.h)有什么不同之处,首先需要弄明白编译器的工作过程,一般说来编译器会做以下几个过程:       1.预处理阶段 2.词法与语法分析阶段 .编译阶段,首先编译成纯汇编语句,再将之汇编成跟CPU相关的二进制码,生成各个目标文件 (.obj文件) 4.连接阶段,将各个目标文件中的各段代码进行绝对地址定位,生成跟特定平台相关的可执行文件,当然,最后还可以用objcopy生成纯二进制码,也就是去掉了文件格式信息.(生成.exe文件) 编译器在编译时是以C文件为单位进

继上篇教程中提到的,我们新建一个简单的tabs类型的Ionic项目. 依据文件夹文件我们知道,系统自己主动创建了一个controller文件和server文件,而且把全部的控制器和服务都写到这两个文件中面. 这是一个简单的项目,业务逻辑代码也非常少.这样子实现并没有什么问题.可是当我们的项目越写越多.业务逻辑越来越复杂.假设我们还是把全部的控制器写到同一个文件中面.那可能我们将要面对的就是一个有着上万行代码的文件. 每次编辑仅仅能通过搜索keyword来定位了. 所以真正编辑项目的时候我们应该都

PyCharm常用快捷键及调试模式 2017年10月18日 23:13:43 菜鸟之神 阅读数:5835    版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/csdntt00/article/details/78279175 1. PyCharm常用快捷键 Ctrl + / # 注释 Ctrl + A # 全选 Ctrl + C # 不需要选中一行,直接复制整行内容 Ctrl + X #不需要选中一行,直接剪切整行内容 Ctrl + V # 粘