庐州月光 如何提取一个转录本的3'UTR区域的序列 在做microRNA 和 mRNA 相互作用预测的时候,大家都知道microRNA 作用的靶点是位于mRNA 的3'UTR取,所以只需要提取mRNA 对应的3'UTR 区的序列去做分析即可: 那么如何提取一个mRNA的3'UTR区呢? 在UCSC数据库中,提供了3'UTR区序列的下载,以人类hg19为例, 利用table browser 浏览器选择对应的序列 链接:http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables

最近在上生物信息学原理,打算记录一些课上的作业.第一次作业:如题. 基本思路: 1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息.GFF格式见http://blog.sina.com.cn/s/blog_8a4f556e0102yd3l.html. 2.利用起始/终止位置等信息从FNA文件中提取CDS序列.FNA格式见 http://boyun.sh.cn/bio/?p=1192. 3.利用CDS序列及密码子表得到FAA文件并输出. 注意:最需要注意的一点是:当GFF中CDS位于负链时,需要

#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; ########input######## ];my $cut = &cut($gff);my %cut = %$cut; ],],]); #########main####### my %hash_2 = %{$cut{$gene_name}}; foreach my $key_2(keys %hash_2) { ][]+-;][]-+; print "$gene_name\t$key_2\t$arr[

ipsw文件 提取系统文件 方法总结 由于修改运营商文件造成我的有锁4S无法使用移动卡了,在网上苦寻一番还是没有结果,最后萌生了从固件中提取文件的想法,于是便开始在网上搜集资料,最后文件终于提取成功并修复了我的问题,现在把我的经历记录一下,希望对有需要的朋友有所帮助. 注:本次提取操作全部是在ubuntu下进行的,另外附件里面有已经解密.解压过的dmg文件,可以直接在MAC或linux下挂载 1,首先到theiphonewiki网站看看你所需要的文件对应的设备及系统版本是不是已经有破译的密钥,如

 前一种方法是将manifest文件放入exe中,但是要记得需要在工程中设置 这样的话exe中就不存在manifest了,在debug目录下就会看到相应的manifest文件.后者是将exe中的manifest文件提取出来,但是exe中依然有manifest文件!

XML文件??? xml即可扩展标记语言,它可以用来标记数据.定义数据类型,是一种允许用户对自己的标记语言进行定义的源语言. 里面的标签都是可以随心所欲的按照他的命名规则来定义的,文件名为roi.xml <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <readingSession> <roi> <xCoord id="1">312</xCoord> <

在讲解提取css之前,我们先看下项目的架构如下结构: ### 目录结构如下: demo1 # 工程名 | |--- dist # 打包后生成的目录文件 | |--- node_modules # 所有的依赖包 | |--- app | | |---index | | | |-- views # 存放所有vue页面文件 | | | | |-- index.vue | | | | |-- list.vue | | | |-- components # 存放vue公用的组件 | | | |-- js

摘自 Ajax获取 Json文件提取数据 1. json文件内容(item.json) [ { "name":"张国立", "sex":"男", "email":"zhangguoli@123.com", "url":"./img/1.jpg" }, { "name":"张铁林", "sex&quo

前言 标注数据导出文件是json格式的,也就是python的dict格式,需要读取标注结果,可以使用c++或者python,本文使用c++实现的. JsonCpp简介 JsonCpp是一种轻量级的数据交换格式,是个跨平台的开源库,可以从github和sourceforge上下载源码.查找资料的过程中发现另一个开源库RapidJson,有时间可以了解一下. JsonCpp使用 1.安装JsonCpp开源库: $ sudo apt-get install libjsoncpp-dev 2.根据jso

var gulp = require('gulp') var fs = require("fs") var babelify = require('babelify') var browserify = require('browserify') var rename = require('gulp-rename') var uglifyjs = require('gulp-uglifyjs') var vendors = ['react','react-dom','jquery'];

jks是JAVA的keytools证书工具支持的证书私钥格式.pfx是微软支持的私钥格式. cer是证书的公钥. 如果是你私人要备份证书的话记得一定要备份成jks或者pfx格式,否则恢复不了. 简单来说,cer就是你们家邮箱的地址,你可以把这个地址给很多人让他们往里面发信.pfx或jks就是你家邮箱的钥匙,别人有了这个就可以冒充你去你家邮箱看信,你丢了这个也没法开邮箱了 ===================== ===================== https://blog.csdn.n

已安装包校验 rpm -V 已安装的包名-V 校验指定rpm包中的文件 rpm -V pth没有任何提示,说明自安装后没有做过任何修改 rpm包中文件提取 比如对一个系统配置文件误操作,可以根据这个文件找到它所属的rpm包,然后再从rpm包中提取这个文件再覆盖被误操作文件 rpm2cpio 包全名 | cpio -idv .rpm包中文件绝对路径-i copy-in模式,还原-d 还原时自动新建目录-v 显示还原过程 rpm2cpio将rpm包转换为cpio格式的文件 cpio是一个标准工具,它

我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件.他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里呢? GFF全称为general feature format,这种格式主要是用来注释基因组. GTF全称为gene transfer format,主要是用来对基因进行注释. 数据结构 GTF文件以及GFF文件都由9列数据组成,这两种文件的前8列都是相同的(一些小的差别) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 reference sequence name

1. RPM 包校验 $ rpm -V 已安装的包名 选项 释义 -V (verify) 校验指定 RPM 包中的文件 (1) 验证内容中的 8 个信息的具体内容如下 信息名称 释义 S 文件大小是否改变 M 文件的类型或文件的权限 (rwx) 是否被改变 5 文件 MD5 校验和是否改变(可以看成文件内容是否改变) D 设备的主从代码是否改变 L 文件路径是否改变 U 文件的属主(所有者)是否改变 G 文件的属组是否改变 T 文件的修改时间是否改变 (2) 文件类型 类型名称 释义 c (co

很多时候第三方库或其他项目提供的库多数会以动态库的形式提供dll以及相应的lib导入库.头文件,不过也有的只是提供dll和头文件,或者也提供了def模块定义(用于导出函数)文件,此时若使用将不得不调用LoadLibrary以及GetProcAddress以获取一系列需要的函数,相对来说比较繁琐:多数人更喜欢使用引入库的方式. 此时需要通过提供的dll或者def文件来获取lib导入库文件,操作步骤如下: 1. 若只提供dll,则需通过dumpbin工具提取dll中导出的各个函数: dumpbin

<?php /* php 从zip压缩文件中提取文件 */ $zip = new ZipArchive; if ($zip->open('jQuery五屏上下滚动焦点图代码.zip') === TRUE) {//中文文件名要使用ANSI编码的文件格式 $zip->extractTo('foldername');//提取全部文件 //$zip->extractTo('/my/destination/dir/', array('pear_item.gif', 'testfromfile

博客迁移后整理发型这篇文章当时没写完,不补了,不过还是得说明一些东西 下面这部分代码可用之处为从flac文件头开始然后各种形式的大跳,最后到达专辑封面的数据块,之后解析. 当时写的时候不会写图片解析部分,于是照搬了ShadowPlayer中某部分的代码,其有一特色为如果图片部分代码不认照样会爆搜然后尝试解析.实际上下面给出的代码的图片解析部分就是照搬的,而此处的正确做法恰恰不是如代码所示,我之前自己尝试能提取出图片的原因也就是爆搜成功了... 于是如果看官想要研究真正能用的代码,建议直接去看Sh

1.使用的插件 MiniCssExtractPlugin:https://webpack.js.org/plugins/mini-css-extract-plugin/#src/components/Sidebar/Sidebar.jsx 注意:在webapck4中使用的是MiniCssExtractPlugin,而不是extract-text-webpack-plugin. optimize-css-assets-webpack-plugin:https://webpack.js.org/pl

校验主要用于判断文件是否做了更改 修改标志: 会用-V,会看输出结果即可. 当有误操作,比如删了某一个文件,只需知道他属于哪一个rpm包,可用提取找回覆盖就行.并不把整个rpm包安装,而是提取其中的某个指定文件. 2  等同于  to 首先将rpm格式转化为cpio格式以便于提取,之后使用cpio命令.\代表命令未输完 .代表当前目录.

rpm -V httpd 查看已安装的apache包中文件信息是否已经被人修改 rpm -ql httpd 查看已安装的apache包中文件的位置 vim /etc/httpd/conf/httpd.conf 编辑修改apache包的配置文件httpd.conf 在命令模式下输入"402G",跳转到402行 在命令模式下输入"A",然后在插入模式下输入" index.aspx" 按"ESC"键退出插入模式回到命令模式在按两次&