本文首发于“生信补给站”:https://mp.weixin.qq.com/s/8kz2oKvUQrCR2_HWYXQT4g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot包绘制瀑布图,有多种展示和统计maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)和maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化,如果只有多个样本的基因突变与否的excel,不用担心,也可以用complexheatmap包绘制. 这个包功能很强大,本次只简单的介绍如何绘制基因组景观图(瀑布图).

抱歉原文链接未知 Technorati 标签: DRG,DLG,DOM,DEM 以下有不同的说法,但是意思都很相近. 一. DOM (数字正射影像图):利用数字高程模型对扫描处理的数字化的航空相片.遥感影像,经逐个像元纠正,按图幅范围裁切生成的影像数据,它的信息比较直观,具有良好的可判读性和可量测性,从中可直接提取自然地理和社会经济信息. DEM (数字高程模型) :通过等高线.或航空航天影像建立以表达地面高程起伏形态的数字集合. DRG (数字栅格地图) :数字栅格地图是纸制地形图的栅格形式的

ps:摘抄地址http://blog.163.com/wangqing_rs/blog/static/16451519120111026102916472/  什么是4D(DRG.DLG.DOM.DEM)数据?(转自gisriver的空间) 蓝色部分为本作者根据自己专业特点及自身知识结构添加,版权归属个人. 什么是4D(DRG.DLG.DOM.DEM)数据? 以下有不同的说法,但是意思都很相近. 一. DOM (数字正射影像图):利用数字高程模型对扫描处理的数字化的航空相片.遥感影像,经逐个像元

Assembly and diploid architecture of an individual human genome via single-molecule technologies 文章链接:专业版" PacBio 遇到 BioNano" (三代测序那些事儿 第十二期) 前两天发表在Nature Mehtods一篇联合PacBio与BioNano数据组装人类基因组的文章在行业里引起了不小的震动(这其实也不是PacBio在动植物组装中的第一次表现了),大家惊讶的发现,原来大型

柳叶刀发表的文献解读:Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study 背景介绍 随着超声波在产科护理中的应用,胎儿结构异常的鉴别已成为例行公事.当发现异常时,进一步评估核型.全染色体非整倍体与染色体微阵列(CMA)上较小的微缺失和复制(CNV),则是非常的重要.目前研究发现,大约32%结构异常胎儿具有临床相关的异常核型,6%的结构异常胎儿能找到致病

实现效果如图 数据格式如下: pps: [{"code":"6","createTime":"2018-09-07 00:00:00","des":"可选择居住情况","id":"6","key":"liveType","multi":false,"name":&quo

ALK FISH探针是FDA批准的用于检测肺癌患者中ALK重排的方法,这些患者可能受益于ALK激酶抑制剂.FISH测定在技术上可能具有挑战性并且难以解释.已经有研究者提出以ALK免疫组织化学和下一代测序作为替代方法.在本研究中,我们比较了各种ALK-FISH模式与下一代测序(NGS)针对基因融合的检测效果,以及ALK免疫组织化学(IHC)和肿瘤对克唑替尼的反应.在2116例肺腺癌样本中,72例(4%)是ALK-FISH阳性,其中28个ALK-FISH阳性病例用于研究,包括15个分裂信号(54%)

课程目录:   第1章第一期1第一节 火焰拳头1:12:252第二节 荷叶合成00:05:143第三节 新年巨惠海报(一)1:00:374第四节 新年巨惠海报(二)1:05:345第五节 美食印刷品1:09:526第六节 矿泉水瓶合成1:23:457第七节 电影海报(一)1:14:078第八节 电影海报(二)1:14:259第九节 来自星球的我1:26:2910第十节 新年卡片1:00:0811第十一节 霓虹灯1:01:3612第十二节 新生1:12:5613第十三节 江边桥下女孩1:04:51

1 基本概念 DEM是数字高程模型的英文简称(Digital Elevation Model),是研究分析地形.流域.地物识别的重要原始资料.由于DEM 数据能够反映一定分辨率的局部地形特征,因此通过DEM 可提取大量的地表形态信息,可用于绘制等高线.坡度图.坡向图.立体透视图.立体景观图,并应用于制作正射影像.立体地形模型与地图修测.在测绘.水文.气象.地貌.地质.土壤.工程建设.通讯.军事等国民经济和国防建设以及人文和自然科学领域有着广泛的应用. 如在工程建设上,可用于如土方量计算.通视分析

OpenTelemetry 介绍 OpenTelemetry是一种开放的源代码规范,工具和SDK,用于检测,生成,收集和导出遥测数据(指标,日志和跟踪),开放遥测技术得到了Cloud Native Computing Foundation(CNCF)的支持,该基金会支持一系列流行的优秀的开源项目,你可以去看一下CNCF景观图,https://landscape.cncf.io/ ,就明白了我的意思,这个SDK支持所有主要的编程语言,包括C#和ASP.NET Core. 在这篇文章中,我将讨论Op

vue源码业余时间差不多看了一年,以前在网上找帖子,发现很多帖子很零散,都是一部分一部分说,断章的很多,所以自己下定决定一行行看,经过自己坚持与努力,现在基本看完了,差ddf那部分,因为考虑到自己要换工作了,所以暂缓下来先,ddf那块后期我会补上去.这个vue源码逐行分析,我基本每一行都打上注释,加上整个框架的流程思维导图,基本上是小白也能看懂的vue源码了. 说的非常的详细,里面的源码注释,有些是参考网上帖子的,有些是自己多年开发vue经验而猜测的,有些是自己跑上下文程序知道的,本人水平可能有

项目要做组织架构图,要把它做成自上而下的树形结构. 一.说明 (1)通过后台查询数据库,生成树形数组结构,返回到前台. (2)需要引入的js插件和css文件: ①jquery.jOrgChart.css ②jquery.min.js ③jquery.jOrgChart.js (3)使用jOrgChart插件,根据返回的数据将其子节点加入到相应的<li></li>中. 首先,我们的数据表应该要有 id(节点),pid(父节点的id),name的字段, 那么我们要把这个数组转为树形数组

[文章摘要] 最近用开源的AdminLTE做框架感觉效果特别好,其针对图表库Morris.js和flot都提供了不错的支持,也都提供了这两者的例子.不过Morris.js是基于Raphael.js来的,也就是其使用SVG和VML来绘制图形,而flot则是使用Canvas进行绘制,在绘制效率和浏览器兼容性等方面会有出入,同时两者需要的数据格式也不相同.本文中对两者的使用和性能进行了比较. [文章索引] Morris.js的使用 flot的使用 性能比较 [一.Morris.js的使用] Morri

1.上一篇中讲了如何绘制一个简单的柱状图,这次要画的是饼图,饼图主要是通过扇形的弧度表现不同类目的数据在总和中的占比,它的数据格式比柱状图更简单,只有一维的数值,不需要给类目.因为不在直角坐标系上,所以也不需要xAxis,yAxis. 2.itemStyle都会有normal和emphasis两个选项,normal选项是正常展示下的样式,emphasis是鼠标 hover 时候的高亮样式.也可以把阴影的效果设置在hover的时候. 3.背景色是全局的,所以直接在 option 下设置backgr

图片上传好用插件有,比如 uploadify  ueditor html5的各种ajax上传插件,大部分都是异步,返回只是true之类,有些时候需要上传图片需要一起上传,其实可以通过操作流程来避免这个问题,如果需要同步上传,改造的东西比较多 异步避免,比如有每个用户的图片相册,异步上传,然后你自己选需要上传图片,比如首先第一步吧需要的信息先提交给主表,第二步在上传多图,使用上面提到的插件,因为有了主表的ID, 还有自己比较大的改造,就是在同一页面,异步上传之后,返回图片的名字和相对路径input

Python matplotlib模块,是扩展的MATLAB的一个绘图工具库,它可以绘制各种图形 建议安装 Anaconda后使用 ,集成了很多第三库,基本满足大家的需求,下载地址,对应选择python 2.7 或是 3.5 的就可以了: https://www.continuum.io/downloads#windows 脚本默认执行方式:              1.获取当前文件夹下的1.log文件              2.将数据格式化为矩阵              3.以矩阵的列

S-Reord是一种由摩托罗拉公司创建的文件格式(不得不说,摩托罗拉厉害啊,SPI和S-Record都是他们创造的).S-Record的基本字符为ASCII字符,用以表示相应的十六进制数据.该数据格式还有以下的几种名字或缩写SRECORD, SREC, S19, S28, S37.S-Record格式多用在存储类芯片,Flash.EPROMs.EEPROMs等. 本文主要介绍S-Record格式及其各部分所代表的含义,更多详细的介绍可以看本文资料主要来源,Wikipedia--SREC (fil

YUV格式有两大类:planar和packed. 对于planar的YUV格式,先连续存储所有像素点的Y,紧接着存储所有像素点的U,随后是所有像素点的V.对于packed的YUV格式,每个像素点的Y,U,V是连续交*存储的. YUV,分为三个分量,“Y”表示明亮度(Luminance或Luma),也就是灰度值:而“U”和“V” 表示的则是色度(Chrominance或Chroma),作用是描述影像色彩及饱和度,用于指定像素的颜色. 与我们熟知的RGB类似,YUV也是一种颜色编码方法,主要用于电视

一.想要实现eCharts线状图表的断点效果,如图(后来又查到数据格式为data:['-', 2, 3,'-' , 5, 6, 7]:也可以断点显示) 这种效果,在设置数据的时候应该是这样: data:[, 2, 3, , 5, 6, 7]:但是想要动态添加数据,实现方式有两种 1.拼接字符串法:var str='[, 2, 3, , 5, 6, 7]';var arr=eval(str); 2.改变数组长度法: var arr=[]; for(var i=1;i<8;i++){ if(i==1

看到小芮介绍了pygal文章后, http://rfyiamcool.blog.51cto.com/1030776/1378400, 我一直搞数据工作, 所以对于这种数据的展现很有兴趣. 做了点研究, 记录如下: =================pygal的特点=================Web中显示chart, 现在的主流做法是使用javascript chart包, 比如highcharts和ECharts, 交互性很好. 另外还有server端生成图片, 然后在浏览器端加载图片,