转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充. Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度. 1.例如,若初始值为30,最终值为60,则相应的fold change为2,或者可以描述为一个2折的增长.fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到.

基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid,第2~61列是疾病样本的表达,第62~76列是正常样本的表达. 图1 基因表达谱的矩阵表示 寻找差异表达的基因: 原理介绍: 差异表达分析是目前比较常用的识别疾病相关miRNA以及基因的方法,目前也有很多差异表达分析的方法,但比较简单也比较常用的是Fold change方法.它的优点是计算简单直观

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is

fold change 英文简称 : FC 中文全称 : 倍性变化 所属分类 : 生物科学 词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法.例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2. 用这种方法分析微阵列的数据可以说明: 1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的: 2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著: 3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选.

题目链接:http://codevs.cn/problem/3492/ 题目描述 Description 一矩形阵列由数字0到9组成,数字1到9代表细胞,细胞的定义为沿细胞数字上下左右还是细胞数字则为同一细胞,求给定矩形阵列的细胞个数.如阵列: 0234500067103456050020456006710000000089有4个细胞. 输入描述 Input Description [输入格式] 整数m,n (m行,n列)矩阵 输出描述 Output Description [输出格式] 细胞的

问题描述 一矩形阵列由数字0到9组成,数字1到9代表细胞,细胞的定义为沿细胞数字上下左右还是细胞数字则为同一细胞,求给定矩形阵列的细胞个数. 输入格式 2行:第1行为两个整数 mm, nn, 代表矩阵的行数和列数. 接下来 mm 行,每行有nn 个由0—9构成的字符. 输出格式 1个整数,表示细胞的个数. 样例一 input 4 10 0234500067 1034560500 2045600671 0000000089 output 4 数据范围与约定 时间限制: 1s1s 内存限制:256m

根据输入数字,计算大于一个数的最小素数. 话不多说,直接贴码. package com.fuxuemingzhu.countprime.main; import java.util.Scanner; /** * <p> * Title: Main * </p> * <p> * Description:计算大于某个输入数的最小素数 * </p> * * @author fuxuemingzhu * * @email fuxuemingzhu@163.com *

问题是这样的,有一幅经过二值化处理之后的图像,我们希望统计其中细胞的个数,和不同粘连情况的细胞个数,比如,下图中有1个细胞组成连通区域的,也有2个细胞组成连通区域的,也有更多个细胞组成连通区域的,我们希望分别统计不同的情况. 我想出的一种可行的方法是这样的: 通过图像形态学的处理erode,将一些邻接的细胞分离开来,并减少单个像素的噪声干扰 计算其中的连通域 计算每一个连通域的面积 根据面积计算其中的聚类,其中聚类算法采用kmeans,其中k,由用户设定 根据聚类的情况计算其中细胞数 里面的采用

[TOC] Spark计算模型 Spark程序模型 一个经典的示例模型 SparkContext中的textFile函数从HDFS读取日志文件,输出变量file var file = sc.textFile("hdfs://***") RDD中的filter函数过滤带有'ERROR'的行,输出errors(一个RDD) var errors = file.filter(line=>line.contains("ERROR")) RDD中的count函数返回&q

Description "奋战三星期,造台计算机".小W响应号召,花了三星期造了台文艺计算姬.文艺计算姬比普通计算机有更多的艺术细胞.普通计算机能计算一个带标号完全图的生成树个数,而文艺计算姬能计算一个带标号完全二分图的生成树个数.更具体地,给定一个一边点数为n,另一边点数为m,共有n*m条边的带标号完全二分图K_{n,m},计算姬能快速算出其生成树个数.小W不知道计算姬算的对不对,你能帮助他吗? Input 仅一行三个整数n,m,p,表示给出的完全二分图K_{n,m} 1 <=

Luogu T7152 细胞(递推,矩阵乘法,快速幂) Description 小 X 在上完生物课后对细胞的分裂产生了浓厚的兴趣.于是他决定做实验并 观察细胞分裂的规律. 他选取了一种特别的细胞,每天每个该细胞可以分裂出 x − 1 个新的细胞. 小 X 决定第 i 天向培养皿中加入 i 个细胞(在实验开始前培养皿中无细胞). 现在他想知道第 n 天培养皿中总共会有多少个细胞. 由于细胞总数可能很多,你只要告诉他总数对 w 取模的值即可. Input 第一行三个正整数 n, x,w Outpu

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4766: 文艺计算姬 Time Limit: 1 Sec  Memory Limit: 128 MB Description "奋战三星期,造台计算机".小W响应号召,花了三星期造了台文艺计算姬.文艺计算姬比普通计算机有更多的艺 术细胞.普通计算机能计算一个带标号完全图的生成树个数,而文艺计算姬能计算一个带标号完全二分图的生成树 个数.更具体地,给定一个一边点数为n,另一边点数为m,共有n*m条边的带标号完全二分图K_{n,m},计算姬能快 速算出其生成树个数.小W不知道计算姬算的对

文艺计算姬 Time Limit: 1 Sec  Memory Limit: 128 MB[Submit][Status][Discuss] Description "奋战三星期,造台计算机". 小W响应号召,花了三星期造了台文艺计算姬. 文艺计算姬比普通计算机有更多的艺术细胞. 普通计算机能计算一个带标号完全图的生成树个数,而文艺计算姬能计算一个带标号完全二分图的生成树个数. 更具体地,给定一个一边点数为n,另一边点数为m,共有n*m条边的带标号完全二分图K_{n,m},计算姬能快速

4766: 文艺计算姬 Time Limit: 1 Sec  Memory Limit: 128 MBSubmit: 456  Solved: 239[Submit][Status][Discuss] Description "奋战三星期,造台计算机".小W响应号召,花了三星期造了台文艺计算姬.文艺计算姬比普通计算机有更多的艺 术细胞.普通计算机能计算一个带标号完全图的生成树个数,而文艺计算姬能计算一个带标号完全二分图的生成树 个数.更具体地,给定一个一边点数为n,另一边点数为m,共有

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题目描述:数细胞 一矩形阵列由数字0到9组成,数字1到9代表细胞,细胞的定义为沿细胞数字上下左右还是细胞数字则为同一细胞,求给定矩形阵列的细胞个数.编程需要用到的队列及其相关函数已经实现,你只需要完成count函数以及主函数即可. #include #include using namespace std; const int maxsize =50000; struct pos { int x; int y; }; typedef struct se { pos data[maxsize];

1.堆栈-Stack 堆栈(也简称作栈)是一种特殊的线性表,堆栈的数据元素以及数据元素间的逻辑关系和线性表完全相同,其差别是线性表允许在任意位置进行插入和删除操作,而堆栈只允许在固定一端进行插入和删除操作. 堆栈中允许进行插入和删除操作的一端称为栈顶,另一端称为栈底.堆栈的插入和删除操作通常称为进栈或入栈,堆栈的删除操作通常称为出栈或退栈. Java中已经出了Stack的具体实现类 堆栈的数据集合可以表示为a0,a1,-,an-1,每个数据元素的数据类型可以是任意的类类型. 操作集合 (1)入栈

Description 我们定义斐波那契数列如下: f1=1 f2=2 f(n)=f(n-1)+f(n-2)(n>=3)   现在,给定两个数a和b,计算有多少个斐波那契数列中的数在a和b之间(包含边界). Input 输入包含多组测试数据,每组测试数据都是两个非负整数a和b,当a和b都等于0时,程序结束.0<=a<=b<=10^100,注意a和b都不会出现前导0的情况(即首位为0). Output 输出在a和b之间(满足a<=f(i)<=b)数的数量. Sample

题目描述 一矩形阵列由数字0到9组成,数字1到9代表细胞,细胞的定义为沿细胞数字上下左右若还是细胞数字则为同一细胞,求给定矩形阵列的细胞个数.(1<=m,n<=100)? 输入输出格式 输入格式: 输入:整数m,n(m行,n列) 矩阵 输出格式: 输出:细胞的个数 输入输出样例 输入样例#1: 4 10 0234500067 1034560500 2045600671 0000000089 输出样例#1: 4 解释样例: 0000 0000 000 00000000 一样的颜色表示为一个细胞