MATLAB聚类有效性评价指标(外部 成对度量) 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 更多内容,请看:MATLAB: Clustering Algorithms, MATLAB聚类有效性评价指标(外部) 前提:数据的真实标签已知!TP:真阳性,FP:假阳性,FN:假阴性,TN:真阴性 1. MATLAB程序 function result = Evaluate(real_label,pre_label) % This fucntion

密度峰值聚类算法MATLAB程序 凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 密度峰值聚类算法简介见:[转] 密度峰值聚类算法(DPC) 数据见:MATLAB中“fitgmdist”的用法及其GMM聚类算法,保存为gauss_data.txt文件,数据最后一列是类标签. 1. MATLAB程序 clear all close all %% 从文件中读取数据 data_load=dlmread('gauss_data.txt'); [num,dim]=

国内博客,上介绍实现的K-medodis方法为: 与K-means算法类似.只是距离选择与聚类中心选择不同. 距离为曼哈顿距离 聚类中心选择为:依次把一个聚类中的每一个点当作当前类的聚类中心,求出代价值最小的点当作当前聚类中心. 维基百科上,实现的方法为PAM算法. 分成K类,把每个点都尝试当作聚类中心,并求出当前组合聚类中心点组合的代价值.找到总最小代价值的中心点. 国内实现: kMedoids.m代码: function [cx,cost] = kMedoids(K,data,num) %

K-modes算法主要用于分类数据,如 国籍,性别等特征. 距离使用汉明距离,即有多少对应特征不同则距离为几. 中心点计算为,选择众数作为中心点. 主要功能: 随机初始化聚类中心,计算聚类. 选择每次聚类次数,选择最佳聚类初始化. kmodes.m代码 function [cx,cost] = kmodes(K,data,num) % 生成将data聚成K类的最佳聚类 % K为聚类数目,data为数据集,num为随机初始化次数 [cx,cost] = kmodes1(K,data); :num

以K-means算法为例,实现了如下功能 自动生成符合高斯分布的数据,函数名为gaussianSample.m 实现多次随机初始化聚类中心,以找到指定聚类数目的最优聚类.函数名myKmeans.m 自动寻找最佳聚类数目,函数名称besKmeans.m,并绘制了拐点图(L图) gaussianSample.m function [data] = gaussianSample(n,m,mu,sigma,sigma1) % 生成n个符合多元高斯分布的样本 % data = gaussianSample

% ========================================================================= % 算 法 名 称: Spectral Clustering Algorithm % 编 码 作 者: Lee Wen-Tsao % 编 码 邮 箱: liwenchao36@163.com % 输 入 参 数: % W ---> 邻接矩阵 % k ---> 簇数目 % t ---> 拉普拉斯矩阵归一化处理类型 % ===========

clear load fisheriris X = meas; m = size(X,2); % load machine % load census % % X = meas; % X=X(1:2000,:); d = pdist(X,'euclidean'); Z = linkage(d,'ward');%Create a hierarchical binary cluster tree using linkage % [Hr,Tr]=dendrogram(Z, 0); %generates

在数据挖掘中聚类和分类的原理被广泛的应用. 聚类即无监督的学习. 分类即有监督的学习. 通俗一点的讲就是:聚类之前是未知样本的分类.而是根据样本本身的相似性进行划分为相似的类簇.而分类 是已知样本分类,则需要将样本特征和分类特征进行匹配,进而将每个样本归入给出的特定的类. 由于本文是对聚类算法中的k-means算法的实现,所以接下来主要进行一些聚类算法的介绍. 聚类算法包括多种,可按如下分配: 1.划分法:基于此种思想的聚类算法包括 k-means,PAM,CLARA,CLARANS,STIRR

MATLAB聚类有效性评价指标(外部) 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 更多内容,请看:MATLAB.聚类.MATLAB聚类有效性评价指标(外部 成对度量).MATLAB: Clustering Algorithms 前提:数据的真实标签已知! 1. 归一化互信息(Normalized Mutual information) 定义 程序 function MIhat = nmi(A, B) %NMI Normalized mutua

在Spark2.0版本中(不是基于RDD API的MLlib),共有四种聚类方法:             (1)K-means             (2)Latent Dirichlet allocation (LDA)             (3)Bisecting k-means(二分k均值算法)             (4)Gaussian Mixture Model (GMM).             基于RDD API的MLLib中,共有六种聚类方法:          

密度峰值聚类算法(DPC) 凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 1. 简介 基于密度峰值的聚类算法全称为基于快速搜索和发现密度峰值的聚类算法(clustering by fast search and find of density peaks, DPC).它是2014年在Science上提出的聚类算法,该算法能够自动地发现簇中心,实现任意形状数据的高效聚类. 该算法基于两个基本假设:1)簇中心(密度峰值点)的局部密度大于围绕它的邻居的局部密

sklearn中的指标都在sklearn.metric包下,与聚类相关的指标都在sklearn.metric.cluster包下,聚类相关的指标分为两类:有监督指标和无监督指标,这两类指标分别在sklearn.metric.cluster.supervised和sklearn.metric.cluster.unsupervised包下.聚类指标大部分都是有监督指标,无监督指标较少. 无监督指标和有监督指标应该充分配合起来:无监督指标很好,有监督指标很差,表明这个问题可能不是单靠聚类就能解决的:无

一.K均值聚类算法 算法步骤如下: 1.初始化 已知数据集合X,及事先指定聚类的总类数N,在X中随机选取N个对象作为初始的聚类中心. 2.设定迭代终止条件 通常设置最大循环次数或者聚类中心的变化误差. 3.更新样本对象所属类 根据距离准则将数据对象分配到距离最接近的类. 4.更新类的中心位置 将每一类的平均向量作为下次迭代的聚类中心. 5.重复步骤3~4,满足步骤2中的迭代终止条件时,停止 Matlab代码见下图: K均值聚类算法-Matlab代码 二.K均值聚类算法应用举例 1.随机生成三组数

简单易学的机器学习算法-基于密度的聚类算法DBSCAN 一.基于密度的聚类算法的概述 我想了解下基于密度的聚类算法,熟悉下基于密度的聚类算法与基于距离的聚类算法,如K-Means算法之间的区别.     基于密度的聚类算法主要的目标是寻找被低密度区域分离的高密度区域.与基于距离的聚类算法不同的是,基于距离的聚类算法的聚类结果是球状的簇,而基于密度的聚类算法可以发现任意形状的聚类,这对于带有噪音点的数据起着重要的作用. 二.DBSCAN算法的原理 1.基本概念     DBSCAN(Density

一.基于密度的聚类算法的概述     最近在Science上的一篇基于密度的聚类算法<Clustering by fast search and find of density peaks>引起了大家的关注(在我的博文“论文中的机器学习算法——基于密度峰值的聚类算法”中也进行了中文的描述).于是我就想了解下基于密度的聚类算法,熟悉下基于密度的聚类算法与基于距离的聚类算法,如K-Means算法之间的区别.     基于密度的聚类算法主要的目标是寻找被低密度区域分离的高密度区域.与基于距离的聚类算

基础知识: K-means聚类算法 聚类,简单地说就是把相似的东西分到一组.同 Classification (分类)不同,对于一个 classifier ,通常需要你告诉它“这个东西被分为某某类”. 理想情况下,一个 classifier 会从它得到的训练集中进行“学习”, 从而具备对未知数据进行分类的能力,这种提供训练数据的过程通常叫做 supervised learning (监督学习). 而在聚类的时候,我们并不关心某一类是什么,我们需要实现的目标只是把相似的东西聚到一起,因此,一个聚类

继上两篇文章介绍聚类中基于划分思想的k-means算法和k-mediod算法 本文将继续介绍另外一种基于划分思想的k-mediod算法-----clara算法 clara算法可以说是对k-mediod算法的一种改进,就如同k-mediod算法对k-means算法的改进一样. clara(clustering large application)算法是应用于大规模数据的聚类.而其核心算法还是利用k-mediod算法. 只是这种算法弥补了k-mediod算法只能应用于小规模数据的缺陷. clara算

scikit-learn API 这是scikit-learn的类和函数参考.有关详细信息,请参阅完整的用户指南,因为类和功能原始规格可能不足以提供有关其用途的完整指南. sklearn.base:基类和实用函数 所有估算器的基类. 基类 base.BaseEstimator:scikit-learn中所有估算器的基类 base.BiclusterMixin:Mixin类适用于scikit-learn中的所有bicluster估算器 base.ClassifierMixin:Mixin类适用于s

## 版权所有,转帖注明出处 章节 SciKit-Learn 加载数据集 SciKit-Learn 数据集基本信息 SciKit-Learn 使用matplotlib可视化数据 SciKit-Learn 可视化数据:主成分分析(PCA) SciKit-Learn 预处理数据 SciKit-Learn K均值聚类 SciKit-Learn 支持向量机 SciKit-Learn 速查 Scikit-learn是一个开源Python库,它使用统一的接口实现了一系列机器学习.预处理.交叉验证和可视化算法

其实一直以来也没有准备在园子里发这样的文章,相对来说,算法改进放在园子里还是会稍稍显得格格不入.但是最近邮箱收到的几封邮件让我觉得有必要通过我的博客把过去做过的东西分享出去更给更多需要的人.从论文刊登后,陆陆续续收到本科生.研究生还有博士生的来信和短信微信等,表示了对论文的兴趣以及寻求算法的效果和实现细节,所以,我也就通过邮件或者短信微信来回信,但是有时候也会忘记回复. 另外一个原因也是时间久了,我对于论文以及改进的算法的记忆也越来越模糊,或者那天无意间把代码遗失在哪个角落,真的很难想象我还会全

前言:这几天一直都在研究模糊聚类.感觉网上的文档都没有一个详细而具体的讲解,正好今天有时间,就来聊一聊模糊聚类. 一:模糊数学 我们大家都知道计算机其实只认识两个数字0,1.我们平时写程序其实也是这样if 1 then do.永远这种模式,在这种模式中,一个元素要么属于这个集合,要么不属于这个集合,但是对我们现在介绍的模糊集来说,某个元素可能部分属于这个集合,又可能部分属于另外的集合,显然,例如,一个男人(1表示),一个女人(0表示),但是随着科学技术的发展,出现了人妖这个生物(可能0.3属于男