MEGAN(Metagenome Analyzer)是宏基因组学进行物种和功能研究的常用软件,实际上现在的Diamond+MEGAN6已经是一套比较完整的物种和功能注释流程了. 但是由于各种原因,我们在流程中使用的并非最新版.不同版本的MEGAN使用方法差别较大,尤其在命令行模式下.网上的关于这方面的资料也寥寥无几,这里简单记录下使用方法,主要是针对Linux平台的使用. MEGAN的GUI版相对友好,如果你在Windows平台使用过该软件,那么在Linux上使用和理解起来相对容易些. MEGA
目录 一.iMetaLab简介 二.内置工具与模块 1. Data Processing module 2. Functional Analysis 3. R Developing environment 4. R based data analysis packages 5. Web development libraries and frameworks 三.报告内容 1. 谱图肽段ID统计 2. 肽段鉴定结果分析 3. 蛋白鉴定结果分析 4. 物种分析 5. 功能分析 MetaMep fo