DGE-seq和普通的transcriptomic profiling相比较有什么不同,有什么特点? DGE就是用酶将mRNA切断,只使用靠近poly A的一小段RNA去测序. #1 由于不是测定mRNA的全长,DGE的数据量比转录组要小一些: #2 DGE比转录组价格低一些: #3 DGE和转录组都可以分析所有基因的表达丰度,并且比较组间基因表达差异: #4 转录组还可以分析SNP.RNA editing.splicing.gene fusion等:而DGE不适宜做这些分析. 转录组测序和数字

单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用.其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录本的表达情况.但传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性.近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-

可变剪接(alternative splicing),在真核生物中是一种非常基本的生物学事件.即基因转录后,先产生初始RNA或称作RNA前体,然后再通过可变剪接方式,选择性的把不同的外显子进行重连,从而产生不同的剪接异构体(isoform).这种方式,使得一个基因可产生多个不同的转录本,这些转录本分别在细胞/个体分化发育的不同阶段,在不同的组织中有各自特异的表达和功能,从而极大地丰富了编码RNA和非编码RNA种类和数量,进而增加了转录组和蛋白质组的复杂性. 可变剪接主要有以下五种常见的形式: 1

    转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合.转录组研究能够从整体水 平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,已广泛应 用于基础研究.临床诊断和药物研发等领域.基于 Illumina 高通量测序平台的转录组测序技术使 能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同 时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及 cSNP(编码序列单核苷 酸多态性),提供最全面的转录组信息.相对于传统的芯片

GET和POST是HTTP请求的两种基本方法,要说它们的区别,接触过WEB开发的人都能说出一二. 最直观的区别就是GET把参数包含在URL中,POST通过request body传递参数. 你可能自己写过无数个GET和POST请求,或者已经看过很多权威网站总结出的他们的区别,你非常清楚知道什么时候该用什么. 当你在面试中被问到这个问题,你的内心充满了自信和喜悦. 你轻轻松松的给出了一个"标准答案": GET在浏览器回退时是无害的,而POST会再次提交请求. GET产生的URL地址可以被

因为之前写的程序比较小,编译起来比较快,所以一直都没有太在意 Build 和 Rebuild 之间的区别,后来发现两个还是有很大不同. Build 只针对在上次编译之后更改过的文件进行编译,在项目比较庞大的时候,Build 还是很有优势的. Rebuild 会编译所有文件,一般相当于执行 Clean + Build(清理并生成). 无论 Build 和 Rebuild,都可以分别针对解决方案和项目.当目标是解决方案的时候,那么 Build 或者 Rebuild 的目标就是解决方案中所有的项目.

SQL Server 中 EXEC 与 SP_EXECUTESQL 的区别 MSSQL为我们提供了两种动态执行SQL语句的命令,分别是 EXEC 和 SP_EXECUTESQL ,我们先来看一下两种方式的用法. 先建立一个表,并添加一些数据来进行演示: CREATE TABLE t_student( Id INT NOT NULL, Name NVARCHAR () NULL, Age TINYINT NULL, School NVARCHAR() NULL, Class NVARCHAR()

   java集合中List与set的区别.     List可以存储元素为有序性并且元素可以相同.     set存储元素为无序性并且元素不可以相同.     下面贴几段代码感受一下: ArrayList list = new ArrayList();//构造出List对象 list.add(1); list.add("string"); list.add(true); list.add(3.14); list.add(null); for(int i = 0; i < siz

java中set map list的区别: 都是集合接口 简要说明 set --其中的值不允许重复,无序的数据结构 list   --其中的值允许重复,因为其为有序的数据结构 map--成对的数据结构,健值必须具有唯一性(键不能同,否则值替换) List按对象进入的顺序保存对象,不做排序或编辑操作.Set对每个对象只接受一次,并使用自己内部的排序方法(通常,你只关心某个元素是否属于Set,而不关心它的顺序--否则应该使用List).Map同样对每个元素保存一份,但这是基于"键"的,Ma

oracle中函数和存储过程的区别和联系[转载竹沥半夏] 在oracle中,函数和存储过程是经常使用到的,他们的语法中有很多相似的地方,但也有自己的特点.刚学完函数和存储过程,下面来和大家分享一下自己总结的关于函数和存储过程的区别. 一.存储过程 1.定义 存储过程是存储在数据库中提供所有用户程序调用的子程序,定义存储过程的关键字为procedure. 2.创建存储过程 create [or replace] procedure 存储过程名 [(参数1 类型,参数2 out 类型……)] as

JS中isPrototypeOf 和hasOwnProperty 的区别 1.isPrototypeOf isPrototypeOf是用来判断指定对象object1是否存在于另一个对象object2的原型链中,是则返回true,否则返回false. 格式如下: object1.isPrototypeOf(object2); object1是一个对象的实例: object2是另一个将要检查其原型链的对象. 原型链可以用来在同一个对象类型的不同实例之间共享功能. 如果 object2 的原型链中包含

Java中Comparable和Comparator接口区别分析 来源:码农网 | 时间:2015-03-16 10:25:20 | 阅读数:8902 [导读] 本文要来详细分析一下Java中Comparable和Comparator接口的区别,两者都有比较的功能,那么究竟有什么区别呢,感兴趣的Java开发者继续看下去吧.Comparable 简介Comparable 是排序接口.若一个类实现了Comparab 本文要来详细分析一下Java中Comparable和Comparator接口的区别,

trigger(event, [data]) 在每一个匹配的元素上触发某类事件. 这个函数也会导致浏览器同名的默认行为的执行.比如,如果用trigger()触发一个'submit',则同样会导致浏览器提交表单.如果要阻止这种默认行为,应返回false. 你也可以触发由bind()注册的自定义事件 $("p").click( function (event, a, b) { // 一个普通的点击事件时,a和b是undefined类型 // 如果用下面的语句触发,那么a指向"fo

转自:Java中abstract和interface的区别 abstract class和interface是Java语言中对于抽象类定义进行支持的两种机制,正是由于这两种机制的存在,才赋予了Java强大的面向对象能力. abstract class和interface之间在对于抽象类定义的支持方面具有很大的相似性,甚至可以相互替换,因此很多开发者在进行抽象类定义时对于 abstract class和interface的选择显得比较随意.其实,两者之间还是有很大的区别的,对于它们的选择甚至反映出

C++中typename和class的区别 在c++Template中很多地方都用到了typename与class这两个关键字,而且好像可以替换,是不是这两个关键字完全一样呢? 相信学习C++的人对class这个关键字都非常明白,class用于定义类,在模板引入c++后,最初定义模板的方法为: template<class T>...... 在 这里class关键字表明T是一个类型,后来为了避免class在这两个地方的使用可能给人带来混淆,所以引入了typename这个关键字,它的作用同 cl

引用文章:http://www.ibm.com/developerworks/cn/java/j-jsp04293/ http://www.cnblogs.com/lazycoding/archive/2011/04/04/two_include.html JSP中两种include的区别 首先说明这两种都是什么: <%@ include file=”relativeURI”%> 可以叫作静态include(静态包含),是jsp指令中的一种,(JSP指令控制JSP编译器如何去生成servlet

php中explode与split的区别介绍 作者: 字体:[增加 减小] 类型:转载 今天在使用split时遇到一些问题.还是对函数理解不深刻,特写出来做个记 首先来看下两个方法的定义: 函数原型:array split (string $pattern, string $string [, int $limit]) 函数原型:array explode ( string $separator, string $string [, int $limit]) 初看没有啥差别,貌似功能都一样.我就

C#中virtual与abstract的区别 C#的virtual & abstract经常让人混淆,这两个限定词都是为了让子类进行重新定义,覆盖父类的定义.但是用法上差别很大. a)     virtual修饰的方法必须有方法实现(哪怕只有一对大括号),abstract修饰的方法不能有实现. b)    virtual可以被子类重写,abstract必须被子类重写 c)     如果类中的某一函数被abstact修饰,则类名也必须用abstact修饰 d)    Abstract修饰的类不能被

jquery中attr和prop的区别. 什么时候用 attr 什么时候用 prop   在高版本的jquery引入prop方法后,什么时候该用prop?什么时候用attr?它们两个之间有什么区别?这些问题就出现了. 关于它们两个的区别,网上的答案很多.这里谈谈我的心得,我的心得很简单: 对于HTML元素本身就带有的固有属性,在处理时,使用prop方法. 对于HTML元素我们自己自定义的DOM属性,在处理时,使用attr方法. 上面的描述也许有点模糊,举几个例子就知道了. <a href="

C++中引用与指针的区别(详细介绍) C++中的引用与指针的区别   指向不同类型的指针的区别在于指针类型可以知道编译器解释某个特定地址(指针指向的地址)中的内存内容及大小,而void*指针则只表示一个内存地址,编译器不能通过该指针所指向对象的类型和大小,因此想要通过void*指针操作对象必须进行类型转化.       ★ 相同点:       1. 都是地址的概念:        指针指向一块内存,它的内容是所指内存的地址:        引用是某块内存的别名.       ★ 区别: