作者:桂. 时间:2017-04-14   06:22:26 链接:http://www.cnblogs.com/xingshansi/p/6685811.html 声明:欢迎被转载,不过记得注明出处哦~ 前言 之前梳理了一下非负矩阵分解(Nonnegative matrix factorization, NMF),主要有: 1)准则函数及KL散度 2)NMF算法推导与实现 3)拉格朗日乘子法求解NMF(将含限定NMF的求解 一般化) 谱聚类可以参考之前的文章: 1)拉普拉斯矩阵(Laplace

本文从基础介绍隐语义模型和NMF. 隐语义模型 ”隐语义模型“常常在推荐系统和文本分类中遇到,最初来源于IR领域的LSA(Latent Semantic Analysis),举两个case加快理解. 向用户推荐物品 在推荐系统中,可以通过隐含语义模型将用户(user)和物品(item)自动分类,这些类别是自动生成的.这些类别也可以叫做“隐含的分类”,也许看不懂.每个用户或者物品会被分到多个类别中,属于某个类别的权重会被计算出来. 假设现在有一个大小为m×n的评分矩阵V,包含了m个用户对n个物品的

作者:桂. 时间:2017-04-06  12:29:26 链接:http://www.cnblogs.com/xingshansi/p/6672908.html 声明:欢迎被转载,不过记得注明出处哦~ 前言 之前在梳理最小二乘的时候,矩阵方程有一类可以利用非负矩阵分解(Non-negative matrix factorization, NMF)的方法求解,经常见到别人提起这个算法,打算对此梳理一下.优化问题求解,最基本的是问题描述与准则函数的定义,紧接着才涉及准则函数的求解问题,本文为NMF

http://blog.csdn.net/pipisorry/article/details/52098864 非负矩阵分解(NMF,Non-negative matrix factorization) NMF的发展及原理 著名的科学杂志<Nature>于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果.该文提出了一种新的矩阵分解思想--非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF是在矩阵中所

在文本主题模型之潜在语义索引(LSI)中,我们讲到LSI主题模型使用了奇异值分解,面临着高维度计算量太大的问题.这里我们就介绍另一种基于矩阵分解的主题模型:非负矩阵分解(NMF),它同样使用了矩阵分解,但是计算量和处理速度则比LSI快,它是怎么做到的呢? 1. 非负矩阵分解(NMF)概述 非负矩阵分解(non-negative matrix factorization,以下简称NMF)是一种非常常用的矩阵分解方法,它可以适用于很多领域,比如图像特征识别,语音识别等,这里我们会主要关注于它在文本主

著名的科学杂志<Nature>于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果.该文提出了一种新的矩阵分解思想――非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件之下的矩阵分解方法.该论文的发表迅速引起了各个领域中的科学研究人员的重视:一方面,科学研究中的很多大规模数据的分析方法需要通过矩阵形式进行有效处理,而NMF思想则为人类处理大规模数据提供了一种新的途径

一.矩阵分解回想 在博文推荐算法--基于矩阵分解的推荐算法中,提到了将用户-商品矩阵进行分解.从而实现对未打分项进行打分. 矩阵分解是指将一个矩阵分解成两个或者多个矩阵的乘积.对于上述的用户-商品矩阵(评分矩阵),记为Vm×n.能够将其分解成两个或者多个矩阵的乘积,如果分解成两个矩阵Wm×k和Hk×n.我们要使得矩阵Wm×k和Hk×n的乘积能够还原原始的矩阵Vm×n: Vm×n≈Wm×k×Hk×n=V^m×n 当中,矩阵Wm×k表示的是m个用户与k个主题之间的关系,而矩阵Hk×n表示的是k个主题

著名的科学杂志<Nature>于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果.该文提出了一种新的矩阵分解思想――非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF是在矩阵中所有元素均为非负数约束条件之下的矩阵分解方法.该论文的发表迅速引起了各个领域中的科学研究人员的重视:一方面,科学研究中的很多大规模数据的分析方法需要通过矩阵形式进行有效处理,而NMF思想则为人类处理大规模数据提供了一种新的途径

1.交叉验证 交叉验证(Cross validation),交叉验证用于防止模型过于复杂而引起的过拟合.有时亦称循环估计, 是一种统计学上将数据样本切割成较小子集的实用方法. 于是可以先在一个子集上做分析, 而其它子集则用来做后续对此分析的确认及验证. 一开始的子集被称为训练集.而其它的子集则被称为验证集或测试集. 交叉验证是一种评估统计分析.机器学习算法对独立于训练数据的数据集的泛化能力(generalize).交叉验证一般要尽量满足: 1)训练集的比例要足够多,一般大于一半2)训练集和测试集

一.矩阵分解回想 矩阵分解是指将一个矩阵分解成两个或者多个矩阵的乘积.对于上述的用户-商品(评分矩阵),记为能够将其分解为两个或者多个矩阵的乘积,如果分解成两个矩阵和 .我们要使得矩阵和 的乘积能够还原原始的矩阵 当中,矩阵表示的是m个用户于k个主题之间的关系,而矩阵表示的是k个主题与n个商品之间的关系 通常在用户对商品进行打分的过程中,打分是非负的,这就要求: 这便是非负矩阵分解(NMF)的来源. 二.非负矩阵分解 2.1.非负矩阵分解的形式化定义 上面介绍了非负矩阵分解的基本含义.简单来讲,

1.什么是非负矩阵分解? NMF的基本思想可以简单描述为:对于任意给定的一个非负矩阵V,NMF算法能够寻找到一个非负矩阵W和一个非负矩阵H,使得满足 ,从而将一个非负的矩阵分解为左右两个非负矩阵的乘积.如下图所示,其中要求分解后的矩阵H和W都必须是非负矩阵. 分解前后可理解为:原始矩阵的列向量是对左矩阵中所有列向量的加权和,而权重系数就是右矩阵对应列向量的元素,故称为基矩阵,为系数矩阵.一般情况下的选择要比小,即满足,这时用系数矩阵代替原始矩阵,就可以实现对原始矩阵进行降维,得到数据特征的降维矩

1. 起因 之前的代码(单细胞分析实录(17): 非负矩阵分解(NMF)代码演示)没有涉及到python语法,只有4个python命令行,就跟Linux下面的ls grep一样的.然鹅,有几个小伙伴不会命令行,所以我决定再改写一下,把命令行都放到R下面运行. 2. 尝试 2.1 一开始,我的想法是教大家在R里面调用python,需要提前下载好anaconda和一些python包 然而想了想在Windows上安装python包可能对大家不是很友好,有些包很难装,我之前也弄了很久.考虑到这次更新是针

非负矩阵分解(NMF)是一种无监督学习算法,目的在于提取有用的特征(可以识别出组合成数据的原始分量),也可以用于降维,通常不用于对数据进行重建或者编码. NMF将每个数据点写成一些分量的加权求和(与PCA相同),并且分量和系数都大于0, 只能适用于每个特征都是非负的数据(正负号实际上是任意的). 1.将NMF应用于模拟数据 应用NMF时,我们必须保证数据是正的 如图 两个分量的NMF:分量指向边界,所有的数据点都可以写成这两个分量的正数组合. 一个分量的NMF:分量指向平均值,指向这里可以对数据

英文链接:http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/applications/topics_extraction_with_nmf_lda.html 这是一个使用NMF和LDA对一个语料集进行话题抽取的例子. 输入分别是是tf-idf矩阵(NMF)和tf矩阵(LDA). 输出是一系列的话题,每个话题由一系列的词组成. 默认的参数(n_samples/n_features/n_topics)会使这个例子运行数十秒. 你可以尝试修改问题的规模,但是要注

本次演示使用的数据来自2017年发表于Cell的头颈鳞癌单细胞文章:Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer.本次演示提供处理好的测试数据,以及所有代码,一共6个脚本(我目前写得最详细的教程,也是全网少有的). 数据的预处理就不演示了,预处理的代码存放在0.pre.R文件中. 以下是肿瘤细胞tsne图和原图的对比,和原文一致,说明前面

作者:桂. 时间:2017-04-13  07:43:03 链接:http://www.cnblogs.com/xingshansi/p/6702188.html 声明:欢迎被转载,不过记得注明出处哦~ 前言 前面分析了非负矩阵分解(NMF)的应用,总觉得NMF与谱聚类(Spectral clustering)的思想很相似,打算分析对比一下.谱聚类更像是基于图(Graph)的思想,其中涉及到一个重要概念就是拉普拉斯矩阵(Laplace matrix),想着先梳理一下这个矩阵: 1)拉普拉斯矩阵基

作者:桂. 时间:2017-04-13  19:14:48 链接:http://www.cnblogs.com/xingshansi/p/6702174.html 声明:本文大部分内容来自:刘建平Pinard博客的内容. 前言 之前对非负矩阵分解(NMF)简单梳理了一下,总觉得NMF与聚类非常相似,像是谱聚类的思想.在此将谱聚类的知识梳理一下,内容无法转载,不然直接转载刘建平Pinard的博文了,常用的谱聚类有RatioCut和Ncut算法,全文主要梳理RatioCut算法: 1)背景知识: 2

作者:桂. 时间:2017-04-13  19:14:48 链接:http://www.cnblogs.com/xingshansi/p/6702174.html 声明:本文大部分内容来自:刘建平Pinard博客的内容. 前言 之前对非负矩阵分解(NMF)简单梳理了一下,总觉得NMF与聚类非常相似,像是谱聚类的思想.在此将谱聚类的知识梳理一下,内容无法转载,不然直接转载刘建平Pinard的博文了,常用的谱聚类有RatioCut和Ncut算法,全文主要梳理RatioCut算法: 1)背景知识: 2

本例构建一个管道来进行降维和预测的工作:先降维,接着通过支持向量分类器进行预测.本例将演示与在网格搜索过程进行单变量特征选择相比,怎样使用GrideSearchCV和管道来优化单一的CV跑无监督的PCA降维与NMF降维不同类别评估器. (原文:This example constructs a pipeline that does dimensionality reduction followed by prediction with a support vector classifier. I

本文汇编了一些机器学习领域的框架.库以及软件(按编程语言排序). 1. C++ 1.1 计算机视觉 CCV —基于C语言/提供缓存/核心的机器视觉库,新颖的机器视觉库 OpenCV—它提供C++, C, Python, Java 以及 MATLAB接口,并支持Windows, Linux, Android and Mac OS操作系统. 1.2 机器学习 MLPack DLib ecogg shark 2. Closure Closure Toolbox—Clojure语言库与工具的分类目录 3