二代reads最短都有50bp,所以大家常用的比对工具都是不支持50bp以下的reads的比对的. 但是,在实际中,我们确实又有比对super short reads的需求. So,我找到了如下方法来比对super short reads: 1.msa.sh,bbmap里的,好用,但是太慢. 2.bbduk.sh,bbmap里的,不支持输出sam文件,只能输出map和unmap的reads. 3.bbmap.sh,好用,超快,但是不支持mismatch,可惜. 4.seal.sh,没试过. 5.

一.key与primary key区别 CREATE TABLE wh_logrecord ( logrecord_id ) NOT NULL auto_increment, ) default NULL, operation_time datetime default NULL, logrecord_operation ) default NULL, PRIMARY KEY (logrecord_id), KEY wh_logrecord_user_name (user_name) ) 解析:

参考:https://blog.csdn.net/nanamasuda/article/details/52543177 总的来说,primary key .unique key 这些key建立的同时索引index也就建好了.primary key 和 unique key 都是唯一记录表的一行数据,区别在于前者只能有一个,而后者可以有多个. 如果想深入了解,请继续往下看. 索引被用来快速找出在一个列上用一特定值的行.没有索引,MySQL不得不首先以第一条记录开始并然后读完整个表直到它找出相关的

MySQL索引的概念    索引是一种特殊的文件(InnoDB数据表上的索引是表空间的一个组成部分),它们包含着对数据表里所有记录的引用指针.更通俗的说,数据库索引好比是一本书前面的目录,能加快数据库的查询速度.    索引分为聚簇索引和非聚簇索引两种,聚簇索引是按照数据存放的物理位置为顺序的,而非聚簇索引就不一样了:聚簇索引能提高多行检索的速度,而非聚簇索引对于单行的检索很快    要注意的是,建立太多的索引将会影响更新和插入的速度,因为它需要同样更新每个索引文件.对于一个经常需要更新和插入的

mysql中key .primary key .unique key 与index区别

问题背景 最近用explain命令分析查询sql执行计划,时而能看到Extra中显示为"Using index"或者"Using where; Using Index",对这两者之间的明确区别产生了一些疑惑,于是通过网上搜索.自行实验探究了一番其具体区别. 测试数据准备 以下表作为测试表进行sql分析. CREATE TABLE `test_table` ( `id` bigint(20) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT, `f0`

看似有差不多的作用,加了Key的表与建立了Index的表,都可以进行快速的数据查询.他们之间的区别在于处于不同的层面上. Key即键值,是关系模型理论中的一部份,比如有主键(Primary Key),外键(Foreign Key)等,用于数据完整性检查与唯一性约束等. 而Index则处于实现层面,比如可以对表个的任意列建立索引,那么当建立索引的列处于SQL语句中的Where条件中时,就可以得到快速的数据定 位,从而快速检索.至于Unique Index,则只是属于Index中的一种而已,建立了U

众所周知,MySQL创建索引有两种语法,即:ALTER TABLE HeadOfState ADD INDEX (LastName, FirstName);CREATE INDEX index_name HeadOfState (LastName, FirstName);那么,这两种语法有什么区别呢? 在网上找了一下,在一个英文网站上,总结了下面几个区别,我翻译出来,如下:1.CREATE INDEX必须提供索引名,对于ALTER TABLE,将会自动创建,如果你不提供:2.CREATE IND

mysql的key和index多少有点令人迷惑,这实际上考察对数据库体系结构的了解的.    1).key 是数据库的物理结构,它包含两层意义,一是约束(偏重于约束和规范数据库的结构完整性),二是索引(辅助查询用的).包括primary key, unique key, foreign key 等.   primary key 有两个作用,一是约束作用(constraint),用来规范一个存储主键和唯一性,但同时也在此key上建立了一个index:   unique key 也有两个作用,一是约

Legacy Indexes 在Neo4j 2.0版本之前,Legacy index被称作indexes.这个索引是通过外部图存储在外的Lucene实现,允许“节点”和“联系”以key:value键值对的方法被检索.从Neo4j 提供的REST接口来看,被称作“index”的变量通常是指Legacy indexes. Legacy index能够提供全文本检索的能力.这个功能并没有在schema index中被提供,这也是Neo4j 2.0* 版本保留legacy indexes的原因之一 注意

CREATE TABLE pre_forum_post ( pid int(10) unsigned NOT NULL COMMENT '帖子id', fid mediumint(8) unsigned NOT NULL default '0' COMMENT '论坛id', tid mediumint(8) unsigned NOT NULL default '0' COMMENT '主题id', `first` tinyint(1) NOT NULL default '0' COMMENT

参考:MySQL中KEY.PRIMARY KEY.UNIQUE KEY.INDEX 的区别 对于题目中提出的问题,可以拆分来一步步解决.在 MySQL 中 KEY 和 INDEX 是同义.那这个问题就可以简化为 PRIMARY KEY,UNIQUE KEY 和 INDEX 的区别.而这三者也正好是索引的划分,主键索引,唯一索引和普通索引(INDEX). 使用 INDEX 来加速从数据库中读取数据.INDEX 通常加在那些 JOIN, WHERE,和 ORDER BY 子句的列上. 创建索引时,需

一.key与primary key区别 CREATE TABLE wh_logrecord ( logrecord_id int(11) NOT NULL auto_increment, user_name varchar(100) default NULL, operation_time datetime default NULL, logrecord_operation varchar(100) default NULL, PRIMARY KEY (logrecord_id), KEY wh

MySQL InnoDB Add Index实现调研 MySQL Add Index实现 MySQL各版本,对于add Index的处理方式是不同的,主要有三种: Copy Table方式 这是InnoDB最早支持的创建索引的方式.顾名思义,创建索引是通过临时表拷贝的方式实现的. 新建一个带有新索引的临时表,将原表数据全部拷贝到临时表,然后Rename,完成创建索引的操作. 这个方式创建索引,创建过程中,原表是可读的.但是会消耗一倍的存储空间. Inplace方式 这是原生MySQL 5.5,以

python中index.slice与slice assignment用法 一.index与slice的定义: index用于枚举list中的元素(Indexes enumerate the elements): slice用于枚举list中元素集合(Slices enumerate the spaces between the elements). slice assignment,是一个语法糖,主要用于list的快速插入.替换.删除元素. 二.语法 index index语法很简单,如下表所

webForm页面运行起来url一般是这样的:localhost:****/index.aspx,这个过程就是当你运行页面的时候,vs开发工具自带的微型服务器会打开你存在硬盘上的这个文件然后显示在浏览器上,所以url是后半部分是页面的名字(index.aspx),但是在mvc中却是这样的:localhost:****/index,因为mvc中有一整套路由机制来控制浏览器的请求. 看看Global.asax文件里路由的定义: public static void RegisterRoutes(Ro

关于外键约束关系下修改或者删除表的方法: http://wenku.baidu.com/link?url=RRaI160kvsdf7ibMLqxN815RvStSyenz_-ig1ONfpRfpfFpqtbGQIL4w3IhAw3XySR7Jfxn4Pncl68bIm3qQ_ZZkpJj_HoBt6tFVLa_IHsu mysql中key .primary key .unique key 与index区别: http://zccst.iteye.com/blog/1697043 CREATE T

1.循环正常结束是指没有中间截断,即没有执行break; for i in range(10) print(i) else: print("循环正常结束") 2.嵌套循环 for i in range(10) for j in range(10) print(i,j) 3.break 只会跳出当前循环 for i in range(10) for j in range(10) print(i,j) if j >5: break 4.for 循环,小循环不走 for i in ra

一.oracle递归查询语句start with ...connect by prior ① 给你一张表,表里面有主键id,以及该项的父节点parent_id,查询出该表中所有的父子关系节点树? Oracle: start with ...connect by prior 例如:对分类下的所有组图(包括子分类下的组图)列表进行分页 select g.* from t_group g, t_counter c where g.counter_id = c.id and g.category_id 

若Route中有Route::get('home/test', 'HomeController@index')->name('test'); ①视图中的href跳转 一.<a href="{{ url('home/test') }}"> 区别:最方便,但路由改变时就又要修改了 二.<a href="{{ route('test') }}">    区别:可直接命名使用,不因uri改变而改变,我喜欢用 注:用route需要在route中-

doT.js 灵感来源于搜寻基于 V8 和 Node.js ,强调性能,最快速最简洁的 JavaScript 模板函数 引入 javascript 文件: <script type="text/javascript" src="doT.js"></script> doT.templateSettings - 默认编译设置 可以通过改变编译设置自定义 doT.这是默认设置: doT.templateSettings = { evaluate: