简单说明: 从2.28.0版开始,bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件,bedtools默认所有的输入文件都以TAB键分割 除非使用-sorted选项,bedtools默认不支持大于512M的染色体 如果没有使用-sorted参数对染色体按编码顺序进行排序(e.g., sort -k1,1 -k2,2n ),则必须使用-g参数输入相同排序染色体 bedtools要求染色体命名方案在比较文件中是相同的(例如'chr1'和'1'不能同时存在) 1 genomecov 计

这个也是一个线段树的模板 #include<iostream> #include<string.h> #include<algorithm> #include<stdio.h> #include<set> using namespace std; ; set<int>s; struct node{ int color; int left; int right; int mid; }a[maxx<<]; void pushd

When ?? was born, seven crows flew in and stopped beside him. In its childhood, ?? had been unfortunately fall into the sea. While it was dying, seven dolphins arched its body and sent it back to the shore. It is said that ?? used to surrounded by 7

第一步:创建数据-区间 辅助表(注意:首列值必须以升序排列,为后面vlookup模糊匹配做准备) 第二步:用vlookup模糊匹配生成一个新的“金额区间”字段 第三步:以“金额区间”字段为行透视汇总

题目传送门//res tp hdu 目的 对长度为n的区间,m次询问,每次提供一个区间两端点与一个值x,求区间内不超过x的元素个数 n 1e5 m 1e5 ai [1,1e9] (i∈[1,n]) 多测 数据结构与--? 划分树 + 二分查找 分析 建树0(nlogn) 单次查询第k小,需O(logn) 蛮力枚举区间内所有元素,查看是否大于x,需O(nlogn),m次询问,总O(mnlogn),显然会超时. 考虑以二分x的方式枚举出不超过x的最大上界只需O(mlogxlogn).这种方法是可接受

[链接] 我是链接,点我呀:) [题意] 题意 [题解] 因为区间的端点移动一个单位的话,只会涉及到一个元素的增多或减少. 因此可以用莫队算法来解决. 只需要开一个数组(大小1百万),用下标来快速检索元素的个数即可. [代码] #include <bits/stdc++.h> #define ll long long using namespace std; struct abc{ int l,r,id; }; const int N = 30000; const int Q = 200000

http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=4509 题目大意: 中文意义,应该能懂. 解题思路: 因为题目给的时间是一天24小时,而且还有分钟.为了解题方便,我们将小时换成分钟,那么一天24小时,总共有1440分钟.顾我就可以把一天里的任意HH:MM时间换成分钟.就这样一天的时间就变成[0,1440]区间了. 因为所给的活动最多是5*10^5,如果把活动的时间在线段[0,1440]都修改,那么时间的复杂度最坏是O(5*10^5*1440). (1)方法一

前言 线段树(区间树)是什么呢?有了二叉树.二分搜索树,线段树又是干什么的呢?最经典的线段树问题:区间染色:正如它的名字而言,主要解决区间的问题 一.线段树说明 1.什么是线段树? 线段树首先是二叉树,并且是平衡二叉树(它是一 棵空树或它的左右两个子树的高度差的绝对值不超过1,并且左右两个子树都是一棵平衡二叉树),并且具有二分性质. 如下图,就是一颗线段树: 假如,用数组表示线段树,如果区间有n个元素,数组表示需要有多少节点? 2.4n节点推导过程 要进行一下,如果对推导过程不感兴趣的,可以直接

mysql 作为常用数据库,操作贼六是必须的,对于数字操作相关的东西,那是相当方便,本节就来拎几个统计案例出来供参考! order订单表,样例如下: CREATE TABLE `t_order` ( `id` ) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT, `) NOT NULL, `order_nid` ) NOT NULL, `status` ) ', `,) NOT NULL DEFAULT '0.00', `create_time` timestamp NOT N

如何进行分区间数据统计示例 业务场景:统计消费总金额大于1000元的,800到1000元的,500到800元的,以及500元以下的人数. SELECT COUNT(CASE WHEN IFNULL(total_money,0) >=1000 THEN a.customer_id END) AS '>1000' ,COUNT(CASE WHEN IFNULL(total_money,0) >=800 AND IFNULL(total_money,0) <1000 THEN a.cus

一)概述 Facet是solr的高级搜索功能之一,可以给用户提供更友好的搜索体验.在搜索关键字的同时,能够按照Facet的字段进行分组并统计.例如下图所示,你上淘宝,输入“电脑”进行搜索,就会出现品牌分类,价格范围等分类,这个就叫Facet. 二)Solr Facet类型 Solr提供了4种类型的Fact <lst name="facet_counts"> <lst name="facet_queries"/> <lst name=&q

ZOJ Problem Set - 1610 Count the Colors Time Limit: 2 Seconds      Memory Limit: 65536 KB Painting some colored segments on a line, some previously painted segments may be covered by some the subsequent ones. Your task is counting the segments of dif

一.nginx日志结构 nginx中access.log 的日志结构: $remote_addr 客户端地址 211.28.65.253 $remote_user 客户端用户名称 -- $time_local 访问时间和时区 18/Jul/2012:17:00:01 +0800 $request 请求的URI和HTTP协议 "GET /article-10000.html HTTP/1.1" $http_host 请求地址,即浏览器中你输入的地址(IP或域名) www.it300.co

如何划窗统计测序数据的reads数(depth):https://blog.csdn.net/shenshenwu666/article/details/80936374 方法1,用samtools depth.但是这个方法仅仅局限于对单个位点进行depth进行统计 samtools depth -b bed_file sample.bam > sample.depth bed 用来指定统计区间,运行后输出指定区间每一个碱基的测序深度(由于涉及所有碱基,因此文件很大) 方法2,用samtools

转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6721167201018fyw.html GATK (全称The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute开发的用于二代重测序数据分析的一款软件,里面包含了很多有用的工具. 网址:http://www.broadinstitute.org/gsa/wiki/index.php/Home_Page 前段时间刚发布了2.x版本的,最近几天都在不断更新,网址也搬迁到 http://www.br

Codeforces-566F 题目大意:给出一个有序数列a,这个数列中每两个数,如果满足一个数能整除另一个数,则这两个数中间是有一条边的,现在有这样的图,求最大联通子图. 题解:并不需要把图搞出来,可以直接dp,$f[i]$表示以第$i$个数为开头的最大的联通子图,转移类似最长上升子序列,$f[i]=max(f[i],f[j]+1)$ Code: #include<iostream> #include<cstdio> #include<algorithm> #incl

本文是本人前一段时间做一个简单Java监控工具调研总结,主要包括VisualVm ,JProfiler,Perfino,Yourkit,Perf4J,JProbe,以及对Java微基准测试的简单介绍,总结下来比较推荐,Visualvm,Perfino,yourkit和Jprofiler(推荐值按顺序依次递减),其它工具不太推荐使用.下面是文章目录结构:  一.VisualVm  1.简介 2 2.安装插件并启动VisualVM 2 3.内存分析 3 4.CPU分析 5 5.线程分析 6 6.连接

ThinkPHP3.2 G函数代码及 使用方法 代码: // 内存是否可调用 define('MEMORY_LIMIT_ON',function_exists('memory_get_usage')); /** * 记录和统计时间(微秒)和内存使用情况 * 使用方法: * <code> * G('begin'); // 记录开始标记位 * // ... 区间运行代码 * G('end'); // 记录结束标签位 * echo G('begin','end',6); // 统计区间运行时间 精确

http://poj.org/problem?id=1177 (题目链接) 题意 求矩形周长并. Solution 转自:http://www.cnblogs.com/Booble/archive/2010/10/10/1847163.html 先看图: 为了解决这个问题 我们先把一坨一坨的矩形 进行矩形切割: 我们考虑周长由哪些部分构成 其中,红线是需要统计入周长的竖边,绿线是需要统计入周长的横边 我们称两条蓝线之间的部分为统计区间 我们需要依次统计从左到右的统计区间内的需要计数的矩形边,累加

2014-08-22 Created By BaoXinjian

一.关于ASH 我们都知道,用户在 ORACLE 数据库中执行操作时,必然要创建相应的连接和会话, 其中,所有当前的会话信息都保存在动态性能视图 V$SESSION 中,通过该视图,DBA 可 以查看用户实际执行的操作,或者当前的等待事件等.通常这部分信息是调优过程中的关键 信息,不过,一旦连接断开.会话信息就会被同时从V$SESSION及其它相关视图中清除, 也就是说,用户执行完操作走人,而你(DBA),如果不能在当前逮到他,过了这点,就不知 道它曾经做过什么了. 10g 版本中,ORACLE