转载于 Original 2017-06-20 liuhui 生信百科 KEGG 数据库中,把功能相似的蛋白质归为同一组,然后标上 KO 号.通过相似性比对,可以为未知功能的蛋白序列注释上 KO 号.通过KEGG数据库的注释极大的方便我们进行生物学通路的研究,可以直接查看物种某条生物学通路上基因的存在情况. 最简单的方法是看公司给的KEGG注释或者直接下载本物种每个基因的注释结果(比如,植物Phytozome:动植物Ensemble),然后对应到自己的差异基因集里面. 当然如果自己的物种没有KE

由于基因组数据过大,想进一步用R语言处理担心系统内存不够,因此想着将文件按染色体拆分,发现python,awk,R 语言都能够非常简单快捷的实现,那么速度是否有差距呢,因此在跑几个50G的大文件之前,先用了244MB的数据对各个脚本进行测试,并且将其速度进行对比. 首先是awk处理,awk进行的是逐行处理,具有自己的语法,具有很大的灵活性,一行代码解决,用时24S, #!/usr/bin/sh function main() { start_tm=date start_h=`$start_tm

SRA - NCBI example - NCBI 要发文章了,审稿时编辑肯定会要求你上传NGS测序数据. 一般数据都是放在集群,不可能放在个人电脑上,因为有的数据大的吓人(几个T). 所以我们就建一个文件夹,然后把所有需要的fastq文件链接到这个文件夹就行了(copy太慢,也太占空间). 接下来,如何NCBI账号申请好了,那就可以直接上传了,用aspera来上传. 命令如下: ~/.aspera/connect/bin/ascp -i ~/download/aspera.openssh -Q

2017年4月28日,核酸研究(Nucleic Acids Research)杂志上,在线公布了一个可搜索微生物次生代谢物合成基因组簇的综合性数据库antiSMASH数据库 4.0版,前3版年均引用250次,累计引物1600+:可实现基因组与基因组之间的相关天然产物合成基因簇的查询和预测.   临床上使用的大部分抗生素和药物均来自植物或微生物的天然产物.结合基因组挖掘的经典分离与分析法使得能鉴定和描述基于宏基因组的天然产物途径,该过程与研究结果是天然产物研究领域中在近二十年来较为创新的技术.为使

来博客园有一个月了,哈哈.在这里学到了很多东西.今天也来试着分享一下学到的东西.希望能和大家做朋友共同进步. 最近由于项目需要上传多张图片,对于我这只菜鸟来说,以前上传图片都是直接拖得控件啊,而且还是一次只能传一张.由于现在 项目用的是MVC,像Asp那样 拖控件 是不现实了.在我脑海中立刻就浮现出一个想法,网上一定有插件,哈哈.去网上一搜索,哇哦这么多.在众多的插件中我被百度的WebUploader吸引了.官网上写着:"WebUploader是由Baidu WebFE(FEX)团队开发的一个简

背景 在网站开发中,文件上传是很常见的一个功能.相信很多人都会遇到这种情况,想传一个文件上去,然后网页提示"该文件过大".因为一般情况下,我们都需要对上传的文件大小做限制,防止出现意外的情况. 但是在有些业务场景中,大文件上传又是必须的,比如邮箱附件,或者内部OA等等. 问题 服务端为什么不能直接传大文件?跟php.ini里面的几个配置有关 upload_max_filesize = 2M //PHP最大能接受的文件大小 post_max_size = 8M //PHP能收到的最大PO

1.jquery.uploadify简介 在ASP.NET中上传的控件有很多,比如.NET自带的FileUpload,以及SWFUpload,Uploadify等等,尤其后面两个控件的用户体验比较好,无刷新,带上传进度等等.在最近的短信平台开发中,使用Uploadify进行文件上传. Uploadify官网地址是:http://www.uploadify.com/ 可满足项目开发需求. 下载地址:http://www.uploadify.com/wp-content/uploads/files/

input file相关知识简例 在此介绍的input file相关知识为: 上传照片及文件,其中包括单次上传.批量上传.删除照片.增加照片.读取图片.对上传的图片或文件的判断,比如限制图片的张数.限制图片的格式.大小等. 在开发中,文件上传必不可少,<input type="file" /> 是常用的上传标签,但特别low.浏览的字样又不能换,但难不倒强迫症患者...看一些其他网站有的将<input type="file" />隐藏,用点击

运维相关:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#iis 先注册一个nuget账号https://www.nuget.org/ 下载并安装一下NuGetPackageExplorer:https://github.com/NuGetPackageExplorer/NuGetPackageExplorer 创建一个包(vs其实也是可以制作的,我这边说最简单的方法) 添加资源包并修改metadata 保存一下 先说第一种上传方法: 自带的上传:

LOT.UI分解系列汇总:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#lotui LoT.UI开源地址如下:https://github.com/dunitian/LoTCodeBase/tree/master/LoTUI 先看在LoT.UI里面的应用效果图: 懒人福利:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/5535455.html(一句代码直接实现) 关键代码解析:(https://github.com/dunit

双核浏览器下在chrome内核中使用uploadify总有302问题,也不知道如何修复,之所以喜欢360浏览器是因为帮客户控制渲染内核: 若页面需默认用极速核,增加标签:<meta name="renderer" content="webkit"/> 若页面需默认用ie兼容内核,增加标签:<meta name="renderer" content="ie-comp"/> 若页面需默认用ie标准内核,增加

默认的上传样式我们总觉得不太好看,根据需求总想改成和上下结构统一的风格…… 实现方法和思路: 1.在input元素外加a超链接标签 2.给a标签设置按钮样式 3.设置input[type='file']为透明,并定位,覆盖在a上面 html代码: <a class="input-file input-fileup" href="javascript:;"> + 选择文件<input size="100" type="f

文件上传 表单准备 要想使用 HTML 表单上传一个或多个文件 须把 HTML 表单的 enctype 属性设置为 multipart/form-data 须把 HTML 表单的method 属性设置为 post 需添加 <input type="file"> 字段. Struts 对文件上传的支持 在 Struts 应用程序里, FileUpload 拦截器和 Jakarta Commons FileUpload 组件可以完成文件的上传. 步骤: 在 Jsp 页面的文件上

IE8/9 JQuery.Ajax 上传文件有两个限制: 使用 JQuery.Ajax 无法上传文件(因为无法使用 FormData,FormData 是 HTML5 的一个特性,IE8/9 不支持) 使用 JQuery Form 上传,contentType 只能为 text/html,因为如果是 application/json 类型,IE8/9 会以文件下载的方式展现 json 数据. 所以,在 IE8/9 中使用 JQuery 上传只能使用 Form 的方式,示例代码: $("#&quo

其实,图片预览功能非常地常见.很意外,之前遇到上传图片的时候都不需要预览,也一直没有去实现过.现在手上的项目又需要有图片预览功能,所以就动手做了一个小插件.在此分享一下思路. 一.实现图片预览的一些方法. 了解了一下,其实方法都是大同小异的.大概有以下几种方式: ①订阅input[type=file]元素的onchange事件. 一旦选择的路径被改变就把图片上传至服务器,然后就返回图片在服务器端的地址,并且赋值到img元素上. 缺点:工作量大,有些上传并不是用户最终需要上传的图片,但是这种方式会

成功了,搞了2天.分享一下经验. 首先是把官方的那个例子下载下来,然后照如下的方式修改. 其中tempValue是一个全局变量. function savetoqiniu() { var uploader = Qiniu.uploader({ runtimes: "html5,flash,html4", browse_button: "setfile", save_key:false, //uptoken: qiniu_uptoken, get_new_uptoke

终端实现大文件上传一直都是比较难的技术,其中涉及到后端与前端的交互,稳定性和流量大小,而且实现原理每个人都有自己的想法,后端主流用的比较多的是Http来实现,因为大多实现过断点下载.但稳定性不能保证,一旦断开,无法续传.所以得采用另一种流行的做法,TCP上传大文件. 网上查找了一些资料,大多数是断点下载,然后就是单独的C#端的上传接收,或是HTTP的,或是只有android端的,由于任务紧所以之前找的首选方案当然是Http先来实现文件上传,终端采用Post方法,将文件直接传至后端,后端通过Fil

一.Ubuntu 安装 Vsftpd 服务 1.安装 sudo apt-get install vsftpd 2.添加用户(uftp) sudo useradd -d /home/uftp -s /bin/bash uftp 3.设置用户密码 sudo useradd -d /home/uftp -s /bin/bash uftp 4.创建用户目录 sudo mkdir /home/uftp 5.设置用户密码 sudo passwd uftp 6.设置/etc/vsftpd.conf配置文件 s

前言 首先声明一下,我这个是对WebUploader开源上传控件的二次封装,底层还是WebUploader实现的,只是为了更简洁的使用他而已. 下面先介绍一下WebUploader 简介: WebUploader是由Baidu WebFE(FEX)团队开发的一个简单的以HTML5为主,FLASH为辅的现代文件上传组件.在现代的浏览器里面能充分发挥HTML5的优势,同时又不摒弃主流IE浏览器,沿用原来的FLASH运行时,兼容IE6+,iOS 6+, android 4+.两套运行时,同样的调用方式

今天群里正好有人问起了Java文件上传的事情,本来这是Java里面的知识点,而我目前最主要的精力还是放在了JS的部分.不过反正也不麻烦,我就专门开一贴来聊聊Java文件上传的基本实现方法吧. 话不多说,直接开始. 第一步,新建一个空白的web项目.开发工具我还是用的eclipse,我不喜欢用IDEAL. 接下来,编写index.jsp <%@ page language="java" contentType="text/html; charset=UTF-8"

工作用到文件上传的功能,在这个分享下 ~~ Controller: public class PictureController : Controller { private IHostingEnvironment hostingEnv; public PictureController(IHostingEnvironment env) { this.hostingEnv = env; } // GET: /<controller>/ public IActionResult Index()