一.bwa比对软件的使用 1.对参考基因组构建索引 bwa index -a bwtsw hg19.fa   #  -a 参数:is[默认] or bwtsw,即bwa构建索引的两种算法,两种算法都是基于BWT的(BWT search while the CIGAR string by Smith-Waterman alignment.).-a bwtsw对于短的参考序列是不工作的,必须要大于等于10Mb:-a is 不适用于大的参考序列,必须要小于等于2G: output:hg19.fa.am

正则匹配中 ^ $ 和 \b 的区别     ^和$分别代表字符串的开始和结束,因此^\d$只能匹配包含一个数字的字符串\b代表单词边界,其前后必须是不同类型的字符,可以组成单词的字符为一种类型,不可组成单词的字符(包括字符串的开始和结束)为另一种类型因此\b\d\b可以匹配"%3%"中的3,但不能匹配"23"中的任意一个数字

转自:http://blog.csdn.net/wuchuanpingstone/article/details/6678653 个人建议:以下这篇文章,是从例子说明的方式,解释ArrayList.LinkedList,但是最好的方式还是看源代码.其实ArrayList就是一个动态数组,LinkedList是一个链表.  1.ArrayList是实现了基于动态数组的数据结构,LinkedList基于链表的数据结构.     2.对于随机访问get和set,ArrayList优于LinkedLis

数据库中MyISAM与InnoDB区别 首页 » DIY技术区 » 数据库中MyISAM与InnoDB区别 09:57:40   MyISAM:这个是默认类型,它是基于传统的ISAM类型,ISAM是Indexed Sequential Access Method (有索引的顺序访问方法) 的缩写,它是存储记录和文件的标准方法.与其他存储引擎比较,MyISAM具有检查和修复表格的大多数工具. MyISAM表格可以被压缩,而且它们支持全文搜索.它们不是事务安全的,而且也不支持外键.如果事物回滚将造成

socket网络编程中read与recv区别 1.read 与 recv 区别 read 原则: 数据在不超过指定的长度的时候有多少读多少,没有数据则会一直等待.所以一般情况下:我们读取数据都需要采用循环读的方式读取数据,因为一次read 完毕不能保证读到我们需要长度的数据,read 完一次需要判断读到的数据长度再决定是否还需要再次读取. recv 原则:        recv 中有一个MSG_WAITALL 的参数:                recv(sockfd, buff, buf

详解 $_SERVER 函数中QUERY_STRING和REQUEST_URI区别 http://blog.sina.com.cn/s/blog_686999de0100jgda.html   实例: 1,http://localhost/aaa/ (打开aaa中的index.php)结果:$_SERVER['QUERY_STRING'] = "";$_SERVER['REQUEST_URI']  = "/aaa/";$_SERVER['SCRIPT_NAME'] 

  Java中equals和==的区别 java中的数据类型,可分为两类: 1.基本数据类型,也称原始数据类型.byte,short,char,int,long,float,double,boolean   他们之间的比较,应用双等号(==),比较的是他们的值. 2.复合数据类型(类)   当他们用(==)进行比较的时候,比较的是他们在内存中的存放地址,所以,除非是同一个new出来的对象,他们的比较后的结果为true,否则比较后结果为false. JAVA当中所有的类都是继承于Object这个基

java中equals和==的区别  值类型是存储在内存中的堆栈(以后简称栈),而引用类型的变量在栈中仅仅是存储引用类型变量的地址,而其本身则存储在堆中. ==操作比较的是两个变量的值是否相等,对于引用型变量表示的是两个变量在堆中存储的地址是否相同,即栈中的内容是否相同. equals操作表示的两个变量是否是对同一个对象的引用,即堆中的内容是否相同.  ==比较的是2个对象的地址,而equals比较的是2个对象的内容. 显然,当equals为true时,==不一定为true: 一.String中

转载自:JSP中pageEncoding和charset区别,中文乱码解决方案 JSP指令标签中<%@ page contentType="text/html;charset=GB2312"%>这句有什么用途?关于JSP页面中的pageEncoding和contentType两种属性的区别: pageEncoding是jsp文件本身的编码 contentType的charset是指服务器发送给客户端时的内容编码 JSP要经过两次的“编码”,第一阶段会用pageEncodin

lua 中pairs 和 ipairs区别 标准库提供了集中迭代器,包括迭代文件每行的(io.lines),迭代table元素的(pairs),迭代数组元素的(ipairs),迭代字符串中单词的 (string.gmatch)等等.LUA手册中对与pairs,ipairs解释如下: ipairs (t) Returns three values: an iterator function, the table t, and 0, so that the construction for i,v

关于EF中ApplyCurrentValues和ApplyOriginalValues区别:两者都是编辑数据时使用. //        // 摘要:        //     将 System.Data.Objects.ObjectStateEntry 的 System.Data.Objects.ObjectStateEntry.CurrentValues        //     属性设置为与所提供对象的属性值相匹配.        //        // 参数:        // 

[转]Java中equals和==的区别 java中的数据类型,可分为两类: 1.基本数据类型,也称原始数据类型.byte,short,char,int,long,float,double,boolean   他们之间的比较,应用双等号(==),比较的是他们的值. 2.复合数据类型(类)   当他们用(==)进行比较的时候,比较的是他们在内存中的存放地址,所以,除非是同一个new出来的对象,他们的比较后的结果为true,否则比较后结果为false. JAVA当中所有的类都是继承于Object这个

java中a++与++a区别 a++与++a的区别,如果单独使用没有任何区别,如果在运算中就有区别了,a++是先运算在赋值,而++a是先赋值在运算!! 先看a++的代码哦 class demo1 { public static void main(String[] args) { int a=20; int b=19; /* 先运算在赋值: 1. b先和a作比较,b比a小为假,所以a还是20: 2. b在自增加1,所以b为20: 3. 因为三元判断为假,所以c等于自增后的b加a为40: */ i

原文:c#与java中byte字节的区别及转换方法 在java中  byte的范围在 [-128,127] 在C#中  byte的范围在 [0,255] 所以 java程序与C#程序 进行数据传输的时候 要先把java的byte数组转换成在[0,255]范围内的int型数组a[];再把a[]进行加密得到字符串str, 把字符串传到web服务上. 转换方法: int data[] = new int[bytes.length]; for(int i=0;i    data[i] = bytes[i

原文:SQL点滴31-SQL语句中@@IDENTITY和@@ROWCOUNT区别 SQL语句中@@IDENTITY和@@ROWCOUNT区别 在一条 INSERT.SELECT INTO 或大容量复制语句完成后,@@IDENTITY 中包含语句生成的最后一个标识值. 如果语句未影响任何包含标识列的表,则 @@IDENTITY 返回 NULL. 如果插入了多个行,生成了多个标识值,则 @@IDENTITY 将返回最后生成的标识值. 如果语句触发了一个或多个触发器,该触发器又执行了生成标识值的插入操

C#中 Equals和= =的区别 前言:最近感觉技术进步实在是太慢,一直被游戏缠身不能自拔哈哈,但是游戏打多了真的是感觉整个人浮躁的不行,所以我现在要去游戏多写代码多看书,今天在博客园中看到一个前辈去阿里面试的面试题,由浅入深的问了很多问题,所以我想这就是个契机,可以通过答题来学习知识让自己进步,闲话少说,我们正式开始 0.复习堆栈知识 因为要通过引用类型和值类型分情况讨论,所以对C#中堆栈知识的复习还是有必要的 简单说结论: 1·栈通常保存着我们代码执行的步骤,而堆上存放的则多是对象,数据等

值类型是存储在内存中的堆栈(以后简称栈),而引用类型的变量在栈中仅仅是存储引用类型变量的地址,而其本身则存储在堆中. ==操作比较的是两个变量的值是否相等,对于引用型变量表示的是两个变量在堆中存储的地址是否相同,即栈中的内容是否相同. equals操作表示的两个变量是否是对同一个对象的引用,即堆中的内容是否相同. ==比较的是2个对象的地址,而equals比较的是2个对象的内容. 显然,当equals为true时,==不一定为true: 一.String中的equals和== 1. public

1. 使用支持和范围的区别: PHP提供了对PUT方法的支持,在Http定义的与服务器的交互方法中,PUT是把消息本体中的消息发送到一个URL,形式上跟POST类似; PHP 提供对诸如 Netscape Composer 和 W3C Amaya 等客户端使用的 HTTP PUT 方法的支持; PHP 4 中,必须使用标准的输入流来读取一个 HTTP PUT 的内容; PUT方法没有POST方法使用广泛,但PUT方法却是向服务器上传文件最有效率的方法: 2. 上传过程的区别: POST上传文件时

Java中的"&"和"&&"的区别 1."&"是位运算符,"&&"是逻辑运算符: 2."&"没有"短路","&&"按"短路"方式.

标题:JavaScript 中 操作符"==" 和"===" 的区别 记录一些很坑的区别: 1. '' == '0' // false 0 == '' // true 0 == '0' // true false == 'false' // false false == '0' // true false == undefined // false false == null // false null == undefined // true ' \t\r\n '

Angularjs中scope与rootscope区别及联系 scope是html和单个controller之间的桥梁,数据绑定就靠他了.rootscope是各个controller中scope的桥梁.用rootscope定义的值,可以在各个controller中使用.下面用实例详细的说明一下. 1.js代码 phonecatApp.controller('TestCtrl',['$scope','$rootScope', function($scope,$rootScope) { $rootS