bwa 构建数据库的index 是本地数据库么

2024-10-17

bwa用法

一建立索引比对之前,需要对fasta文件构建FM-index索引:bwa index -a bwtsw hg19.fasta 生成 hg19.fasta.amb.hg19.fasta.ann.hg19.fasta.bwt.hg19.fasta.pac.hg19.fasta.sa四个文件. 起可参数 -a 有两种构建index算法: bwtsw 大的基因组数据,必须大于10MB,比如人的全基因组. is 默认的算法,速度较快,需要较大的内存,不能构建大于2GB的数据库 -P str 输出数

阿里云RDS数据库备份文件恢复到本地数据库

参考这里:https://help.aliyun.com/knowledge_detail/41817.html 第4.2步要多注释掉一些(应该根据实际报错来注释): [mysqld] innodb_checksum_algorithm=innodb #innodb_log_checksum_algorithm=innodb innodb_data_file_path=ibdata1:200M:autoextend innodb_log_files_in_group= innodb_log_fi

Windows Phone开发（48）：不可或缺的本地数据库

原文:Windows Phone开发(48):不可或缺的本地数据库也许WP7的时候,是想着让云服务露两手,故似乎并不支持本地数据库,所有数据都上传上"云"数据库中.不过呢,在SDK 7.1后,又加进了本地数据库功能. 这个本地数据库的操作,与我们平常在WindowsForm或WPF项目中所使用数据库的情况有些不一样:一者没有图形化的设计器:二来不使用SQL语句. 那么,你一定会问:"那用什么来处理与数据库的交互?" 不知道各位.NET基础学得怎么样,如果你的基础比

SQLCE本地数据库

SQLCE是一个标准得关系数据库,可以使用 LINQ 和DateContext来处理本地数据库数据库. 使用SQLCE 要在代码中使用本地数据库功能,需要添加以下命名空间 : using System.Data.Linq; using System.Data.Linq.Mapping; using Microsoft.Phone.Data.Linq; using Microsoft.Phone.Data.Linq.Mapping; DateContext能将LINQ数据库操作语句转换成关系数据库

Windows Phone本地数据库（SQLCE）：6、[Index] attribute（翻译）（转）

这是“windows phone mango本地数据库(sqlce)”系列短片文章的第六篇. 为了让你开始在Windows Phone Mango中使用数据库,这一系列短片文章将覆盖所有你需要知道的知识点. 我将谈谈在windows phone mango本地数据库时使用[Index] attribute. 首先.要说到的是,windows phone 7.1上基本的数据库功能是SQL Compact关于Mango的一个实现.你将使用linq to sql访问存储在数据库上的数据. 注

SQLCE使用本地数据库优化

一.数据绑定 1.使用数据虚拟化和SKIP/TAKE 使用 Skip 和 Take 方法可确保直到需要在 ListBox 控件中显示数据时才将数据库中的数据加载到内存中. 例如,以下代码显示了如何从数据库中检索第 501 到 550 条记录. ? return (from f in App.FeedsDB.Feeds select f).Skip(500).Take(50); 由于在用户滚动列表时执行此加载操作会产生开销,因此该技术应该仅限于数据集较庞大(大

C# DateTime的11种构造函数 [Abp 源码分析]十五、自动审计记录 .Net 登陆的时候添加验证码使用Topshelf开发Windows服务、记录日志日常杂记——C#验证码 c#_生成图片式验证码 C# 利用SharpZipLib生成压缩包 Sql2012如何将远程服务器数据库及表、表结构、表数据导入本地数据库

C# DateTime的11种构造函数别的也不多说没直接贴代码 using System; using System.Collections.Generic; using System.Globalization; using System.Linq; using System.Text; using System.Text.RegularExpressions; using System.Threading; using System.Threading.Tasks; namespace

Nova PhoneGap框架第四章本地数据库

我一直想把EntityFramework(简称EF)的那一套搬过来,应用于HTML5 SQLite. 幸运的是,我几乎做到了,有些功能无法完成的那是因为SQLite本身不支持.至少从现在已经完成的功能来看,我们几乎可以像EF那样去操作数据库. 在我们这个框架中,所有对数据库的访问都封装在了命名空间"nova.data"下面.其下主要包括了以下类: nova.data.DbContext nova.data.Entity nova.data.Repository nova.data.Qu

HTML5本地数据库（SQLite）示例

本文转载自http://blog.sina.com.cn/s/blog_641cf27f01016pm5.html 按照国内一HTML5先行者的例子仿写了一个用HTML5 API来操作本地SQLite数据库的例子,感觉这个功能蛮好玩的,但是还不够强大,尤其浏览器支持力度不够:HTML代码:1. <!DOCTYPE html>2. <head>3. <meta charset="UTF-8">4. <title>使用HTML5本地数据库DE

如何结合自己本地数据库，使用【百度地图】API

如何结合自己本地数据库,使用[百度地图]API百度地图使用越来越多,官网上的示例数据都是写死的,实际上我们的开发中的数据都是从数据库中取出来的,最近看了很多大神的文章,结合自己本地数据库使用百度地图API,这里来总结一下具体的代码.本示例中,实现了将数据库里的位置信息显示在地图中,还实现了基本的搜索功能.这里需要用到:请将这些库提前准备好放到文件中 jquery.min.js与后台交互:Ajax 技术另外用到:MySQL+PHP (没有基础也没事,后面附有)注意使用前先到官网申请秘钥

如何利用【DataTable】结合自己本地数据库，使用表格

如何利用[DataTable]结合自己本地数据库,使用表格我们都知道DataTable的使用与配置,平时我们都是用一个json文件来代替后台,但是实际上我们在与后台交互的时候,后台先取到数据库里面的信息,然后经过后台代码的处理,返回json格式或者其他数据格式,然后前台得到后再在页面中显示出来.我们一般用json文件代替后台数据会然我们忽略一些细节.下面我们就来讲解一下如何根据自己本地数据库和后台语言(mysql+php),将数据库中的信息显示在前端页面的表格里.这里需要用到:请将这些库提前准备

与众不同 windows phone (7) - Local Database（本地数据库）

原文:与众不同 windows phone (7) - Local Database(本地数据库) [索引页][源码下载] 与众不同 windows phone (7) - Local Database(本地数据库) 作者:webabcd介绍与众不同 windows phone 7.5 (sdk 7.1) 之本地数据库概述演示如何使用“本地数据库” 示例1.概述Summary.xaml <phone:PhoneApplicationPage x:Class="Demo.LocalDat

浏览器本地数据库 IndexedDB 基础详解

一.概述随着浏览器的功能不断增强,越来越多的网站开始考虑,将大量数据储存在客户端,这样可以减少从服务器获取数据,直接从本地获取数据. 现有的浏览器数据储存方案,都不适合储存大量数据:Cookie 的大小不超过4KB,且每次请求都会发送回服务器:LocalStorage 在 2.5MB 到 10MB 之间(各家浏览器不同),而且不提供搜索功能,不能建立自定义的索引.所以,需要一种新的解决方案,这就是 IndexedDB 诞生的背景. 通俗地说,IndexedDB 就是浏览器提供的本地数据库,它可

Windows Phone本地数据库（SQLCE）：7、Database mapping（翻译）

这是“windows phone mango本地数据库(sqlce)”系列短片文章的第七篇. 为了让你开始在Windows Phone Mango中使用数据库,这一系列短片文章将覆盖所有你需要知道的知识点. 我将谈谈在数据库中映射类到表中,也就是说,在你的对象模型和数据库模式之间映射. 1.Database mapping是什么为了创建一个本地数据库,第一,你必须定义实体类.这些类定义了你的对象模型和它到数据库模式上的映射.LINQ to SQL的对象关系能力取决于映射的详细信息,以此

Windows Phone本地数据库（SQLCE）：1、介绍（翻译）（转）

一只大菜鸟,最近要学习windows phone数据库相关的知识,找到了一些比较简短的教程进行学习,由于是英文的,顺便给翻译了.本身英语水平就不好,估计文中有不少错误,如果有不幸读到的童鞋请保持对翻译质量的质疑,多多指教. 这是原文地址:http://windowsphonegeek.com/tips/Windows-Phone-Mango-Local-Database%28SQL-CE%29-Introduction 正文如下: 我开始了一个新的系列——Windows Phone Mango本

html5本地存储之localstorage 、本地数据库、sessionStorage简单使用示例

这篇文章主要介绍了html5本地存储的localstorage .本地数据库.sessionStorage简单使用示例,需要的朋友可以参考下 html5的一个非常cool的功能,就是web storage,类似于之前的cookie,不过与之不同的是,web storage 拥有本地5兆的容量可以存储,而cookie却只有4K,这是完全不能比的优势.webstrange又分为:localstorage,sessionstorage和本地数据库. 接下来我就来一一介绍: 1.localstorage

HMTL5 本地数据库

数据库这个东东现在也可以用在web上了,目前为止, chrom 6 以上版本,opera 10 以上,safari 5以上支持这个功能. htm4中数据库只能放在服务器,只能通过服务器来访问,但是在html5中,可以像访问本地文件那样轻松的对内置数据库进行访问. HMTL5中内置了两种本地数据库,一种是通过SQL语言来访问的文件型SQL数据库被称为“SQLLite,另一种是是被称为indexedDB 的数据库,我们今天说一下“SQLLite”数据库. 首先介绍几个方法 1.openDatabas

(转)HTML5 本地数据库（SQLite）示例

HTML5 本地数据库(SQLite) 示例 2012-05-07 16:21:13 标签:SQLite HTML5本地数据库原创作品,允许转载,转载时请务必以超链接形式标明文章原始出处 .作者信息和本声明.否则将追究法律责任.http://supercharles888.blog.51cto.com/609344/856071 按照国内一HTML5先行者的例子仿写了一个用HTML5 API来操作本地SQLite数据库的例子,感觉这个功能蛮好玩的,但是还不够强大,尤其浏览器支持力度不够:

html5本地存储（三）--- 本地数据库 indexedDB

html5内置了2种本地数据库,一是被称为“SQLLite”,可以通过SQL语言来访问文件型SQL数据库.二是被称为“indexedDB” 的NoSQL类型的数据库,本篇主要讲indexedDB数据库. 该数据库是一种存储在客户端本地的NoSQL数据库,目前chrome11以上.Firefox4以上.Opera18以上.Safar8以上及IE10以上的浏览器提供支持一.连接数据库使用indexedDB.open方法连接数据库 var dbName = 'indexedDBTest'; //数

python爬虫构建代理ip池抓取数据库的示例代码

爬虫的小伙伴,肯定经常遇到ip被封的情况,而现在网络上的代理ip免费的已经很难找了,那么现在就用python的requests库从爬取代理ip,创建一个ip代理池,以备使用. 本代码包括ip的爬取,检测是否可用,可用保存,通过函数get_proxies可以获得ip,如:{'HTTPS': '106.12.7.54:8118'} 下面放上源代码,并详细注释: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 2

HTML5权威指南--Web Storage,本地数据库,本地缓存API,Web Sockets API,Geolocation API(简要学习笔记二)

1.Web Storage HTML5除了Canvas元素之外,还有一个非常重要的功能那就是客户端本地保存数据的Web Storage功能. 以前都是用cookies保存用户名等简单信息. 但是cookie有下面几个问题: a:大小:cookies的大小被限制在4KB b:带宽:cookies随HTTP事务一起被发送,因此会浪费一部分发送的cookies时使用的带宽. c:复杂性:要正确的操纵cookies是很困难的. Web Storage分为两种: <1>sessionStorag

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