一.bwa比对软件的使用 1.对参考基因组构建索引 bwa index -a bwtsw hg19.fa   #  -a 参数:is[默认] or bwtsw,即bwa构建索引的两种算法,两种算法都是基于BWT的(BWT search while the CIGAR string by Smith-Waterman alignment.).-a bwtsw对于短的参考序列是不工作的,必须要大于等于10Mb:-a is 不适用于大的参考序列,必须要小于等于2G: output:hg19.fa.am

SAM是Sequence Alignment/Map 的缩写.像bwa等软件序列比对结果都会输出这样的文件.samtools网站上有专门的文档介绍SAM文件.具体地址:http://samtools.sourceforge.net/SAM1.pdf 很多人困惑SAM文件中的第二列FLAG值是什么意思.根据文档介绍我们可以计算,但是为了方便大家,下面给大家提供一个脚本工具,大家直接输入flag值就可以知道它代表的含义了. 该脚本的使用方法如下截图所示: 脚本工具的使用方法: 将下面的代码保存在记事

sam文件怎么打开 (Security Accounts Manager安全帐户管理器)负责SAM数据库的控制和维护.SAM数据库位于注册表HKLM\SAM\SAM下,受到ACL保护,可以使用regedt32.exe打开注 册表编辑器并设置适当权限查看SAM中的内容. SAM数据库在磁盘上就保存在%systemroot%system32\config\目录下的sam文件中,在这个目录下还包括一个security文件,是安全数据库的内容,两者有不少关系 最近没有事情就翻翻自己的系统文件夹, 走到C

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给你一个SAM文件,如何提取出登录密码? SAM文件 ① LMHASH Administrator:500:0182bd0bd4444bf867cd839bf040d93b:c22b315c040ae6e0efee3518d830362b::: Guest:501:aad3b435b51404eeaad3b435b51404ee:31d6cfe0d16ae931b73c59d7e0c089c0::: HelpAssistant:1000:132893a93031a4d2c70b0ba3fd876

转载:http://www.cnblogs.com/nkwy2012/p/6362996.html  SAM是Sequence Alignment/Map 的缩写.像bwa等软件序列比对结果都会输出这样的文件.samtools网站上有专门的文档介绍SAM文件.具体地址:http://samtools.sourceforge.net/SAM1.pdf 很多人困惑SAM文件中的第二列FLAG值是什么意思.根据文档介绍我们可以计算,但是为了方便大家,下面给大家提供一个脚本工具,大家直接输入flag值就

Python通过调用windows命令行处理sam文件 以samtools软件为例 一.下载或者索取得到windows版本的samtools软件,解压后如下: 进入文件内部,有如下几个文件: 二.将samtools设置环境变量: 上图是设置环境变量的窗口,建议在 系统变量里更改,这样即使变更用户名,环境变量依然有效. 在cmd中输入samtools,出现samtools的命令说明,表明环境变量成功 三. 调试 通过cmd的命令行调用samtools命令: A.将sam转化为bam文件  Samt

篇一:WPF常用知识以及本项目设计总结:http://www.cnblogs.com/baiboy/p/wpf.html 篇二:基于OneNote难点突破和批量识别:http://www.cnblogs.com/baiboy/p/wpf1.html 篇三:批量处理后的txt文件入库处理:http://www.cnblogs.com/baiboy/p/wpf2.html 篇四:关于OneNote入库处理以及审核:http://www.cnblogs.com/baiboy/p/wpf3.html [

本章将讲解如何通过svn命令获取某版本后改动的所有文件 一键操作,告别svn log的繁杂对比工作. 1:安装SVN命令行工具Subversion(不是TortoiseSVN) 下载Subversion,并安装,本人安装目录为 D:\Subversion 2:把Subversion配置到环境变量,使其可以通过dos窗口执行命令 进入安装目录,找到bin文件,把bin路径配置到环境变量Path下.如图所示: 3:打开dos窗口,执行svn help,出现如下内容则配置成功. 4:准备工作结束,激动

hbase将dfs作为存储,公司测试环境断电后,hadoop集群会因此而损坏一些block文件,这个时候,客户端在读取文件时会报一些错: DataXceiver error processing READ_BLOCK operation Got error for OP_READ_BLOCK 因为文件损坏,我直接是把损坏的文件删除 先检查损坏文件: hadoop fsck / 输出: 注意到 CORRUPT FILES 22:表示有22个损坏的块文件 删除损坏文件: hadoop fsck /

对使用zend加密后的php文件进行解密 使用zend加密后的php文件用notpad++打开会出现类似的乱码 下面使用解密工具进行解密 http://pan.baidu.com/s/1i3n4ysX 下载上面的解密工具,解压到盘里面,最好不要有中文路径,我解压到 I:\Dezender 里面,修改 I:\Dezender\PHP5\PHP5\php.ini文件,修改里面的文件路径 打开cmd命令行 然后就可以看见你的文件目录下面会多出一个文件    文件名.de.php I:\Dezender

使用UtralEdit或者sublime text打开编译后的.class文件, 其中cafe babe为magic number(魔数),标识这个文件是java的class文件. 0033转换成10进制是51(3*16^1+3*16^0).而51则是jdk 1.7.(50是jdk1.6.49为jdk1.5) 而51就是jdk1.7的minor.major version. 延伸:: 下表既是minor.major version表

datafile.txt  #文件 Man: this is the right room for an argument. Other Man: I've told you once. Man: No you haven't Other Man: Yes, I have. (pause) Man: When? Other Man: Just now. Man: No you didn't Other Man: Yes I did. Man: You didn't Other Man: I'm

http://www.iteye.com/problems/72150 写了一段代码 大体是 InputStream读取文件到string后OutputStream到文件 遇到的问题为TXT文件大小格式等都没有问题,但是PDF\RAR等格式的就无法打开了,重新生成的文件大小会比原文件小,代码如下. package com.stream; import java.io.BufferedReader; import java.io.ByteArrayOutputStream; import java

eclipse开发工具Import工程后,工程文件夹上出现黄色感叹号. 可能是Work目录无效,解决方法:删除Work目录即可,如下图所示: 删除后,如下图:

MainWindow.xaml文件 <Window xmlns="http://schemas.microsoft.com/winfx/2006/xaml/presentation" xmlns:x="http://schemas.microsoft.com/winfx/2006/xaml" xmlns:d="http://schemas.microsoft.com/expression/blend/2008" xmlns:mc="

ST-E00211::H5L3NCCXY:::: chr14 141M = - ACTTCACCTCCTGGAGTCCTGGACTTCCCCACATCTCCCCTGCCCCTCCCACGTTTCCATAGTCCAAGGGCCAGAGTAAATGAAAATACAGCAGCCGCCCAAGCAATGGGGCCCATGCTGGGGCTTCAGTCATCCCCATGT JFJFJFJJJJJJJJJJJJJJJFAJJJJJJJJJFFJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJ

tomcat编译项目后,classes文件没有相应的改变: tomcat不能将项目部署到服务器: 1.首先,在tomcat安装目录webapps中将编译后的整个项目删掉,然后再在eclipse将tomcat中添加的项目移除,再clean…一次,然后再导入你的项目到tomcat,再编译. 2.如果还有错: 很可能是.xml文件没有加载上:可参考http://www.cnblogs.com/mmzs/p/8757709.html

首先,是wine QQ的安转教程:Wine安装最新版QQ(8.9.2)的简单教程 - Powered by Discuz! 里面作者也提到了关于重启后出现个人文件夹被占用的情况. 如下: 这里,如果不替换riched20的话则安装好QQ后无法输入用户名,不停用txplatform.exe则WineQQ无法完整退出,导致关掉重开后提示QQ文件被占用,禁用ntoskrnl.exe是为了规避可能出现QQ无法启动的bug.前面的*号可以省略,不过我觉得比较好看,还是加上去了. 我按照上面的设置后,发现还

target存放的是编译后的.class文件地方 默认情况下不会讲非class文件放入进入 如果要使用非.class文件 需要通过增加配置方式自动加入文件

压缩.log 文件为zip后删除原文件 需要注意:本人作为小白,该脚本需要和.log在一起,后面有时间需要改正. #!/usr/local/python/bin/python #-*-coding=utf8 -*- import time import os import sys import zipfile N = 7 #设置删除多少天前的文件 def zip(srcpath): for folder,sumfolder,files in os.walk(srcpath): for file