ChIP-seq流程图

2024-10-20

ChIP-seq基本流程及工具

ChIP-seq数据分析整理 1.Alignment 2.Peak detection 3.Peak annotation 1. GO analysis 2. Pathway analysis 4.Differential analysis 5.Peak gene 6.Pathway analysis 7.Data visualization 1.Alignment base calling——Off-Line Basecaller software (OLB V1.8.0). Solexa C

测序深度和覆盖度（Sequencing depth and coverage）

总是跑数据,却对数据一无所知,这说不过去吧. 看几篇文章吧 Sequencing depth and coverage: key considerations in genomic analyses(只讲二代) Assembly of large genomes using second-generation sequencing(参考文献) Identification of optimum sequencing depth especially for de novo genome asse

getopt两个模块getopt 和gun_getopt 的异同

getopt的两个模块getopt和gun_getopt都可以接收参数,但是又有不同; 先看 getopt.getopt这个模块: import sys import getopt def main(param): opts, args = getopt.getopt(param,"hc:s:") print("opts",opts ) print("args",args) for opt,arg in opts: if opt == "

ChIP-seq技术介绍｜易基因

大家好,这里是专注表观组学十余年,多组学科研服务领跑者的易基因. 染色质免疫沉淀后测序(ChIP seq)是一种针对DNA结合蛋白.组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术.由于二代测序技术的巨大进步,ChIP-seq比其最初版本ChIP-chip具有更高的分辨率.更低的噪声和更大的覆盖范围.随着测序成本的降低,ChIP- seq已成为研究基因调控和表观遗传机制不可或缺的工具. 原理:甲醛处理细胞使目标蛋白与DNA交联,通过超声波将交联后的染色质打断成小片段,一般在200-600bp范围内.再利用抗

干货收藏 | Java 程序员必备的一些流程图

阅读本文大概需要 6 分钟. 转载自:https://juejin.im/post/5d214639e51d4550bf1ae8df 1.Spring 的生命周期 Spring 作为当前 Java 最流行.最强大的轻量级容器框架,了解熟悉 spring 的生命周期非常有必要: 首先容器启动后,对 bean 进行初始化按照 bean 的定义,注入属性检测该对象是否实现了 xxxAware 接口,并将相关的 xxxAware 实例注入给 bean,如 BeanNameAware 等以上步骤,b

Java 程序员必备的一些流程图

1.spring的生命周期 2.TCP三次握手,四次挥手 3.线程池执行流程图 4.JVM内存结构 5.Java内存模型 6.springMVC执行流程图 7.JDBC执行流程 8.spring cloud组件架构 9.dubbo 调用整理了一些Java基础流程图/架构图,做一下笔记,大家一起学习. 1.spring的生命周期 Spring作为当前Java最流行.最强大的轻量级容器框架,了解熟悉spring的生命周期非常有必要: 首先容器启动后,对bean进行初始化按照bean的定义,注入属

Java程序员必备的一些流程图

Java程序员必备的一些流程图转自https://juejin.im/post/5d214639e51d4550bf1ae8df 前言: 整理了一些Java基础流程图/架构图,做一下笔记,大家一起学习. 1.spring的生命周期 Spring作为当前Java最流行.最强大的轻量级容器框架,了解熟悉spring的生命周期非常有必要: 首先容器启动后,对bean进行初始化按照bean的定义,注入属性检测该对象是否实现了xxxAware接口,并将相关的xxxAware实例注入给bean,如Be

Java必备主流技术流程图，写得非常好！

作者:Jay_huaxiao https://juejin.im/post/5d214639e51d4550bf1ae8df 1.spring的生命周期 Spring作为当前Java最流行.最强大的轻量级容器框架,了解熟悉spring的生命周期非常有必要: 首先容器启动后,对bean进行初始化按照bean的定义,注入属性检测该对象是否实现了xxxAware接口,并将相关的xxxAware实例注入给bean,如BeanNameAware等以上步骤,bean对象已正确构造,通过实现BeanPo

开源一个WEB版本GEF，基于SVG的网页流程图框架

8月开始断断续续的制作这个web gef,没有任何依赖,完全原生js开发,目前已经完成了雏形,基本上可以在项目里应用了. 下图展示的是demo1的效果,包括拖拽,生成连线,点击生成\取消墙体,整个demo开发时间60分钟不到. 下图展示的是demo2效果,这是个流程图,功能更多一些,包括虚影拖拽,选择框,连线路由等等. github地址: https://github.com/anrainie/anrajs/ 该框架正在频繁更新中,如果使用中遇到什么问题,直接联系本人即可. 如果有兴趣一起开发的

SpringMVC入门案例及请求流程图（关于处理器或视图解析器或处理器映射器等的初步配置）

SpringMVC简介:SpringMVC也叫Spring Web mvc,属于表现层的框架.Spring MVC是Spring框架的一部分,是在Spring3.0后发布的 Spring结构图 SpringMVC请求流程图 SpringMVC请求流程图语述: request-------->DispatcherServler(中央调度器/前端控制器)-----> HandlerMapping(处理器映射器)------>返回一个执行链----->将执行链转交给HandlerAdap

UML 用例图、顺序图、状态图、类图、包图、协作图、流程图

用例图.顺序图.状态图.类图.包图.协作图面向对象的问题的处理的关键是建模问题.建模可以把在复杂世界的许多重要的细节给抽象出.许多建模工具封装了UML(也就是Unified Modeling Language™),这篇课程的目的是展示出UML的精彩之处. UML中有九种建模的图标,即: 用例图类图对象图顺序图协作图状态图活动图组件图配置图本课程中的某些部分包含了这些图的细节信息的页面链接.而且每个部分都有一个小问题,测试一下你对这个部分的理解. 为什么UML很重要? 为了回

BZOJ1798: [Ahoi2009]Seq 维护序列seq[线段树]

1798: [Ahoi2009]Seq 维护序列seq Time Limit: 30 Sec Memory Limit: 64 MBSubmit: 5504 Solved: 1937[Submit][Status][Discuss] Description 老师交给小可可一个维护数列的任务,现在小可可希望你来帮他完成. 有长为N的数列,不妨设为a1,a2,…,aN .有如下三种操作形式: (1)把数列中的一段数全部乘一个值; (2)把数列中的一段数全部加一个值; (3)询问数列中的一段数的和

发布一个免费开源软件-- PAD流程图绘制软件PADFlowChart

软件的可执行文件下载:PADFlowChart-exe.zip MD5校验码:91FCA9FEC9665FD09BEB3DA94ADC1CE6 SHA1校验码:ECD742AA3092A085AB07AB2A1B014064B21EB958 本软件在GitHub上的开源地址:<https://github.com/semaluo/PADFlowChart> 欢迎感兴趣的朋友一起开发! 一.概述在软件设计过程中,前期设计有UML等建模方法,但是软件的详细设计阶段却没有什么特别的工具.传统的流程

ThinkPHP2.2框架执行流程图,ThinkPHP控制器的执行流程

ThinkPHP2.2框架执行原理.流程图在线手册 ThinkPHP控制器的执行流程对用户的第一次URL访问 http://<serverIp>/My/index.php/Index/show/ 所执行的流程进行详细的分析,用户的URL访问首先是定位到了My项目的index.php 入口文件(注意:如果使用了URL_REWRITE,可能index.php已经被隐藏了),项目的入口文件所做的其实是实例化一个App应用实例,并且执行这个应用. 1.加载公共入口文件在实例化App类之前,我们需要

gojs绘流程图

引用:http://www.tuicool.com/articles/eEruaqu http://www.open-open.com/lib/view/open1435023502544.html gojs是一个能够让我们很容易的实现基于html5浏览器绘制具有交互性的图形图表的JavaScript框架. gojs采用了面向对象的编程模式.以图形对象表示绘图模板.以用普通js对象存储数据作为数据模型,然后赋值给图形对象的属性作为数据绑定的模式. gojs同样提供了大量工具类来代表我们的交互行为

a chip multiprocessor

COMPUTER OR GANIZATION AND ARCHITECTURE DESIGNING FOR PERFORMANCE NINTH EDITION A multicore computer, also known as a chip multiprocessor, combines two or more processors (called cores) on a single piece of silicon (called a die). Typically, each cor

html5 canvas画流程图

<!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8" /> <title></title> </head> <body> <canvas id="myCanvas" width="1200" height="800" style="border: solid 1px;

Linux 设备驱动程序 proc seq

不能再简化 #include<linux/module.h> #include<linux/init.h> #include<linux/seq_file.h> #include<linux/fs.h> #include <linux/proc_fs.h> void * meng_seq_start(struct seq_file*s,loff_t*pos) { ) return NULL; return pos; } void * meng_s

第二篇:Retrofit调用流程图和使用到的设计模式

2016-05-08 09:35:58 这篇文章解析一下Retrofit的调用流程 1. 先看一下我们是如何使用Retrofit的,代码如下: public interface WeatherDataService { @GET("/wtr-v2/temp/realtime") Call<MiWeatherData> getMiWeather(@Query("cityId") String cityId); @GET("/wtr-v2/temp

Spring Boot整合Activiti，查看流程图出现中文乱码问题

最近研究SpringBoot 整合Activiti时,实现流程图高亮追踪是出现中文乱码问题,找了很多方法,现在把我最后的解决方法提供给大家. Spring Boot是微服务快速开发框架,强调的是零配置,显然不推荐采用XML配置文件的方式解决.不使用Spring Boot的时候, 是通过下面这种方式就可以解决 ①原始解决方式:在Spring配置文件中的 <bean id="processEngineConfiguration" class="org.activiti.sp

DIOCP之开发流程图之Client

本次分析开发流程图采用的是DIOCP群里的群友[彩蛋]所给的DEMO,依然是win7的画图作品. 本人分析认为:学习网络开发不同本地开发,首先你应该知道完整的开发流程即网络程序运行的先后顺序,有个整体感知,不能一头深入到代码中,框架明白之后再去研究具体实现,大家可以用思维导图来画画,试着写个DEMO,你会发现很多,大神们多多关照,不要扔鞋子,可以扔点红包,哈哈……

ChIP-seq流程图

热门专题