1.adapter是一段短的序列已知的核酸链,用于链接序列未知的目标测序片段. 2.barcode,也称为index,是一段很短的寡居核酸链,用于在多个样品混合测序时,标记不同的样品. 3.insert是用于测序的目标片段,因为是包括在两个adapter之间,所以被称为“插入”片段. 一个常见测序片段类似与adapter--barcode--insert--adapter.测序开始时前几个碱基无法测得,第一个adapter在数据输出时被去除:由于测序仪读长限制,第二个adapter通常无法测得.

2457: [BeiJing2011]双端队列 链接 很奇妙的转化. 题目要求最后的所有序列也是有序的,所以可以求出最后的序列(即排序后的序列),然后分成许多份,要求每一份都是一个双端序列,求最少分成多少份. 一个结论或者规律:每一个双端队列的数对应原序列的下标都是先下降后增加的(考虑双端序列的构造过程,加入一个数,坐标为a,往后枚举的数要么在序列前,要么加入到后,而且往后的数的下标都比a大,所以是先下降后递增的) 那么就是求排序后的序列,的坐标最少多少先下降后上升的序列. 相同的数可以放到同一

http://blog.csdn.net/Jerr__y/article/details/70471066 欢迎转载,但请务必注明原文出处及作者信息. @author: huangyongye @creat_date: 2017-04-19 前言 本例子主要介绍如何使用 TensorFlow 来一步一步构建双端 LSTM 网络(听名字就感觉好腻害的样子),并完成序列标注的问题.先声明一下,本文中采用的方法主要参考了[中文分词系列] 4. 基于双向LSTM的seq2seq字标注这篇文章.该文章用

关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲 RNA-Seq adapter barcode cutadapt 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已知的核酸链,用于链接序列未知的目标测序片段. 2.barcode,也称为index,是一段很短的寡居核酸链,用于在多个样品混合测序时,标记不同的样品. 3.insert是用于测序的目标片段,因为是包括在两个adapter之间,所以被称为“插入”片段. 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已

Roche 454,Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式.在基因组De Novo测序过程中,Roche454的单端测序读长可以达到400p,经常用于基因组骨架的组装,而Solexa和ABI SOLID双端测序可以用于组装scaffolds和填补gap.下面以solexa为例,对单端测序(Single-ead)和双端测序(Paied-end和Mate-pai)进行介绍. Single-ead.Paied-end和Mate-pai主要区别在测序文库的构建方法上.1.单端测序

题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=5289 Problem Description Tom owns a company and he is the boss. There are n staffs which are numbered from 1 to n in this company, and every staff has a ability. Now, Tom is going to assign a special tas

题目链接: http://www.lintcode.com/zh-cn/problem/binary-tree-zigzag-level-order-traversal/ 二叉树的锯齿形层次遍历 给出一棵二叉树,返回其节点值的锯齿形层次遍历(先从左往右,下一层再从右往左,层与层之间交替进行) 样例 给出一棵二叉树 {3,9,20,#,#,15,7}, 3 / \ 9 20 / \ 15 7 返回其锯齿形的层次遍历为: [ [3], [20,9], [15,7] ] 思路: 我们用双端队列模拟一下

Deque是一种优化了的.对序列两端元素进行添加和删除操作的基本序列容器.它允许较为快速地随机访问,但它不像vector 把所有的对象保存在一块连续的内存块,而是采用多个连续的存储块,并且在一个映射结构中保存对这些块及其顺序的跟踪.向deque 两端添加或删除元素的开销很小.它不需要重新分配空间,所以向末端增加元素比vector 更有效. 其内部结构如下图所示: deque和vector很类似,也是采用动态数组来管理元素. 使用deque之前需包含头文件: #include <deque> 它

题意:有一串数字,两个指针,然后一些添加,删除,反转,以及移动操作,最后输出序列. 解法:可以splay做,但是其实双端队列更简便. 维护三个双端队列LE,MI,RI分别表示[L,R]序列左边,[L,R]这段区间的值和[L,R]右边的值.然后维护一个revd标记表示[L,R]内的数是否被翻转了,翻转了的话改变一下一些操作就行了.自己写一个pop_Front()和pop_Back()函数,分别取队首和队尾元素,然后队首或队尾pop掉. 代码: #include <iostream> #inclu

Sliding Window Time Limit: 12000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 41844   Accepted: 12384 Case Time Limit: 5000MS Description An array of size n ≤ 106 is given to you. There is a sliding window of size k which is moving from the very left

[问题描述] Sherry现在碰到了一个棘手的问题,有N个整数需要排序.  Sherry手头能用的工具就是若干个双端队列.        她需要依次处理这N个数,对于每个数,Sherry能做以下两件事: 1．新建一个双端队列,并将当前数作为这个队列中的唯一的数: 2．将当前数放入已有的队列的头之前或者尾之后.   对所有的数处理完成之后,Sherry将这些队列排序后就可以得到一个非降的序列.   [问题分析] 加粗的字...必须要看清啊!! 因为将队列排序就可以得到一个有序的序列,所以:1.队列

2457: [BeiJing2011]双端队列 Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 128 MBSubmit: 209  Solved: 95[Submit][Status][Discuss] Description          Sherry现在碰到了一个棘手的问题,有N个整数需要排序.        Sherry手头能用的工具就是若干个双端队列.        她需要依次处理这N个数,对于每个数,Sherry能做以下两件事: 1．新建一个双端队列,并将当前

队列: 先进先出,处理类似排队的问题,先排的.先处理,后排的等前面的处理完了,再处理 对于插入和移除操作的时间复杂度都为O(1).从后面插入,从前面移除 双端队列: 即在队列两端都能够insert和remove:insertLeft.insertRight.removeLeft.removeRight 含有栈和队列的功能,如去掉insertLeft.removeLeft,那就跟栈一样了.如去掉insertLeft.removeRight.那就跟队列一样了 一般使用频率较低,时间复杂度 O(1)

正如lyd所说,和数据结构本身没什么太大关联 题意 中文题面   Sherry现在碰到了一个棘手的问题,有N个整数需要排序.        Sherry手头能用的工具就是若干个双端队列.        她需要依次处理这N个数,对于每个数,Sherry能做以下两件事: 1．新建一个双端队列,并将当前数作为这个队列中的唯一的数: 2．将当前数放入已有的队列的头之前或者尾之后.   对所有的数处理完成之后,Sherry将这些队列排序后就可以得到一个非降的序列.   求Sherry最少需要的双端队列数.

虽然分类在数据结构里,但是实际上是个贪心题...... 我自己一开始想到了一个错误的贪心.后来发现对于相等值的处理不行. 有个很神的转化,就是把排好序的队列以及对应的原下标都给搞出来. 然后考虑其中一段:若这一段属于同一个双端队列,那么原下标一定呈单谷状. 相等的值如何处理呢?因为相等的值可以任意在排序后的序列里交换位置,所以我们可以任意设计它们的原下标而达到单谷状态来为我们所用. 所以特判一下就好了.时间O(nlogn),因为有排序. (惨痛的教训:把 == 写成了 = ) /********

传送门 题意: 庭院中有 n 个围栏,每个围栏上都被涂上了不同的颜色(数字表示): 有 m 条指令,每条指令给出一个整数 x ,你要做的就是将区间[ x第一次出现的位置 , x最后出现的位置 ]中的围栏 全部涂成 x ,经过 m 次操作后,输出每个围栏的涂色情况: 题解: 比赛的时,在读完题后,一瞬间,想到了线段树的区间更新,懒惰标记,but 我已经好久好久没写过线段树的代码了(嫌代码太长,逃): 所以,比赛时,就不了了之,去看其他题了: 今天,温习了一下线段树的用法,重新思考了本题的解题思路,

题意是有至多150000个双端队列,400000次简单操作,直接开会导致内存超限,所以用 STL 中的 map 和 deque ,而读入过大已经在题目中有所说明,直接用已经给出的快速读入即可.要注意的是在两个队列合并时,要用 insert 函数,直接一个一个操作会超时(自己对双端队列的 STL 还是不够熟悉......)代码如下: #include <bits/stdc++.h> using namespace std; ; map<int, deque<int> >

描述 Ha'nyu是来自异世界的魔女,她在漫无目的地四处漂流的时候,遇到了善良的少女Rika,从而被收留在地球上.Rika的家里有一辆飞行车.有一天飞行车的电路板突然出现了故障,导致无法启动. 电路板的整体结构是一个R行C列的网格(R,C≤500),如右图所示.每个格点都是电线的接点,每个格子都包含一个电子元件.电子元件的主要部分是一个可旋转的.连接一条对角线上的两个接点的短电缆.在旋转之后,它就可以连接另一条对角线的两个接点.电路板左上角的接点接入直流电源,右下角的接点接入飞行车的发动装置.

1.双端队列介绍 在介绍双端队列之前,我们需要先介绍队列的概念.和栈相对应,在许多算法设计中,需要一种"先进先出(First Input First Output)"的数据结构,因而一种被称为"队列(Queue)"的数据结构被抽象了出来(因为现实中的队列,就是先进先出的). 队列是一种线性表,将线性表的一端作为队列的头部,而另一端作为队列的尾部.队列元素从尾部入队,从头部出队(尾进头出,先进先出). 双端队列(Double end Queue)是一种特殊的队列结构,

题目链接:https://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=2457 Description Sherry现在碰到了一个棘手的问题,有N个整数需要排序. Sherry手头能用的工具就是若干个双端队列.她需要依次处理这N个数,对于每个数,Sherry能做以下两件事:1．新建一个双端队列,并将当前数作为这个队列中的唯一的数:2．将当前数放入已有的队列的头之前或者尾之后.对所有的数处理完成之后,Sherry将这些队列排序后就可以得到一个非降的序列. In