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cytoscape做PPI网络图时怎么把基因按照矩形排列
2024-11-05
利用cytoscape做网络图
首先做出下面的基因间相互关系图 1.准备sif文件 data.sif 网络数据文件 gene1 pp gene2 gene3 gene4 gene5 gene6 gene7 gene8 gene9 node.txt 网络属性文件 gene expgene1 0.2gene2 0.3gene3 0.7gene4 0.3gene5 0.9gene6 0.7gene7 0.3gene8 0.1gene9 0.5 2.将两个文件分别导入cytoscape File --> Import -->Netw
使用Cytoscape画PPI网络图
打开Cytoscape软件,根据菜单导入string_interactions.tsv文件 File ----> Import ----> Network from File 会弹出下图对话框,在对话框中设置如下:
关于有默认值的字段在用EF做插入操作时的思考(续)
问题描述 今天下午(看现在这时间,应该是昨天下午了哈),园友 choon 写了这样一篇博文<关于有默认值的字段在用EF做插入操作时的思考>. 博文内容主要记录的是 choon 使用 EF 做数据插入与更新时,字段默认值的问题,这个问题我们平常应该都会遇到,但是,最后博文内容包括评论,并没人能给出一个准确的答案,真是很可惜(知识点的博文都是一侃一大堆,而这些实际项目遇到的问题却回答不上来,又有什么用呢,哎...).详细内容请查看上面的博文,这边我再简单叙述下: 数据库有一个 Users 表,表中
关于有默认值的字段在用EF做插入操作时的思考
今天在用EF做插入操作的时候发现数据库中一个datetime类型的字段(CreateDate)的值居然全部为null.于是赶紧看表结构发现CreateDate字段居然是允许为空的. 虽然为空,但是设置了默认值getdate(),按说不应该为null的.于是开始测试. 字段允许Null值的情况 Users表结构如下: 假如一个字段有了默认值,并且又允许为Null,在做插入操作时会发生什么? 如上图中的表结构,CreateDate是允许为null的,而又有默认值getdate().这样在用传统SQL
在做excel导出时如何将excel直接写在输出流中
之前做excel导出时,我都是先将文件写在服务器上,然后再下载下来,后来发现原来可以直接将文件写在输出流里边. 下面是一个小demo: package com.huaqin.fcstrp.util; import java.io.IOException; import java.io.OutputStream; import java.io.UnsupportedEncodingException; import java.net.URLEncoder; import javax.servlet
【Nginx】使用Nginx做反向代理时,关于被代理服务器相应的超时设置
> 参考的优秀文章 Module ngx_http_proxy_module > 设置等待被代理服务器的最大响应时间 使用Nginx做反向代理时,因被代理服务器因业务确实复杂,需时较久,往往超过60秒.而Nginx默认设置超时时间为60秒. 针对这一情况,需修改默认配置.因配置项中涉及超时的选项太多,这里记录一下. 等待被代理服务器的最大响应时间为120秒,需加如下配置: proxy_read_timeout 120s; 较完整的配置为: location /erp { proxy_pass
在VS2012后的版本中做数据报表时,提示尚未指定报表“Report1”的报表定义
有一群的朋友在用VS2012做数据报表时,老是提示 本地报表处理期间出错. 尚未指定报表“Report1”的报表定义 未将对象引用设置到对象的实例. 我看了一下,步骤没错,我用VS2010做了一下,一切OK,没问题,但用VS2013做时, 就提示这错误 后仔细看了一下设计生成的源码,嘿,还真有区别,在VS2012与VS2013中, ReportViewer生成的代码在引用报表数据时,使用的是ReportEmbeddedResource属性 <LocalReport ReportEmbeddedR
做web项目时对代码改动后浏览器端不生效的应对方法(持续更新)
做web项目时,常常会遇到改动了代码,但浏览器端没有生效,原因是多种多样的,我会依据我遇到的情况逐步更新解决的方法 1.执行的时候採用debug模式,普通情况下使用项目部署button右边那个button下的tomcat7中的run即可,假设使用的是serves中的run serves,这样的情况貌似不会自己主动编译 2.点击project菜单下的clean选项,在打开的窗体中选择你使用的项目,ok,这样会删除tomcat容器中关于该项目的一些信息,然后又一次部署,执行 3.删除电脑中tomca
做web项目时对代码修改后浏览器端不生效的应对方法(持续更新)
做web项目时,经常会遇到修改了代码,但浏览器端没有生效,原因是多种多样的,我会根据我遇到的情况逐步更新解决办法 1.运行的时候采用debug模式,一般情况下使用项目部署按钮右边那个按钮下的tomcat7中的run就行,如果使用的是serves中的run serves,这种情况貌似不会自动编译 2.点击project菜单下的clean选项,在打开的窗口中选择你使用的项目,ok,这样会删除tomcat容器中关于该项目的一些信息,然后重新部署,运行 3.删除电脑中tomcat文件夹,重新解压,然后在
How to: Installshield做安装包时如何添加文件
原文:How to: Installshield做安装包时如何添加文件 我一直以为这不是一个问题,可是没想到在几个群内,对于如何向安装包添加文件不解的大有人在,今日稍暇,整理成篇,以供参考 首先我想再大声地说一遍:不要再跟我说英文看不懂了!!!!你做了程序员这一行,就得逼自己去看懂英文!!!说看不懂的赶快转行吧!甭在这行混了!去工地搬个砖也有四五千了!不比你在这里一边牢骚一边拿两千强啊!谷歌度娘都免费提供翻译功能!别再跟姐叨叨!姐不是翻译机!!! 以Installscript Project为例
MIRO做发票校验时实现替代功能的多种方式
http://blog.sina.com.cn/s/blog_3f2c03e30100ngje.html MIRO做发票校验时,如果需要对产生的会计凭证做某些字段的替代,可有多种方法. 1.GGB1替代(抬头和行项目,标准的财务会计替代) 2.BTE 1120 3.badi:ac_document 4.Smod: FMRESERV 上面涉及到SAP开发的多种增强技术,以及财务模块非常好用的substitution功能.但是我发现ggb1行项目替代是无法替代利润中心字段的,修改了gb01tab
PHP做APP接口时,如何保证接口的安全性??????????
PHP做APP接口时,如何保证接口的安全性? 1.当用户登录APP时,使用https协议调用后台相关接口,服务器端根据用户名和密码时生成一个access_key,并将access_key保存在session中,将生成的access_key和session_id返回给APP端. 2.APP端将接收到的access_key和session_id保存起来 3.当APP端调用接口传输数据时,将所传数据和access_key使用加密算法生成签名signature,并将signature和session_i
在用easyui中做CRUD功能时,当删除一行或多行数据后再点击修改会提示你选中了多行,如何解决这个bug了?
在用easyui中做CRUD功能时,当删除一行或多行数据后再点击修改会提示你选中了多行,如何解决这个bug了? 在删除成功后,加上这句话就可以了:$("#dg").datagrid('clearSelections');//清空已经选择的行
使用java做paypal开发时购买东西支付不成功的原因
使用java做paypal开发时购买东西支付不成功的原因 没有设置网站习惯设定,登陆自己的paypal账户,在网站习惯设定上填写回调的url路径,这样就可以 支付成功了并且异步修改订单的状态. 支付成功后回调的url中获取不到任何参数 你没有在测试的卖家账户上设置PDT数据传输功能,所以获取不到任何的参数,例如价格.商品信息等等 获取到参数之后.为什么会出现链接超时 你应该把你的PDT的token复制过来.也就是传说中at参数.
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做Mysql主从时,注意使用replicate_wild_do_table和replicate-wild-ignore-table 浓缩版: 使用replicate_do_db和replicate_ignore_db时有一个隐患,跨库更新时会出错. 如在Master(主)服务器上设置 replicate_do_db=test(my.conf中设置) use mysql; update test.table1 set ...... 那么Slave(从)服务器上第二句将不会被执行 如Master设置
解决docker中使用nginx做负载均衡时并发过高时的一些问题
# 解决docker中使用nginx做负载均衡时并发过高时的一些问题 1.问题产生原因: 由于通过nginx作为负载均衡服务,在访问并发数量达到一定量级时jmeter报错. nginx日志关键信息:accept4() failed (24: Too many open files). 此日志引起原因是nginx进程打开文件数过多.度娘一堆类似的帖子这里引用网上的解决方式比太实用 同时出现一些502 504nginx假死问题.考虑通过增加nginx工作进程数解决. 2.解决思路: 通过配置修改ul
vue-router做路由拦截时陷入死循环
今天分享一下使用vue-router做路由拦截时遇到的坑. 需要提前了解的api 1:router.beforeEach( to , from ,next) ; to: Route: 即将要进入的目标 路由对象 from: Route: 当前导航正要离开的路由 next: Function: 一定要调用该方法来 resolve 这个钩子.执行效果依赖 next 方法的调用参数. next(): 进行管道中的下一个钩子.如果全部钩子执行完了,则导航的状态就是 confirmed (确认的). ne
nginx做反向代理时出现302错误
现象:nginx在使用非80端口做反向代理时,浏览器访问发现返回302错误 详细现象如下: 浏览器请求登录页: 输入账号密码点击登录: 很明显登录后跳转的地址少了端口号. 原因:proxy.conf文件中定义的proxy_set_header Host $host; 意思是nginx接收到浏览器请求后修改请求头中的host信息,然后再把请求转发给后端真实服务节点,服务节点响应后把返回信息传送给nginx,而由于nginx是使用的非80端口做代理,后端服务节点却依然以为nginx是80端口,所以响
nginx做反向代理时出现302错误(转载)
现象:nginx在使用非80端口做反向代理时,浏览器访问发现返回302错误 详细现象如下: 浏览器请求登录页: 输入账号密码点击登录: 很明显登录后跳转的地址少了端口号. 原因:proxy.conf文件中定义的proxy_set_header Host $host; 意思是nginx接收到浏览器请求后修改请求头中的host信息,然后再把请求转发给后端真实服务节点,服务节点响应后把返回信息传送给nginx,而由于nginx是使用的非80端口做代理,后端服务节点却依然以为nginx是80端口,所以响
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这个问题我也是无意间碰到的,之前一直是使用单机的ActiveMQ,所以也没这个问题,但是做集群时碰到这个问题,问题是这样子出现的: 首先,我准备了三台虚拟机,然后使用 Replicated LevelDB 的方式配置集群,配置如下: <persistenceAdapter> <!--<kahaDB directory="${activemq.data}/kahadb"/>--> <replicatedLevelDB directory=&quo
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