何为功能富集分析? 功能富集分析是将基因或者蛋白列表分成多个部分,即将一堆基因进行分类,而这里的分类标准往往是按照基因的功能来限定的.换句话说,就是把一个基因列表中,具有相似功能的基因放到一起,并和生物学表型关联起来. 何为GO和KEGG? 为了解决将基因按照功能进行分类的问题,科学家们开发了很多基因功能注释数据库,.这其中比较有名的一个就是Gene Ontology(基因本体论,GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(京都基因与基因组百科全书,K

使用Timeline做性能分析 Timeline面板记录和分析了web应用运行时的所有活动情况,这是研究和查找性能问题的最佳途径.###Timeline面板概览 Timeline面板主要有三个部分构成:顶部的概述部分.记录视图和工具栏. 点击开始/停止切换按钮,开始或停止记录(参考记录) 点击清理按钮来从Timeline中清除已有的记录 关联异步事件模式让你更容易的关联异步事件和这些异步事件的调用(参考关于嵌套事件) 你可以根据记录中的类型.执行时长去过滤Timeline中的记录(参考过滤和搜索

  image Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a computational method that determines whether an a priori defined set of genes shows statistically significant, concordant differences between two biological states (e.g. phenotypes). 用GSEA做富集分析是非常简单的,结

抓取摩拜单车API数据,并做可视化分析 纵聊天下 百家号|04-19 15:16 关注 警告:此篇文章仅作为学习研究参考用途,请不要用于非法目的. 摩拜是最早进入成都的共享单车,每天我从地铁站下来的时候,在APP中能看到很多单车,但走到那里的时候,才发现车并不在那里.有些车不知道藏到了哪里:有些车或许是在高楼的后面,由于有GPS的误差而找不到了:有些车被放到了小区里面,一墙之隔让骑车人无法获得到车. 那么有没有一个办法通过获得这些单车的数据,来分析这些车是否变成了僵尸车?是否有人故意放到小区里面

爬取过程在这里: Python爬取你好李焕英豆瓣短评并利用stylecloud制作更酷炫的词云图 本文基于前文爬取生成的douban.txt,基于SnowNLP做情感分析. 依赖库: 豆瓣镜像比较快: pip install snownlp -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host=pypi.douban.com/simple 初识SnowNLP: SnowNLP是一个常用的Python文本分析库,是受到TextBlob启发而发明的.由于当

导引 在计算密集型计算或一些Web应用中,我们常常需要对代码做性能分析.在Python中,最原始的方法即是使用time包中的time函数(该函数以秒为计时单位): from time import sleep, time def func1(): sleep(0.001) def func2(): sleep(2) begin1 = time() func1() end1 = time() begin2 = time() func2() end2 = time() print("func1 co

1.对整个程序的性能分析 如果只是想简单地对整个程序做计算统计,通常使用UNIX下的time命令就足够了. (base) ➜ Learn-Python time python someprogram.py python someprogram.py 0.10s user 0.01s system 98% cpu 0.117 total 由于我用的是Mac系统,和Linux系统的输出可能有不同,不过关键都是这三个时间: user: 运行用户态代码所花费的时间,也即CPU实际用于执行该进程的时间,其

之前帮助Script.net做了一部分网站的汉化工作,不过我对ScriptCase自己做的网站不满意,对其汉化网站更是不满意. ScriptCase7出来之后,比较让人头疼的就是汉化的问题,较之v6,汉化确实是退步了,估计有可能是内部有人员变动,或者是版本保存上出了点问题. 有些翻译简直是令人发指,难道是从Google Translate上直接弄的?搞到我现在只想使用英文版,不想使用中文界面打开了. 和技术人员联系了,近期会协助他们做些翻译的矫正工作. 希望下一个版本会更好些.

两部分,1需要喂什么东西给软件,2它能干什么(输出什么东西在下一篇讲) 博客园/B站/知乎/CSDN @秋意正寒 转载请在头部附上源地址 目录:https://www.cnblogs.com/onsummer/p/10777520.html 1. 数据的输入 DepthMapX(简称DMX)主要支持以下几种数据格式: AutoCAD的交换格式 *.dxf,只能是线或者面 MapInfo的 *.mif csv/txt/gml... 吐槽:居然不支持shp/json,真垃圾 1.1 数据的类型及要求

使用AddressSanitizer做内存分析 新建文件mem_leak.cpp,键入代码: #include <iostream> int main() { ]; p = NULL; ; } 编译时加上-fsanitizer=leak选项,并执行: $ g++ mem.leak.cpp -o main -fsanitize=leak $ ./main ./main: error while loading shared libraries: liblsan.so.0: cannot open

http://bbs.tianya.cn/post-stocks-612892-3.shtml ————看了一页就感觉没什么太大的意义 选时重于选股 这是一条股市生存的基本法则 看看天涯真正的高手 现在都选择了休息 最不济也是轻仓 所以 这些劳什子最好等到下一个牛市再拿来摆弄吧 近日收到很多朋友发来消息,希望转载笔者的文章,在此非常感谢这些朋友对"异动的K线"的厚爱,转载的时候请注明转载二字和原创文章来自新浪博客"异动的K线".在此感谢 .因平时工作时间很紧,如文章

如何用SPSS做联合分析 如果产品的描述是由几个属性特征决定的,比如说mp3的音质.外形.容量.价格等等,商家为了确定哪个属性对消费者的影响最大,以及预测什么样的属性组合最受消费者的欢迎,选择的办法应该就是联合分析了.事实上从抽样调查的角度来看,高质量和低价格的组合是消费者的最爱,但是这对商家而言,这没有任何意义. 在SPSS中分成三个阶段,转载一个例子,帮助自己学习. (1)ORTHOPLAN(正交设计),属性特征的所有组合产品是非常多的,所以应该通过正交设计进行筛选.以下是使用SPSS进行正

MyBatis做持久层框架,返回值类型要为Integer MyBatis 做持久层时,之前没注意,有时候为了偷懒使用了int类型做为返回的类型,这样是不可取的,MyBatis做持久层框架,返回值类型要为Integer 今天在使用的时候发现一个java基础类型的重要问题, int类型不能与null比较,即int不能赋值为null(这在C语言中是可以存在的),在数据的操作时常出现空的情况,问题就严肃了 这衍生出一个问题,使用MyBatis作为持久层框架的情况,若返回值是空将发生什么? 项目中用myb

NetworkX 是 Python 上最常用的图分析包,GraphScoep 兼容 NetworkX 接口.本文中我们将分享如何用 GraphScope 像 NetworkX 一样在(大)图上进行分析. NetworkX 是什么 NetworkX 是一个用 Python 语言开发的图论与复杂网络建模工具,它内置了常用的图与复杂网络分析算法,提供了一套简单易用的图分析接口,可以方便地进行复杂网络数据分析.仿真建模等工作.NetworkX 的接口设计十分简洁,对于作为刚进入图算法领域的小白来说,Ne

项目内容 本案例选择>> 商品类目:沙发: 数量:共100页  4400个商品: 筛选条件:天猫.销量从高到低.价格500元以上. 项目目的 1. 对商品标题进行文本分析 词云可视化 2. 不同关键词word对应的sales的统计分析 3. 商品的价格分布情况分析 4. 商品的销量分布情况分析 5. 不同价格区间的商品的平均销量分布 6. 商品价格对销量的影响分析 7. 商品价格对销售额的影响分析 8. 不同省份或城市的商品数量分布 9.不同省份的商品平均销量分布 注:本项目仅以以上几项分析为

软件开发过程中,项目上线并不是终点.上线后,还要对程序的取样分析运行情况,并重构现有的功能,让程序执行更高效更稳写. golang的工具包内自带pprof功能,使找出程序中占内存和CPU较多的部分功能方便了不少.加上uber的火焰图,可视化显示,让我们在分析程序时更简单明了. pprof有两个包用来分析程序一个是net/http/pprof另一个是runtime/pprof,net/http/pprof只是对runtime/pprof包进行封装并用http暴露出来,如下图源码所示: 使用net/

转载:http://www.bio-info-trainee.com/1327.html 收集了那么多的癌症细胞系的表达数据,拷贝数变异数据,突变数据,总不能放着让它发霉吧! 这些数据可以利用的地方非常多,但是在谷歌里面搜索引用了它的文章却不多,我挑了其中几个,解读了一下别人是如何利用这个数据的,当然,主要是用那个mRNA的表达数据咯! 第一篇:http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0111146 这篇文

简述:      在TCP协议中影响数据发送的三个因素分别为:发送端窗口值.接收端窗口值和拥塞窗口值. 本文主要分析MPTCP中各个子路径对接收端窗口值rcv_wnd的处理.   接收端窗口值的初始化      根据<MPTCP 源码分析(二) 建立子路径>中描述服务端在发送完SYN/ACK并接收到ACK的时候建立新的sock. 在内核实现中,针对连接请求分为两个步骤处理: SYN队列处理:当服务端收到SYN的时候,此连接请求request_sock将被存放于listening socket的

一.doc_values介绍 doc values是一个我们再三重复的重要话题了,你是否意识到一些东西呢? 搜索时,我们需要一个“词”到“文档”列表的映射 排序时,我们需要一个“文档”到“词“列表的映射,换句话说,我们需要一个在倒排索引的基础上建立的“正排索引” 这里的“正排索引”结构通常在其他系统中(如关系型数据库)被称为“列式存储”.本质上,它是在数据字段的一列上存储所有value,这种结构在某些操作上会表现得很高效,比如排序. 在ES里这种“列式存储”就是我们熟悉的“doc values”

mysql慢查询日志是mysql提供的一种日志记录,它是用来记录在mysql中相应时间超过阈值的语句,就是指运行时间超过long_query_time值的sql,会被记录在慢查询日志中.long_query_time的默认值是10,意思是运行10S之上的语句. 慢查询日志的设置 1 .查看是否开启慢查询日志命令: show variables like '%slow_query_log%' 2.设置慢查询开启的命令 set global slow_query_log=1 注: slow_quer

作为PHP程序员我们或多或少都了解或使用过xdebug.此文章记录安装和配置xdebug,以及如何使用它来分析php程序. 我的机器环境: mac, php 安装 xdebug 推荐使用 pecl 安装扩展 pecl install xdebug 注:可以选择版本, https://pecl.php.net/package/xdebug 启用和配置 如果不知道php的配置文件,可以用 php --ini 查看 启用 xdebug,添加一个独立的 ext-xdebug.ini 到 php 的配置目