嵌合体序列指在pcr过程中,两条不同的序列产生杂交扩增的序列,属于人工污染,在ITS和16S分析中,应该首先去除,USearch提供去除嵌合体的功能 usearch -uchime_ref reads.fna -db reference.fna -strand plus -nonchimeras nonchimeras.fna usearch 链接:http://drive5.com/usearch/manual/uparse_cmds.html 同时usearch提供更加可靠的聚类方案(未详考

一.背景 最近在Azkaban的测试工作中,需要在测试环境下模拟线上的调度场景进行稳定性测试.故而重操python旧业,通过python编写脚本来构造类似线上的调度场景.在脚本编写过程中,碰到这样一个需求:要在测试环境创建10000个作业流. 最开始的想法是在一个azkaban project下循环调用10000次create job接口(每个Flow只包含一个job).由于azkaban它本身没有增加/删除作业流的接口,所有的作业流修改.增加.删除其实都是通过重新上传项目zip包实现的,相应地

前面的文章:多线程爬坑之路-学习多线程需要来了解哪些东西?(concurrent并发包的数据结构和线程池,Locks锁,Atomic原子类) 多线程爬坑之路-Thread和Runable源码解析 前面大致的了解了Thread的一些方法和属性下面对一些方法进行运用看看具体效果<下面可能还是会贴很多的源代码,其实我是拒绝的,我只想贴每个方法的代码,但是有时候看到一个方法里面有调用了方法,但是笔者有没有给出来,很蛋疼,有种爽到一半的感觉,所以我还是会把它贴出来,希望一次就能挖到底,不论有没有全懂,但至

前言:刚学习了一段机器学习,最近需要重构一个java项目,又赶过来看java.大多是线程代码,没办法,那时候总觉得多线程是个很难的部分很少用到,所以一直没下决定去啃,那些年留下的坑,总是得自己跳进去填一次. 思路:大概看了线程相关的一些知识,对线程的运行机制,同步机制,以及整个系统都做一个全面的了解.在深入每一个部分去看一下线程及其相关包的源码做深入了解. 目标:线程,并发包(线程池,并发的数据结构,锁,原子类). 通过一些资料的查看最终把目标定位在线程和并发包上,线程是核心,并发包是辅助工具,

一:进程与线程 概述:几乎任何的操作系统都支持运行多个任务,通常一个任务就是一个程序,而一个程序就是一个进程.当一个进程运行时,内部可能包括多个顺序执行流,每个顺序执行流就是一个线程.   进程:进程是指处于运行过程中的程序,并且具有一定的独立功能.进程是系统进行资源分配和调度的一个单位.当程序进入内存运行时,即为进程.   进程的三个特点: 1:独立性:进程是系统中独立存在的实体,它可以独立拥有资源,每一个进程都有自己独立的地址空间,没有进程本身的运行,用户进程不可以直接访问其他进程的地址空间

Index : (1)类型语法.内存管理和垃圾回收基础 (2)面向对象的实现和异常的处理基础 (3)字符串.集合与流 (4)委托.事件.反射与特性 (5)多线程开发基础 (6)ADO.NET与数据库开发基础 (7)WebService的开发与应用基础 一.多线程编程的基本概念 下面的一些基本概念可能和.NET的联系并不大,但对于掌握.NET中的多线程开发来说却十分重要.我们在开始尝试多线程开发前,应该对这些基础知识有所掌握,并且能够在操作系统层面理解多线程的运行方式. 1.1 操作系统层面的进程

在开发多线程程序时,如果每个多线程处理的事情都不一样,每个线程都互不相关,这样开发的过程就非常轻松.但是很多时候,多线程程序是需要同时访问同一个对象,或者变量的.这样,一个对象同时被多个线程访问,会出现处理的结果和预期不一致的可能.因此,需要了解如何对对象及变量并发访问,写出线程安全的程序,所谓线程安全就是处理的对象及变量的时候是同步处理的,在处理的时候其他线程是不会干扰.本文将从以下几个角度阐述这个问题.所有的代码都在char02 对于方法的同步处理 对于语句块的同步处理 对类加锁的同步处理

在上一篇C#多线程之线程池篇2中,我们主要学习了线程池和并行度以及如何实现取消选项的相关知识.在这一篇中,我们主要学习如何使用等待句柄和超时.使用计时器和使用BackgroundWorker组件的相关知识. 五.使用等待句柄和超时 在这一小节中,我们将学习如何在线程池中实现超时和正确地实现等待.具体操作步骤如下: 1.使用Visual Studio 2015创建一个新的控制台应用程序. 2.双击打开"Program.cs"文件,编写代码如下所示: using System; using

在上一篇C#多线程之线程池篇1中,我们主要学习了如何在线程池中调用委托以及如何在线程池中执行异步操作,在这篇中,我们将学习线程池和并行度.实现取消选项的相关知识. 三.线程池和并行度 在这一小节中,我们将学习对于大量的异步操作,使用线程池和分别使用单独的线程在性能上有什么差异性.具体操作步骤如下: 1.使用Visual Studio 2015创建一个新的控制台应用程序. 2.双击打开"Program.cs"文件,编写代码如下所示: using System; using System.

在C#多线程之线程池篇中,我们将学习多线程访问共享资源的一些通用的技术,我们将学习到以下知识点: 在线程池中调用委托 在线程池中执行异步操作 线程池和并行度 实现取消选项 使用等待句柄和超时 使用计时器 使用BackgroundWorker组件 在前面的"C#多线程之基础篇"以及"C#多线程之线程同步篇"中,我们学习了如何创建线程以及如何使用多线程协同工作,在这一篇中,我们将学习另外一种场景,就是我们需要创建许多花费时间非常短的异步操作来完成某些工作.我们知道创建一

在上一篇C#多线程之线程同步篇2中,我们主要学习了AutoResetEvent构造.ManualResetEventSlim构造和CountdownEvent构造,在这一篇中,我们将学习Barrier构造.ReaderWriterLockSlim构造和SpinWait构造. 七.使用Barrier构造 在这一小节中,我们将学习一个比较有意思的同步构造:Barrier.Barrier构造可以帮助我们控制多个等待线程达到指定数量后,才发送通知信号,然后所有等待线程才能继续执行,并且在每次等待线程达到

在上一篇C#多线程之线程同步篇1中,我们主要学习了执行基本的原子操作.使用Mutex构造以及SemaphoreSlim构造,在这一篇中我们主要学习如何使用AutoResetEvent构造.ManualResetEventSlim构造和CountDownEvent构造. 四.使用AutoResetEvent构造 在这一小节中,我们将学习如何使用AutoResetEvent构造从一个线程向另一个线程发送通知.AutoResetEvent通知一个等待线程某个事件已经发生.具体步骤如下所示: 1.使用V

在多线程(线程同步)中,我们将学习多线程中操作共享资源的技术,学习到的知识点如下所示: 执行基本的原子操作 使用Mutex构造 使用SemaphoreSlim构造 使用AutoResetEvent构造 使用ManualResetEventSlim构造 使用CountdownEvent构造 使用Barrier构造 使用ReaderWriterLockSlim构造 使用SpinWait构造  一.执行基本的原子操作 在这一小节中,我们将学习如何在没有阻塞线程(blocking threads)发生的

在上一篇C#多线程之基础篇2中,我们主要讲述了确定线程的状态.线程优先级.前台线程和后台线程以及向线程传递参数的知识,在这一篇中我们将讲述如何使用C#的lock关键字锁定线程.使用Monitor锁定线程以及线程中的异常处理. 九.使用C#的lock关键字锁定线程 1.使用Visual Studio 2015创建一个新的控制台应用程序. 2.双击打开"Program.cs"文件,然后修改为如下代码: using System; using System.Threading; using

Swift3.0相关代码已在github上更新.之前关于iOS开发多线程的内容发布过一篇博客,其中介绍了NSThread.操作队列以及GCD,介绍的不够深入.今天就以GCD为主题来全面的总结一下GCD的使用方式.GCD的历史以及好处在此就不做过多的赘述了.本篇博客会通过一系列的实例来好好的总结一下GCD.GCD在iOS开发中还是比较重要的,使用场景也是非常多的,处理一些比较耗时的任务时基本上都会使用到GCD, 在使用是我们也要主要一些线程安全也死锁的东西. 本篇博客中对iOS中的GCD技术进行了

多线程:(百度百科借一波定义) 多线程(英语:multithreading),是指从软件或者硬件上实现多个线程并发执行的技术.具有多线程能力的计算机因有硬件支持而能够在同一时间执行多于一个线程,进而提升整体处理性能.具有这种能力的系统包括对称多处理机.多核心处理器以及芯片级多处理(Chip-level multithreading)或同时多线程(Simultaneous multithreading)处理器. 在一个程序中,这些独立运行的程序片段叫作"线程"(Thread),利用它编程

说到多线程编程,那么就不得不提并行和并发,多线程是实现并发(并行)的一种手段.并行是指两个或多个独立的操作同时进行.注意这里是同时进行,区别于并发,在一个时间段内执行多个操作.在单核时代,多个线程是并发的,在一个时间段内轮流执行:在多核时代,多个线程可以实现真正的并行,在多核上真正独立的并行执行.例如现在常见的4核4线程可以并行4个线程:4核8线程则使用了超线程技术,把一个物理核模拟为2个逻辑核心,可以并行8个线程. 并发编程的方法 通常,要实现并发有两种方法:多进程和多线程. 多进程并发 使用

最近花些时间学习了一下Python,并写了一个多线程的爬虫程序来获取电影天堂上资源的迅雷下载地址,代码已经上传到GitHub上了,需要的同学可以自行下载.刚开始学习python希望可以获得宝贵的意见. 先来简单介绍一下,网络爬虫的基本实现原理吧.一个爬虫首先要给它一个起点,所以需要精心选取一些URL作为起点,然后我们的爬虫从这些起点出发,抓取并解析所抓取到的页面,将所需要的信息提取出来,同时获得的新的URL插入到队列中作为下一次爬取的起点.这样不断地循环,一直到获得你想得到的所有的信息爬虫的任务

建议126:适时选择不同的线程池来实现 Java的线程池实现从根本上来说只有两个:ThreadPoolExecutor类和ScheduledThreadPoolExecutor类,这两个类还是父子关系,但是Java为了简化并行计算,还提供了一个Exceutors的静态类,它可以直接生成多种不同的线程池执行器,比如单线程执行器.带缓冲功能的执行器等,但归根结底还是使用ThreadPoolExecutor类或ScheduledThreadPoolExecutor类的封装类. 为了理解这些执行器,我们

有许多耗时操作时,还要响应用户操作.这时候就需要用其他线程或者异步来搞.本来是改造公司的日志组件.因为多上了个国外大区的业务到来本系统来.这个系统其他地方都好就是日志,动不动就要死给我们看.有时候寻找业务流程时缺失了一块日志,令人欲仙欲死.刚好年末了没什么业务上线,决定改造日志.前人栽树后人心凉.本着我不入地狱谁入地狱的精神,折腾完了这个日志.发现线程的有些地方处理的不好.顺带给自己留个念想谢谢异步或者多线程的东西.有错误欢迎指正. beginInvoke EndInvoke 使用 1. 使用历

线程可以理解为下载的通道,一个线程就是一个文件的下载通道,多线程也就是同时开启好几个下载通道.当服务器提供下载服务时,使用下载者是共享带宽的,在优先级相同的情况下,总服务器会对总下载线程进行平均分配.不难理解,如果你线程多的话,那下载的越快. 现流行的下载软件都支持多线程,且支持中途暂停下载,再次开始时不会从头开始下载. 两种功能的实现步骤如下: (1)连接到下载资源文件时,首先判断资源文件大小,同步的在本地创建一个大小相同的临时文件用于存储下载数据. (2)根据线程数量确定每个线程所需下载的文