总结起来就三句话: (1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正 (2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-value cutoff就更小了,从而使得结果更加严谨 (3)FDR校正是对每个p-value做校正,转换为q-value.q=p*n/rank,其中rank是指p-value从小到大排序后的次序. 举一个具体的实例: 我们测量了M个基因在A,B,C,D,E一共5个时间点的表达量,求其中的差异基因,具体

Bonferroni校正:如果在同一数据集上同时检验n个独立的假设,那么用于每一假设的统计显著水平,应为仅检验一个假设时的显著水平的1/n http://baike.baidu.com/view/1217813.htm?fr=aladdin Bonferroni校正法: 此方法是在进行两两比较时对检验水准进行调整的办法,但是该方法在比较的次数较多时,就不太适合,因为校正后的检验水准会过小.此时可采用sidark法进行多重比较(仍然是对检验水准进行调整). 统计学中一般以小概率作为判断差异是否显著

GWAS的数据形式:SNP数据,即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态(0正常,1患病)的样例-对照数据. 在遗传流行病学上,全基因组关联研究(Genome Wide Association Studies,GWAS)是一种检测特定物种中不同个体间的全部或大部分基因,从而了解不同个体间的基因变化有多大的一种方法.不同的变化带来不同的性状,如各种疾病的不同. 这些研究通常比较两组参与者的DNA:有疾病的人(病例)和相同条件的无该疾病的人(对照).每个人都提供些作为样本的细胞,如从口腔内

p值还是 FDR ? 差异分析 如何筛选显著性差异基因,p value, FDR 如何选 经常有同学询问如何筛选差异的基因(蛋白).已经计算了表达量和p value值,差异的基因(蛋白)太多了,如何筛选.其中最为关键的是需要对p value进行校正. 基本概念: 零假设:在随机条件下的分布. p值:在零假设下,观测到某一特定实验结果的概率称为p值. 假阳性:得到了阳性结果,但这个阳性结果是假的. 假阴性:得到了阴性结果,但这个阴性结果是假的. 单次检验: 针对单个基因(蛋白),采用统计检验,假设

转自:https://baike.baidu.com/item/FDR/16312044?fr=aladdin  https://blog.csdn.net/taojiea1014/article/details/79681249 http://www.360doc.com/content/18/0914/21/19913717_786724085.shtml   https://www.sohu.com/a/165109778_785442 https://www.jianshu.com/p/

sklearn实战-乳腺癌细胞数据挖掘(博主亲自录视频) https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1005269003&utm_campaign=commission&utm_source=cp-400000000398149&utm_medium=share 医药统计项目联系:QQ231469242 # -*- coding: utf-8 -*- # Import standard packages impor

大家工作或者平时是不是经常遇到要读写一些简单格式的Excel? shit!~很蛋疼,因为之前吹牛,就搞了个这东西,还算是挺实用,和大家分享下. 厌烦了每次搞简单类型的Excel读写?不怕~来,喜欢流式操作?来~,喜欢用lambda(虽然java的比较蛋疼~),来~看这个~ 哈哈,如果你用的不是java8~~没问题,那就默默地用老方式匿名类来实现这些功能吧,但是这并不妨碍您的使用哈哈~~~ 更新多次~希望大家也能够集思广益~ github地址:https://github.com/MatrixSe

原因: Excel2007设置过单元格格式后,并不能立即生效必须挨个双击单元格,才能生效.数据行很多.效率太低. 原因:主要是一些从网上拷贝过来的日期或数字excel默认为文本格式或特殊-中文数字格式大小写. 手动设置单元格,将格式改成日期格式,但仍不能参与计算. 只有挨个单元格双击,才能生效:才可以计算. 解决: 选中整列,"数据"--->"分列"--->"分隔符号"--->"下一步"--->&quo

本篇主要介绍C#的Excel导入.导出. 目录 1. 介绍:描述第三方类库NPOI以及Excel结构 2. Excel导入:介绍C#如何调用NPOI进行Excel导入,包含:流程图.NOPI以及C#代码 3. Excel导出:介绍C#如何调用NPOI进行Excel导出,包含:流程图.NOPI以.C#代码以及代码分析 4. 源码下载:展示运行图及源码下载 1. 介绍 1.1 第三方类库:NPOI 说明:NPOI是POI项目的.NET 版本,可用于Excel.Word的读写操作. 优点:不用装Off

前言 近日项目中做到一个功能,需要上传附件后能够在线预览.之前也没做过这类似的,于是乎就查找了相关资料,.net实现Office文件预览大概有这几种方式: ① 使用Microsoft的Office组件将文件直接转换为html文件(优点:代码实现最简单,工作强度最小.缺点:效果极差) ②使用Microsoft的Office组件将文件转换为PDF格式文件,然后再使用pdf2swf转换为swf文件,也就是flash文件在使用FlexPaper展示出来(优点:预览效果能接受,缺点:代码量大) ③使用Of

系列目录 前言 上一节使用了LinqToExcel和CloseXML对Excel表进行导入和导出的简单操作,大家可以跳转到上一节查看: ASP.NET MVC5+EF6+EasyUI 后台管理系统(63)-Excel导入和导出 本节演示一些比较复杂的模型场景 情景 上次的场景:(标准的Excel表格格式) 制定的场景:(指定表模的场景,多张sheet,不是横排的形式) 实现 实现思路:利用LinqToExcel循环读取Sheet,再循环读取Sheet指定单元格的内容 (其实Excel是一个二维数

我们知道Microsoft Excel并没有内置的功能直接给Excel表添加水印,但是其实我们可以用其他变通的方式来解决此问题,如通过添加页眉图片或艺术字的方法来模仿水印的外观.所以在这篇文章中,我将向您演示来如何通过在Excel中创建和插入页眉图片来为excel添加水印.之前我也分享了如何给word文档添加水印和pdf文件添加水印的方法,有需要也可以参考. 这里我下载了一个E-iceblue公司开发的免费版的Excel组件- Free Spire.XLS,这样既节省时间,又简化了代码. 控件安

在进行图表分析的时候,我们可能需要在一张图表呈现两个或多个样式的图表,以便更加清晰.直观地查看不同的数据大小和变化趋势.在这篇文章中,我将分享C#中如何在一张图表中创建不同的图表类型,其中包括如何在同一个图表添加第二个轴. 下面是一个简单的excel工作表,可以看到系列3数据不同于系列1和2,这样我们就可以绘制不同的图表类型和不同的坐标轴来表示变化的数据:

[2015] 很多时候,我们在生成数据库文档时,使用某些工具,可效果总不理想,不是内容不详细,就是表现效果一般般.很多还是word.html的.看着真是别扭.本人习惯用Excel,所以闲暇时,就简单的编写了数据库文档生成工具,供大家交流学习之用,与程序员共勉.     该工具为C#控制台,以NPOI为基础,操作Excel.简单方便,简单配置.两次回车,OK!即可生成清晰的数据库文档.另外,支持生成HTML文档.源码大小7MB,OS上传不了,放到百度云盘里了:http://pan.baidu.co

很多的软件项目几乎都包含着对文档的操作,前面已经介绍过两款操作文档的组件,现在介绍一款文档操作的组件NPOI. NPOI可以生成没有安装在您的服务器上的Microsoft Office套件的Excel报表,并且在后台调用Microsoft Excel ActiveX更有效率;从Office文档中提取文本,以帮助您实现全文索引功能(大多数时候,此功能用于创建搜索引擎): 从Office文档提取图像: 生成包含公式的Excel工作表. 一.NPOI组件概述: NPOI是完全免费使用: 涵盖Excel

参考页面: http://www.yuanjiaocheng.net/webapi/create-crud-api-1-post.html http://www.yuanjiaocheng.net/webapi/create-crud-api-1-put.html http://www.yuanjiaocheng.net/webapi/create-crud-api-1-delete.html http://www.yuanjiaocheng.net/webapi/Consume-web-api

首先,需要添加引用Aspose.Cells.dll,官网下载地址:http://downloads.aspose.com/cells/net 将DataTable导出Xlsx格式的文件下载(网页输出): /// <summary> /// 导出Excel表格 /// </summary> /// <param name="list">数据集合</param> /// <param name="header">

import java.lang.reflect.Field;import java.lang.reflect.InvocationTargetException;import java.lang.reflect.Method;import java.sql.Date;import java.util.ArrayList;import java.util.List; import org.apache.poi.ss.usermodel.Cell;import org.apache.poi.ss.

由于工作中需要将Excel中的此两种函数转换成java函数,从而计算内部评级的资本占用率和资本占用金额.经过多方查阅资料和整理,总结出如下两个转换方法 标准正态分布累计函数NORMSDIST: public static double NormSDist(double z) { // this guards against overflow if (z > 6) return 1; if (z < -6) return 0; double gamma = 0.231641900, a1 = 0

从Excel导入数据最令人头疼的是数据格式的兼容性,特别是日期类型的兼容性.为了能够无脑导入日期,折腾了一天的NPOI.在经过测试确实可以导入任意格式的合法日期后,写下这篇小文,与大家共享.完整代码请移步:https://github.com/xuanbg/Utility 2016-11-13 04:06 修正一个bug.由try DateCellValue改为判断列数据类型,如类型为DateTiime返回DateCellValue,否则返回NumericCellValue或StringCell