exonerate编码区标注

2024-10-20

【基因组注释】同源注释比对软件tblastn、gamp和exonerate比较

基因结构预测中同源注释策略,将mRNA.cDNA.蛋白.EST等序列比对到组装的基因组中,在文章中通常使用以下比对软件: tblastn gamp exonerate blat 根据我的实测,以上软件整体都比较慢.gmap可设置多线程来提升速度.tblastn虽然也可以,但对提速没什么影响.exonerate和gamp巨吃内存. 以下是跑的资源情况.我的组装基因组约400Mb.tblastn的查询序列311764条,gmap的查询序列1483791条,exonerate的查询序列43632条.

【java】细说 JAVA中标注注解（annotation）

Java注解是附加在代码中的一些元信息,用于一些工具在编译.运行时进行解析和使用,起到说明.配置的功能.注解不会也不能影响代码的实际逻辑,仅仅起到辅助性的作用下面我们来详细说说这个注解,到底是怎么一回事,一步一步看下去,总会后收获. 注解起源:Annotation(注解)是JDK5.0及以后版本引入的.在java.lang.annotation包中. 注解作用:它可以用于创建文档,跟踪代码中的依赖性,甚至执行基本编译时检查. 注解格式:注解是以‘@注解名’在代码中存在的注解分类:标记注解.单

ArcGIS中的标注和注记

在ArcMap中可以使用标注和注记来识别要素,选择标注或注记取决于你需要如何控制文本显示以及在ArcMap中如何存储文本. 1.标注只是临时显示相关数据或字段 2.标注用于长时间保存数据以及显示方式. 创建关联要素的注记要素类有两种方法: 第一种方法是在 ArcCatalog 或目录窗口中创建一个关联要素的注记要素类.需要一个地理数据库. 第二种方法是通过将标注转换为注记要素在 ArcMap 中创建关联要素的注记要素类.保存在地图文档(mxd)中上述两种方法创建的注记都可以通过Draw工具条进

Angularjs+node+Mysql实现地图上的多点标注

注:本文适合对于node有一定基础的人,如果您是小白,请先用1个小时学习node.node文档https://nodejs.org/en/docs/ 该片博文的源码地址:https://github.com/zhangxy1035/Gould 一.项目介绍近几年,在大数据的驱动下,数据可视化变的越来越重要,其中现在比较火的就是地理位置可视化,在这篇文章中,将使用node作为服务器,angularjs作为前台显示,mysql作为数据库,实现地图上的多点标注.系统架构建设简单,可复用性高. 在这里

Servlet使用注解标注监听器(Listener)

Servlet3.0提供@WebListener注解将一个实现了特定监听器接口的类定义为监听器,这样我们在web应用中使用监听器时,也不再需要在web.xml文件中配置监听器的相关描述信息了. 下面我们来创建一个监听器,体验一下使用@WebListener注解标注监听器,如下所示: 监听器的代码如下: package me.gacl.web.listener; import javax.servlet.ServletContextEvent; import javax.servlet.Servl

sqlserver数据库标注为可疑的解决办法（转）

前几天客户那边的服务器死机了,然后客户强制关机,重新启动服务器后,系统就没法正常使用,连接不上服务器,我远程操作后,看到数据库标注为可疑,由于客户之前没备份数据库,看来只能是修复了: 1:停止数据库服务,将可疑的数据库及日志备份到别的文件夹,随后删除数据库文件及日志文件 2:打开数据库服务,连接数据库后删除可疑的数据库,并新建同名的数据库(目录位原来的目录) 3:停止数据库服务,将备份的数据库文件替换新建的数据库文件(日志文件不需要替换) 4:打开数据库服务,连接数据库后执行alter data

百度地图API显示多个标注点带检索框

通过百度地图的api,可以在地图上显示多个标注点,并给所有的标注点实现了带检索功能的信息框 <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> &

【Python实战】机型自动化标注（搜狗爬虫实现）

1. 引言从安卓手机收集上来的机型大都为这样: mi|5 mi|4c mi 4c 2014022 kiw-al10 nem-tl00h 收集的机型大都杂乱无章,不便于做统计分析.因此,标注显得尤为重要. 中关村在线有对国内大部分手机的介绍情况,包括手机机型nem-tl00h及其对应的常见名称荣耀畅玩5C.因而,设计机型自动化标注策略如下: 在搜狗搜索中输入机型进行搜索,为了限定第一个返回结果为ZOL网站,加上限定词site:detail.zol.com.cn: 通过第一条返回结果的链接,跳转到

ArcGIS标注

关于ArcGIS的标注问题整理. 要求: 保留小数点后三位, 若原数据小于1(.12345),对小数加0显示分行显示两个字段值解决: 右击图层 -- ”properties“(属性) 中选择“label”(标注)标签,选择expression(表达式),出现下述窗口, 此处采用VBScript语言,代码如下: Function FindLabel ( [test], [BM] ) //输入参数,选操作用到的两个字段 S = int([test]*1000)/1000 //

[python]沪深龙虎榜数据导入通达信的自选板块，并标注于K线图上

将沪深龙虎榜数据导入通达信的自选板块,并标注于K线图上原理:python读取前一次处理完的计算5日后涨跌幅输出的csv文件文件名前加"[paint]" 安照通达信的画图文件和板块文件格式,输出文件用通达信的导入功能,导入画图文件和板块文件即可事前数据截图: 处理后所得文件: 导入通达信后板块截图: k线截图: 代码: #coding=utf-8 #读取'[paint]'开头的csv文件 #copyright @ WangXinsheng #http://www.cnblogs.

百度地图API显示多个标注点并添加百度样式检索窗口

原作者博客地址:http://blog.csdn.net/a497785609/article/details/24009031 在此基础上进行了修改: 1.添加闭包,将i传入内部 2.添加地图和卫星模式的切换 3.将单纯信息窗口改为百度样式检索窗口代码如下: <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-tr

iOS原生地图开发指南续——大头针与自定义标注

iOS原生地图开发指南续——大头针与自定义标注出自:http://www.sxt.cn/info-6042-u-7372.html 在上一篇博客中http://my.oschina.net/u/2340880/blog/415360系统总结了iOS原生地图框架MapKit中主体地图的设置与应用.这篇是上一篇的一个后续,总结了系统的大头针视图以及自定义标注视图的方法. 一.先来认识一个协议MKAnnotation 官方文档告诉我们,所有标注的类必须遵守这个协议.所以可以了解,标注这个概念在逻辑属

百度地图API多个点聚合时，标注添加的标签label地图刷新就丢失的问题解决

当将自定义的Marker(含有Label)通过MarkerClusterer 管理的时候,当地图发生任何移动.缩放的时候,Marker 的Label 就会自动消失. 这个问题主要是由于百度的点聚合API<script type="text/javascript" src="http://api.map.baidu.com/library/MarkerClusterer/1.2/src/MarkerClusterer_min.js"></scrip

ae显示标注

//添加标注,比TextElment功能更强大 public static void ToAddAnnotate(ILayer layer, string fieldName) { IGeoFeatureLayer pGeoLayer = layer as IGeoFeatureLayer; IAnnotateLayerPropertiesCollection IPALPColl = pGeoLayer.AnnotationProperties; IPALPColl.Clear(); IColo

iOS开发之百度地图的集成——地图标注&POI检索

本篇分为两部分: 一.地图标注第一步:首先创建 BMKMapView 视图第二步:在视图完全显示出来后设置,并实现代理方法第三步:运行程序,此时大头针效果可以正常显示二.POI检索第一步:延时加载对象第二步:实现BMKPoiSearchDelegate代理方法第三步:实现 BMKPoiSearchDelegate 处理回调结果第四步:运行程序,此时便可检索到附近小吃相关标注一.地图标注标注BMKAnnotation一定要实现为标注对应的protocal<BMKMapViewD

安卓开发：效果图中标注的像素尺寸如何转换为安卓的dp尺寸？

我们的UI基于1920x1080分辨率给的尺寸标注,但是在安卓开发中大家一般都使用dp.sp来标注界面尺寸,所以需要一个dp与sp的转换公式. 一开始参考的的这篇文章:关于Android开发中px.dip.dp.sp等单位的概念和转换关系(http://blog.csdn.net/watt520/article/details/9667079) 然后得到下面这两个公式: public static int dip2px(Context mContext, float dp) { float sc

iOS 百度地图坐标标注

注:由于iOS9改用更安全的https,为了能够在iOS9中正常使用地图SDK,请在"Info.plist"中进行如下配置,否则影响SDK的使用. <key>NSAppTransportSecurity</key> <dict> <key>NSAllowsArbitraryLoads</key> <true/> </dict> 配置.framework形式开发包第一步.引入BaiduMapAPI.fr

javascript百度地图添加一个普通标注点（2014-3-8 记）

1.导入jquery.js文件:<script type="text/javascript" src="js/jquery.js"></script> 2.导入百度地图JS: <script type="text/javascript" src="http://api.map.baidu.com/api?v=2.0&ak=您的密钥"></script>3.编写JS: &l

[转] 基于ArcGISServer实现活动地图标注

——王嘉彬(Esri中国上海分公司) 1.背景 1.1.主流互联网地图应用的现状在目前主流的互联网地图应用中,如 Google Map(图 1).搜狗地图(图2),POI 兴趣点的文字标注越来越多的应用了“活动地图标注”技术.相较于传统的静态地图标注,活动地图标注可以接受鼠标事件,用户既可以在地图上通过把鼠标指针移动到标注文字上或 POI 点获取简要信息,也可直接点击标注文字或 POI点以获取更为详细的 POI 信息,并能完成与该 POI 点相关的其它功能,从而为用户提供了良好的操作体验. 图

ASP.NET MVC验证标注的扩展-checkbox必选

我们知道ASP.NET mvc提供一些表单的验证标注,比如必填属性RequiredAttribute 但是这个属性不适合选择框的必选但是很多时候,我们却是需要一些必选的单选框比如网站注册的时候,需要用户同意网站的一些规定等等为此,我封装了一个BooleanRequiredAttribute的标注类, 该类可以标注那些框必填具体类如下: public class BooleanRequiredAttribute : ValidationAttribute, IClientValidatab

sloth——算法工程师标注数据的福音

一般算法工程师做标注,都要先开发个标注工具,无非下面几个选项: 1.mfc,C#,优点是交互界面友好,开发难度适中,缺点是没法跨平台 2.matlab,优点是可以跨平台,开发难度非常低,缺点是速度慢.交互界面很烂 3.搭个服务(土豪选项),直接服务器上搭个标注服务,再写个界面,标注人员通过浏览器打开页面就能标注,标注结果保存在数据库,工程师直接几行命令或者点几个按钮就能获取到数据.优点是高大上,跨平台,可以系统化管理,看着特nb,缺点是开发成本有点高,至少得找个全栈开发实习生,搞出来这一套后还得

exonerate编码区标注

热门专题