Google了一下,现成的工具不多. 自己写代码也可以,就是速度肯定不快,而且每次写也很麻烦. 偶然看到QIIME的filter_fasta.py有这个功能,从name list中提取多个序列. filter_fasta.py -f extract_no_N_200.fasta -o remain.fasta -s out.list [REQUIRED] -f, --input_fasta_fp Path to the input fasta file -o, --output_fasta_fp

package com.swift.kuozhan; import java.io.File; import java.io.FileFilter; /*使用文件过滤器筛选将指定文件夹下的小于200K的小文件获取并打印(包括所有子文件夹的文件).*/ public class kuaozhan1 { public static void main(String[] args) { File dir = new File("c:/"); if(!dir.exists()) { throw

//去掉字符串末尾指定符号 function RemoveSymbol(str, symbol) { if (str.charAt(str.length - 1) == symbol) { str = str.substring(0, str.length - 1); } return str; }

jquery实现对象数组 筛选出每条记录中的特定属性字段 直接上图: 源码: /** * 对后端返回的数据,筛选出符合报表的列项,多余的列项去除 */ function filterParams(data) { if (data.length > 0) { this.reportData = data; let result = []; this.reportData.map((item) => result.push({ Name: item.Name, MarketCodeName: it

一.关于程序: FUN:计算FASTA文件中每条序列中G和C的含量百分比,输出最大值及其id INPUT:FASTA格式文件 >seq1 CGCCGAGCGCTTGACCTCCAGCAAGACGCCGTCTGGCACATGCAACGAGCTGTAGCAGAC >seq2 ATGCCTAGAACGTTCGAGACTTCTCGGGTGCGGTAGAATTAGCCATTCGACCGACTTCCA GCATCTGCGAGCCGCCTGTTGATTGCATCCGCCGGGGACGCAACAAGGCAAG

今天在codewar做练习题时,要求写一个函数把一个字符串去掉WUB这些多余的字符然后把剩下的组成一句话输出,如传入"WUBAWUBBWUBCWUB"后返回"A B C"我的源代码是如下 function songDecoder(song){ // ... var words=song.split('WUB'); var str1=""; for(var i=0;i<words.length;i++){ if(words[i]=="

#!/usr/bin/env python # usages: python extract_seq_by_pos.py input.fasta id_start_end > result.fasta import sys import re FASTA= sys.argv[1] BED= sys.argv[2] fasta= open(FASTA, 'U') fasta_dict= {} for line in fasta: line= line.strip() if line == '':

如:在每一列meeting_persons的现有内容之上,去掉15112319字符串 ','')

今天用springboot写到一个需求:每周定时发送任务,但是要避开法定节假日. 网上找了些博客看,主要参考了https://www.cnblogs.com/lic309/p/4089633.html,整理补充了一下,完成需求. (另,如果想要实时动态更新定时任务,可以参考http://blog.csdn.net/liuchuanhong1/article/details/60873295) 为了避开节假日,我写触发器,试了下用quartz的Calendar和HolidayCalendar,代码

在pandas中怎么样实现类似mysql查找语句的功能: select * from table where column_name = some_value; pandas中获取数据的有以下几种方法: 布尔索引 位置索引 标签索引 使用API 假设数据如下: import pandas as pd import numpy as np df = pd.DataFrame({'A': 'foo bar foo bar foo bar foo foo'.split(), 'B': 'one one

str = " ai lafu yo ";str = trim(str); 输出的将是"ai lafu yo"

例: var arr= ["4.5岁", "3.5岁", "5.5岁", "5岁", "4岁"] var num = arr.replace(/岁/ig, '') console.log(num) 结果为:["4.5", "3.5", "5.5", "5", "4"]

select top 10  SUBSTRING( sproductcode, CHARINDEX('-', SProductCode)+1, LEN(SProductCode)) from csmrep.crmextdb.dbo.imei sql server 小技巧 集锦

public static String filterFieldsJson(Object src, Class<?> clazz, String... args) { SimplePropertyPreFilter filter = new SimplePropertyPreFilter(clazz, args); return JSON.toJSONString(src, filter); }

包头48bit 数据98464 ...如此循环: piece_size = 48 piece_size1 = 98464 with open("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\bins\\234.bin", "rb") as in_file, open("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\bins\\234_deal.bin", "ab+") as ou

该软件对于处理FASTA/Q十分方便,省去自己编写脚本 安装 1 conda install seqkit 使用 序列操作(seq) 1 ## 取方向序列 2 seqkit seq test.fa -r > test_re.fa 3 4 ## 取互补序列 5 seqkit seq test.fa -p > test_com.fa 6 7 ## 取方向互补序列 8 seqkit seq test.fa -r -p > test_re_com.fa 9 10 ## RNA---> DN

简单案例: $(function(){ $("td[id][id!='']").click(function(){ //你的逻辑 }); }); 上述代码,有id且id不为空的td都会执行"你的逻辑". =======================转载======================= 1.eq()  筛选指定索引号的元素2.first() 筛选出第一个匹配的元素3.last() 筛选出最后一个匹配的元素4.hasClass() 检查匹配的元素是否含有

最近php7的消息铺天盖地, 忍不住想尝试下.星期天看了下语法, 写个小脚本练下手: 这个脚本读取fasta 文件, 输出序列的长度和GC含量: <?php $fasta = "test.fasta"; $meta = array(); $meta = parse_fasta($fasta); write_res($meta); function parse_fasta($fasta) { $meta = array(); $file_handle = fopen($fasta,

列表生成式 a = [1, 2, 3, 4, -1, -2] b = [i for i in a if a > 0] 如果数据量很大,会产生一个庞大的结果.这时可以用生成器表达式: b = (i for i in a if a > 0) 如果筛选的过程中涉及一些复杂的细节,可以使用内建的 filter() 函数: values = [', 'N/A', '-', 5] def is_int(val): try: x = int(val) return True except ValueErro

 上下文  问题  影响因素  解决方案  变体  示例  结果上下文  相关模式  致谢  上下文 对于任何一个曾经从头建立 Web 应用程序的人来说,他们都会有这样的体会:这项任务所需要的独立完成的工作量要比建立内部客户端 - 服务器应用程序多一些.首先,必须处理 HTTP 及其所有相关问题,比如 HTTP 头.多部分形式.HTTP 的无状态性.字符集编码方案.多用途 Internet 邮件扩展 (MIME) 类型和 URL 重写.在此之上,必须处理安全措施,比如安全套接字层 (SSL) 和

Taskkill 结束一个或多个任务或进程.可以根据进程 ID 或图像名来结束进程. 语法 taskkill [/s Computer] [/u Domain\User [/p Password]]] [/fi FilterName][/pid ProcessID]|[/im ImageName] [/f][/t] 参数 /s Computer 指定远程计算机名称或 IP 地址(不能使用反斜杠).默认值是本地计算机. /u Domain\User 运行具有由 User 或 Domain\User