基于下面这份ppt:Comparing SPM and FSL, by lChris Rorden fsl & spm都是免费的,都很受欢迎.spm更受欢迎. 两者的区别在于何时利用normalise 归一化操作. 二者的头动矫正算法是不同的: spm是基于variance指标,fsl是基于normalised correlation 指标.spm的头动,包含非刚体变换unwarp操作.fsl的会将头动参数传递给feat的统计模型中.spm的头动矫正,sophisticated(好,但是复杂),

<The NPAIRS Computational Statistics Framework for Data Analysis in Neuroimaging> Strother. performance metric ,作为评测分析的量化方式,我们必须对分析的结果和效应进行量化分析. 1.通过将(p,r)作为一个函数用来衡量PDA分析的主成份子空间的大小. NPAIRS框架有三个作用: 1.衡量全局信噪比: 2.衡量fmri数据集的维度: 3.优化fmri数据处理的时间轴. 2.以前的PE

                                                        先来看看成果图: OK,开始画图: 实验背景声明:在脑影像分析中,我们首先构建脑网络,然后使用双样本t对比两组人的连接差异,然后使用以上的图进行可视化,一般红色连接代表显著升高,绿色代表显著下降.(非必须,根据实际需求设计,如上图中红色代表相应的连接差异与HAMD抑郁量表评分显著相关,绿色表示不相关).这里呢,我们研究了一组病人以及年龄性别匹配的健康被试的fMRI的数据,首先进行fMR

introduction: 1. feat 是一种基于模型的fmri数据分析方法. 2. feat 首先使用顺手,至少看起来,比spm漂亮多了. feat是按照正常人的使用方法去设计的. spm 由于matlab的gui库的限制,诶,不说了.还是自己能力不够啊.不够熟练啊. 3. feat 对于单被试,也就是individual的情形,大概需要5到10分钟,能跑出结果,最后,结果在网页进行显示.直接显示了激活图,显示了时间序列和model的拟合情况. 4. feat是基于glm而设计的,也就是基

原文地址:http://www.cnblogs.com/minks/p/4889497.html 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent functional magnetic resonance imaging, BOLD-fMRI)技术得到极快的发展,除了与扫描硬件.扫描技术的进步有关外,更得力于以图形图像等计算机科学为核心的相关学科的支持:图像数据的后处理技术成为fMRI中的关键环节 一.功能图像数据的性质 功能磁共振数据

Source:http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/DualRegression Research Overview A common need for analyses such as ICA for resting-state FMRI is to run a group-average ICA, and then, for each subject, estimate a "version" of each of the group-leve

Source: http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/MELODIC; https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/MELODIC/FAQ#How_do_I_transform_the_MELODIC_results_from_a_low-resolution_space_to_a_higher-resolution_one.3F Research Overview MELODIC ( Multivariate Explor

来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent functional magnetic resonance imaging, BOLD-fMRI)技术得到极快的发展,除了与扫描硬件.扫描技术的进步有关外,更得力于以图形图像等计算机科学为核心的相关学科的支持:图像数据的后处理技术成为fMRI中的关键环节 一.功能图像数据的性质 功能磁共振数据包括解剖(结构)

1.  MRI analysis tutorials:http://www.mccauslandcenter.sc.edu/CRNL/wp-content/tools/tutorial/index.html 2.  国外关于神经科学的软件库:http://neuro.debian.net/ 3.  spm主站:http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/ 4.  fsl主站:http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/ 5. 美国某大学开始的一个公开

转自莫毕业 目前,脑成像数据主要有DTI.fmri.3D三种模态.这些数据在分析前都要进行格式转换,不同公司的扫描仪存储格式也不尽相同.脑成像处理软件也很多,不同软件使用的格式也不一样,所以数据转换是脑成像数据处理的第一步,必须非常清楚.这里主要以siemens的机器为准,介绍在windowx下的MRIcron的dcm2nii转换和MRIConvert转换. 从扫描中心下载的原始数据是以dicom数据格式存在的压缩文件,解压后,得到原始文件.来自siemens的扫描仪的原始文件以“IMA”下为后

fMRI数据分析处理原理及方法 来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent functional magnetic resonance imaging, BOLD-fMRI)技术得到极快的发展,除了与扫描硬件.扫描技术的进步有关外,更得力于以图形图像等计算机科学为核心的相关学科的支持:图像数据的后处理技术成为fMRI中的关键环节 一.功能图像数据的性质

背景 在学习fMRI数据处理的过程中,通过其他的资料看到了别人推荐的有用的fMRI数据处理软件和小插件,在此记录一下,以便后期慢慢学习使用. 1.NeuroImaging Analysis Kit (NIAK) fMRI数据预处理及质量控制pipeline. 2.FieldTrip 处理EEG.MEG数据的非GUI工具,实现一些高级功能如coherence analysis. 3.GLM Flex 做二次统计用,除了SPM包括的那些,还允许更多功能如三因素分析和缺失数据兼容. 4.Medical

原文链接 简介 为发挥 SIMD1 的最大作用,除了对其进行矢量化处理2外,我们还需作出其他努力.可以尝试为循环添加 #pragma omp simd3,查看编译器是否成功进行矢量化,如果性能有所提升,则达到满意状态. 然而,可能性能根本不会提升,甚至还会降低. 无论处于何种情况,为了最大限度发挥 SIMD 执行的优势并实现性能提升,通常需要重新设计算法和数据布局,以便生成的 SIMD 代码尽可能高效. 另外还可收到额外的效果,即标量(非矢量化)版代码会表现得更好. 本文将通过一个 3D 动画算

× 目录 [1]定义 [2]准备语句 [3]绑定参数[4]执行查询[5]获取数据[6]大数据对象 前面的话 本来要把预处理语句和前面的基础操作写成一篇的.但是,由于博客园的限制,可能是因为长度超出,保存时总是报错,于是再开一篇.另一方面,相较于前面的exec()和query()语句来说,预处理语句更加常用 定义 在生成网页时,许多PHP脚本通常都会执行除参数之外,其他部分完全相同的查询语句,针对这种重复执行一个查询,每次迭代使用不同的参数情况,PDO提供了一种名为预处理语句(prepared s

这是2016年的最后一篇博客,年初定的计划是写12篇博客,每月一篇,1/3转载,2/3原创,看来是实现不了了! -- 题外话.今天要写的东西是C语言中的预处理器,我们常说的宏定义的用法.为什么要写这个东西呢,原因很简单:之前对预处理了解不深.如果你对C语言只是了解或者是仅仅在大学中学习过C语言,说到预处理估计你只知道下面这条语句:(因为我就是这种情况,哈哈!) #define name value 我再学习预处理直接的驱动力是看了php的源码,开头一大推的宏定义器,之前'掌握'的一点#defin

CSS不像其它高级语言一样支持算术运算.变量.流程控制与面向对象特性,所以CSS样式较多时会引起一些问题,如修改复杂,冗余,某些别的语言很简单的功能实现不了等.而javascript则是一种半面向对象的动态语言,有java的影子,有C的味道,中间有比其它语言多的糟粕,使用预处理办法可以解决这些问题.其中Less[les]与Sass是CSS的预处理技术,而CoffeeScript.TypeScript则是javascript的预处理技术. 一.Less 1.1.概要 Less是一种动态样式语言,L

Tika常见格式文件抽取内容并做预处理 作者 白宁超 2016年3月30日18:57:08 摘要:本文主要针对自然语言处理(NLP)过程中,重要基础部分抽取文本内容的预处理.首先我们要意识到预处理的重要性.在大数据的背景下,越来越多的非结构化半结构化文本.如何从海量文本中抽取我们需要的有价值的知识显得尤为重要.另外文本格式常常不一,诸如:pdf,word,excl,xml,ppt,txt等常见文件类型你或许经过一番周折还是有办法处理的.倘若遇到database,html,邮件,RTF,图像,语音

1简介 GCC 的意思也只是 GNU C Compiler 而已.经过了这么多年的发展,GCC 已经不仅仅能支持 C 语言:它现在还支持 Ada 语言.C++ 语言.Java 语言.Objective C 语言.Pascal 语言.COBOL语言,以及支持函数式编程和逻辑编程的 Mercury 语言,等等.而 GCC 也不再单只是 GNU C 语言编译器的意思了,而是变成了 GNU Compiler Collection 也即是 GNU 编译器家族的意思了.另一方面,说到 GCC 对于操作系统平

#pragma介绍 #pragma是一个预处理指令,pragma的中文意思是『编译指示』.它不是Objective-C中独有的东西(貌似在C/C++中使用比较多),最开始的设计初衷是为了保证代码在不同编译器之间的兼容性,但随着时间推移,它出现在了更多更丰富的应用场景中. #pragma代码是在编译期间处理的:它既不属于注释,也不属于逻辑代码的一部分:并且它和其他预处理命令譬如#ifdef ... #endif不同,它不会影响代码在运行时的逻辑处理,所以#pragma指令丝毫不会影响到程序在运行时

宏定义 宏定义是对一些常见的变量.字符串等进行定义,被定义的数据在编译会进行自动替换.有时一些变量或字符串被多次使用,当需要修改时,就需要对源文件中它们出现的地方一一修改,效率比较低,而通过宏定义,只需要对定义进行一次修改,就可以实现批量修改,提高效率,或者有时有些数字或字符需要多次输入,而数字或字符又不是很规律时,输入就会比较繁琐且容易出错.通过宏义将为输入和维护带来便利. 定义的格式 #define 标识符 字符串 其中的“#”表示这是一条预处理命令.凡是以“#”开头的均为预处理命令.“de