前言 本文主要演示GEO数据库的一些工具,使用的数据是2015年在Nature Communications上发表的文章Regulation of autophagy and the ubiquitin-proteasome system by the FoxO transcriptional network during muscle atrophy.[pubmed:25858807] 作者通过将FoxO1-3-4-floxed小鼠(FoxO1,3,4 f / f)与表达Cre重组酶的转基因系

上周收到一条求助信息:“如何用TCGA数据库分析LINC00152在卵巢癌与正常组织的的表达差异?” 所以以这个题目为记录分析过程如下: 一.下载数据 a)进入网站https://cancergenome.nih.gov/   网页截图如下: b)进入数据下载 Launch Data Portal   ,截图如下: 进入数据下载接口后,有Projects Exploration Analysis Repository 四个栏目,我们数据下载可进入Repository菜单栏,截图如下: 网页分成左

ORACLE怎么比较两个数据库的差异 方法1:使用PL-SQL工具 点击 工具->比较用户对象

现在需要分析访问日志,怎么办? 比如分析D:\Servers\Apache2.2\logs\access2014-05-22.log http://my.oschina.net/cart/针对这个问题特意开发了一款小工具分析Apache 日志,拆分字段成CSV文件并插入Mysql数据库分析 <?php $date = '2014-05-22'; file_put_contents($date.'.csv', ''); file_put_contents($date.'.csv', '"IP

tile38 是基于golang 编写的geo 数据库,支持地理空间索引.实时地理围栏,同时也支持leader-flower 的部署模型 备注: 下边测试一个简单的地理围栏功能 环境准备 docker-compose 文件 包含了一个简单的webhook 工具   version: "3" services:  app:    image: tile38/tile38    ports:    - "9851:9851"  benthos:    image: je

一.数据库分析 二.表的分析 1.分析表exec dbms_stats.gather_table_stats('SFISM4','R_SN_DETAIL_T',CASCADE=>TRUE);exec dbms_stats.gather_table_stats('ISMP','MAPI_ASYNC_NOTIFY',degree => 8,estimate_percent=> 100,cascade=>true);2.分析分区表exec dbms_stats.gather_table_

随着MySQL数据库的应用越来越广泛,DB2向MySQL数据库的迁移需求也越来越多.进行数据库之间迁移的时候,首先遇到的并且也是最基本最重要的就是两种数据库数据类型之间的转换. 相关阅读: 从商用到开源:15个维度,全面剖析DB2与MySQL数据库的差异 从商用到开源:DB2迁移至MySQL的最佳实践 下面结合中国证券等级结算深圳分公司开源数据库研究测试项目的DB2数据库向MySQL数据库迁移项目,说明两种数据库数据类型的差异以及迁移过程中的一些注意事项. 无论是DB2数据库,还是MySQL数据

https://www.plob.org/article/9969.html Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库,设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据,但是后来也加入了甲基化芯片,甚至高通量测序数据! GEO数据库基础知识 GEO Platform (GPL) 芯片平台 GEO Sample (GSM) 样本ID号 GEO Series (GSE) study的ID号 GEO Dataset (GDS) 数据集的ID号

SRA - NCBI example - NCBI 要发文章了,审稿时编辑肯定会要求你上传NGS测序数据. 一般数据都是放在集群,不可能放在个人电脑上,因为有的数据大的吓人(几个T). 所以我们就建一个文件夹,然后把所有需要的fastq文件链接到这个文件夹就行了(copy太慢,也太占空间). 接下来,如何NCBI账号申请好了,那就可以直接上传了,用aspera来上传. 命令如下: ~/.aspera/connect/bin/ascp -i ~/download/aspera.openssh -Q

标签(空格分隔): 千牛,逆向 问题:Android 千牛登陆后产生保存用户数据的db无法直接用sqlite3打开,需要解密. 反编译Apk后jd-gui查看源码.熟悉的sqlcrypto模块加密,阿里大部分的apk数据库都采用这种方案.Sqlcrypto加密方案,由java层生成一个16位的秘钥,传入libdatabase_sqlcyrpto.so加解密.关键点获取该秘钥进行解密 1.对SqliteOpenHelper类的setPassword 已经各种涉及到mPassword的函数下断 1)

作者:倪煜 InnoDB锁机制常常困扰大家,不同的条件下往往表现出不同的锁竞争,在实际工作中经常要分析各种锁超时.死锁的问题.本文通过不同条件下的实验,利用InnoDB系统给出的各种信息,分析了锁的工作机制.通过本文可以帮助大家了解InnoDB锁的基本原理,常见的冲突.死锁,以及对InnoDB事务日志信息的解读. 1. 索引基本原理 InnoDB主要使用行级锁(row lock),其行锁是通过在索引项上加锁而实现的,如果MySQL的执行计划没有用到索引,那么行锁也就无意义了,所以了解锁之前需要了

做了一年的大一年度项目了,对于关系型数据库结构还是有些了解了,有的时候还是觉得这种二维表不是很顺手.在看过一篇文章之后,对NoSQL有了初步的了解,(https://keen.io/blog/53958349217/analytics-for-hackers-how-to-think-about-event-data).这边文章写的很好,确实写出来了在实际情况下NoSQL的“用武之地”,而且用了MineCraft作分析,但是也许不够全面.比如文章中只是提到了,entity数据用关系型怎么存,ev

在使用Navicate for mysql进行数据库设计时,如果要分析已有db的表结构,则可以将已经分析过的表放入一个新建的组中,把精力更加集中在剩下的表中,以免受到干扰.

网上对于SQL数据库的使用比较详细,但是对于Oracle的使用比较少,本文特别适合学过SQL数据库但是工程需要使用Oracle数据的编程人员查看, 时间匆忙,文章可能写得不够详细,希望有人指出错误或者不同见解. 1.VS工作环境的设置    VS中Oracle的功能在2010左右已经停止的更新,如果需要最新的功能可以去Oracle官网上下载 ODP.NET的插件,装好之后手动添加两个引用分别为: -->using Oracle.DataAccess.Client; -->using Oracl

参考资料: Python 集合(set)   此脚本用于两个数据库之间的表.列.栏位.索引的差异对比. cat oracle_diff.py #!/home/dba/.pyenv/versions/3.5.2/bin/python#coding=utf-8import cx_Oracleimport timeimport difflibimport os v_host=os.popen('echo $HOSTNAME') class Oracle_Status_Output():    def

我配置的是: 一个月执行一次完整备份数据库,删除三个月前备份文件.每天执行一次差异备份,删除一个月钱备份文件. 1.管理-维护计划   右键-新建维护计划 2.创建子计划 3.分别配置作业计划属性(执行时间) 4.为子计划添加“备份数据库”任务和“清除历史记录”任务 5.备份数据库配置和清除历史记录配置(截图为完整备份的配置) 6.配置报告与记录日志写入本地 本次配置保存路径: 完整数据库保存路径:   D:\DbBackupFiles\Medusa_Full 差异数据库保存路径:   D:\D

bbqsql SQL盲注可能很难被利用. 当可用的工具工作时,它们运行良好,但是当它们不工作时,您必须编写自定义的东西. 这是耗时且乏味的. BBQSQL可以帮助你解决这些问题. BBQSQL是一个用Python编写的SQL盲注框架. 在攻击棘手的SQL注入漏洞时非常有用. BBQSQL也是一个半自动工具,允许对那些难以触发SQL注入结果进行相当多的自定义. 该工具可与数据库无关,并且功能多样. 它还具有直观的UI,可以更轻松地设置攻击. Python geven的实现使BBQSQL运行非常快.

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